allyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: allyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: Allyl 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside；N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-2-prop-2-enoxyoxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₁₁H₁₉NO₆
• 分子量: 261.275
• InChiKey: GFLRLITULFAIEW-ISUQUUIWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  ——	D-GlcNAc	7512-17-6	C8H15NO6	221.21
  2-乙酰氨基-2-脱氧-Alpha-D-吡喃糖	N-acetyl-D-glucosamine	10036-64-3	C8H15NO6	221.21
  β-D-葡萄糖胺五乙酸酯	2-acetamido-1,3,4,6-tetra-O-acetyl-2-deoxy-β-D-glucopyranose	7772-79-4	C16H23NO10	389.359
  2-乙酰氨基-1,3,4,6-O-四乙酰基-2-脱氧-alpha-D-吡喃葡萄糖	2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-D-glucopyranosyl acetate	14086-90-9	C16H23NO10	389.359
  A-D-氨基葡萄糖五乙酸盐	Acetic acid (2R,3R,4R,5S,6R)-2,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-3-acetylamino-tetrahydro-pyran-4-yl ester	7784-54-5	C16H23NO10	389.359
  2-乙酰氨基-3,4,6-三-O-乙酰-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖酰基氯	Acetic acid (2R,3S,4R,5R,6R)-3-acetoxy-2-acetoxymethyl-5-acetylamino-6-chloro-tetrahydro-pyran-4-yl ester	3068-34-6	C14H20ClNO8	365.768
  ——	2-methyl-(1,2-dideoxy-5,6-O-isopropylidene-α-D-glucofurano)-<2,1-d>-2-oxazoline	117177-19-2	C11H17NO5	243.26
  (3aR)-2-甲基-5alpha-(乙酰氧基甲基)-6beta,7alpha-二乙酰氧基-3Aalpha,6,7,7Aalpha-四氢-5H-吡喃并[3,2-d]恶唑	2-methyl-(3,4,6-tri-O-acetyl-1,2-dideoxy-α-D-glucopyranoso)[1,2-d]-2-oxazoline	35954-65-5	C14H19NO8	329.307

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  丙基 2-乙酰氨基-2-脱氧-beta-D-吡喃葡萄糖苷	propyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside	70832-36-9	C11H21NO6	263.291
  ——	allyl penta-N-acetyl-chitopentaose	390387-59-4	C43H71N5O26	1074.05
  ——	Galβ1,4GlcNAcβ-O-allyl	86733-47-3	C17H29NO11	423.417
  ——	Allyl D-1-13C-galactopyranosyl-β(1,4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside	142457-05-4	C17H29NO11	424.406
  ——	2-acetamido-2-deoxy-6-O-β-D-glucopyranosyl-D-glucopyranoside	——	C14H25NO11	383.353
  ——	propyl 2-acetamido-2-deoxy-4-O-(β-D-galactopyranosyl)-β-D-glucopyranoside	85386-55-6	C17H31NO11	425.433
  ——	2-acetamido-2,6-dideoxy-D-glucose	200272-62-4	C8H15NO5	205.211
  ——	allyl 2-acetamido-2-deoxy-4,6-di-O-pivaloyl-β-D-galactopyranoside	158382-59-3	C21H35NO8	429.511
  ——	allyl 2-acetamido-2-deoxy-3-O-(methoxycarbonyl)-β-D-glucopyranoside	136882-32-1	C13H21NO8	319.312
  ——	α-D-mannopyranosyl-(1->3)-2-acetamido-2-deoxy-D-glucopyranose	489-52-1	C14H25NO11	383.353

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  allyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside 在 咪唑 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 3 A molecular sieve 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 Allyl 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-β-D-galactopyranosyl-(1,3)-2-acetamido-2-deoxy-6-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Glycosyl Phosphites as Glycosylation Reagents: Scope and Mechanism

  摘要：

  The glycosylation reactions with glycosyl phosphites in the presence of catalytic amounts of TMSOTf at low temperature have been studied with different donors and accepters for the synthesis of several glycosides, including O-glycosides, S-glycosides, C-glycosides, and glycopeptides. Mechanistic investigations of the reactions indicate that the glycosyl phosphite is activated by either TfOH or TMSOTf, depending on how the substrates are mixed. When the acceptor is treated with TMSOTf first, the glycosyl phosphite is activated by the resulting TfOH. The glycosyl phosphite can also be activated by TMSOTf directly. The best result is, however, to mix the acceptor and TMSOTf first, followed by addition of the glycosyl phosphite.

