5'-氯-5'-脱氧腺苷 | 892-48-8

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 脱氧核苷酸及其类似物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 中文名称: 5'-氯-5'-脱氧腺苷
• 中文别名: 5’-氯-5’-脱氧腺苷
• 英文名称: 5'-deoxy-5'-chloroadenosine
• 英文别名: 5'-chloro-5'-deoxyadenosine；5’-chloro-5’-deoxyadenosine；5'-chloroadenosine；(2R,3R,4S,5S)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-(chloromethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol；5′-chloro-5′-deoxyadenosine；(2R,3R,4S,5S)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(chloromethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 892-48-8
• 化学式: C₁₀H₁₂ClN₅O₃
• mdl: MFCD00049038
• 分子量: 285.69
• InChiKey: IYSNPOMTKFZDHZ-KQYNXXCUSA-N

物化性质

• 熔点：
  187 °C (exothermic decomp onset @144.5 C)(lit.)
• 沸点：
  645.6±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.03±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于DMSO（轻微）、水（轻微、加热）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2934999090
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

用途

5'-氯-5'-脱氧腺苷是合成5'-脱氧-5'-(甲硫基)腺苷的中间体，也是研究5'-甲基硫腺苷磷酸化酶 (MTAP, EC2.7.1.68) 特异性和动力学的重要底物。这种化合物支持S-腺苷甲硫氨酸 (AdoMet) 和甲硫氨酸补救途径，与肿瘤抑制基因表达密切相关。

制备

5'-氯-5'-脱氧腺苷通过选择性氯代反应由腺苷制得。合成过程的化学反应方程式如下图所示：

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-氯-5'-脱氧腺苷 在 sodium hydrogen sulfide 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 24.0h， 以8%的产率得到5'-硫代腺苷
  参考文献：
  名称：

  C类自由基S-腺苷甲硫氨酸甲基转移酶NosN的催化机理

  摘要：

  S-腺苷甲硫氨酸（SAM）是酶催化甲基化反应中最常见的共底物之一。大多数依赖于SAM的反应都是通过S N 2机理进行的，而其中的一个子集则涉及自由基中间体，用于使非亲核底物甲基化。在此，我们报告了NosN的表征和机理研究，NosN是参与硫肽抗生素Nosiheptide的生物合成的C类自由基SAM甲基转移酶。我们证明，与所有已知的SAM依赖性甲基转移酶相比，NosN不会产生S腺苷同型半胱氨酸（SAH）作为副产品。相反，NosN将SAM转化为5'-甲基硫代腺苷作为直接的甲基供体，采用基于自由基的机制进行甲基化并释放5'-硫代腺苷作为副产物。一系列的生化和计算研究使我们能够提出NosN催化的综合机制，这代表了酶催化甲基化反应的新范式。

  DOI：

  10.1002/anie.201609948
• 作为产物：
  描述：

  腺苷 在 吡啶 、 氯化亚砜 、 ammonium hydroxide 作用下， 以 乙腈 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 0.5h， 以60%的产率得到5'-氯-5'-脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  N 6-苄基腺苷连接子的长度和结构的改变调节其针对肠道病毒的选择性抗病毒活性71

  摘要：

  最近，我们证明了N 6-异戊烯基腺苷，一种细胞分裂素核苷，对人肠病毒71的复制具有有效的选择性抗病毒作用。本研究致力于另一种天然化合物N 6-苄基腺苷的结构优化。我们主要研究腺嘌呤和苯环之间连接基的大小和性质，以及D-核糖残基的必要性。制备了30多种N 6-苄基腺苷类似物，并评估了它们的抗病毒特性。两种主要的制备方法：N 6-乙酰基-2'，3'，5'-tri- O-乙酰基腺苷可以在碱促进条件下通过烷基卤或在Mitsunobu反应中通过醇进行区域选择性烷基化。在室温下用4 M PrNH 2在MeOH中的溶液脱酰1天后，以高总收率获得所需产物。对结构-活性关系的分析清楚地表明，连接子的最佳尺寸限于2或3个原子（化合物4 – 7）。2'-脱氧腺苷衍生物没有引起任何抑制或细胞毒性作用，而5'-脱氧核苷仍然诱导了某些细胞保护性抗病毒活性。基于这些观察，可以假设除了可能的5'-三磷酸化继之以对RNA合

