2’,3’邻异亚丙基尿苷 | 362-43-6

• 物质功能分类: 医药中间体 - 原料药中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 2’,3’邻异亚丙基尿苷
• 中文别名: 2',3'-异丙基脲；异丙叉鸟苷；2',3'-异丙叉鸟苷；2',3'-O-异亚丙基尿苷
• 英文名称: 2',3'-O-isopropylideneuridine
• 英文别名: 2’,3’-O-isopropylidene uridine；2',3'-isopropylideneuridine；2′,3′-O-isopropylideneuridine；1-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；2’,3‘-O-isopropylideneuridine；1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuran[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]pyrimidine-2,4-dione；1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 362-43-6
• 化学式: C₁₂H₁₆N₂O₆
• 分子量: 284.269
• InChiKey: GFDUSNQQMOENLR-PEBGCTIMSA-N

物化性质

• 熔点：
  163-166 °C
• 沸点：
  426.76°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2932 (rough estimate)
• 溶解度：
  可溶于氯仿（轻微、加热）、DMSO（轻微）、甲醇（轻微）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 安全说明：
  S24/25
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  29339900
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2’,3’邻异亚丙基尿苷 在 三氟乙酸 作用下， 生成 尿嘧啶核苷
  参考文献：
  名称：

  核苷的 17O NMR。3—取代的尿苷和核糖苷的化学位移

  摘要：

  在乙腈和水性溶剂中，通过 17O NMR 研究了在 C-5 处带有不同取代基并在 O-4 和 O-2 羰基中富含 17O（Ca50%）的尿苷和核糖苷衍生物。乙腈和水在 O-4 (30-42 ppm) 和 O-2 (13-16 ppm) 处的溶剂位移差异彼此显着不同，但改变 C-5 取代基引起的化学位移变化相关性很好仅具有 O-4 位移和取代基的吸电子能力。对模型化合物的 17O 位移的检查再次证实了两种羰基的酮互变异构体的优势。关于核苷碱基王的电子结构和羰基的氢键能力，讨论了溶剂位移和取代基位移的重要性。

  DOI：

  10.1002/mrc.1260231102
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine 在 水 、 lithium chloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 65.0h， 以90%的产率得到2’,3’邻异亚丙基尿苷
  参考文献：
  名称：

  氯离子裂解叔丁基二甲基甲硅烷基醚

  摘要：

  对的选择性裂解的一般方法叔丁基二醇醚的存在下叔使用H的组合已经建立-butyldiphenylsilyl者2 O和氯化锂的DMF在90℃下的浓缩溶液。由于不使用酸，碱，还原剂或氧化剂，因此该方法似乎非常适合在存在其他敏感官能团的情况下对TBDMS醚进行脱保护。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(97)10479-8
• 作为试剂：
  描述：

  benzyl (4,5,7,8,9-penta-O-acetyl-3-deoxy-D-glycero-β-D-galacto-2-nonulopyranosyl bromide)onate 在 4 A molecular sieve 、 2’,3’邻异亚丙基尿苷 、 silver trifluoromethanesulfonate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 240.0h， 以61%的产率得到benzyl 4,5,7,8,9-penta-O-acetyl-2,6-anhydro-2,3-dideoxy-D-glycero-D-galacto-non-2-enonate
  参考文献：
  名称：

  A Novel Glycosylation of 3-Deoxy-D-glycero-D-galacto-2-nonulosonic Acid (KDN) via in Situ Pyranose-Furanose Rearrangement.

  摘要：

  在对 3-脱氧-D-甘油-D-半乳糖-2-壬磺酸（KDN）衍生物的糖基化研究中，在柯尼希斯-克诺尔反应条件下，以 4, 5, 7, 8, 9-五-O-乙酰基-2-溴-2, 3-脱氧-D-甘油-D-半乳糖-2-壬磺吡喃糖酸苄酯为原料合成了呋喃糖型 KDN 的 O-糖苷。1H-NMR 实验证实了 KDN 分子的呋喃结构，并认为该反应是一种新型的缩环糖基化反应，是通过 KDN 分子的原位吡喃糖-呋喃糖重排以及随后与受体的偶联进行的。

  DOI：

  10.1248/cpb.45.795

文献信息

• Selective Cleavage of O-(Dimethoxytrityl) Protecting Group with Sodium Periodate
  作者：Dominik Rejman、Šárka Králíková、Zdeněk Točík、Radek Liboska、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1135/cccc20020502

  日期：——

  Sodium periodate in aqueous organic solvents selectively removes, under mild reaction conditions, the O-(dimethoxytrityl) protecting group. Selectivity of the cleavage was studied using the nucleoside derivatives protected by various types of groups commonly used in nucleoside and nucleotide chemistry.

