2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖 | 36792-88-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖
• 英文名称: 2-deoxy-D-ribose
• 英文别名: 2'-deoxyribose；2'-desoxyribose；beta-D-2-Deoxyribose；(2R,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)oxolane-2,4-diol
• CAS: 36792-88-8
• 化学式: C₅H₁₀O₄
• 分子量: 134.132
• InChiKey: PDWIQYODPROSQH-VPENINKCSA-N

物化性质

• 沸点：
  363.0±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.453±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  69.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖 在 盐酸 、 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 sodium methylate 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 乙酰氯 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 氯仿 、 甲苯 为溶剂， 反应 18.25h， 生成 三氟胸苷
  参考文献：
  名称：

  [EN] SOLID STATE FORMS OF 5-CHLORO-6-[(2-IMINOPYRROLIDIN-1-YL)METHYL]PYRIMIDINE-2,4-(1H,3H)-DIONE HYDROCHLORIDE AND THEIR PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF
  [FR] FORMES À L'ÉTAT SOLIDE DE CHLORHYDRATE DE 5-CHLORO-6-[(2-IMINOPYRROLIDIN-1-YL)MÉTHYL]PYRIMIDINE-2,4-(1H,3H)-DIONE ET PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ASSOCIÉS

  摘要：

  本发明涉及化合物5-氯-6-[(2-亚胺吡咯啉-1-基)甲基]嘧啶-2,4-(1H,3H)-二酮盐酸盐的固态形式，其化学式为1a，以及其制备方法和改进的制备方法。本发明者还提供了由2'-脱氧-5-(三氟甲基)尿苷和5-氯-6-[(2-亚胺吡咯啉-1-基)甲基]嘧啶-2,4-(1H,3H)-二酮单盐酸组成的组合药物的非晶形态多晶形态及其制备方法。

  公开号：

  WO2019049174A1
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧鸟苷 在 1-甲基吡咯烷 、 吡啶 、 2,6-二甲基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 27.58h， 生成 2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖
  参考文献：
  名称：

  Reese, Colin B.; Skone, Philip A., Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1984, p. 1263 - 1271

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Discovery of novel Cyclophilin D inhibitors starting from three dimensional fragments with millimolar potencies
  作者：Ulrich Grädler、Daniel Schwarz、Michael Blaesse、Birgitta Leuthner、Theresa L. Johnson、Frederic Bernard、Xuliang Jiang、Andreas Marx、Marine Gilardone、Hugues Lemoine、Didier Roche、Catherine Jorand-Lebrun

  DOI：10.1016/j.bmcl.2019.126717

  日期：2019.12

  connecting millimolar fragments in the S1' and S2 pockets. We successfully improved the in vitro CypD potencies in the biochemical FP and PPIase assays and in the biophysical SPR binding assay from millimolar towards the low micromolar and submicromolar range by >1000-fold for some fragment derivatives. The initial SAR together with the protein crystal structures of our novel CypD inhibitors provide a suitable

  通过SPR进行基于片段的筛选，可以发现与肽基-脯氨酰异构酶亲环蛋白D（CypD）具有毫摩尔结合亲和力的化学多样性片段。6个片段命中的CypD蛋白质晶体结构通过片段合并和连接产生了三个不同的化学序列，其中尿素，草酰或酰胺连接体连接了S1'和S2口袋中的毫摩尔片段，为随后的药物化学优化提供了基础。对于某些片段衍生物，我们成功地将生化FP和PPIase分析以及生物物理SPR结合分析中的体外CypD效能从毫摩尔向低微摩尔和亚微摩尔范围提高了1000倍以上。
• Synthesis of 2?-Deoxyisoinosine and Related 2?-Deoxyribonucleosides
  作者：Frank Seela、Yaoming Chen、Uwe Bindig、Zygmunt Kazimierczuk

  DOI：10.1002/hlca.19940770122

  日期：1994.2.9

  and pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 2′-deoxyribonucleosides with methylthio (13a), chloro (13b), methoxy (9b), and oxo (2, 3) substituents at C(2) are prepared. They are obtained either via stereoselective nucleobase-anion glycosylation or by base transformation. A three-step synthesis of the unknown 2′-deoxyisoinosine (2) from 2′-deoxyguanosine (15) is described. Compound 2 as well as its 7-deazapurine derivative