  DOI：

  10.1021/jo00083a032
• 作为产物：
  描述：

  β-D-葡萄糖胺五乙酸酯 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 75.25h， 生成 allyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  探索Galectin-1配体相互作用的结构空间

  摘要：

  结合中：通过合成的多功能Lac N Ac模拟物扩展天然N-乙酰基乳糖胺（Lac N Ac）结合支架，导致配体的膨胀，其结合方式几乎与天然碳水化合物模板的结合方式相同。X射线晶体学提供了对半乳凝素1-配体相互作用的结构理解。这项研究的结果使开发半乳糖凝集素靶标家族成员的配体成为可能。

  DOI：

  10.1002/cbic.201700251

文献信息

• Chemical synthesis of N-acetylglucosamine derivatives and their use as glycosyl acceptors by the Mesorhizobium loti chitin oligosaccharide synthase NodC
  作者：Eric Kamst、Korien Zegelaar-Jaarsveld、Gijs A. van der Marel、Jacques H. van Boom、Ben J.J. Lugtenberg、Herman P. Spaink

  DOI：10.1016/s0008-6215(99)00190-1

  日期：1999.10

  lipo-chitin oligosaccharide signal molecules (Nod factors) that are essential for the formation of symbiotic organs on the roots of host plants, a process known as nodulation. Biosynthesis of the chitin oligosaccharide moiety in Nod factors is carried out by the rhizobial N-acetylglucosaminyltransferase NodC. The initial acceptor or primer used for the synthesis of chitin oligosaccharides in vivo is

  摘要根瘤菌细菌合成了脂-几丁质寡糖信号分子（Nod因子），这对于在宿主植物根部形成共生器官至关重要，这一过程称为结瘤。Nod因子中的几丁质寡糖部分的生物合成是通过根瘤菌N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶NodC进行的。用于体内几丁质寡糖合成的初始受体或引物是未知的。为了研究NodC的受体特异性，我们合成了具有不同糖苷配基的N-乙酰氨基葡糖（GlcNAc）衍生物，并使用表达lotorhizobium loti几丁质寡糖合酶NodC的大肠杆菌菌株的膜制剂在体外测试了它们是否为NodC的受体。使用薄层色谱法分析反应产物表明，含有简单烷基链或连接C-1的其他疏水基团的GlcNAc衍生物是NodC的受体。该酶似乎对糖苷配基是β-连接的受体具有特异性。NodC仍将其中GlcNAc的N-乙酰基部分的甲基被烯丙氧基或苄氧基取代的GlcNAc衍生物用作受体。因此，在该位置上的原始甲基对于NodC和GlcNAc之间
• Protected glycosides and disaccharides of 2-amino-2-deoxy-d-glucopyranose by ferric chloride-catalyzed coupling
  作者：Makoto Kiso、Laurens Anderson

  DOI：10.1016/0008-6215(85)85205-8

  日期：1985.2

  N-chloroacetyl, and N-phthaloyl congeners of 3. The latter compounds, except for the N-phthaloyl derivative, gave oxazolines in the absence of an alcoholic reactant. Compound 3 and the related N-benzoyl, N-chloroacetyl, N-acetyl-3,4,6-tri-O-benzyl, and N-acetyl-4-O-acetyl-3,6-di-O-benzyl derivatives were coupled to one or more protected sugars to form protected, beta-linked disaccharides. Coupling

  描述了受保护的2-酰基氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖1-乙酸盐的氯化铁催化的羟基化合物的糖基化。除了醇与2-乙酰氨基-1,3,4,6-四-O-乙酰基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖（3），烯丙基（和其他烷基）β-糖苷是从3的N-苯甲酰基，N-苯氧基乙酰基，N-甲氧基乙酰基，N-氯乙酰基和N-邻苯二甲酰基同系物获得的。除了N-邻苯二甲酰基衍生物以外，后一种化合物在不存在醇类反应物的情况下生成恶唑啉。化合物3和相关的N-苯甲酰基，N-氯乙酰基，N-乙酰基-3,4,6-三-O-苄基和N-乙酰基-4-O-乙酰基-3,6-二-O-苄基衍生物将其与一种或多种受保护的糖偶联以形成受保护的，β-连接的二糖。受体6位的偶联反应顺利进行，收率为67-80％。为了在位置3和4上成功偶联，需要较长的反应时间和多次添加糖基供体，收率范围从60％到低至30％。1,3,4,6-四-O-乙酰基-2-（氯乙酰胺基）-2-
• Why Is Direct Glycosylation with <i>N</i>-Acetylglucosamine Donors Such a Poor Reaction and What Can Be Done about It?
  作者：Mikkel H. S. Marqvorsen、Martin J. Pedersen、Michelle R. Rasmussen、Steffan K. Kristensen、Rasmus Dahl-Lassen、Henrik H. Jensen

