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胸苷-5'-三磷酸 | 365-08-2

物质功能分类

生物化工 - 核苷类药物 - 脱氧核苷酸及其类似物

分子结构分类

有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸

中文名称

胸苷-5'-三磷酸

中文别名

脱氧胸苷三磷酸；胸苷-5ˊ-三磷酸；胸腺嘧啶脱氧核糖-5ˊ-三磷酸；脱氧胸苷-5ˊ-三磷酸；三磷酸脱氧胸苷；2'-脱氧胸苷三磷酸；dTTP

英文名称

dTTP

英文别名

Thymidine-5'-triphosphate；[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

CAS

365-08-2

化学式

C₁₀H₁₇N₂O₁₄P₃

mdl

——

分子量

482.171

InChiKey

NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N

BEILSTEIN

——

EINECS

——

物化性质

密度：

1.922±0.06 g/cm3(Predicted)
物理描述：

Solid
碰撞截面：

207.41 Å² [M+Na]+ [CCS Type: DT, Method: stepped-field]

计算性质

辛醇/水分配系数(LogP)：

-5
重原子数：

29
可旋转键数：

8
环数：

2.0
sp3杂化的碳原子比例：

0.6
拓扑面积：

239
氢给体数：

6
氢受体数：

14

安全信息

危险品标志：

Xi
危险类别码：

R36/37/38
WGK Germany：

3
储存条件：

存储条件：2-8℃，密封保存，并保持干燥。

SDS

SDS：24af4a9e56955f9a0fec86ef01b15cdd

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制备方法与用途

脱氧胸苷三磷酸是一种脱氧核酸衍生物，可用于有机合成中间体和医药中间体。它主要应用于实验室的有机合成及生物化工研发过程。

上下游信息

上游原料

中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
[羟基-[[3-羟基-5-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-四氢呋喃-2-基]甲氧基]磷酰]氧基膦酸	2-deoxythymidine diphosphate	491-97-4	C₁₀H₁₆N₂O₁₁P₂	402.191
胸苷酸	thymidine 5'-phosphate	365-07-1	C₁₀H₁₅N₂O₈P	322.211
beta-胸苷	thymidine	146183-25-7	C₁₀H₁₄N₂O₅	242.232
——	3'-O-benzyl-2'-deoxythymidine	63593-01-1	C₁₇H₂₀N₂O₅	332.356
胸苷3'-苯甲酸酯	3'-O-benzoylthymidine	17331-53-2	C₁₇H₁₈N₂O₆	346.34
——	5'-O-tritylthymidine	7791-71-1	C₂₉H₂₈N₂O₅	484.552
——	3'-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine	93966-64-4	C₃₈H₃₆N₂O₈	648.712
——	5'-O-tert-butyldiphenylsilylthymidine	101527-40-6	C₂₆H₃₂N₂O₅Si	480.636

