6-bromo-9-[2-deoxy-3,5-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-erythro-pentofuranosyl]purine | 228704-85-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-bromo-9-[2-deoxy-3,5-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-erythro-pentofuranosyl]purine
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-5-(6-bromopurin-9-yl)-2-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-3-yl]oxy-tert-butyl-dimethylsilane
• CAS: 228704-85-6
• 化学式: C₂₂H₃₉BrN₄O₃Si₂
• 分子量: 543.652
• InChiKey: QDOVJYFRLYTMGP-GVDBMIGSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.29
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  71.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-bromo-9-[2-deoxy-3,5-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-erythro-pentofuranosyl]purine 在 盐酸羟胺 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以58%的产率得到N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl]hydroxylamine
  参考文献：
  名称：

  通过串联诺里斯I型光裂解，β片段的胺基自由基生成：2'-脱氧腺苷-N 6-基自由基的独立生成和反应性

  摘要：

  从嘌呤核苷中的氮氢键中提取出正式的氢原子，会产生对核酸氧化很重要的反应性中间体。本文中，我们描述了一种从2'-脱氧腺苷（dA•）的N 6-胺中提取氢原子而独立产生嘌呤自由基的方法。该方法涉及对酮（7b）进行顺序的Norrish I型光裂解，以及对最初形成的烷基（8b）进行β片段化以形成dA•和丙酮。DA•的形成随后激光闪光光解，这产生与λ的瞬时最大≈340纳米和更广泛的弱吸收在~560为中心。此瞬态以≥2×10 5 s –1的速度增长; 但是，计算和反应性数据表明，β片段的发生要快得多，这意味着在形成dA•时会消耗掉它。在亚铁离子或硫酚的存在下，7b的连续光解产生了良好的dA收率，而反应性较低的硫醇大概是由于极性不匹配而提供了较低的收率。通常，这种串联的光化学，β片段化方法有望用于核酸低聚物和/或聚合物中dA•的位点特异性生产，以及通常也可用于生产氨基自由基。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.7b00093
• 作为产物：
  描述：

  9-((2R,4S,5R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-5-(((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)甲基)四氢呋喃-2-基)-9H-嘌呤-6-胺 在 三溴甲烷 、 亚硝酸异戊酯 作用下， 反应 24.0h， 生成 6-bromo-9-[2-deoxy-3,5-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-erythro-pentofuranosyl]purine
  参考文献：
  名称：

  受保护的2'-脱氧腺苷C-6炔基化中的第一个无铜和无胺的Sonogashira型交叉偶联

  摘要：

  Sonogashira交叉偶联反应为到达C（sp）–C（sp 2）键的形成。尽管Sonogashira反应传统上是在Pd催化剂和Cu（I）盐的助催化剂存在下进行的，但是Cu（I）盐的使用通常效率不高，因为它会导致形成不需要的副产物。近年来，这引起了人们对开发无Cu Sonogashira交叉偶联反应条件的兴趣。另外，用于核苷衍生物的炔基化的无铜Sonogashira交叉偶联条件的开发在很大程度上仍未开发。本文中，我们证明了无铜和无胺的Sonogashira型交叉偶联可成功实现芳基溴化物和杂芳基溴化物的炔基化。首次，我们扩展了这种方法，用于在C-6位保护的2'-脱氧腺苷进行炔基化。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2009.03.064

文献信息

• Influence of Biaryl Phosphine Structure on C−N and C−C Bond Formation
  作者：Ramendra Pratap、Damon Parrish、Padmaja Gunda、D. Venkataraman、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/ja902679b

  日期：2009.9.2

  phosphine ligands affect Pd-catalyzed C-N and C-C bond-forming reactions, a new ligand, 2-(dicyclohexylphosphino)-4'-(N,N-dimethylamino)-1,1'-biphenyl, was synthesized. This compound is isomeric with the commercially available 2-(dicyclohexylphosphino)-2'-(N,N-dimethylamino)-1,1'-biphenyl that has been useful in C-N bond-forming reactions of nucleosides. The new p-dimethylamino biphenyl ligand bears