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.01.036
• 作为试剂：
  描述：

  L-蛋氨酸 、 N-(4,7-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-3-yl)-1-phenethyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide 在 wild type SalL 、 5'-氯-5'-脱氧腺苷 、 sodium hydroxide 、 Cleland's reagent 、 bovine serum albumin 、 methyltransferase NoVO DNA 、 Salmonella MTAN 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 48.0h， 以23%的产率得到N-(4,7-dihydroxy-8-methyl-2-oxo-2H-chromen-3-yl)-1-phenethyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  S-腺苷甲硫氨酸辅因子修饰增强小分子C-烷基化的生物催化库。

  摘要：

  描述了通过原位形成S-腺苷甲硫氨酸（SAM）辅助因子类似物来增强小分子C-烷基化范围的串联酶促策略。SAM形成酶SalL中存在的溶剂暴露通道可耐受在腺嘌呤核苷碱基2位修饰的5'-氯-5'-脱氧腺苷（ClDA）类似物。SalL催化的辅因子生产与甲基转移酶（MTase）催化的C-（间）乙基转移至香豆素底物相结合，相对于使用缺乏核碱基修饰的辅因子获得的C-（间）乙基香豆素具有更高的收率和更大的底物范围。建立影响C-烷基化的分子决定簇为开发用于制备高价值小分子的后期酶促平台提供了基础。

  DOI：

  10.1002/anie.201908681

文献信息

• Redox-Neutral P(O)–N Coupling between P(O)–H Compounds and Azides via Dual Copper and Photoredox Catalysis
  作者：Yanan Wu、Ken Chen、Xia Ge、Panpan Ma、Zhiyuan Xu、Hongjian Lu、Guigen Li

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c02207

  日期：2020.8.7

  We report a redox-neutral P(O)–N coupling reaction of P(O)–H compounds with azides via photoredox and copper catalysis, providing new access to useful phosphinamides, phosphonamides, and phosphoramides. This transformation tolerates a wide range of nucleophilic functionalities including alcohol and amine nucleophiles, which makes up for the deficiency of classical nitrogen nucleophilic substitution

  我们报道了P（O）-H化合物与叠氮化物通过光氧化还原和铜催化的氧化还原中性P（O）-N偶联反应，提供了获得有用的次膦酰胺，膦酰胺和磷酰胺的新途径。这种转化可耐受多种亲核功能，包括醇和胺亲核，这弥补了传统氮亲核取代反应的不足。为了证明这种新方法的广泛潜在应用，已开发了多种含叠氮基天然产物和药物分子的后期功能化，初步的不对称反应和连续的可见光光流过程。
• [EN] COMPOSITIONS COMPRISING SELENIUM AND USE OF SAME FOR THE TREATMENT AND PREVENTION OF DISEASE OR CONDITIONS ASSOCIATED WITH MITOCHONDRIAL DYSFUNCTION<br/>[FR] COMPOSITIONS COMPRENANT DU SÉLÉNIUM ET UTILISATION DE CELLES-CI POUR LE TRAITEMENT ET LA PRÉVENTION DE MALADIE OU D'ÉTATS ASSOCIÉS AVEC UN DYSFONCTIONNEMENT MITOCHONDRIAL
  申请人：ALLTECH INC

  公开号：WO2014144776A1

  公开（公告）日：2014-09-18

  The present application relates to compositions comprising selenium (e.g., selenium enriched yeast and selenium containing compounds obtained or derived therefrom) and methods of using the same to treat and inhibit obesity, diabetes and related conditions. In particular, the present application provides compositions comprising selenium enriched yeast (e.g., selenium enriched yeast comprising 2% or less inorganic selenium), selenium containing compounds present therein and/or derived therefrom, and methods of using the same to enhance mitochondrial activity and function (e.g., in skeletal muscle and liver) in a subject (e.g., as a therapeutic and/or prophylactic treatment for diabetes, obesity and related conditions).

