3'-amino-3'-deoxy-3'-[N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-phenylalanyl]-5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)-N⁶,N⁶-dimethyladenosine 2'-O-succinate | 833447-56-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-amino-3'-deoxy-3'-[N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-phenylalanyl]-5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)-N⁶,N⁶-dimethyladenosine 2'-O-succinate
• 英文别名: 4-[(2R,3R,4R,5S)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-2-[6-(dimethylamino)purin-9-yl]-4-[[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-phenylpropanoyl]amino]oxolan-3-yl]oxy-4-oxobutanoic acid
• CAS: 833447-56-6
• 化学式: C₆₁H₅₉N₇O₁₁
• 分子量: 1066.18
• InChiKey: SUIYSCPCLVGPFD-QAHXBYKASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.4
• 重原子数：
  79
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  215
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-acetyl-5'-O-[benzhydroxybis(trimethylsiloxy)silyl]-2'-O-[bis(2-acetoxyethoxy)methyl]cytidine-3'-(methyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite 、 3'-amino-3'-deoxy-3'-[N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-phenylalanyl]-5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)-N⁶,N⁶-dimethyladenosine 2'-O-succinate 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 LCAA-polystyrene 作用下， 反应 26.0h， 生成 cytidylyl-(3'-5')-3'-amino-3'-deoxy-3'-L-phenylalanyl-N⁶,N⁶-dimethyladenosine
  参考文献：
  名称：

  同位素标记的嘌呤霉素衍生物的合成，用于核糖体催化肽键形成的动力学同位素效应分析

  摘要：

  核糖体催化肽键形成的机制仍存在争议。在这里，我们描述了可用于动力学同位素效应实验中的二核苷酸的合成，以评估核糖体催化的肽键形成的过渡态。这些底物是同位素标记的二核苷酸胞嘧啶-（3'-5'）-3'-氨基-3'-脱氧-3'-1-苯丙氨酰基-N 6，N 6-二甲基腺苷（Cm 6 A N Phe-NH 2）和胞嘧啶-（3'-5'）-3'-氨基-3'-脱氧-3'-（1-2-羟基-3-苯基丙酰基）-N 6，N 6-二甲基腺苷（Cm 6 A NPhe-OH）。这些底物在肽键形成中具有活性，可用于测量核糖体催化的蛋白质合成中的动力学同位素效应。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.10.023
• 作为产物：
  描述：

  氨基核苷嘌呤霉素 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 N-羟基丁二酰亚胺 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 3'-amino-3'-deoxy-3'-[N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-phenylalanyl]-5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)-N⁶,N⁶-dimethyladenosine 2'-O-succinate
  参考文献：
  名称：

  同位素标记的嘌呤霉素衍生物的合成，用于核糖体催化肽键形成的动力学同位素效应分析

  摘要：

  核糖体催化肽键形成的机制仍存在争议。在这里，我们描述了可用于动力学同位素效应实验中的二核苷酸的合成，以评估核糖体催化的肽键形成的过渡态。这些底物是同位素标记的二核苷酸胞嘧啶-（3'-5'）-3'-氨基-3'-脱氧-3'-1-苯丙氨酰基-N 6，N 6-二甲基腺苷（Cm 6 A N Phe-NH 2）和胞嘧啶-（3'-5'）-3'-氨基-3'-脱氧-3'-（1-2-羟基-3-苯基丙酰基）-N 6，N 6-二甲基腺苷（Cm 6 A NPhe-OH）。这些底物在肽键形成中具有活性，可用于测量核糖体催化的蛋白质合成中的动力学同位素效应。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.10.023