  为了了解联苯膦配体的电子和其他结构特征如何影响 Pd 催化的 CN 和 CC 键形成反应，一种新的配体，2-(二环己基膦)-4'-(N,N-二甲氨基)-1,1 '-联苯，合成。该化合物与市售的 2-(二环己基膦基)-2'-(N,N-二甲氨基)-1,1'-联苯异构，后者已用于核苷的 CN 键形成反应。新的对二甲氨基联苯配体与邻二甲氨基异构体具有电子相似性，但它也具有与 2-（二环己基膦基）联苯的结构相似性，例如非膦环中未取代的邻位。而 2-（二环己基膦基）联苯可以支持形成 CC 键的催化剂，它不能有效地促进核苷底物的芳基胺化。然而，新的配体被证明可以有效地促进核苷底物的芳基胺化和 CC 键形成反应，一些反应甚至在室温下发生。因此，这种新配体的复合结构元素被认为是由它衍生的催化系统反应性的标准。我们已经通过 X 射线晶体学分析探测了异构 N，N-二甲氨基联苯配体的结构。已通过 (31) P 核磁共振研究了两种配体与
• Unusual Deoxygenation and Reactivity Studies Related to <i>O</i>⁶-(Benzotriazol-1-yl)inosine Derivatives
  作者：Suyeal Bae、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/jo7021795

  日期：2008.2.1

  leading to the formation of C-6 (benzotriazol-1-yl)purine nucleoside derivatives and pinB-O-Bpin. This reaction has been investigated by 11B1H} NMR and compared to pinB-O-Bpin obtained by oxidation of pinB-Bpin. The structures of the C-6 (benzotriazol-1-yl)purine nucleosides have been unequivocally established via Pd-mediated C−N bond formation between bromo purine nucleosides and 1H-benzotriazole. Finally

  报道了与O 6-（苯并三唑-1-基）肌苷衍生物的化学有关的新的和不寻常的进展。首先，已经开发了一种通过使用PPh 3 / I 2 / HOBt合成其的简单，可扩展的方法，并通过31 P 1 H} NMR对其进行了机理研究。然后对O 6-（苯并三唑-1-基）肌苷核苷与双（频哪醇）二硼（pinB-Bpin）之间独特的氧转移反应进行了研究，导致形成C-6（苯并三唑-1-基）嘌呤核苷衍生物和pinB-O-Bpin。该反应已被11 B 11 H NMR并与通过氧化pinB-Bpin获得的pinB-O-Bpin进行比较。C-6（苯并三唑-1-基）嘌呤核苷的结构已通过溴嘌呤核苷与1 H-苯并三唑之间的Pd介导的C-N键形成而明确建立。的1最后，短和极其简单的合成，Ñ 6 -ethano-和1，Ñ 6 -propano-2'-脱氧腺苷被报告以便证明所述的合成的通用性ø 6 - （苯并三唑-1-基）
• Palladium-Catalyzed Synthesis of Nucleoside Adducts from Bay- and Fjord-Region Diol Epoxides
  作者：Elise Champeil、Padmanava Pradhan、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/jo070204z

  日期：2007.7.1

  tribenzoate as compared to the bay-region BaP amino tribenzoate. In contrast to reactions leading to the dA adducts, the C−N reactions of both BaP and BcPh amino tribenzoates with the 2-bromo-2‘-deoxyinosine derivative proceeded in comparable yields. This seems to indicate that such Pd-catalyzed adduct forming reactions at the C-6 position may be influenced by steric constraints of the amine component