  本申请涉及含硒的组合物（例如，富硒酵母和从中获得或衍生的含硒化合物）及其用于治疗和抑制肥胖、糖尿病和相关疾病的方法。具体而言，本申请提供了含硒富集酵母的组合物（例如，含有2％或更少无机硒的富硒酵母），其中含有或从中衍生的含硒化合物，并使用它们的方法来增强线粒体活性和功能（例如，在骨骼肌和肝脏中）以治疗和/或预防糖尿病、肥胖和相关疾病。
• [EN] COMPOSITIONS OF SELENOORGANIC COMPOUNDS AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS DE COMPOSÉS SÉLÉNOORGANIQUES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION CORRESPONDANTS
  申请人：ALLTECH INC

  公开号：WO2015137983A1

  公开（公告）日：2015-09-17

  The present application relates to compositions comprising selenium compounds, such as 5'-Methylselenoadenosine, Se-Adenosyl-L -homocysteine, Gamma- glutamyl-methylseleno-cysteine, a compound of formula (I), formula (II), a compound of formula (III) and combinations thereof, and methods of using the same in enhancing mitochondrial function, or treating mitochondrial dysfunction.

  本申请涉及包含硒化合物的组合物，例如5'-甲基硒腺苷、Se-腺苷基-L-同型半胱氨酸、γ-谷氨酰-甲硒氨基酸、式（I）的化合物、式（II）的化合物、式（III）的化合物以及它们的组合物，并且使用这些化合物来增强线粒体功能或治疗线粒体功能障碍的方法。
• Synthesis and Structure–Activity Relationship Investigation of Adenosine-Containing Inhibitors of Histone Methyltransferase DOT1L
  作者：Justin L. Anglin、Lisheng Deng、Yuan Yao、Guobin Cai、Zhen Liu、Hong Jiang、Gang Cheng、Pinhong Chen、Shuo Dong、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/jm300917h

  日期：2012.9.27

  Histone3-lysine79 (H3K79) methyltransferase DOT1L has been found to be a drug target for acute leukemia with MLL (mixed lineage leukemia) gene translocations. A total of 55 adenosine-containing compounds were designed and synthesized, among which several potent DOT1L inhibitors were identified with Ki values as low as 0.5 nM. These compounds also show high selectivity (>4500-fold) over three other histone methyltransferases

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。
• Supramolecular Assemblies of Nucleoside Functionalized Carbon Nanotubes: Synthesis, Film Preparation, and Properties
  作者：Alessandra Micoli、Antonio Turco、Elsie Araujo-Palomo、Armando Encinas、Mildred Quintana、Maurizio Prato

  DOI：10.1002/chem.201304780

  日期：2014.4.25

  confirm that functional groups play an important role in the biodegradation of CNT by HRP: N‐MWCNTs films were completely biodegraded, whereas for d‐N‐MWCNTs films no degradation was observed, showing that the pristine CNT undergoes minimal enzyme‐catalyzed oxidation This novel methodology offers a straightforward supramolecular strategy for the construction of conductive and biodegradable carbon nanotube

  合成并表征了核苷官能化的多壁碳纳米管（N-MWCNT）。然后使用利用氢键相互作用的自组织过程来制造不含稳定剂，聚合物或表面活性剂的自组装N-MWCNTs膜。膜是使用简单的基于水分散的真空过滤方法生产的。氢键识别通过红外光谱和TEM图像分析得到确认。通过在氩气气氛下热处理除去有机部分，从而得到d-N-MWCNT，从而恢复N-MWCNTs膜中的电子传导性能。。电导率和热重分析（TGA）测量证实了退火工艺的效率。最后，使用辣根过氧化物酶（HRP）和低浓度的H 2 O 2对N-MWCNTs和d-N-MWCNTs膜进行氧化生物降解。我们的结果证实，官能团在HRP对CNT的生物降解中起着重要作用：N-MWCNTs膜被完全生物降解，而d-N-MWCNTs 膜未观察到降解，表明原始CNT经历了最小的酶催化氧化。这种新颖的方法为构建导电和可生物降解的碳纳米管膜提供了一种直接的超分子策略。