tert-butyl [(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate | 153045-91-1

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物 - 羧酸酯及其衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: tert-butyl [(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate
• 英文别名: tert-butyl-N-[(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate；tert-Butyl ((1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl)carbamate；tert-butyl N-[(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate
• CAS: 153045-91-1
• 化学式: C₁₁H₂₁NO₄
• 分子量: 231.292
• InChiKey: KJSNDUWCYCALLS-HLTSFMKQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.91
• 拓扑面积：
  78.8
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl [(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate 在 咪唑 、 盐酸 、 (1,1'-bis(diphenylphosphino)ferrocene)palladium(II) dichloride 、 potassium carbonate 、 caesium carbonate 、 三乙胺 、 zinc dibromide 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 124.5h， 生成 [(1R,2S,4R)-4-({5-[(4,5-dibenzyl-2-thienyl)carbonyl]pyrimidin-4-yl}amino)-2-hydroxycyclopentyl]methyl sulfamate
  参考文献：
  名称：

  [EN] HETEROARYL COMPOUNDS USEFUL AS INHIBITORS OF SUMO ACTIVATING ENZYME
  [FR] COMPOSÉS HÉTÉROARYLE UTILES EN TANT QU'INHIBITEURS DE L'ENZYME D'ACTIVATION SUMO

  摘要：

  公开了公式(I)的化合物或其药物可接受的盐； 其中Y、Ra、Ra'、Rb、Rc、X1、X2、X3、Rd、Z1和Z2具有本文所述的值，并且星号位置表示的立体化学配置指示绝对立体化学。 根据本公开的化学实体可用作Sumo激活酶（SAE）的抑制剂。 进一步提供了包含本公开化合物的药物组合物以及使用该组合物治疗增殖性、炎症性、心血管和神经退行性疾病或病症的方法。

  公开号：

  WO2016004136A1
• 作为产物：
  描述：

  2-甲基-2-丙基(1R,4S)-3-氧代-2-氮杂双环[2.2.1]庚-5-烯-2-羧酸酯 在 咪唑 、 sodium tetrahydroborate 、 间氯过氧苯甲酸 、 红铝 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 24.5h， 生成 tert-butyl [(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  Base Pairing and Replicative Processing of the Formamidopyrimidine-dG DNA Lesion

  摘要：

  The 2,6-diamino-4-hydroxy-5-formamidopyrimidine of 2'-deoxyguanosine (FaPydG) is one of the major DNA lesions found after oxidative stress in cells. To clarify the base pairing and coding potential of this major DNA lesion with the aim to estimate its mutagenic effect, we prepared oligonucleotides containing a cyclopentane based analogue of the DNA lesion (cFaPydG). In addition, oligonucleoticles containing the cyclopentane analogue of 2'-deoxyguanosine (cdG), and oligonucleotides containing 8-oxo-7,8-dihydro2'-deoxyguanosine (8-oxodG) were synthesized. The thermodynamic stability of duplexes containing these building blocks and all canonical counterbases were determined by concentration dependent melting-point measurements (van't Hoff plots). The data reveal that cFaPydG greatly destabilizes a DNA duplex (Delta Delta G(o)298K approximate to 2-4 kcal mol(-1)). The optimal base pairing partner for the cFaPydG lesion is dC. Investigation of duplexes containing dG and cdG shows that the effect of substituting the deoxyribose by a cyclopentane moiety is marginal. The data also provide strong evidence that the FaPydG lesion is unable to form a base pair with dA. Our computational studies indicate that the syn-conformation required for base pairing with dA is energetically unfavorable. This is in contrast to 8-oxodG for which the syn-conformation represents the energetic minimum. Kinetic primer extension studies using S. cerevisiae Pol eta reveal that cFaPydG is replicated in an error-free fashion. dC is inserted 2-3 orders of magnitude more efficiently than dT or CIA, showing that FaPydG is a lesion which retains the coding potential of dG. This is also in contrast to 8-oxodG, for which base pairing with dC and dA was established.

