2'-脱氧腺苷 | 958-09-8

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷酸及其类似物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 2'-脱氧腺苷
• 中文别名: 去氧胰苷；2'-脱氧腺苷一水合物；2’-脱氧腺苷；9-Β-D-2ˊ-脱氧呋喃核苷；2ˊ-脱氧腺苷(一水)；2"-脱氧腺苷；2"-脱氧腺甙；2'-脱氧腺甙
• 英文名称: 2'-Deoxyadenosine
• 英文别名: 2'-deoxy-D-adenosine；deoxyadenosine；2’-deoxyadenosine；2′-deoxyadenosine；(2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol；(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 958-09-8
• 化学式: C₁₀H₁₃N₅O₃
• mdl: MFCD00005754
• 分子量: 251.245
• InChiKey: OLXZPDWKRNYJJZ-RRKCRQDMSA-N

物化性质

• 熔点：
  187-189 °C
• 沸点：
  394.4°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2938 (rough estimate)
• 溶解度：
  DMSO（少许）、甲醇（少许）、水（少许）
• 最大波长(λmax)：
  258 (pH 2)；260 (pH 7)
• 物理描述：
  Solid
• 碰撞截面：
  152.3 Ų [M+H]+ [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

ADMET

毒理性

• 致癌物分类

对人类不具有致癌性（未被国际癌症研究机构IARC列名）。

No indication of carcinogenicity to humans (not listed by IARC).

来源:Toxin and Toxin Target Database (T3DB)

毒理性

• 健康影响

慢性高水平脱氧腺苷与腺苷脱氨酶缺乏有关。

Chronically high levels of deoxyadenosine are associated Adenosine Deaminase Deficiency.

来源:Toxin and Toxin Target Database (T3DB)

安全信息

• TSCA：
  Yes
• 危险等级：
  6.1
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2934999090
• 危险品运输编号：
  OTH
• 包装等级：
  III
• 危险类别：
  6.1
• 危险性防范说明：
  P301+P310
• 危险性描述：
  H301
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

简介

2′-脱氧腺苷是一种天然的脱氧核糖核苷，是脱氧核糖核酸DNA的结构片段。与其他天然核苷一样，它几乎参与所有生物细胞的遗传信息传递，影响蛋白质合成以及多糖代谢，并对生物体内细胞的生长、增殖、分化和抑制等具有重要的调控作用。2′-脱氧腺苷不仅是基因药物与基因工程研究的重要原材料，还自身具有良好的生理活性。例如，它可以抑制由糖诱导的胰岛素释放，并能降低特异性磷酸二脂酶抑制剂或腺苷环化酶激活剂促进胰岛素分泌的作用。

作用机制

2′-脱氧腺苷可通过抑制由糖诱导的胰岛素释放来发挥作用，并且能够减弱某些化合物促进胰岛素分泌的效果。此外，它还可以作为抗病毒、抗癌及抗艾滋病药物的重要中间体。例如，2′-氟-2′-脱氧腺苷和克拉屈滨（2′-氯-2′-脱氧腺苷）具有显著的抗肿瘤效果；双脱氧腺苷(ddA)对HIV和HBV病毒有较高的活性；阿昔洛韦则能强烈抑制HSV-1和HSV-2病毒。

制备

一种2′-脱氧腺苷的合成方法如下：

(1) 由腺苷合成2′-O-对甲苯磺酰基腺苷

将1.34g腺苷、1.37g二正丁基氧化锡和35ml甲醇置于100ml圆底烧瓶中，加热回流2小时。生成的2′，3′-二正丁基甲锡亚烷基腺苷直接进行下一步反应。向反应混合物加入对甲苯磺酰氯3.10g、三乙胺2ml，在室温下搅拌3-5小时。反应后静置1小时，抽滤并用甲醇洗涤滤渣。将滤渣置于真空干燥箱内干燥，最终得到白色粉末状固体2′-O-对甲苯磺酰基腺苷1.71g，收率81.2%，HPLC纯度为98.1%。

(2) 由2′-O-对甲苯磺酰基腺苷合成2′-脱氧腺苷

称取1.69g 2′-O-对甲苯磺酰基腺苷和10ml无水二甲基亚砜，置于50ml圆底烧瓶中，在氮气保护下于0～5℃滴加1mol/L三乙基硼氢化锂的四氢呋喃溶液20ml（1小时滴完），继续搅拌1小时。转移至室温后搅拌4-6小时。反应后用5-6ml甲醇熄灭反应，旋转蒸发除去四氢呋喃，减压蒸去二甲基亚砜，最后用乙醇重结晶可得白色晶状产物0.85g，收率为84.6%，HPLC检测纯度＞99.0%。