下游产品

中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
[羟基-[[3-羟基-5-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)-四氢呋喃-2-基]甲氧基]磷酰]氧基膦酸	2-deoxythymidine diphosphate	491-97-4	C₁₀H₁₆N₂O₁₁P₂	402.191
(二羟基亚氨磷酰氧基-羟基-磷酰)[(2R,3S,5R)-3-羟基-5-(5-甲基-2,4-二氧代-嘧啶-1-基)四氢呋喃-2-基]甲基磷酸氢酯	Thymidine 5'-(alpha,beta-imido)triphosphate	141171-14-4	C₁₀H₁₈N₃O₁₃P₃	481.187
胸苷酸	thymidine 5'-phosphate	365-07-1	C₁₀H₁₅N₂O₈P	322.211
——	Thymidine-5'-diphospho-beta-D-xylose	——	C₁₅H₂₄N₂O₁₅P₂	534.307
——	[(2R,3R,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl] [hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate	1006037-45-1	C₁₅H₂₄N₂O₁₅P₂	534.307
——	thymidine 5'-(2-deoxy-α-D-glucopyranosyl diphosphate)	289902-34-7	C₁₆H₂₆N₂O₁₅P₂	548.334
——	2'-Deoxythymidine-5'-diphospho-(4''-deoxy-α-D-xylo-hexopyranose)	——	C₁₆H₂₆N₂O₁₅P₂	548.334
胸苷二磷酸酯-L-鼠李糖	thymidine 5'-diphospho-β-L-rhamnose	2147-59-3	C₁₆H₂₆N₂O₁₅P₂	548.334
——	dTDP-β-L-fucose	——	C₁₆H₂₆N₂O₁₅P₂	548.334
[(2R,3S,5R)-3-羟基-5-(5-甲基-2,4-二氧代-3,4-二氢-1(2H)-嘧啶基)四氢-2-呋喃基]甲基(3R,4S,5S,6R)-3,4,5-三羟基-6-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-2-基二氢二磷酸酯	thymidine 5'-(α-D-glucopyranosyl diphosphate)	2196-62-5	C₁₆H₂₆N₂O₁₆P₂	564.334
——	dTDP-D-glucose	——	C₁₆H₂₆N₂O₁₆P₂	564.334
——	dTDP-α-D-galactose	5817-97-0	C₁₆H₂₆N₂O₁₆P₂	564.334
——	dTDP-α-D-mannose	——	C₁₆H₂₆N₂O₁₆P₂	564.334
——	3-O-methyl-dTDP-α-D-glucose	515138-66-6	C₁₇H₂₈N₂O₁₆P₂	578.361
——	3-O-butyl-dTDP-α-D-glucose	1013650-34-4	C₂₀H₃₄N₂O₁₆P₂	620.441
——	3-O-hexyl-dTDP-α-D-glucose	1013650-35-5	C₂₂H₃₈N₂O₁₆P₂	648.495
——	3-O-octyl-dTDP-α-D-glucose	1013650-36-6	C₂₄H₄₂N₂O₁₆P₂	676.549
——	3-O-dodecyl-dTDP-α-D-glucose	1013650-37-7	C₂₈H₅₀N₂O₁₆P₂	732.656
——	3-O-hexadecyl-dTDP-α-D-glucose	1013650-38-8	C₃₂H₅₈N₂O₁₆P₂	788.764
——	3-O-(2-methylpropyl)-dTDP-α-D-glucose	1013650-39-9	C₂₀H₃₄N₂O₁₆P₂	620.441
——	3-O-(2-ethylbutyl)-dTDP-α-D-glucose	1013650-40-2	C₂₂H₃₈N₂O₁₆P₂	648.495
——	dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose	7132-58-3	C₁₆H₂₄N₂O₁₅P₂	546.318
tdp-4-酮-6-脱氧-D-葡萄糖	dTDP-4-keto-6-deoxy-α-D-glucose	16752-71-9	C₁₆H₂₄N₂O₁₅P₂	546.318
2'-脱氧胞苷三磷酸	2'-deoxycytidine 5'-triphosphate	2056-98-6	C₉H₁₆N₃O₁₃P₃	467.16
——	Thymidine 5'-(6-amino-6-deoxy-α-D-glucopyranosyl diphosphate)	345197-38-8	C₁₆H₂₇N₃O₁₅P₂	563.349
——	dTDP-3-dehydro-6-deoxy-alpha-D-galactose	603998-22-7	C₁₆H₂₄N₂O₁₅P₂	546.318
——	2'-Deoxythymidine-5'-diphospho-(4''-amino-4''-deoxy-α-D-glucopyranose)	172474-01-0	C₁₆H₂₇N₃O₁₅P₂	563.349
——	dTDP-3-amino-3,6-dideoxy-D-glucose	214918-41-9	C₁₆H₂₇N₃O₁₄P₂	547.35
——	dTDP-3-amino-3,6-dideoxy-D-galactose	603998-23-8	C₁₆H₂₇N₃O₁₄P₂	547.35
——	Thymidine 5'-(3-amino-3-deoxy-α-D-glucopyranosyl diphosphate)	345197-36-6	C₁₆H₂₇N₃O₁₅P₂	563.349
——	[(2R,3R,4S,5S,6R)-6-(azidomethyl)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl] [hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate	515138-65-5	C₁₆H₂₅N₅O₁₅P₂	589.347
——	TDP-glucuronic acid	470467-64-2	C₁₆H₂₄N₂O₁₇P₂	578.317
——	dTDP-α-D-glucosamine	——	C₁₆H₂₇N₃O₁₅P₂	563.349
——	Dtdp-3-N-Methylamino-3,6-Dideoxygalactose	1287661-42-0	C₁₇H₂₉N₃O₁₄P₂	561.376
——	dTDP-D-ravidosamine	1287661-43-1	C₁₈H₃₁N₃O₁₄P₂	575.403
P(1)-(腺苷-5')-P(5)-(胸苷-5')-五磷酸酯	adenosine(2'-deoxythymidyne) 5',5'''-P¹,P⁴-tetraphosphate	13457-68-6	C₂₀H₂₉N₇O₂₀P₄	811.38
——	GTDP-GalNAc	516471-26-4	C₁₈H₂₉N₃O₁₆P₂	605.386
2'-脱氧腺苷 5'-三磷酸酯	dATP	1927-31-7	C₁₀H₁₆N₅O₁₂P₃	491.185
5’-三磷酸腺苷	ATP	56-65-5	C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃	507.184