  DOI：10.1021/acs.joc.6b02305

  日期：2017.1.6

  chemical glycosylation is challenging since direct reactions are low yielding. This issue, generally agreed upon to be caused by an intermediate 1,2-oxazoline, is often bypassed by introducing extra synthetic steps to avoid the presence of the NHAc functional group during glycosylation. The present paper describes new fundamental mechanistic insights into the inherent challenges of performing direct glycosylation

  单糖N-乙酰基-d-葡糖胺（GlcNAc）是天然存在的低聚糖中丰富的组成部分，但是由于直接反应的收率低，因此通过化学糖基化的方法引入葡糖胺极具挑战性。通常认为是由中间体1,2-恶唑啉引起的此问题通常通过引入额外的合成步骤来避免，以避免在糖基化过程中出现NHAc官能团。本文介绍了对使用GlcNAc执行直接糖基化的内在挑战的新的基本机械学见解。这些结果表明，控制恶唑啉形成和糖基化的平衡是获得可接受的化学收率的关键。通过运用这种推理方法直接与GlcNAc的传统硫糖苷供体直接进行糖基化，否则其糖基化收率不佳，
• Olefin Cross-Metathesis on Proteins: Investigation of Allylic Chalcogen Effects and Guiding Principles in Metathesis Partner Selection
  作者：Yuya A. Lin、Justin M. Chalker、Benjamin G. Davis

  DOI：10.1021/ja104994d

  日期：2010.12.1

  generally enhance the rate of alkene metathesis reactions. Allyl selenides were found to be exceptionally reactive olefin metathesis substrates, enabling a broad range of protein modifications not previously possible. The principles considered in this report are important not only for expanding the repertoire of bioconjugation but also for the application of olefin metathesis in general synthetic endeavors

  烯烃复分解最近已成为化学蛋白质修饰的可行反应。然而，生物偶联中烯烃复分解的范围和局限性仍不清楚。在此，我们报告了对有助于蛋白质底物生产性交叉复分解的各种因素的评估。空间、底物范围和接头选择都被考虑在内。在这项研究中发现，烯丙基硫属化物通常会提高烯烃复分解反应的速率。发现烯丙基硒化物是异常活泼的烯烃复分解底物，能够进行以前不可能进行的广泛的蛋白质修饰。本报告中考虑的原则不仅对于扩展生物共轭的全部内容很重要，而且对于烯烃复分解在一般合成工作中的应用也很重要。
• The Stereochemical Dependence of Unimolecular Dissociation of Monosaccharide-Glycolaldehyde Anions in the Gas Phase:  A Basis for Assignment of the Stereochemistry and Anomeric Configuration of Monosaccharides in Oligosaccharides by Mass Spectrometry via a Key Discriminatory Product Ion of Disaccharide Fragmentation, <i>m</i>/<i>z</i> 221
  作者：Tammy T. Fang、Brad Bendiak

  DOI：10.1021/ja0717313

  日期：2007.8.1

  stereochemistry and anomeric configuration, for all 16 stereochemical variants. The ions were shown to be glycopyranosyl-glycolaldehydes through chemical synthesis of their standards. The stereochemistry dramatically affected fragmentation which was dependent on four relative stereochemical arrangements: (1) the relationship between the hydroxyl group at position 2 and the anomeric configuration, (2) a cis relationship

  含己糖二糖的质谱分析通常会在负离子模式下产生 m/z 221 的产物离子。使用 Paul 阱，m/z 221 阴离子的分离和碰撞诱导解离产生的质谱图可以轻松区分所有 16 种立体化学变体的立体化学和异头构型。通过标准品的化学合成，这些离子被证明是吡喃糖基乙醇醛。立体化学显着影响碎片化，这取决于四种相对立体化学排列：(1) 2 位羟基与异头构型之间的关系，(2) 异头位置与 2 和 3 位的顺式关系 (1,2 ,3-cis), (3) 1,2 trans-2,3 cis 关系，(4) 4位羟基与异头构型的关系。在用 18O 标记一系列二糖的还原羰基氧以区分它们的单糖成分后，证明 m/z 221 阴离子由一个完整的非还原糖组成，糖苷键连接到来自还原反应的 2-碳苷元糖，与单糖之间的连接位置无关。这使得完整糖的位置能够被分配到糖苷键的非还原侧。对重现性所需的实验因素的详细研究表明，每个 m/z 221