methyl 2,3-O-isopropylidene-α-D-rhamnopyranoside

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl 2,3-O-isopropylidene-α-D-rhamnopyranoside
• 英文别名: (3aS,4S,6R,7R,7aS)-4-methoxy-2,2,6-trimethyl-4,6,7,7a-tetrahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-c]pyran-7-ol
• 化学式: C₁₀H₁₈O₅
• 分子量: 218.25
• InChiKey: TVKKWQAJQZHTDN-DFTQBPQZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  57.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2,3-O-isopropylidene-α-D-rhamnopyranoside 在 氢氧化钾 、 四丁基碘化铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 二甲基亚砜 、 甲苯 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 methyl 2,4-di-O-benzyl-6-deoxy-α-D-mannopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of O-α-D-Rhap-(1 → 3)-O-α-D-Rhap-(1 → 2)-O-α-D-Rhap-(1 → 12)-oxydodecanoyl-bovine serum albumin

  摘要：

  该文献合成了一种标题化合物（19），它是基于α-D-鼠李糖重复三糖的三糖衍生物，该三糖衍生物构成了铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）PAOl菌株的突变体（AK1401）“A-band”脂多糖的多糖部分，与牛血清白蛋白（BSA）结合。该合成从甲基α-D-甘露糖起始。适当保护的D-鼠李糖衍生物，即3,4-二-O-苯甲酰基-1-硫代-α-D-鼠李糖吡喃糖（11）和3-O-乙酰基-2,4-二-O-苯甲酰基-α-D-鼠李糖吡喃糖氯化物（12），分别用作糖基受体和给体，在二糖13的合成中使用。对13的O-去乙酰化产生14，这是一种糖基受体，它与12反应形成三糖15。在15的合成中，N-碘代琥珀酰亚胺-三氟甲磺酸被用作巯基糖苷的活化剂，用于合成16和17。通过用肼处理16，将其转化为肼酸盐18。通过将18的中间酰基叠氮衍生物与BSA偶联，实现了共轭。

  DOI：

  10.1139/v93-275
• 作为产物：
  描述：

  甲基-D-丙噻 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 碘 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 乙醇 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 20.17h， 生成 methyl 2,3-O-isopropylidene-α-D-rhamnopyranoside
  参考文献：
  名称：

  合成糖缀合物表征布鲁氏菌A和M单克隆抗体的优良特异性

  摘要：

  布鲁氏菌细菌的主要细胞壁抗原是光滑脂多糖的O-多糖成分。各种布鲁氏菌生物变种的感染会导致各种家畜和野生动物的流产和不育，并导致人类衰弱的疾病。诊断依赖于针对O-多糖中表达的A和M抗原的抗体的检测。该分子是稀有单糖4-甲酰胺基-4,6-二脱氧-D-甘露吡喃糖（Rha4NFo）的均聚物。A表位是由均匀的α1,2连接的内部聚合物序列产生的，该序列由限定M抗原的独特的四糖序列所覆盖。唯一的寡糖只能通过化学合成获得，并通过牛血清白蛋白的还原性和非还原性残基揭示了精细特异性的结构基础，该特异性可以区分这些密切相关的A和M表位。推断所有这三种M特异性单克隆抗体（mAb）具有在两端开放的凹槽型结合位点，并将α1,3连接的Rha4NFo二糖识别为三糖表位的一部分，在两个mAb中包括末端Rha4NFo残基。这些抗体之一的结合位点足够大，可以结合多达六个Rha4NFo残基，并且涉及对α1,2连接的Rha4NFo

  DOI：

  10.1039/c7ob00445a

文献信息

• [EN] USE OF FUCOSYLATION INHIBITOR FOR PRODUCING AFUCOSYLATED ANTIBODY<br/>[FR] UTILISATION D'UN INHIBITEUR DE FUCOSYLATION POUR PRODUIRE UN ANTICORPS AFUCOSYLÉ
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2021127414A1

