甲基-2-脱氧-D-核糖 | 60134-26-1

• 物质功能分类: 生物化工 - 糖类化合物 - 单糖
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 甲基-2-脱氧-D-核糖
• 中文别名: 1-O-甲基-2-脱氧-D-核糖；1-甲氧基-2-脱氧-D-核糖
• 英文名称: 1-O-methyl-2-deoxy-D-ribofuranoside
• 英文别名: (2R,3S)-2-(hydroxymethyl)-5-methoxytetrahydrofuran-3-ol；methyl 2-deoxy-D-ribofuranoside；methyl 2-deoxy-D-erythro-pentofuranoside；1-O-methyl-2-deoxy-D-ribofuranose；1-O-methyl-2-deoxy-D-ribose；2-hydroxymethyl-5-methoxy-tetrahydro-furan-3-ol；(2R,3S)-2-(hydroxymethyl)-5-methoxyoxolan-3-ol；1-O-methyl-2-deoxy-D-erythro-pentofuranose；methyl 2-deoxyribofuranoside
• CAS: 60134-26-1
• 化学式: C₆H₁₂O₄
• mdl: MFCD00134161
• 分子量: 148.159
• InChiKey: NVGJZDFWPSOTHM-YRZWDFBDSA-N

物化性质

• 沸点：
  294.5±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.224 g/mL at 25 °C(lit.)
• 闪点：
  >230 °F
• 溶解度：
  氯仿（少量溶解）、乙醇（少量溶解）、甲醇（少量溶解）、水（少量溶解）
• 稳定性/保质期：
  避免接触氧化物

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  58.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S26,S36
• 危险类别码：
  R36/37/38
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  29400090
• 危险性防范说明：
  P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302
• 储存条件：
  在密封的贮藏器中存放，并置于阴凉、干燥处保存。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  甲基-2-脱氧-D-核糖 在 盐酸 、 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 sodium methylate 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 乙酰氯 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 氯仿 、 甲苯 为溶剂， 反应 12.75h， 生成 三氟胸苷
  参考文献：
  名称：

  [EN] SOLID STATE FORMS OF 5-CHLORO-6-[(2-IMINOPYRROLIDIN-1-YL)METHYL]PYRIMIDINE-2,4-(1H,3H)-DIONE HYDROCHLORIDE AND THEIR PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF
  [FR] FORMES À L'ÉTAT SOLIDE DE CHLORHYDRATE DE 5-CHLORO-6-[(2-IMINOPYRROLIDIN-1-YL)MÉTHYL]PYRIMIDINE-2,4-(1H,3H)-DIONE ET PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ASSOCIÉS

  摘要：

  本发明涉及化合物5-氯-6-[(2-亚胺吡咯啉-1-基)甲基]嘧啶-2,4-(1H,3H)-二酮盐酸盐的固态形式，其化学式为1a，以及其制备方法和改进的制备方法。本发明者还提供了由2'-脱氧-5-(三氟甲基)尿苷和5-氯-6-[(2-亚胺吡咯啉-1-基)甲基]嘧啶-2,4-(1H,3H)-二酮单盐酸组成的组合药物的非晶形态多晶形态及其制备方法。

  公开号：

  WO2019049174A1
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖 以95%的产率得到甲基-2-脱氧-D-核糖
  参考文献：
  名称：

  A concise synthesis of (R)-hydroxy-E,Z-diene fatty acids: preparation of 12(R)-hete, tetranor-12(R)-hete, and 13(R)-hode

  摘要：

  Chiral E-enals derived from functionalized 2-deoxy-D-ribofuranoses by ylide-induced beta-elimination were exploited for the synthesis of fatty acid metabolites containing the (R)-hydroxy-E,Z-diene subunit.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)79912-6

文献信息

• Efficient procedure for the synthesis of erythro and threo furanoid glycals from 2-deoxyribose
  作者：Mohamed Kassou、Sergio Castillón

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)73538-6

  日期：1994.7

  Differently protected erythro and threo furanoid glycals have been synthesised starting from 2-deoxyribose, via selenoxide elimination as the key step.

  从2-脱氧核糖开始，通过亚硒酸盐的消除，合成了受不同保护的赤藓和苏糖类呋喃糖，这是关键步骤。
• Introduction of Peptide Functions into DNA by Nucleic Acid Peptides, NAPs
  作者：Junji Kawakami、Zhong-Ming Wang、Hiroyoshi Fujiki、Satoshi Izumi、Naoki Sugimoto

  DOI：10.1246/cl.2004.1554

  日期：2004.12

  Nucleic acid peptides (NAPs) with a mimetic amino acid side residue at the base position of the nucleotide via an amide bond were synthesized from 3-deoxy-6-O-(4,4′-dimethoxytrityl)allonic acid methyl ester as the common precursor. Furthermore, an NAP with an octapeptide at the C1′ position was synthesized. The peptide-linked NAP exhibits both functions of the oligopeptide part and of the oligonucleotide part.

