3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷 | 40733-27-5

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷酸及其类似物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷
• 英文名称: 3'-O-(t-butyldimethylsilyl)thymidine
• 英文别名: 3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxythymidine；1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 40733-27-5
• 化学式: C₁₆H₂₈N₂O₅Si
• 分子量: 356.494
• InChiKey: QAPSNMNOIOSXSQ-YNEHKIRRSA-N

物化性质

• 熔点：
  93-94 °C
• 密度：
  1.17±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.52
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319
• 储存条件：
  存放在惰性气体中，避免与空气和湿气接触（可能导致分解），并远离加热源，温度控制在0至10°C。

制备方法与用途

3'-O-叔丁基二甲基甲硅基硫脒是一种嘌呤核苷类似物，它具有广泛抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷 在 air 、 碘苯二乙酸 、 tetramethylpiperidinium-N-oxide 、 四丁基氟化铵 、 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 6.83h， 生成 胸腺嘧啶
  参考文献：
  名称：

  胸苷5'-羧酸的叔丁基过酸酯的热分解。伪C4'自由基的形成和命运

  摘要：

  的热分解的叔胸苷-5'-羧酸的丁基过酸酯1在不同溶剂中，在85℃下进行，得到叔-butylacetal 4a中，从在笼分解导出，和伪C4'基团2。自由基2可以通过从硫醇（硫酚或谷胱甘肽）或THF中夺取氢原子而还原为5，或者可以被双氧或过酸酯1本身氧化为阳离子8。阳离子8被亲核溶剂（叔丁醇，甲醇，水）立体选择性捕获，得到缩醛4a - c。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.03.029
• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 吡啶 、 咪唑 、 乙酰氯 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 51.5h， 生成 3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷
  参考文献：
  名称：

  Muraymycin 核苷抗生素：核苷单位变异的构效关系

  摘要：

  Muraymycins 是天然存在的核苷类抗生素的一个亚类，具有良好的抗菌活性。它们抑制细菌酶转位酶 I (MraY)，这是一种临床上尚未开发的靶标，介导细菌肽聚糖生物合成的重要细胞内步骤。已经合成了几种结构简化的 muraymycin 类似物用于构效关系 (SAR) 研究。我们现在报告在核苷单元中具有前所未有变化的新型衍生物。为了合成这些新的 muraymycin 类似物，我们采用了一种促进不同核苷氨基酸基序引入的双向方法。这还包括胸苷和 5-氟尿苷衍生的核苷核心结构。使用体外检测 MraY 活性，发现在嘧啶核碱基的 5 位引入取代基导致对 MraY 的抑制活性显着丧失。核碱基芳香性的丧失（通过尿嘧啶 C5-C6 双键的还原）导致约。抑制效力降低十倍。相比之下，2'-羟基的去除提供了保留的活性，因此证明核糖部分的修饰可能具有良好的耐受性。总体而言，这些新的 SAR 见解将指导新型 muraymycin

  DOI：

  10.3390/molecules25010022

文献信息

• Selective Cleavage of O-(Dimethoxytrityl) Protecting Group with Sodium Periodate
  作者：Dominik Rejman、Šárka Králíková、Zdeněk Točík、Radek Liboska、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1135/cccc20020502

  日期：——

  Sodium periodate in aqueous organic solvents selectively removes, under mild reaction conditions, the O-(dimethoxytrityl) protecting group. Selectivity of the cleavage was studied using the nucleoside derivatives protected by various types of groups commonly used in nucleoside and nucleotide chemistry.

  在水有机溶剂中，过碘酸钠在温和的反应条件下选择性地去除了O-(二甲氧基三苯甲基)保护基团。利用核苷衍生物进行了裂解的选择性研究，这些核苷衍生物受到核苷和核苷酸化学中常用的各种基团的保护。
• [EN] COMPOUNDS, COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS<br/>[FR] COMPOSÉS, COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD

  公开号：WO2018237194A1

  公开（公告）日：2018-12-27

  The present disclosure, among other things, provides technologies for synthesis, including reagents and methods for stereoselective synthesis. In some embodiments, the present disclosure provides compounds useful as chiral auxiliaries. In some embodiments, the present disclosure provides reagents and methods for oligonucleotide synthesis. In some embodiments, the present disclosure provides reagents and methods for chirally controlled preparation of oligonucleotides. In some embodiments, technologies of the present disclosure are particularly useful for constructing challenging internucleotidic linkages, providing high yields and stereoselectivity.

