3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'(R)-C-vinylthymidine | 157728-35-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'(R)-C-vinylthymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[(1R)-1-hydroxyprop-2-enyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 157728-35-3
• 化学式: C₁₈H₃₀N₂O₅Si
• 分子量: 382.532
• InChiKey: SWYJMMMHGSVZPX-LXTVHRRPSA-N

物化性质

• 密度：
  1.15±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.07
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'(R)-C-vinylthymidine 在 四氮唑 、 叔丁基过氧化氢 作用下， 以 二氯甲烷 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 allyl 3'-O-(5'-O-tert-butyldimethylsilyl)thymidinyl 5'-O-(3'-O-tert-butyldimethylsilyl)-5'(R)-C-vinylthymidinyl phosphoric ester
  参考文献：
  名称：

  构象受限的环状磷酸三酯键合二核苷酸的合成及NMR研究

  摘要：

  合成了其中磷酸二酯键在环状磷酸三酯结构中构象受限的四个非对映异构二核苷酸。来自差向异构体5'- C-乙烯基胸苷衍生物，包含两个末端烯基部分的二核苷酸，是通过标准亚磷酰胺化学方法构建的，并用作闭环复分解（RCM）反应的底物。从而，获得并分离了在核苷间键中具有七个成员磷酸环的四个非对映异构二核苷酸，并通过先进的NMR研究结合受限的分子动力学（rMD）模拟阐明了它们的构型。发现七个成员环在天然核酸主链中提供一定程度的构象限制，并且发现四个二核苷酸之一有利于两个相邻的胸腺嘧啶部分之间的堆叠。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)01047-x
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷 在 戴斯-马丁氧化剂 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'(R)-C-vinylthymidine
  参考文献：
  名称：

  构象受限的环状磷酸三酯键合二核苷酸的合成及NMR研究

  摘要：

  合成了其中磷酸二酯键在环状磷酸三酯结构中构象受限的四个非对映异构二核苷酸。来自差向异构体5'- C-乙烯基胸苷衍生物，包含两个末端烯基部分的二核苷酸，是通过标准亚磷酰胺化学方法构建的，并用作闭环复分解（RCM）反应的底物。从而，获得并分离了在核苷间键中具有七个成员磷酸环的四个非对映异构二核苷酸，并通过先进的NMR研究结合受限的分子动力学（rMD）模拟阐明了它们的构型。发现七个成员环在天然核酸主链中提供一定程度的构象限制，并且发现四个二核苷酸之一有利于两个相邻的胸腺嘧啶部分之间的堆叠。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)01047-x

文献信息

• Synthesis and NMR-studies of dinucleotides with conformationally restricted cyclic phosphotriester linkages
  作者：Anders M Sørensen、Katrine E Nielsen、Barbara Vogg、Jens Peter Jacobsen、Poul Nielsen

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)01047-x

  日期：2001.12

  Four diastereomeric dinucleotides in which the phosphodiester linkages are conformationally restricted in cyclic phosphotriester structures are synthesised. From the epimeric 5′-C-vinyl thymidine derivatives, dinucleotides containing two terminal alkene moieties are constructed via standard phosphoramidite chemistry, and applied as substrates in ring-closing metathesis (RCM) reactions. Hereby, four

  合成了其中磷酸二酯键在环状磷酸三酯结构中构象受限的四个非对映异构二核苷酸。来自差向异构体5'- C-乙烯基胸苷衍生物，包含两个末端烯基部分的二核苷酸，是通过标准亚磷酰胺化学方法构建的，并用作闭环复分解（RCM）反应的底物。从而，获得并分离了在核苷间键中具有七个成员磷酸环的四个非对映异构二核苷酸，并通过先进的NMR研究结合受限的分子动力学（rMD）模拟阐明了它们的构型。发现七个成员环在天然核酸主链中提供一定程度的构象限制，并且发现四个二核苷酸之一有利于两个相邻的胸腺嘧啶部分之间的堆叠。