5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷 | 40733-28-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷
• 中文别名: 6-[4-(叔丁氧羰酰)哌嗪-1-YL]烟酸；4-(5-羧基-吡啶-2-基)-哌嗪-1-羧酸叔丁酯；5-O-叔丁基二甲基甲硅烷基-胸腺嘧啶脱氧核苷
• 英文名称: 5'-tert-butyldimethylsilyloxy-2'-deoxythymidine
• 英文别名: 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxythymidine；1-((2R,4S,5R)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；5'-O-TBDMS-thymidine；5′-O-(tertbutyldimethylsilyl)thymidine；5’-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；5'-(t-butyldimethylsilyl)-2'-deoxythymidine；5'-O-Tert-butyldimethylsilyl-thymidine；1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 40733-28-6
• 化学式: C₁₆H₂₈N₂O₅Si
• 分子量: 356.494
• InChiKey: IJWIJLIIOKZJMS-YNEHKIRRSA-N

物化性质

• 熔点：
  198
• 密度：
  1.148±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  DMSO：100 mg/mL（280.51 mM；需要超声）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.52
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 海关编码：
  2933599090
• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

5'-O-TBDMS-dT 是一种兼具保护和修饰功能的核苷。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷 在 Bu₄NF*2(BF_3.Et₂O) 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成 beta-胸苷
  参考文献：
  名称：

  Bu 4 NF和BF 3 ·Et 2 O的1：1和1：2配合物：用作裂解甲硅烷基醚的试剂的独特性能

  摘要：

  开发了一种新的方法，该方法使用由氟化四丁基铵（TBAF）和BF 3 ·Et 2 O生成的络合物A和络合物B从甲硅烷基醚中除去三烷基甲硅烷基。通过使用这些硼配合物的去甲硅烷基化作用显着地受到Si原子和试剂上的空间因素的影响。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)02193-0
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-O-(4,4'-dimethoxytriphenylmethyl)thymidine 在 碘 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.5h， 以85%的产率得到5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷
  参考文献：
  名称：

  甲醇中碘脱保护四氢吡喃醚的简便方法

  摘要：

  摘要 描述了一种在甲醇中使用碘对四氢吡喃基和 4,4'-二甲氧基三苯甲基醚脱保护的简单有效方法。

  DOI：

  10.1080/00397919908086457
• 作为试剂：
  描述：

  5'-O-tritylthymidine 在 Bu₄NF*BF_3.Et₂O 、 5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.25h， 生成 beta-胸苷
  参考文献：
  名称：

  Bu 4 NF和BF 3 ·Et 2 O的1：1和1：2配合物：用作裂解甲硅烷基醚的试剂的独特性能

  摘要：

  开发了一种新的方法，该方法使用由氟化四丁基铵（TBAF）和BF 3 ·Et 2 O生成的络合物A和络合物B从甲硅烷基醚中除去三烷基甲硅烷基。通过使用这些硼配合物的去甲硅烷基化作用显着地受到Si原子和试剂上的空间因素的影响。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)02193-0

文献信息

• pH-Cleavable Nucleoside Lipids: A New Paradigm for Controlling the Stability of Lipid-Based Delivery Systems
  作者：Khalid Oumzil、Sébastien Benizri、Giovanni Tonelli、Cathy Staedel、Ananda Appavoo、Max Chaffanet、Laurence Navailles、Philippe Barthélémy

  DOI：10.1002/cmdc.201500381

  日期：2015.11

  Herein, we report the design, synthesis and evaluation of novel orthoester nucleoside lipids (ONLs) for the modulation of liposome stability. The ONLs contain head groups with 3′‐orthoester nucleoside derivatives featuring positive or negative charges. The insertion of the orthoester function in the NL structures allows the formation of pH‐sensitive liposomes. ONL‐based liposomes can be hydrolyzed to provide

  基于脂质的输送系统是一项成熟的技术，已在临床上获得了广泛认可，并在人体中得到了多种应用。在这里，我们报告新型，原酸酯核苷脂质（ONLs）的设计，合成和评估脂质体稳定性的调制。ONL包含带有3'-原酸酯核苷衍生物的头部基团，这些衍生物具有正电荷或负电荷。原酸酯功能在NL结构中的插入允许形成pH敏感的脂质体。可以水解基于ONL的脂质体以提供无毒产品，包括核苷衍生物和十六烷醇。为了使释放可以在不同的水解速率下调节，调节了极性头结构的电荷，并且可以在生物学上相关的pH值下释放头基。至关重要的是 当ONL与天然磷酸胆碱脂质（PC）混合时，所得脂质体向十六烷醇/ PC层状体系的形成方向发展。生物学评估表明，用ONL和siRNA配制的稳定的核酸脂质颗粒（SNALP）可以有效进入肿瘤细胞并响应细胞内酸性环境释放其核酸有效载荷。这导致比常规SNALPs高得多的抗肿瘤活性。使用pH可裂解的核苷酸控制基于脂质的
• [EN] NUCLEOSIDE-LIPID COMPOUNDS WITH PH-SENSITIVE DIALKYLORTHOESTER CHAINS AND THEIR USE FOR TRANSPORTATION OR VECTORIZATION OF AT LEAST ONE THERAPEUTIC AGENT<br/>[FR] COMPOSÉS NUCLÉOSIDES-LIPIDES AVEC DES CHAÎNES DIALKYLORTHOESTER SENSIBLES AU PH ET LEUR UTILISATION POUR LE TRANSPORT OU LA VECTORISATION D'AU MOINS UN AGENT THÉRAPEUTIQUE
  申请人：UNIV BORDEAUX