  钯催化的CN键的形成已用于合成苯并[ a ] py（B a P）系列1（syn）和苯并[ c ]的2'-脱氧腺苷（dA）和2'-脱氧鸟苷（dG）加合物。菲（B c Ph）系列2（反）二醇环氧化物。对于这一点，（±）-10α氨基7β，8α，9β-trisbenzoyloxy -7,8,9,10-四氢B一个P和（±）-1β氨基2α，3α，4β-trisbenzoyloxy-1， 2,3,4-四氢B c Ph与6-卤代9- [3,5-双-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-β- d-赤型-戊呋喃糖基]嘌呤和O 6-苄基-3偶联'，5'-bis- O-（叔-丁基二甲基甲硅烷基）-2-溴-2'-脱氧肌苷，使用（±）-BINAP-Pd络合物和Cs 2 CO 3。对于dA加合物的合成，分析了6氯代和6溴嘌呤核苷衍生物与烃基氨基三苯甲酸酯的CN偶联反应。对于B a P氨基三苯甲酸酯，6-氯核苷可提供令人满意的结果，而6-溴类似物被证明对B
• Synthesis of Pyrene and Benzo[<i>a</i>]pyrene Adducts at the Exocyclic Amino Groups of 2‘-Deoxyadenosine and 2‘-Deoxyguanosine by a Palladium-Mediated C−N Bond-Formation Strategy
  作者：Mahesh K. Lakshman、Felix N. Ngassa、Suyeal Bae、Dennis G. Buchanan、Hoh-Gyu Hahn、Heduck Mah

  DOI：10.1021/jo030113b

  日期：2003.7.1

  with the purine 2'-deoxynucleosides to date. In this paper we disclose the synthesis of the model adducts N(6)-(1-pyrenyl)-2'-deoxyadenosine and N(2)-(1-pyrenyl)-2'-deoxyguanosine as well as the first synthesis of the carcinogen-linked nucleoside derivatives N(6)-(6-benzo[a]pyrenyl)-2'-deoxyadenosine and N(2)-(6-benzo[a]pyrenyl)-2'-deoxyguanosine via a palladium-mediated C-N bond formation. Two different

  致癌的烃类苯并[a] py（BaP）的单电子氧化被认为会产生自由基阳离子中间体，并且已经提出该物种会在嘌呤核碱基的氮原子上引起烷基化。尽管已经分离出了几种不同的核苷加合物，它们是由这种代谢活化模式引起的，但是迄今为止，还没有选择性，全合成的任何烃与嘌呤2'-脱氧核苷的单电子氧化形成的稳定的环外氨基加合物。 。在本文中，我们公开了模型加合物N（6）-（1-pyrenyl）-2'-脱氧腺苷和N（2）-（1-pyrenyl）-2'-脱氧鸟苷的合成以及该化合物的第一个合成。致癌物连接的核苷衍生物N（6）-（6-苯并[a]苯甲酰基）-2'-脱氧腺苷和N（2）-（6-苯并[a]苯甲酰基）-2' -脱氧鸟苷通过钯介导的CN键形成。尝试了两种不同的偶联策略：将芳基溴化物与适当保护的核苷偶联以及将芳基胺与适当的卤核苷偶联。前者的适用性有限，因为通过这种方法仅制备了N（6）-（1-吡啶基）-2'-脱氧腺苷。另
• Palladium-Catalyzed Aryl Amination Reactions of 6-Bromo- and 6-Chloropurine Nucleosides
  作者：Paul F. Thomson、Pallavi Lagisetty、Jan Balzarini、Erik De Clercq、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1002/adsc.200900728

  日期：——

  ribonucleosides and the 2'-deoxy analogues with aryl amines are described. Efficient conversions were observed with Pd(OAc)(2)/Xantphos/Cs(2)CO(3), in PhMe at 100 degrees C. Reactions of the bromo nucleoside derivatives could be conducted at a lowered catalytic loading (5 mol % Pd(OAc)(2)/7.5 mol % Xantphos), whereas good product yields were obtained with a higher catalyst load (10 mol % Pd(OAc)(2)/15

  描述了6-溴-以及6-氯嘌呤核糖核苷和2'-脱氧类似物与芳基胺的钯催化的CN键形成反应。在100°C的PhMe中，使用Pd（OAc）（2）/ Xantphos / Cs（2）CO（3）观察到了有效的转化。溴核苷衍生物的反应可以在较低的催化负载下进行（5 mol％Pd （OAc）（2）/7.5 mol％Xantphos），而当使用氯代类似物时，催化剂负载较高时（10 mol％Pd（OAc）（2）/ 15 mol％Xantphos）获得良好的产品收率。在所评估的实施例中，与乙酰基相比，对羟基的甲硅烷基保护看起来更好。该方法已通过与各种芳基胺的反应以及生物学上相关的脱氧腺苷和腺苷二聚体的合成进行了评估。