  公开（公告）日：2021-06-24

  The present invention provides inhibitors of fucosylation during protein expression from mammalian cells. The inhibitors are derived from rhamnose and act by inhibition of GDP-mannose 4,6-dehydratase (GMD). The invention further provides methods of making proteins with reduced level of fucosylation, such as antibodies and antibodies made by the methods of the present invention. Such hypofucosylated or nonfucosylated antibodies may find use, for example, in treatment of human disease in which is it therapeutically beneficial to direct antibody dependent cellular cytotoxicity (ADCC) mediated killing of cells expressing the antibody target on their surface, for example in depletion of Tregs in cancer patients using a hypofucosylated or nonfucosylated anti-CTLA-4 antibody.

  本发明提供了在哺乳动物细胞中蛋白质表达过程中抑制富糖基化的抑制剂。这些抑制剂源自鼠李糖，并通过抑制 GDP-甘露糖4,6-脱水酶（GMD）来发挥作用。该发明还提供了制备具有降低富糖基化水平的蛋白质的方法，例如通过本发明的方法制备的抗体和抗体。这种低富糖化或无富糖化的抗体可以在治疗人类疾病中发挥作用，例如在治疗中对表达抗体靶点的细胞进行抗体依赖性细胞毒作用（ADCC）介导的杀伤，例如在癌症患者中使用低富糖化或无富糖化的抗CTLA-4抗体去除Treg细胞。
• Synthesis of a d-rhamnose branched tetrasaccharide, repeating unit of the O-chain from Pseudomonas syringae pv. Syringae (cerasi) 435
  作者：Emiliano Bedini、Antonella Carabellese、Maria Michela Corsaro、Cristina De Castro、Michelangelo Parrilli

  DOI：10.1016/j.carres.2004.06.010

  日期：2004.8

  The first synthesis of a d-rhamnose branched tetrasaccharide, corresponding to the repeating unit of the O-chain from Pseudomonas syringae pv. cerasi 435, as methyl glycoside is reported. The approach used is based on the synthesis of an opportune building-block, that is the methyl 3-O-allyl-4-O-benzoyl-alpha-D-rhamnopyranoside, which was then converted into both a glycosyl acceptor and two different

  d-鼠李糖支链四糖的首次合成，对应于丁香假单胞菌pv的O链重复单元。cerasi 435，因为报道了甲基糖苷。所使用的方法基于适当的构建基的合成，即甲基3-O-烯丙基-4-O-苯甲酰基-α-D-鼠李糖吡喃糖苷，然后将其转化为糖基受体和两个不同的保护基糖基三氯乙酰亚胺供体。这三种化合物的连续偶联提供了目标寡糖。所报道的合成对于进行重复单元的低聚反应也是有用的。
• Synthesis of antigenic determinants of the Brucella a antigen, utilizing methyl 4-azido-4,6-dideoxy-α-d-mannopyranoside efficiently derived from d-mannose
  作者：David R. Bundle、Manfred Gerken、Thomas Peters

  DOI：10.1016/0008-6215(88)85094-8

  日期：1988.3

  A strategy for the synthesis of Brucella O-antigenic determinants containing 2-linked 4,6-dideoxy-4-formamido-alpha-D-mannopyranosyl residues is described. The approach adopted also permits the N-acyl moiety to be varied. A high-yield synthesis of methyl 4-azido-4,6-dideoxy-alpha-D-mannopyranoside from D-mannose on the 10-20-g scale provided the key intermediate. Regioselective acetylation of 7 gave

