O-(3'-O-t-butyldimethylsilylthymidin-5'-yl) O-(5'-dimethoxytritylthymidin-3'-yl) S-methyl thiophosphite | 134407-75-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: O-(3'-O-t-butyldimethylsilylthymidin-5'-yl) O-(5'-dimethoxytritylthymidin-3'-yl) S-methyl thiophosphite
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-methylsulfanylphosphanyl]oxymethyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 134407-75-3；134524-13-3
• 化学式: C₄₈H₆₁N₄O₁₂PSSi
• 分子量: 977.157
• InChiKey: YHIGPYRAVROJEF-ZCEFWCSBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.69
• 重原子数：
  67
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  198
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O-(3'-O-t-butyldimethylsilylthymidin-5'-yl) O-(5'-dimethoxytritylthymidin-3'-yl) S-methyl thiophosphite 在 吡啶 、 苯硫酚 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 反应 40.0h， 生成 O-(3'-O-t-butyldimethylsilylthymidin-5'-yl) O-(5'-dimethoxytritylthymidin-5'-yl)phosphorodithioate
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸二硫代磷酸酯的合成，核磁共振和结构

  摘要：

  硫代亚磷酰胺和硫代氨基甲酸酯化学已用于制备寡核苷酸的二硫代磷酸酯类似物。通过二维NMR分配3'-胸苷二硫代磷酸二硫代癸酸酯d（CGCTpS - 2 TpS - 2 AAGCG）的1 H和13 P共振，并确定溶液结构

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)81780-4
• 作为产物：
  描述：

  N,N-diisopropylamino-3'-O-<5'-O-(dimethoxytrityl) thymidine>thiomethoxyphosphine 、 3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷 在 四氮唑 作用下， 以 乙腈 、 苯 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 O-(3'-O-t-butyldimethylsilylthymidin-5'-yl) O-(5'-dimethoxytritylthymidin-3'-yl) S-methyl thiophosphite
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸二硫代磷酸酯的合成，核磁共振和结构

  摘要：

  硫代亚磷酰胺和硫代氨基甲酸酯化学已用于制备寡核苷酸的二硫代磷酸酯类似物。通过二维NMR分配3'-胸苷二硫代磷酸二硫代癸酸酯d（CGCTpS - 2 TpS - 2 AAGCG）的1 H和13 P共振，并确定溶液结构

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)81780-4

文献信息

• Synthesis, NMR and structure of oligonucleotide phosphorodithioates
  作者：Martial E. Piotto、Jill Nelson Granger、Yesun Cho、Nasser Farschtschi、David G. Gorenstein

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)81780-4

  日期：1991.1

  Thiophosphoramidite as well as thiophosphoramidate chemistry has been used to prepare dithiophosphate analogues of oligonucleotides. The 1H and 13P resonances of the 3′-thymidine phosphorodithioate decamer d(CGCTpS−2TpS−2 AAGCG) were assigned by two-dimensional NMR and the solution structure determined

  硫代亚磷酰胺和硫代氨基甲酸酯化学已用于制备寡核苷酸的二硫代磷酸酯类似物。通过二维NMR分配3'-胸苷二硫代磷酸二硫代癸酸酯d（CGCTpS - 2 TpS - 2 AAGCG）的1 H和13 P共振，并确定溶液结构