  DOI：

  10.1021/ja0549188
• 作为试剂：
  描述：

  (-)-(6aR, 8R, 9aS)-tert-butyl N-(hexahydro-2,2,4,4-tetraisopropylcyclopenta[f]-1,3,5,2,4-trioxadisilocin-8-yl) carbamate 、 Tetraethylammonium fluoride dihydrate 在 氮 、 四氢呋喃 、 crude title compound 、 ethyl acetate-hexanes 、 tert-butyl [(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 48.75h， 以giving additional crude title compound (27.28 g, 0.1180 mol)的产率得到tert-butyl [(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  Therapeutic nucleosides

  摘要：

  本发明涉及一些嘌呤核苷类似物，其中含有一个碳环代替糖残基，其盐，酯和药学上可接受的衍生物，它们的制备过程，含有它们的制药配方以及这些化合物在治疗中的应用，特别是在治疗或预防某些重要感染方面的应用。

  公开号：

  US05641889A1

文献信息

• [EN] CARBOCYCLIC NUCLEOSIDE ANALOGUE<br/>[FR] ANALOGUE DE NUCLÉOSIDE CARBOCYCLIQUE
  申请人：UNIV MUENCHEN LUDWIG MAXIMILIANS

  公开号：WO2020245351A1

  公开（公告）日：2020-12-10

  The present invention relates to novel hydrolytically stable carbocyclic 5-aza-2-deoxycytidine and carbocyclic 5-aza-cytidine compounds and prodrugs thereof as hypomethylating agents.

  本发明涉及新型水解稳定的碳环5-aza-2-deoxycytidine和碳环5-aza-cytidine化合物及其前药，作为低甲基化剂。
• Discovery of Pyrazolocarboxamides as Potent and Selective Receptor Interacting Protein 2 (RIP2) Kinase Inhibitors
  作者：Curt D. Haffner、Adam K. Charnley、Christopher J. Aquino、Linda Casillas、Máire A. Convery、Julie A. Cox、Mark A. Elban、Nicole C. Goodwin、Peter J. Gough、Pamela A. Haile、Terry V. Hughes、Beth Knapp-Reed、Constantine Kreatsoulas、Ami S. Lakdawala、Huijie Li、Yiqian Lian、David Lipshutz、John F. Mehlmann、Michael Ouellette、Joseph Romano、Lisa Shewchuk、Arthur Shu、Bartholomew J. Votta、Huiqiang Zhou、John Bertin、Robert W. Marquis

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.9b00141

  日期：2019.11.14

  Herein we report the discovery of pyrazolocarboxamides as novel, potent, and kinase selective inhibitors of receptor interacting protein 2 kinase (RIP2). Fragment based screening and design principles led to the identification of the inhibitor series, and X-ray crystallography was used to inform key structural changes. Through key substitutions about the N1 and C5 N positions on the pyrazole ring significant

  在这里，我们报告吡唑并羧酰胺作为受体相互作用蛋白2激酶（RIP2）的新型，有效和激酶选择性抑制剂的发现。基于片段的筛选和设计原理导致了抑制剂系列的鉴定，并使用X射线晶体学分析了关键的结构变化。通过在吡唑环上的N1和C5 N位置进行关键取代，可以实现显着的激酶选择性和效力。桥连的双环吡唑并羧酰胺11代表RIP2的选择性和有效抑制剂，将允许更详细地研究RIP2抑制作为自身炎症性疾病的治疗靶标。
• Synthesis of Stable and Cell-type Selective Analogues of Cyclic ADP−Ribose, a Ca²⁺-Mobilizing Second Messenger. Structure−Activity Relationship of the N1-Ribose Moiety¹
  作者：Takashi Kudoh、Masayoshi Fukuoka、Satoshi Ichikawa、Takashi Murayama、Yasuo Ogawa、Minako Hashii、Haruhiro Higashida、Svenja Kunerth、Karin Weber、Andreas H. Guse、Barry V. L. Potter、Akira Matsuda、Satoshi Shuto