反应信息

作为反应物：

描述：

胸苷-5'-三磷酸在 3,3,3-膦三基三丙酸、 Saccharomyces cerevisiae exopolyphosphatase 1 、 sodium chloride 、 magnesium chloride 作用下，以 aq. buffer 为溶剂，生成磷酸

参考文献：

名称：

A Continuous Enzyme-Coupled Assay for Triphosphohydrolase Activity of HIV-1 Restriction Factor SAMHD1

摘要：

摘要开发基于脱氧核苷三磷酸酯（dNTP）的药物需要定量了解脱靶细胞酶的抑制、激活或水解作用。SAMHD1 是一种调节性 dNTP-三磷酸水解酶，能抑制 HIV-1 在人类骨髓细胞中的复制。我们在此介绍一种酶耦合测定法，用于量化三磷酸水解酶对 dNTP、核苷酸类似物和核苷酸类似物抑制剂的激活、抑制和水解作用。该测定有助于对三磷酸水解酶进行机理研究，并对基于核苷酸的抗病毒和化疗药物的脱靶效应进行量化。

DOI：

10.1128/aac.03903-14
作为产物：

描述：

beta-胸苷在磷酸三甲酯、 1,8-双二甲氨基萘、三氯氧磷、三正丁胺作用下，以 N,N-二甲基甲酰胺为溶剂，反应 12.0h，生成胸苷-5'-三磷酸

参考文献：

名称：

合成核苷酸或核苷酸类似物的方法

摘要：

本发明提出了一种合成核苷酸或核苷酸类似物的方法。该方法包括将核苷与磷酸盐、焦磷酸盐或三聚磷酸盐在相转移催化剂的催化下发生亲核取代反应，以便获得所述核苷酸或核苷酸类似物，所述磷酸盐、焦磷酸盐或三聚磷酸盐为非磷酸铵盐，其中，所述核苷具有式(I)所示的结构或式(I)所示结构的立体异构体、互变异构体、药学上可接受的盐或它的前药，

公开号：

CN113512083A
作为试剂：

描述：

3-溴荧蒽在 potassium carbonate 、胸苷-5'-三磷酸作用下，以四氢呋喃、水为溶剂，生成

参考文献：

名称：

함질소 헤테로환 화합물 및 이를 이용한 유기 발광 소자

摘要：

本规范涉及含氮杂环化合物及其在有机发光器件中的应用。

公开号：

KR20160034832A

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文献信息

[EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS OF PHOSPHORYLATED MOLECULES [FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE DE MOLÉCULES PHOSPHORYLÉES

申请人：UNIV CALIFORNIA

公开号：WO2019195494A1

公开（公告）日：2019-10-10

The invention provides compositions and methods for synthesis of phosphorylated organic compounds, including nucleoside triphosphates.

这项发明提供了合成磷酸化有机化合物的组合物和方法，包括核苷三磷酸。
[EN] NUCLEOTIDE AND NUCLEOSIDE THERAPEUTIC COMPOSITIONS AND USES RELATED THERETO [FR] COMPOSITIONS THÉRAPEUTIQUES À BASE DE NUCLÉOTIDES ET NUCLÉOSIDES ET UTILISATIONS ASSOCIÉES

申请人：UNIV EMORY

公开号：WO2017155923A1

公开（公告）日：2017-09-14

This disclosure relates to nucleotide and nucleoside therapeutic compositions and uses in treating infectious diseases, viral infections, and cancer, where the base of the nucleotide or nucleoside contains at least one thiol, thione or thioether.