  本公开内容提供了合成技术，包括用于立体选择性合成的试剂和方法。在某些实施例中，本公开内容提供了作为手性辅助剂有用的化合物。在某些实施例中，本公开内容提供了用于寡核苷酸合成的试剂和方法。在某些实施例中，本公开内容提供了用于手性控制寡核苷酸制备的试剂和方法。在某些实施例中，本公开内容的技术特别适用于构建具有挑战性的核苷酸间连接，提供高产率和立体选择性。
• Hafnium Triflate as a Highly Potent Catalyst for Regio- and Chemoselective­ Deprotection of Silyl Ethers
  作者：Shan-Shan Gong、Qi Sun、Xiu-An Zheng、Rui Kong、Hua-Shan Huang、Jing-Ying Wei、Ji-Zong Chen

  DOI：10.1055/s-0037-1610307

  日期：2019.2

  3° alkyl and aryl tert-butyldimethylsilyl (TBS) ethers are significantly different, ranging from 0.05 mol% to 3 mol%, regioselective deprotection of TBS could be easily implemented. Moreover, chemoselective cleavage of different silyl ethers or removal of TBS in the presence of most hydroxyl protecting groups was also accomplished. NMR analyses of silyl products from TBS deprotection indicated that Hf(OTf)4-catalyzed

  摘要 作为IVB族过渡金属路易斯酸，三氟甲磺酸[[Hf（OTf）4 ]在脱甲硅烷基化反应中表现出极高的效能。由于1°，2°，3°烷基和芳基叔丁基二甲基甲硅烷基（TBS）醚的脱保护所需的Hf（OTf）4的量显着不同，范围为0.05 mol％至3 mol％，因此TBS的区域选择性脱保护可以轻松实现。此外，还实现了在大多数羟基保护基存在下，不同甲硅烷基醚的化学选择性裂解或TBS的去除。来自TBS脱保护的甲硅烷基产物的NMR分析表明，取决于所使用的溶剂，Hf（OTf）4催化的甲硅烷基化可能通过不同的机理进行。 作为IVB族过渡金属路易斯酸，三氟甲磺酸[[Hf（OTf）4 ]在脱甲硅烷基化反应中表现出极高的效能。由于1°，2°，3°烷基和芳基叔丁基二甲基甲硅烷基（TBS）醚的脱保护所需的Hf（OTf）4的量显着不同，范围为0.05 mol％至3 mol％，因此TBS的区域选择性脱保护可以轻松实现。此
• Phosphoramidate analogs of 2'-deoxyuridine
  申请人：University of Rochester

  公开号：US05233031A1

  公开（公告）日：1993-08-03

  The present invention provides a series of cytotoxic phosphoramidate analogs of 5-fluoro-2'-deoxyuridine of the general formula (I): ##STR1## wherein R.sup.1 is H, F or (C.sub.1 -C.sub.4)alkyl; R.sup.2 is CH.sub.2 CH.sub.2 X wherein X is Cl, Br, I or p-toluenesulfonyl; R.sup.3 is (C.sub.1 -C.sub.4)alkyl or CH.sub.2 CH.sub.2 X wherein X is Cl, Br, I or p-toluenesulfonyl; or wherein R.sup.2 and R.sup.3, taken together with the N atom, can be a 5- or 6-membered heterocyclic ring which is aliphatic or aliphatic interrupted by a ring oxygen or a second ring nitrogen; R.sup.4 is H, one equivalent of a pharmaceutically-acceptable cation or (4,4,6-trimethyltetrahydro-1,3-oxazin-2-yl)ethyl, and the pharmaceutically-acceptable salts thereof.

  本发明提供了一系列细胞毒性的5-氟-2'-脱氧尿嘧啶的磷酰胺类似物，其一般式为(I)：##STR1##其中R.sup.1为H，F或(C.sub.1 -C.sub.4)烷基；R.sup.2为CH.sub.2 CH.sub.2 X，其中X为Cl，Br，I或对甲苯磺酰基；R.sup.3为(C.sub.1 -C.sub.4)烷基或CH.sub.2 CH.sub.2 X，其中X为Cl，Br，I或对甲苯磺酰基；或其中R.sup.2和R.sup.3，与N原子一起，可以是一个5-或6-成员杂环，其为脂肪族的或被一个环氧原子或第二个环氮原子中断的脂肪族；R.sup.4为H，一个等效的药用阳离子或(4,4,6-三甲基四氢-1,3-噁唑啉-2-基)乙基，以及其药用盐。
• 一种三氟甲磺酸铪催化的硅醚保护基脱除方 法
  申请人：江西科技师范大学

  公开号：CN109180405B

  公开（公告）日：2021-07-30

  本发明提供了一种三氟甲磺酸铪催化的硅醚保护基脱除方法，以0.2mol‰‑3mol％的三氟甲磺酸铪为催化剂，以硅醚保护的羟基化合物为底物，以常规AR甲醇作为溶剂，在室温下0.5‑16小时即可高效脱除近50种底物的各种硅醚保护基。粗产物经过常规硅胶柱层析纯化可高产率得到42种硅醚保护基脱除产物。通过调整催化剂用量，Hf(OTf)4催化剂可以实现对1°,2°,3°烷基TBS以及芳基TBS保护基的区域选择性脱除。此外，在适当的当量范围，Hf(OTf)4催化剂还可以实现1)对不同种类硅基保护基的化学选择性脱除；2)在不影响绝大多数常见羟基保护基的情况下，对1°TBS保护基的化学选择性脱除。