3,5-双-o-(t-丁基二甲基甲硅烷基)胸腺嘧啶脱氧核苷 | 40733-26-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 3,5-双-o-(t-丁基二甲基甲硅烷基)胸腺嘧啶脱氧核苷
• 英文名称: 3',5'-O-di(tert-butyldimethylsilyl)thymidine
• 英文别名: 3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；3',5'-di-O-tert-butyldimethylsilyl thymidine；3',5'-bis(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；3',5'-Bis-O-(T-butyldimethylsilyl)thymidine；1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 40733-26-4
• 化学式: C₂₂H₄₂N₂O₅Si₂
• 分子量: 470.757
• InChiKey: DDLOCFSZSYGOPG-RCCFBDPRSA-N

物化性质

• 熔点：
  115 °C
• 密度：
  1.05±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于乙酸乙酯

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.54
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  77.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 储存条件：
  2-8°C

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,5-双-o-(t-丁基二甲基甲硅烷基)胸腺嘧啶脱氧核苷 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以95%的产率得到beta-胸苷
  参考文献：
  名称：

  通过2'-脱氧尿苷的区域选择性锂化合成5-取代的核苷

  摘要：

  在TMEDA存在下，用仲-BuLi处理2'-脱氧-3'，5'-双-O-[（1,1-二甲基乙基）二甲基甲硅烷基]-尿苷导致在C-5高度区域选择性锂化。将锂化的衍生物用许多亲电试剂处理，得到5-取代的2'-脱氧尿苷。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(01)93710-4
• 作为产物：
  描述：

  溴脲苷 在 正丁基锂 、 TEA 、 碘甲烷 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 3,5-双-o-(t-丁基二甲基甲硅烷基)胸腺嘧啶脱氧核苷
  参考文献：
  名称：

  Selective alkylation of pyrimidyl dianions II: synthesis, characterization, and comparative reactivity of 3′, 5′-o-bis- tetrahydropyranyl, trimethylsilyl and tert-butyldimethylsilyl derivatives of 5-bromo-2′-deoxyuridine

  摘要：

  Three compounds which can be used as precursors for thymidine synthesis via methylation at the 5 position, including 3', 5'-o-bis(tetrahydropyranyl)-5-bromo-2'-deoxyuridine 1a, 3', 5'-o-bis-(trimethylsily)-5-bromo-2'-deoxyuridine 1b, and 3', 5'-o-bis-(t-butyldimethylsilyl)-5-bromo-2'-deoxyuridine 1c, were prepared isolated and characterized by spectroscopic methods. Alkylation with methyl iodide using an organo-lithium reagent at low temperature produced 72%, 41% and 74% of thymidine 6, respectively. Tetrahydropyranyl and t-butyldimethylsilyl ethers are found to be better precursors for introduction of a methyl group at the 5 position.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)80845-0

文献信息

• Hafnium Triflate as a Highly Potent Catalyst for Regio- and Chemoselective­ Deprotection of Silyl Ethers
  作者：Shan-Shan Gong、Qi Sun、Xiu-An Zheng、Rui Kong、Hua-Shan Huang、Jing-Ying Wei、Ji-Zong Chen

  DOI：10.1055/s-0037-1610307

  日期：2019.2

  3° alkyl and aryl tert-butyldimethylsilyl (TBS) ethers are significantly different, ranging from 0.05 mol% to 3 mol%, regioselective deprotection of TBS could be easily implemented. Moreover, chemoselective cleavage of different silyl ethers or removal of TBS in the presence of most hydroxyl protecting groups was also accomplished. NMR analyses of silyl products from TBS deprotection indicated that Hf(OTf)4-catalyzed

  摘要 作为IVB族过渡金属路易斯酸，三氟甲磺酸[[Hf（OTf）4 ]在脱甲硅烷基化反应中表现出极高的效能。由于1°，2°，3°烷基和芳基叔丁基二甲基甲硅烷基（TBS）醚的脱保护所需的Hf（OTf）4的量显着不同，范围为0.05 mol％至3 mol％，因此TBS的区域选择性脱保护可以轻松实现。此外，还实现了在大多数羟基保护基存在下，不同甲硅烷基醚的化学选择性裂解或TBS的去除。来自TBS脱保护的甲硅烷基产物的NMR分析表明，取决于所使用的溶剂，Hf（OTf）4催化的甲硅烷基化可能通过不同的机理进行。 作为IVB族过渡金属路易斯酸，三氟甲磺酸[[Hf（OTf）4 ]在脱甲硅烷基化反应中表现出极高的效能。由于1°，2°，3°烷基和芳基叔丁基二甲基甲硅烷基（TBS）醚的脱保护所需的Hf（OTf）4的量显着不同，范围为0.05 mol％至3 mol％，因此TBS的区域选择性脱保护可以轻松实现。此
• Decatungstate‐Mediated C(sp ³ )–H Heteroarylation via Radical‐Polar Crossover in Batch and Flow
  作者：Ting Wan、Luca Capaldo、Gabriele Laudadio、Alexander V. Nyuchev、Juan A. Rincón、Pablo García‐Losada、Carlos Mateos、Michael O. Frederick、Manuel Nuño、Timothy Noël

