氨基核苷嘌呤霉素 | 58-60-6

• 物质功能分类: 原料药 - 抗生素类药物 - 其它抗生素类药
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 氨基核苷嘌呤霉素
• 中文别名: 嘌呤霉素氨基核苷；维生素E醋酸酯
• 英文名称: 3'-amino-3'-deoxy-N⁶,N⁶-dimethyladenosine
• 英文别名: 9-(3-amino-3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-N⁶,N⁶-dimethyladenine；9-(3-amino-3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-6-(dimethylamino)purine；N⁶-Dimethyl-3'-amino-3'-deoxyadenosine；3'-amino-3'-deoxy-N,N-dimethyl-adenosine；purinomycin aminonucleoside；puromycin aminonucleoside；(2R,3R,4S,5S)-4-amino-2-[6-(dimethylamino)purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 58-60-6
• 化学式: C₁₂H₁₈N₆O₃
• 分子量: 294.313
• InChiKey: RYSMHWILUNYBFW-GRIPGOBMSA-N

物化性质

• 熔点：
  235℃ (Decomposition)
• 沸点：
  436.08°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2131 (rough estimate)
• 闪点：
  >110°(230°F)
• 溶解度：
  H2O: 50 mg/mL, 透明, 浅黄色

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  123
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

安全信息

• TSCA：
  Yes
• 危险品标志：
  Xi
• 危险类别码：
  R48/22
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  29419090
• RTECS号：
  AU7337000
• 储存条件：
  本品应充氩气密封，在4℃干燥避光条件下保存。

制备方法与用途

生物活性

Puromycin aminonucleoside (NSC 3056) 是一种氨基核苷类抗生素，属于嘌呤霉素类似物。该物质可诱导细胞凋亡，并且能够逆转地抑制二肽基肽酶（dipeptidyl peptidase II）和胞浆丙氨酸氨基肽酶的活性。Puromycin aminonucleoside 是嘌呤霉素的氨基核苷部分。

体外研究

Puromycin aminonucleoside (NSC 3056)（30 μg/mL 浓度）显著增加足细胞中 p53 蛋白水平。p53 依赖性地诱导 Puromycin aminonucleoside 所致的足细胞凋亡，并且这种效应具有时间依赖性。PMAT 表达细胞与空载体转染细胞的半数抑制浓度（IC₅₀）分别为 48.9 和 122.1 μM，表明 PMAT 的表达增强了细胞对 Puromycin aminonucleoside 的敏感性。当浓度为 250 μM 时，Puromycin aminonucleoside 对 PMAT 表达和空载体转染的细胞均有毒性。在 pH 6.6 下，PMAT 表达细胞对 Puromycin aminonucleoside 的摄取是 pH 7.4 下的四倍。

体内研究

与对照大鼠相比，接受 Puromycin aminonucleoside (NSC 3056)（8 mg/100 g，静脉注射）治疗的肾病大鼠每肾小球中的足细胞数量减少至 90.7。对照大鼠每肾小球的 nephrin 含量为 1.02±0.11 fmol，在 Puromycin aminonucleoside (NSC 3056) 肾病模型中，第 4 天和第 7 天时该含量分别减少至 0.46±0.06 fmol 和 0.35±0.04 fmol。足细胞中的 nephrin 含量随着蛋白尿的发展而显著下降。给予 Puromycin aminonucleoside (NSC 3056)（100 mg/kg，皮下注射）的大鼠体重增长较对照组慢，并且其血清肌酐水平较高。

类别

有毒物品

可燃性危险特性

可燃；燃烧产生有毒氮氧化物烟雾

储运特性

库房通风低温干燥

灭火剂

干粉、泡沫、砂土, 二氧化碳, 雾状水

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  氨基核苷嘌呤霉素 在 哌啶 、 N-羟基丁二酰亚胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 9-{3'-deoxy-3'-[(4-methyl-L-β-phenylalanyl)amino]-β-D-ribofuranosyl}-6-(N,N-dimethylamino)purine
  参考文献：
  名称：

  The Puromycin Route to Assess Stereo- and Regiochemical Constraints on Peptide Bond Formation in Eukaryotic Ribosomes

  摘要：

  We synthesized a series of puromycin analogues to probe the chemical specificity of the ribosome in an intact eukaryotic translation system. These studies reveal that both d-enantiomers and beta-amino acid analogues can be incorporated into protein, and provide a quantitative means to rank natural and unnatural residues. Modeling of a d-amino acid analogue into the 50S ribosomal subunit indicates that steric clash may provide part of the chiral discrimination. The data presented provide one metric of the chiral and regiospecificity of mammalian ribosomes.