  制备了在C（2）具有甲硫基（13a），氯（13b），甲氧基（9b）和氧代（2、3）取代基的各种2-取代的嘌呤和吡咯并[2,3 - d ]嘧啶2'-脱氧核糖核苷。它们可以通过立体选择性核碱基阴离子糖基化或碱基转化获得。描述了由2'-脱氧鸟苷（15）三步合成未知的2'-脱氧异肌氨酸（2）。化合物2及其7-脱氮嘌呤衍生物3显示强荧光。
• REAGENT FOR MASS SPECTROMETRY
  申请人：Roche Diagnostics Operations, Inc.

  公开号：US20200041470A1

  公开（公告）日：2020-02-06

  The present invention relates to reagents suitable in the mass spectrometric determination of analyte molecules such as carbohydrates as well as adducts of such reagents and analyte molecules and applications of said reagents and adducts. Further, the present invention relates to methods for the mass spectrometric determination of analyte molecules.

  本发明涉及适用于质谱测定分析物分子（如碳水化合物）以及该类试剂和分析物分子的加合物的试剂，并涉及所述试剂和加合物的应用。此外，本发明涉及用于质谱测定分析物分子的方法。
• Chiral Coordination Polymers from a New 2-Deoxy-<scp>d</scp>-ribose Derivative Linker: Syntheses, Structures, and Fe³⁺ Fluorescent Probe Functions
  作者：Tian-Sheng He、Yan-Long Lan、Zong-Ying Li、Li-Na Zhu、Xiao-Zeng Li

  DOI：10.1021/acs.cgd.0c01661

  日期：2021.4.7

  the propellers of 1–4 suggest that L is a powerful ligand in controlling the structures and chiralities of its metal complexes. Interestingly, 3 gave weaker emission in the solid state but much stronger emission in suspension, and 2–4 showed the ability to sense Fe3+ with LODs of 2.75, 0.12, and 0.87 μM and quenching constants of 1.07 × 104, 1.67 × 104, and 3.33 × 104 M–1, respectively, and high interference

  研究使用2-脱氧配位聚合物（CPS）d -核糖衍生物作为配体还没有被记录到我们所知的。在，新配体大号（1,3,4- trikisisoniacyl -2-脱氧-β- d -ribopyranose）设计并从2-脱氧合成d -核糖，和四个CP [锰大号2氯2 ]· 4CH 3 OH} ∞（1），[CO大号2氯2 ] 4 4CH 3 OH} ∞（2），[镍大号2氯2 ] CH 4CH 3 OH} ∞（3）和[Co L 2 Br 2 ]•4CH 3 OH} ∞（4）是以L为桥连配体制备的。X射线单晶分析表明，以上四个CP在三角形空间群P 3 1 21中结晶，具有相同的2D网格结构和相同的1D介观螺旋和相同的3D超分子结构，并且每个金属中心键与4吡啶环，以形成在Δ-螺旋桨配置1 - 4。相同的空间群，结构，和手性类型的螺旋桨1 - 4表明L是控制其金属配合物的结构和手性的强大配体。有趣的是
• Synthesis of 6-Substituted 1-Deazapurine 2?-Deoxyribonucleosides
  作者：Thomas Wenzel、Frank Seela

  DOI：10.1002/hlca.19960790117

  日期：1996.2.7

  The synthesis of 6-substituted 1-deazapurine 2′-deoxyribonucleosides is described. Glycosylation of the 1-deazapurine (imidazo[4,5-b]pyridine) anions with the α-D-halogenose 5 gives stereoselectively N7- and N9- regioisomers. 1H-NMR NOE and 13C-NMR spectroscopy are used for unambiguous assignment of isomers, and 15N-NMR chemical shifts are correlated with σparaHammett constants and point charges.

  描述了6-取代的1-脱氮嘌呤2'-脱氧核糖核苷的合成。1-脱氮嘌呤（咪唑并[4,5-的糖基化b与α-d-halogenose]吡啶）阴离子5给出了立体选择性Ñ 7 -和Ñ 9 -区域异构体。1个H-NMR和NOE 13 C-NMR光谱法被用于异构体的明确分配，和15的N- NMR化学位移与σ相关段哈米特常数和点电荷。