  在水有机溶剂中，过碘酸钠在温和的反应条件下选择性地去除了O-(二甲氧基三苯甲基)保护基团。利用核苷衍生物进行了裂解的选择性研究，这些核苷衍生物受到核苷和核苷酸化学中常用的各种基团的保护。
• One-Pot Synthesis of Nucleoside 5′-Triphosphates from Nucleoside 5′-<i>H</i>-Phosphonates
  作者：Qi Sun、Jocelyn P. Edathil、Runzhi Wu、Eric D. Smidansky、Craig E. Cameron、Blake R. Peterson

  DOI：10.1021/ol8003029

  日期：2008.5.1

  Nucleoside 5'-triphosphates (NTPs) play key roles in biology and medicine. However, these compounds are notoriously difficult to synthesize. We describe a one-pot method to prepare NTPs from nucleoside 5'-H-phosphonate monoesters via pyridinium phosphoramidates, and we used this approach to synthesize ATP, UTP, GTP, CTP, ribavirin-TP, and 6-methylpurine ribonucleoside-TP (6MePTP). Poliovirus RNA-dependent

  核苷 5'-三磷酸 (NTP) 在生物学和医学中起着关键作用。然而，众所周知，这些化合物难以合成。我们描述了一种通过氨基磷酸吡啶鎓从核苷 5'-H-膦酸酯单酯制备 NTP 的一锅法，我们使用这种方法合成了 ATP、UTP、GTP、CTP、利巴韦林-TP 和 6-甲基嘌呤核糖核苷-TP（ 6MePTP）。脊髓灰质炎病毒 RNA 依赖性 RNA 聚合酶有效地使用 6MePTP 作为底物，这表明同源核苷（一种知之甚少的抗病毒剂）可能会损害病毒 RNA。
• 4-(Acetylthio)-2,2-dimethyl-3-oxobutyl and 4-(<i>tert</i>-Butyldisulfanyl)-2,2-dimethyl-3-oxobutyl as Protecting Groups for Nucleoside 5′-Phosphoramidates Derived from<scp>L</scp>-Alanine Methyl Ester
  作者：Vyankat A. Sontakke、Harri Lönnberg、Mikko Ora

  DOI：10.1002/ejoc.201500531

  日期：2015.8

  disulfide bond with glutathione from 2 triggers the removal of the protecting group by cyclization releasing quantitatively nucleoside 5′-N-[(1S)-2-oxo-2-methoxy-1-methylethyl]phosphoramidate} (7) as the desired product. With 1, enzymatic deacetylation or acetyl migration from the sulfur atom to the adjacent hydrated oxo group followed by chemical cyclization produces 7. The S–S-bond-mediated dimerization

  亚磷酰胺 1 和 2 是通过 H-膦酸盐方法合成的，随后用 L-丙氨酸甲酯进行氧化胺化。在不存在和存在猪肝酯酶 (PLE) 或谷胱甘肽 (GSH) 的情况下，在 pH = 7.5 和 37 °C 下保护基团的去除通过 HPLC 进行监测。另外研究了氨基磷酸酯 1 在 pH = 9 和 10 下的稳定性。与谷胱甘肽的二硫键从 2 还原触发通过环化作用去除保护基团，从而定量释放核苷 5'-N-[(1S)-2-氧代-2-甲氧基-1-甲基乙基]氨基磷酸酯} (7) 作为所需产物。对于 1，酶促脱乙酰作用或乙酰基从硫原子迁移到相邻的水合氧代基团，然后进行化学环化产生 7。 S-S 键介导的二聚化 (8) 作为副反应进行竞争。长期治疗，
• Parallel Solution-Phase Synthesis and General Biological Activity of a Uridine Antibiotic Analog Library
  作者：Omar Moukha-chafiq、Robert C. Reynolds

  DOI：10.1021/co4001452

  日期：2014.5.12

  coupling of the amino terminus of d-phenylalanine methyl ester to the free 5′-carboxylic acid moiety of 33 followed by sodium hydroxide treatment led to carboxylic acid analog 77. Hydrolysis of this material gave analog 78. The intermediate 77 served as the precursor for the preparation of novel dipeptidyl uridine analogs 79–99 through peptide coupling reactions to diverse amine reactants. None of the described

  在 NIH 路线图计划的中试规模库 (PSL) 计划下，以溶液相方式从胺2和羧酸33和77合成了一个包含 94 种尿苷抗生素类似物的小型库。多样醛，磺酰氯，和羧酸反应物套缩合，2，酸介导的水解导致后，向目标化合物3 - 32以良好的收率和高的纯度。同样，用不同的胺和磺胺处理33得到34 – 75。d氨基末端的偶联-苯丙氨酸甲酯到33的游离 5'-羧酸部分，然后用氢氧化钠处理产生羧酸类似物77。该材料的水解得到类似物78。中间77担任该前体为二肽基新颖尿苷类似物的制备79 - 99通过肽偶联到不同的胺反应剂反应。所描述的化合物均未显示出显着的抗癌或抗疟活性。通过 NIH MLPCN 计划提供和报告的初级筛选中的酶和受体，许多样品表现出各种有希望的抑制性、激动剂、拮抗剂或激活剂特性。
• Synthesis of Pyrimidine-Containing Nucleoside β-(R/S)-Hydroxyphosphonate Analogues
  作者：Maïa Meurillon、Laurent Chaloin、Christian Périgaud、Suzanne Peyrottes

  DOI：10.1002/ejoc.201100219

  日期：2011.7

  β-hydroxyphosphonate analogues is described. The use of a nucleoside β-ketophosphonate as the key intermediate allowed both the (R) and (S) isomers of β-hydroxyphosphonate analogues in the pyrimidine series to be accessed. Such derivatives may be considered as stable mimics of 5

  描述了获得核苷 β-羟基膦酸酯类似物的简明途径。使用核苷 β-酮膦酸酯作为关键中间体允许获得嘧啶系列中 β-羟基膦酸酯类似物的 (R) 和 (S) 异构体。这样的衍生物可以被认为是 5

表征谱图