生物活性

2′-脱氧腺苷是核苷腺苷的一种衍生物，在双链DNA中能够与脱氧胸苷配对。

靶点

Human Endogenous Metabolite

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-脱氧腺苷 在 purine nucleoside phosphorylase 、 thymidine phosphorylase 、 磷酸 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 beta-胸苷
  参考文献：
  名称：

  ヌクレオシド化合物の製造方法

  摘要：

  提供一种可以高效制备同位素标记的核苷化合物的方法。通过在含有磷酸根离子的水溶液中，让原料核苷化合物与碱基经由核苷酸磷酸化酶进行碱基交换反应，从而得到目标核苷化合物的步骤。其中，所述目标核苷化合物是稳定同位素标记或放射性同位素标记的。

  公开号：

  JP2015160832A
• 作为产物：
  描述：

  阿糖腺苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 2-(2-cyanopropan-2-yldiazenyl)-2-methylpropanenitrile 、 四丁基氟化铵 、 三正丁基氢锡 、 silver nitrate 、 硫代氯甲酸苯酯 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 2'-脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  核酸相关化合物。81。9-（3-脱氧-β-D-苏-戊呋喃糖基）腺嘌呤，极具选择性的抗生素农杆菌素84的核心核苷和简化的结构成分类似物的合成† ‡

  摘要：

  设计了9-（3-脱氧-β-D-苏-戊呋喃糖基）腺嘌呤的替代合成方法（4），农杆菌素84 [及其2'-脱氧苏式异构体5 ]的核心核苷：（1）直接转化9 -将（-β-D-阿拉伯呋喃糖基）腺嘌呤转化成9-（2,3-脱水-β-D-呋喃糖基）腺嘌呤，并用硼氢化钠将其环氧乙烷环区域选择性地打开，得到4和5（〜7.5：1）；（2）用氢化钠和2,4,6-三异丙基苯-磺酰氯处理腺苷，并用三乙基硼氢化锂将所得的2'（3'）-磺酸盐进行还原性[1,2]-氢化物移位重排，得到三乙基硼氢化锂。给4和5（〜2：1）; （3）对9- [2（3），5-双-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-β-D-阿拉伯呋喃糖基]腺嘌呤的苯氧基硫代羰基酯进行巴顿脱氧，并脱保护得到4和2 ′-脱氧腺苷（〜5∶1）。方法（2）和（3）给出的产率较低。探索了简化的6- N-和5'- O-腺苷氨基磷酸酯模型化合物的合成，以检查针对农杆菌素84提出的结构中此类特征的潜在途径。

  DOI：

  10.1002/jhet.5570300504
• 作为试剂：
  描述：

  N6-[benzaldehyde hydrazone]-2'-deoxyadenosine 在 2'-脱氧腺苷 作用下， 反应 24.0h， 以10 mg的产率得到2-(苯亚甲基氨基)-2'-脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  苯hydr衍生物的光解反应生成2'-脱氧腺苷N 6-氨基自由基

  摘要：

  以氮为中心的自由基是通过添加羟基自由基和腺嘌呤衍生物的单电子氧化产生的主要物种。在次氯酸盐反应时，腺嘌呤氯胺的分解过程中也会产生氨基自由基。在这里，我们报告包含光活性hydr取代基的2'-脱氧腺苷（dAdo）的光化学作为模型，以研究dAdo N 6-氨基自由基的化学性质。在N6处含有苯hydr部分的dAdo衍生物显示300至400 nm之间的紫外线吸收。在存在氢供体（即谷胱甘肽）的情况下进行紫外光解后，形成了两种主要产物，即dAdo和苯甲醛，表明有效的均质裂解为dAdo N 6-氨基烷基和亚苄基亚氨基。在摩尔过量的未修饰dAdo的存在下，将dAdo N 6-苯photo光解以模拟在DNA中发生的反应，并通过高效液相色谱，质谱和核磁共振来鉴定主要的光产物。2-（亚苄基氨基）-2'-脱氧腺苷的形成以及更广泛的氧化产物可以通过初始dAdo N 6-氨基和亚苄基亚氨基的重组来解释。2'-脱氧肌苷的形成可以通过dAdo

  DOI：

  10.1021/tx900268r

文献信息

• [EN] CYCLIC PHOSPHATE COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS DE PHOSPHATE CYCLIQUE
  申请人：LIGAND PHARM INC

  公开号：WO2020219464A1

  公开（公告）日：2020-10-29

  Provided herein are cyclic phosphate compounds, their preparation and their uses, such as treating liver diseases or conditions or a disease or condition in which the physiological or pathogenic pathways involve the liver.

