2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methoxymethyluridine-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methoxymethyluridine-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite
• 英文别名: 5-Methoxymethyl-DU cep；3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[5-(methoxymethyl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• 化学式: C₄₁H₅₁N₄O₉P
• 分子量: 774.851
• InChiKey: PBNTXMNQZGREOR-OSHXEJAZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3,5-双-o-(t-丁基二甲基甲硅烷基)胸腺嘧啶脱氧核苷 在 吡啶 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 偶氮二异丁腈 、 sodium methylate 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 苯 为溶剂， 反应 26.17h， 生成 2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-methoxymethyluridine-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  O-糖苷的方向是动质体DNA结合蛋白JBP1识别J碱基的重要方面。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200604635

文献信息

• O-Glycoside Orientation Is an Essential Aspect of Base J Recognition by the Kinetoplastid DNA-Binding Protein JBP1
  作者：Rajesh K. Grover、Stephanie J. K. Pond、Qizhi Cui、Prem Subramaniam、David A. Case、David P. Millar、Paul Wentworth

  DOI：10.1002/anie.200604635

  日期：2007.4.13