  DOI：10.1002/anie.202104682

  日期：2021.8.9

  Photocatalytic hydrogen atom transfer is a very powerful strategy for the regioselective C(sp3)–H functionalization of organic molecules. Herein, we report on the unprecedented combination of decatungstate hydrogen atom transfer photocatalysis with the oxidative radical–polar crossover concept to access the direct net-oxidative C(sp3)–H heteroarylation. The present methodology demonstrates a high functional group

  光催化氢原子转移是有机分子区域选择性C(sp 3 )–H功能化的一种非常强大的策略。在此，我们报道了十钨酸氢原子转移光催化与氧化自由基-极性交叉概念的前所未有的结合，以实现直接的净氧化C(sp 3 )-H杂芳基化。本方法展示了高官能团耐受性（40 个示例），并且在使用连续流反应器技术时可扩展。所开发的方案还适用于生物相关分子的后期功能化，例如康力龙、(-)-氨溴索、鬼臼毒素和双脱氧核糖。
• 4-vinyl-substituted pyrimidine nucleosides exhibit the efficient and selective formation of interstrand cross-links with RNA and duplex DNA
  作者：Atsushi Nishimoto、Daichi Jitsuzaki、Kazumitsu Onizuka、Yosuke Taniguchi、Fumi Nagatsugi、Shigeki Sasaki

  DOI：10.1093/nar/gkt197

  日期：2013.7

  substrates indicated that interstrand cross-link formation is preferential for the adenine base on the 5′-side of the opposing uridine. In the absence of a 5′-adenine, a uridine at the opposite position underwent cross-linking. The oligodeoxynucleotides probe incorporating the T-vinyl derivative efficiently formed interstrand cross-links in parallel-type triplex DNA with high selectivity for dA in the

  核酸中链间交联的形成会对核酸的生物学功能产生强烈影响；因此，已经开发了许多用于生物应用的交联剂。尽管进行了大量研究，但仍然需要兼具效率和选择性的交联剂。在这项研究中，胸苷的 4-乙烯基取代类似物（T-乙烯基衍生物）被设计为一种新的交联剂，其中乙烯基朝向 Watson-Crick 面，与腺嘌呤碱基。链间交联与 T-乙烯基衍生物相对位点的 RNA 底物上的尿苷快速且选择性地形成。在改变 RNA 底物的侧翼碱基时对交联形成的详细分析表明，链间交联形成优先于相对尿苷 5' 侧的腺嘌呤碱基。在没有 5'-腺嘌呤的情况下，相反位置的尿苷发生交联。结合 T-乙烯基衍生物的寡脱氧核苷酸探针有效地在平行型三链 DNA 中形成链间交联，对高嘌呤链中的 dA 具有高选择性。T-乙烯基衍生物的效率和选择性说明了其在生物和材料研究中作为独特工具的潜在用途。结合 T-乙烯基衍生物的寡脱氧核苷酸探针有效地在平行型三链 DNA
• 一种三氟甲磺酸铪催化的硅醚保护基脱除方 法
  申请人：江西科技师范大学

  公开号：CN109180405B

  公开（公告）日：2021-07-30

  本发明提供了一种三氟甲磺酸铪催化的硅醚保护基脱除方法，以0.2mol‰‑3mol％的三氟甲磺酸铪为催化剂，以硅醚保护的羟基化合物为底物，以常规AR甲醇作为溶剂，在室温下0.5‑16小时即可高效脱除近50种底物的各种硅醚保护基。粗产物经过常规硅胶柱层析纯化可高产率得到42种硅醚保护基脱除产物。通过调整催化剂用量，Hf(OTf)4催化剂可以实现对1°,2°,3°烷基TBS以及芳基TBS保护基的区域选择性脱除。此外，在适当的当量范围，Hf(OTf)4催化剂还可以实现1)对不同种类硅基保护基的化学选择性脱除；2)在不影响绝大多数常见羟基保护基的情况下，对1°TBS保护基的化学选择性脱除。
• Organocatalytic Conversion of Nucleosides to Furanoid Glycals
  作者：Edna Mao、Cheol K. Chung、Yining Ji、Yu-hong Lam、Peter E. Maligres

  DOI：10.1021/acs.joc.1c00555

  日期：2021.6.4

  2′-deoxynucleosides to furanoid glycals have been discovered. These phosphorimides, (Ph2PS)2NH and (Ph2PSe)2NH, were shown to effectively mediate persilylation of 2′-deoxynucleosides allowing the elimination of the nucleobase giving the corresponding glycal. These mild conditions were demonstrated in the syntheses of glycals with various substitution patterns while minimizing the formation of undesired byproducts

  已经发现了一类对将 2'-脱氧核苷转化为呋喃糖苷具有高活性的有机催化剂。这些磷酰亚胺(Ph 2 PS) 2 NH 和 (Ph 2 PSe) 2 NH 显示出可有效介导 2'-脱氧核苷的全甲硅烷基化，从而消除核碱基，产生相应的糖基。这些温和的条件在具有各种取代模式的糖醛的合成中得到了证明，同时最大限度地减少了不需要的副产物的形成并扩大了该方法的范围。