  公开号：WO2016188868A1

  公开（公告）日：2016-12-01

  The invention relates to new nucleoside-lipid compounds with pH-sensitive dialkylorthoesterchains, to the process for their preparation and to their uses, in particular their use for transportation or vectorization of at least one therapeutic agent.

  这项发明涉及具有pH敏感二烷基正酯链的新核苷脂类化合物，涉及它们的制备过程以及它们的用途，特别是用于运输或载体化至少一种治疗剂的用途。
• Modified oligonucleotides
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US05808023A1

  公开（公告）日：1998-09-15

  Novel compounds that mimic and/or modulate the activity of wild-type nucleic acids are provided. The novel compounds have modified internucleoside linkages which preferably replace naturally-occurring phosphodiester-5'-methylene linkages with four atom linking groups. Preferred linkages have structures such as, for example, CH.sub.2 --R.sub.A --NR.sub.1 --CH.sub.2, CH.sub.2 --NR.sub.1 --R.sub.A --CH.sub.2, R.sub.A --NR.sub.1 --CH.sub.2 --CH.sub.2, CH.sub.2 --CH.sub.2 --NR.sub.1 --R.sub.A, CH.sub.2 --CH.sub.2 --R.sub.A --NR.sub.1, or NR.sub.1 --R.sub.A --CH.sub.2 --CH.sub.2 where R.sub.A is O or NR.sub.2. These linkages are prepared from appropriately functionalized nucleosides and oligonucleotides.

  提供模拟和/或调节野生型核酸活性的新化合物。这些新化合物具有修改的核苷酸间连接，最好用四原子连接基固定取代自然发生的磷酸二酯-5'-亚甲基连接。首选连接具有结构，例如，CH.sub.2 --R.sub.A --NR.sub.1 --CH.sub.2，CH.sub.2 --NR.sub.1 --R.sub.A --CH.sub.2，R.sub.A --NR.sub.1 --CH.sub.2 --CH.sub.2，CH.sub.2 --CH.sub.2 --NR.sub.1 --R.sub.A，CH.sub.2 --CH.sub.2 --R.sub.A --NR.sub.1，或NR.sub.1 --R.sub.A --CH.sub.2 --CH.sub.2，其中R.sub.A为O或NR.sub.2。这些连接是从适当功能化的核苷酸和寡核苷酸制备的。
• Visible Light-Induced α-C(sp³)–H Acetalization of Saturated Heterocycles Catalyzed by a Dimeric Gold Complex
  作者：Xiaojia Si、Lumin Zhang、Zuozuo Wu、Matthias Rudolph、Abdullah M. Asiri、A. Stephen K. Hashmi

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c01924

  日期：2020.8.7

  situ-formed gold complex. The broad functional group compatibility and substrate scope indicate that our strategy is a promising way to synthesize acetal analogues. The method was successfully applied in late-stage modifications of bioactive molecules. Gram scale syntheses and mechanistic studies are also presented.

  饱和杂环缩醛是有机合成和其他领域的有用片段。本文中，使用碘代苯和原位形成的金络合物在可见光照射下实现了醚，四氢噻吩和吡咯烷的C（sp 3）–H脱氢交叉偶联。广泛的官能团相容性和底物范围表明，我们的策略是合成缩醛类似物的一种有前途的方法。该方法已成功应用于生物活性分子的后期修饰。还介绍了革兰氏鳞片的合成和机理研究。
• Photoinduced Deoxygenative Borylations of Aliphatic Alcohols
  作者：Jingjing Wu、Robin M. Bär、Lin Guo、Adam Noble、Varinder K. Aggarwal

  DOI：10.1002/anie.201910051

  日期：2019.12.19

  A photochemical method for converting aliphatic alcohols into boronic esters is described. Preactivation of the alcohol as a 2-iodophenyl-thionocarbonate enables a novel Barton-McCombie-type radical deoxygenation that proceeds efficiently with visible light irradiation and without the requirement for a photocatalyst, a radical initiator, or tin or silicon hydrides. The resultant alkyl radical is intercepted

  描述了一种将脂肪醇转化为硼酸酯的光化学方法。将醇预活化为 2-碘苯基硫代碳酸酯，可实现新型 Barton-McCombie 型自由基脱氧，该自由基脱氧可在可见光照射下有效进行，且无需光催化剂、自由基引发剂或锡或氢化硅。生成的烷基被双（儿茶酚）二硼拦截，从各种结构复杂的醇中提供硼酸酯。