  本文提供了环磷酸酯化合物，它们的制备以及它们的用途，例如用于治疗肝脏疾病或病况，或者涉及肝脏的生理或病理途径的疾病或病况。
• [EN] PROCESSES FOR MAKING TRIAZOLO[4,5D] PYRAMIDINE DERIVATIVES AND INTERMEDIATES THEREOF<br/>[FR] PROCÉDÉS DE PREPARATION DE DÉRIVÉS DE TRIAZOLO [4,5 D] PYRIMIDINE ET INTERMÉDIAIRES DE CEUX-CI
  申请人：CORVUS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2018183965A1

  公开（公告）日：2018-10-04

  Provided herein are, inter alia, methods for making triazolo[4,5]pyramidine derivatives and intermediates thereof that are useful for treating diseases.

  本文提供了制备三氮杂[4,5]吡啶衍生物及其中间体的方法，这些衍生物对治疗疾病有用。
• [EN] COMPOUNDS COMPRISING CLEAVABLE LINKER AND USES THEREOF<br/>[FR] COMPOSÉS COMPRENANT UN LIEUR CLIVABLE ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：INTOCELL INC

  公开号：WO2019008441A1

  公开（公告）日：2019-01-10

  Provided are a compound including a cleavable linker, a use thereof, and an intermediate compound for preparing the same, and more particularly, the compound including a cleavable linker of the present invention may include an active agent (for example, a drug, a toxin, a ligand, a probe for detection, etc.) having a specific function or activity, a SO2 functional group which is capable of selectively releasing the active agent, and a functional group which triggers a chemical reaction, a physicochemical reaction and/or a biological reaction by external stimulation, and may further include a ligand (for example, oligopeptide, polypeptide, antibody, etc.) having binding specificity for a desired target receptor.

  提供了一种包括可切割连接物的化合物，其用途，以及用于制备该化合物的中间体化合物，更具体地，本发明的包括可切割连接物的化合物可能包括具有特定功能或活性的活性剂（例如，药物，毒素，配体，用于检测的探针等），能够选择性释放活性剂的SO2官能团，以及通过外部刺激触发化学反应，物理化学反应和/或生物反应的官能团，并且还可以包括具有与所需靶受体结合特异性的配体（例如，寡肽，多肽，抗体等）。
• [EN] PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE INHIBITORS AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] INHIBITEURS DE PROTÉINE TYROSINE PHOSPHATASE ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：CALICO LIFE SCIENCES LLC

  公开号：WO2020186199A1

  公开（公告）日：2020-09-17

  Provided herein are compounds, compositions, and methods useful for inhibiting protein tyrosine phosphatase, e.g., protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 (PTPN2) and/or protein tyrosine phosphatase non-receptor type 1 (PTPN1), and for treating related diseases, disorders and conditions favorably responsive to PTPN 1 or PTPN2 inhibitor treatment, e.g., a cancer or a metabolic disease.

  本文提供了用于抑制蛋白酪氨酸磷酸酶的化合物、组合物和方法，例如蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型2（PTPN2）和/或蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型1（PTPN1），以及用于治疗对PTPN1或PTPN2抑制剂治疗有良好反应的相关疾病、紊乱和状况的方法，例如癌症或代谢性疾病。
• Synthesis of Disaccharide Nucleosides by the<i>O</i>-Glycosylation of Natural Nucleosides with Thioglycoside Donors
  作者：Shin Aoki、Taketo Fukumoto、Taiki Itoh、Masayuki Kurihara、Shigeto Saito、Shin-ya Komabiki

  DOI：10.1002/asia.201403319

  日期：2015.3

  Disaccharide nucleosides constitute an important group of naturally‐occurring sugar derivatives. In this study, we report on the synthesis of disaccharide nucleosides by the direct O‐glycosylation of nucleoside acceptors, such as adenosine, guanosine, thymidine, and cytidine, with glycosyl donors. Among the glycosyl donors tested, thioglycosides were found to give the corresponding disaccharide nucleosides

  二糖核苷是天然存在的糖衍生物的重要组成部分。在这项研究中，我们报道了通过核苷受体（如腺苷，鸟苷，胸苷和胞苷）与糖基供体的直接O-糖基化来合成二糖核苷。在测试的糖基供体中，发现硫代糖苷可以使用对甲苯磺酰氯（TolSCl）和三氟甲磺酸银（AgOTf）作为促进剂，以上述核苷受体以中等至高化学产率提供相应的二糖核苷。通过1 H NMR光谱实验检查了这些启动子与核苷受体的相互作用。

表征谱图