  描述了一种合成含有2-连接的4,6-二脱氧-4-甲酰胺基-α-D-甘露吡喃糖基残基的布鲁氏菌O抗原决定簇的策略。所采用的方法还允许改变N-酰基部分。由D-甘露糖以10-20g的规模高产率合成甲基4-叠氮基-4,6-二脱氧-α-D-甘露吡喃糖苷提供了关键的中间体。7的区域选择性乙酰化得到2-乙酸酯8，其用三氯乙酰亚胺苄基酯处理后，提供了甲基2-O-乙酰基-4-叠氮基-3-O-苄基-4，6-二脱氧-α-D-甘露吡喃糖苷。该化合物用作糖基供体12和受体10分子的共同前体。三氟甲磺酸银促进的10乘12的糖基化反应产生了二糖衍生物，其经氢解后生成了甲基4-氨基-2-O-（4-氨基-4,6-二脱氧-α-D-甘露吡喃糖基）-4，从中获得N-甲酰基和N-乙酰基衍生物的6-二脱氧-α-D-甘露吡喃糖苷。13脱乙酰基，然后与12进行糖基化，得到三糖衍生物。N-甲酰化的二糖17抑制布鲁氏菌O-多糖与布鲁氏菌特异性单克隆抗体的结合。
• Probe sialidase substrate specificity using chemoenzymatically synthesized sialosides containing C9-modified sialic acid
  作者：Zahra Khedri、Musleh M. Muthana、Yanhong Li、Saddam M. Muthana、Hai Yu、Hongzhi Cao、Xi Chen

  DOI：10.1039/c2cc17393j

  日期：——

  A library of α2–3- and α2–6-linked sialyl galactosides containing C9-modified sialic acids was synthesized from C6-modified mannose derivatives using an efficient one-pot three-enzyme system. These sialosides were used in a high-throughput sialidase substrate specificity assay to elucidate the importance of C9–OH in sialidase recognition.

  利用高效的一锅三酶系统，从 C6 修饰的甘露糖衍生物合成了含有 C9 修饰的硅烷基半乳糖苷的 α2-3 和 α2-6 连接的硅烷基半乳糖苷库。这些半乳糖苷被用于高通量硅糖苷酶底物特异性测定，以阐明 C9-OH 在硅糖苷酶识别中的重要性。
• Synthesis, conformational analysis, and the glycosidic coupling reaction of substituted 2,7-dioxabicyclo[4.1.0]heptanes: 1,2-anhydro-3,4-di-O-benzyl-β-l- and β-d-rhamnopyranoses
  作者：Qian Chen、Fanzuo Kong、Lingxiao Cao

  DOI：10.1016/0008-6215(93)84176-7

  日期：1993.2

  were obtained in high yields. Conformational calculations, which were carried out using vicinal proton-proton coupling constants by the modified Karplus equation, suggested that the conformations of the pyranose rings of the title compounds were basically a half chair (4H5) with some flattening at C-4. Force-field calculations (MMP2) confirmed the experimental conformation with good agreement. The coupling

  由L-鼠李糖合成1,2-脱水-3,4-二-O-苄基-α-鼠李吡喃糖，而D-对映异构体由甲基6-脱氧-2,3-O-异亚丙基-α合成-D-甘露吡喃糖苷。对于这两种合成，关键中间体是2-O-乙酰基-3,4-二-O-苄基-α-D-和-α-L-鼠李糖基吡喃糖基氯，它们是通过氯化从相应的二乙酸酯定量制备的。用叔丁醇钾在氧戊烷中容易地完成氯化物的闭环反应，并以高收率获得了结晶的1,2-脱水-3,4-二-O-苄基-β-D-和β-L-鼠李吡喃糖。 。通过改进的Karplus方程使用邻近质子-质子耦合常数进行的构象计算，这表明标题化合物的吡喃糖环的构象基本上是半椅（4H5），在C-4处有些展平。力场计算（MMP2）证实了实验构象，吻合得很好。1,2-脱水-L-鼠李糖醚与1,2; 3,4-二-O-异亚丙基-α-D-吡喃半乳糖的偶联反应是通过路易斯酸催化在环氧丙烷中进行的，只有α获得了连接的二糖。