  DOI：

  10.1021/ja034817e
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5S)-4-(benzylamino)-2-[6-(dimethylamino)purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol 在 palladium hydroxide - carbon 甲酸铵 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 13.0h， 以71.4%的产率得到氨基核苷嘌呤霉素
  参考文献：
  名称：

  由3'，5'-O-亚磺酰基木糖核苷简单有效地合成嘌呤霉素，2,2'-脱水嘧啶核苷，胞苷和2'，3'-脱水腺苷

  摘要：

  利用xylo-3′，5′-二羟基的环状亚硫酸盐6a作为新的保护基，合成了嘌呤霉素和3′-氨基-3′-脱氧-N 6，N 6-二甲基腺苷11。关键的合成步骤是通过2-α-氨基甲酸酯7的分子内环化作用对亚硫酸盐部分进行脱保护。类似地，2,2'-脱水嘧啶核苷15，核糖胞苷17和2'，3'-分别由相应的亚硫酸盐4、5和6b高产率地制备了脱水腺苷14。

  DOI：

  10.1080/15257770600725929

文献信息

• Ribosome-Mediated Incorporation of Dipeptides and Dipeptide Analogues into Proteins in Vitro
  作者：Rumit Maini、Larisa M. Dedkova、Rakesh Paul、Manikandadas M. Madathil、Sandipan Roy Chowdhury、Shengxi Chen、Sidney M. Hecht

  DOI：10.1021/jacs.5b03135

  日期：2015.9.9

  23S rRNA randomized at positions 2057-2063 and 2502-2507 were introduced into Escherichia coli, affording a library of clones which produced modified ribosomes in addition to the pre-existing wild-type ribosomes. These clones were screened with a derivative of puromycin, a natural product which acts as an analogue of the 3'-end of aminoacyl-tRNA and terminates protein synthesis by accepting the growing

  将包含在 2057-2063 和 2502-2507 位置随机化的 23S rRNA 的质粒引入大肠杆菌，提供一个克隆文库，除了预先存在的野生型核糖体外，还产生修饰的核糖体。这些克隆用嘌呤霉素的衍生物进行筛选，嘌呤霉素是一种天然产物，作为氨酰 tRNA 3'-末端的类似物，通过接受不断增长的多肽链来终止蛋白质合成，从而杀死细菌细胞。本研究中的嘌呤霉素衍生物含有二肽对甲氧基苯丙氨酸甘氨酸，这意味着对这种嘌呤霉素类似物敏感的克隆中修饰的核糖体具有识别二肽的能力。几个被嘌呤霉素衍生物抑制的克隆被用来制备 S-30，并且其中一些被证明支持将二肽掺入蛋白质中。四种掺入的物质包括两种二肽（Gly-Phe (2) 和 Phe-Gly (3)），以及硫醇化二肽类似物 (4) 和具有胺基和羧基相距大致相同距离的荧光恶唑 (5)就像在正常的二肽中一样。发现含有硫醇二肽 4 和 7-甲氧基香豆素荧光团的蛋白质会发生荧光猝灭。将恶唑荧光团
• Synthesis of 6-dimethylamino-9-[3?-(O-methyl) (2S)-[UL-14C]-tyrosinylamino)-3?-deoxy-?-D-ribofuranosyl] purine
  作者：Amit P. Mehrotra、Martin D. Ryan、David Gani

  DOI：10.1002/(sici)1099-1344(200005)43:6<623::aid-jlcr347>3.0.co;2-o

  日期：2000.5

  the mechanism of the unique cleavage activity of the 18 amino acid 2A region of the foot-and-mouth-disease virus (FMDV), the synthesis of 14C-labelled puromycin is required. Puromycin is an inhibitor of protein synthesis and is an analogue of the terminal aminoacyl-adenosine portion of aminoacyl-tRNA. A short and expedient four step synthesis of 6-dimethylamino-9-[3′-([[O-methyl) (2S)-[UL-14C]-tyros