这份披露涉及到核苷酸和核苷类治疗组合物，用于治疗传染病、病毒感染和癌症，在这些组合物中，核苷酸或核苷的碱基至少含有一个硫醇、硫酮或硫醚。
[EN] ALKYNE CONTAINING NUCLEOTIDE AND NUCLEOSIDE THERAPEUTIC COMPOSITIONS AND USES RELATED THERETO [FR] COMPOSITIONS THÉRAPEUTIQUES À BASE DE NUCLÉOTIDES ET NUCLÉOSIDES CONTENANT UN ALCYNE ET UTILISATIONS ASSOCIÉES

申请人：UNIV EMORY

公开号：WO2017189978A1

公开（公告）日：2017-11-02

This disclosure relates to nucleotide and nucleoside therapeutic compositions and uses in treating infectious diseases, viral infections, and cancer, where the base of the nucleotide or nucleoside contains at least one thiol, thione or thioether.

这份披露涉及到核苷酸和核苷类治疗组合物，用于治疗传染病、病毒感染和癌症，其中核苷酸或核苷的碱基至少含有一个硫醇、硫酮或硫醚。
[EN] NUCLEOTIDE AND NUCLEOSIDE COMPOSITIONS AND USES RELATED THERETO [FR] COMPOSITIONS À BASE DE NUCLÉOTIDE ET DE NUCLÉOSIDE ET UTILISATIONS CORRESPONDANTES

申请人：UNIV EMORY

公开号：WO2015038596A1

公开（公告）日：2015-03-19

This disclosure relates to nucleotide and nucleoside therapeutic compositions and uses in treating infectious diseases, viral infections, and cancer, where the base of the nucleotide or nucleoside contains at least one thiol, thione or thioether.

这份披露涉及到核苷酸和核苷类治疗组合物，用于治疗传染病、病毒感染和癌症，在这些组合物中，核苷酸或核苷的碱基至少含有一个硫醇、硫酮或硫醚。
Characterization and Mechanistic Studies of DesII: A Radical S-Adenosyl-<scp>l</scp>-methionine Enzyme Involved in the Biosynthesis of TDP-<scp>d</scp>-Desosamine

作者：Ping-Hui Szu、Mark W. Ruszczycky、Sei-hyun Choi、Feng Yan、Hung-wen Liu

DOI：10.1021/ja903354k

日期：2009.10.7

Previous genetic and biochemical studies of the biosynthesis of desosamine in S. venezuelae showed that the conversion of TDP-4-amino-4,6-dideoxy-D-glucose (8) to TDP-3-keto-4,6-dideoxy-D-glucose (9) is catalyzed by DesII, which is a member of the radical S-adenosyl-L-methionine (SAM) enzyme superfamily. Here, we report the purification and reconstitution of His(6)-tagged DesII, characterization of its [4Fe-4S]

D-脱糖胺 (1) 是一种 3-(N,N-二甲氨基)-3,4,6-三脱氧己糖，存在于多种大环内酯类抗生素中，包括甲霉素 (2)、新甲霉素 (3)、匹克霉素 (4) 和纳博霉素(5)由委内瑞拉链霉菌产生。它在赋予其亲本苷元生物活性方面发挥着重要作用。以前对委内瑞拉沙门氏菌中去糖胺生物合成的遗传和生化研究表明，TDP-4-AMino-4,6-dideoxy-D-glucose (8) 转化为 TDP-3-keto-4,6-dideoxy- D-葡萄糖 (9) 由 DesII 催化，DesII 是自由基 S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 酶超家族的成员。在这里，我们报告了 His(6) 标记的 DesII 的纯化和重建，使用 UV-vis 和 EPR 光谱对其 [4Fe-4S] 簇的表征，以及黄素氧还蛋白、黄素氧还蛋白还原酶、和 NADPH 以减少 [4Fe-4S](2+) 簇。还包括 DesII