  DOI：10.1021/ja050732x

  日期：2005.6.1

  We previously developed cyclic ADP-carbocyclic ribose (cADPcR, 2) as a stable mimic of cyclic ADP-ribose (cADPR, 1), a Ca(2+)-mobilizing second messenger. A series of the N1-ribose modified cADPcR analogues, designed as novel stable mimics of cADPR, which were the 2"-deoxy analogue 3, the 3"-deoxy analogue 4, the 3"-deoxy-2"-O-(methoxymethyl) analogue 5, the 3"-O-methyl analogue 6, the 2",3"-dideoxy

  我们以前开发了循环 ADP-碳环核糖 (cADPcR, 2) 作为稳定模拟的循环 ADP-核糖 (cADPR, 1)，Ca(2+) 动员第二信使。一系列 N1-核糖修饰的 cADPcR 类似物，设计为 cADPR 的新型稳定模拟物，它们是 2"-脱氧类似物 3、3"-脱氧类似物 4、3"-脱氧-2"-O-(甲氧基甲基) 类似物 5、3"-O-甲基类似物 6、2",3"-dideoxy 类似物 7 和 2",3"-dideoxydidehydro 类似物 8，使用与苯硫代磷酸酯型的关键分子内缩合反应成功合成我们研究了这些类似物和 cADPR 的构象，发现腺嘌呤和 N9-核糖部分之间以及腺嘌呤和 N1-核糖部分之间的空间排斥是构象的决定因素。Ca(2+)-动员效应被系统地评估使用三个不同的生物系统，即海胆卵、 NG108-15 神经元细胞和Jurkat T 淋巴细胞。这些 cADPR 类似物对
• 2-Azabicyclo[2.2.1]hept-5-en-3-one epoxide: A versatile intermediate for the synthesis of cyclopentyl carbocyclic 2-deoxy-, 3-deoxy- &amp; ara- ribonucleoside analogues
  作者：Belén M Domínguez、Paul M Cullis

  DOI：10.1016/s0040-4039(99)01113-2

  日期：1999.7

  5,6-Epoxy-exo-2-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-one has been used as a versatile intermediate in the synthesis of 2-deoxy-, 3-deoxy- and ara- cyclopentyl carbocyclic nucleosides. An efficient, short synthesis of the (+) carbocyclic thymidine 13 is reported.

  5，6-环氧-外-2--2-氮杂双环[2.2.1]庚-3-已被用作合成2-脱氧，3-脱氧和芳基-环戊基碳环核苷的通用中间体。报道了（+）碳环胸苷13的有效的，短的合成。
• Influencing Epigenetic Information with a Hydrolytically Stable Carbocyclic 5‐Aza‐2′‐deoxycytidine
  作者：Thomas M. Wildenhof、Sarah Schiffers、Franziska R. Traube、Peter Mayer、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.201904794

  日期：2019.9.9

  tumor-suppressor genes, which elicits a beneficial effect. The problem associated with AzadC is that the compound is hydrolytically unstable. It decomposes during treatment to a variety of poorly characterized hydrolysis products. After its incorporation into the genome, this hydrolytic instability generates abasic sites. It is consequently difficult to dissect whether the activity of the compound is

  5-Aza-2'-脱氧胞苷（AzadC）在临床上是一种抗代谢物，可降低表观遗传修饰5-甲基-2'-脱氧胞苷（mdC）的水平。AzadC被掺入到增殖细胞的基因组中，在那里它抑制DNA甲基转移酶（DNMT），导致mdC减少​​。mdC丢失，mdC是基因上游启动子区域的转录沉默子，导致相应基因（包括抑癌基因）的重新激活，从而产生有益的作用。与AzadC相关的问题是该化合物水解不稳定。在处理过程中，它会分解为多种特性不佳的水解产物。将其掺入基因组后，这种水解不稳定性会产生无碱基位点。因此，很难剖析化合物的活性是由DNMT抑制引起的还是更普遍地由DNA损伤的形成引起的。我们现在发现，脱核版本的AzadC（其中核糖氧被CH2基团取代）在各种pH值下都非常稳定，同时保持了针对DNMT的活性。