  以3-脱氧-6-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)别乳酸甲酯为共同前体，合成了在核苷酸碱基位置通过酰胺键带有模拟氨基酸侧残基的核酸肽（NAP）。此外，还合成了一种在C1'位置带有八肽的NAP。这种连接肽的NAP既表现出寡肽部分的功能，也表现出寡核苷酸部分的功能。
• Synthesis and DNA/RNA Binding Properties of Conformationally Constrained Pyrrolidinyl PNA with a Tetrahydrofuran Backbone Deriving from Deoxyribose
  作者：Pitchanun Sriwarom、Panuwat Padungros、Tirayut Vilaivan

  DOI：10.1021/acs.joc.5b00890

  日期：2015.7.17

  following an 11-step reaction sequence. The tetrahydrofuran amino acid is used as a building block for a new peptide nucleic acid (PNA), which exhibits excellent DNA binding affinity with high specificity. It also shows preference for binding to DNA over RNA and specifically in the antiparallel orientation. In addition, the presence of the hydrophilic tetrahydrofuran ring in the PNA structure reduces nonspecific

  糖衍生的环状β-氨基酸是设计折叠剂和其他仿生结构的重要组成部分。我们在此报告了C活化的N - Fmoc保护的反式-（2 S，3 S）-3-氨基四氢呋喃-2-羧酸的首次合成，作为Fmoc固相肽合成的基础。从2-deoxy- d开始-核糖，按照11步反应顺序，以6.7％的总收率获得产物。四氢呋喃氨基酸用作新肽核酸（PNA）的构件，该肽核酸具有出色的DNA结合亲和力和高特异性。它还显示了与DNA结合的优先于RNA的结合，特别是在反平行方向上。另外，在PNA结构中亲水四氢呋喃环的存在减少了非特异性相互作用和自聚集，这由于其疏水性而在PNA中是一个普遍的问题。
• Design of novel RNA ligands that bind stem–bulge HIV-1 TAR RNA
  作者：Maria Duca、Vincent Malnuit、Florent Barbault、Rachid Benhida

  DOI：10.1039/c0cc00645a

  日期：——

  We report here the rational design and the synthesis of a new series of RNA ligands. These molecules are constituted of various binding motifs that interact cooperatively with HIV-1 TAR RNA, used as a model.

  我们在这里报告了一系列新的RNA配体的合理设计和合成。这些分子由各种结合基序构成，这些结合基序与作为模型的HIV-1 TAR RNA相互作用。
• Synthesis of beta-L-2'-deoxy nucleosides
  申请人：Storer Richard

  公开号：US20050059632A1

  公开（公告）日：2005-03-17

  An improved process for the preparation of 2′-modified nucleosides and 2′-deoxy-nucleosides, such as, β-L-2′-deoxy-thymidine (LdT), is provided. In particular, the improved process is directed to the synthesis of a 2′-deoxynucleoside that may utilize different starting materials but that proceeds via a chloro-sugar intermediate or via a 2,2′-anhydro-1-furanosyl-nucleobase intermediate. Where an 2,2′-anhydro- 1 -furanosyl base intermediate is utilized, a reducing agent, such as Red-Al, and a sequestering agent, such as 15-crown-5 ether, that cause an intramolecular displacement reaction and formation of the desired nucleoside product in good yields are employed. An alternative process of the present invention utilizes a 2,2′-anhydro-1-furanosyl base intermediate without a sequestering agent to afford 2′-deoxynucleosides in good yields. The compounds made according to the present invention may be used as intermediates in the preparation of other nucleoside analogues, or may be used directly as antiviral and/or antineoplastic agents.

  提供了一种改进的2'-改性核苷和2'-脱氧核苷的制备工艺，例如，β-L-2'-脱氧胸苷（LdT）。特别是，改进的工艺针对的是2'-脱氧核苷的合成，该合成可能使用不同的起始材料，但都通过氯糖中间体或通过2,2'-脱水-1-呋喃糖核苷中间体进行。当使用2,2'-脱水-1-呋喃糖碱基中间体时，会采用还原剂（如Red-Al）和隔离剂（如15-冠-5醚），它们能引起分子内位移反应，并形成所需核苷产品的高收率。本发明的一种替代工艺使用2,2'-脱水-1-呋喃糖碱基中间体而不使用隔离剂，也能以高收率获得2'-脱氧核苷。根据本发明制成的化合物可以作为制备其他核苷类似物的中间体，或者可以直接用作抗病毒和/或抗肿瘤剂。