  为了研究和进一步完善口蹄疫病毒 (FMDV) 18 个氨基酸 2A 区独特切割活性的机制，需要合成 14C 标记的嘌呤霉素。Puromycin 是一种蛋白质合成抑制剂，是氨酰-tRNA 末端氨酰-腺苷部分的类似物。6-二甲氨基-9-[3'-([[O-甲基) (2S)-[UL-14C]-酪氨酰氨基)-3'-脱氧-β-D-呋喃核糖基]嘌呤的短而方便的四步合成因此描述了从 (2S)-[UL-14C]-酪氨酸开始的（14C 标记的嘌呤霉素）。版权所有 © 2000 John Wiley & Sons, Ltd.
• Peptide bond formation by aminolysin-A catalysis: A simple approach to enzymatic synthesis of diverse short oligopeptides and biologically active puromycins
  作者：Hirokazu Usuki、Yukihiro Yamamoto、Jiro Arima、Masaki Iwabuchi、Shozo Miyoshi、Teruhiko Nitoda、Tadashi Hatanaka

  DOI：10.1039/c0ob00403k

  日期：——

  peptide bonds to give linear homo-oligopeptides, hetero-dipeptides, and cyclic dipeptides using cost-effective substrates in a one-pot reaction. Aminolysin-A can recognize several C-terminal-modified amino acids, including the L- and D-forms, as acyl donors as well as free amines, including amino acids and puromycin aminonucleoside, as acyl acceptors. The absence of amino acid esters prevents the formation

  新S9系列的氨肽酶从嗜热放线菌衍生Acidothermus了解纤维素被催化丝氨酸的定点突变克隆和工程化到transaminopeptidase 491到半胱氨酸。经过工程改造的生物催化剂，称为氨基溶素A，可以在一锅反应中使用经济高效的底物来催化肽键的形成，从而生成线性同型寡肽，杂二肽和环状二肽。氨基溶素A可以识别多个C末端修饰的氨基酸（包括L-和D-形式）作为酰基供体，以及游离胺（包括氨基酸和嘌呤霉素氨基核苷）作为酰基受体。氨基酸酯的缺乏阻止了肽的形成。因此，反应机理涉及氨解而不是水解的逆反应。氨基溶素系统将是通过简单方法制备结构多样的肽模拟物的有益工具。
• PYRIDAZINONES AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Goldfinch Bio, Inc.

  公开号：US20200102301A1

  公开（公告）日：2020-04-02

  Disclosed are compounds according to Formula (I), and related pharmaceutical compositions. Also disclosed are therapeutic methods, e.g., of treating kidney diseases, using the compounds of Formula (I).

  根据公式(I)揭示了化合物，以及相关的药物组合物。还揭示了治疗方法，例如使用公式(I)的化合物治疗肾脏疾病。
• Incorporation of Phosphorylated Tyrosine into Proteins: <i>In Vitro</i> Translation and Study of Phosphorylated IκB-α and Its Interaction with NF-κB
  作者：Shengxi Chen、Rumit Maini、Xiaoguang Bai、Ryan C. Nangreave、Larisa M. Dedkova、Sidney M. Hecht

  DOI：10.1021/jacs.7b05168

  日期：2017.10.11

  coli, guided by the use of a phosphorylated puromycin, to identify modified ribosomes capable of incorporating unprotected phosphotyrosine into proteins from a phosphotyrosyl-tRNACUA by UAG codon suppression during in vitro translation. Selection of a library of modified ribosomal clones with phosphorylated puromycin identified six modified ribosome variants having mutations in nucleotides 2600-2605

  磷酸化蛋白在许多不同细胞网络的调节中发挥重要作用。然而，与含有未修饰的蛋白质氨基酸的蛋白质的制备不同，后者可以通过定点诱变很容易地改变并在体外和体内表达，在预定位点磷酸化的蛋白质的制备不能容易地以可接受的产率完成。为了能够合成用于体外研究的磷酸化蛋白质，我们探索了磷酸化氨基酸的使用，其中磷酸基团带有化学保护基团，从而消除了对蛋白质翻译有负面影响的负电荷。磷酸酪氨酸的双邻硝基苄基保护使其能够使用野生型核糖体并入 DHFR 和 IκB-α，并且精心制作的蛋白质随后可以通过光解进行脱保护。还平行研究了大肠杆菌的 23S rRNA 的重新设计，在使用磷酸化嘌呤霉素的指导下，以在体外翻译过程中通过 UAG 密码子抑制来鉴定能够将未受保护的磷酸酪氨酸纳入来自磷酸酪氨酸-tRNACUA 的蛋白质的修饰核糖体. 选择具有磷酸化嘌呤霉素的修饰核糖体克隆文库鉴定了六种修饰核糖体变体，它们在 23S rRNA 的核苷酸