尿苷二磷酸酯甘露糖 | 16375-64-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 中文名称: 尿苷二磷酸酯甘露糖
• 英文名称: uridine 5'-diphospho-α-D-mannopyranoside
• 英文别名: UDP-Man；Uridine diphosphate mannose；Uridine-5'-diphosphate-mannose；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(2R,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 16375-64-7
• 化学式: C₁₅H₂₄N₂O₁₇P₂
• 分子量: 566.306
• InChiKey: HSCJRCZFDFQWRP-NYYOCOOHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.97±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.3
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  292
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-甲基伞形-β-D-乳吡喃糖苷 、 尿苷二磷酸酯甘露糖 在 β1-3-N-acetylglucosaminyltransferase from Helicobacter pylori 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 24.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  细菌β1-3-N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶的供体底物混杂度和β1-4-半乳糖基转移酶的受体底物柔韧性。

  摘要：

  beta1-3-N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶（beta3GlcNAcTs）和beta1-4-半乳糖基转移酶（beta4GalTs）已广泛用于酶法合成含N-乙酰乳糖胺（LacNAc）的寡糖和包括聚LacNAc和乳糖（N-新四糖）的糖缀合物LNnT）存在于人类和其他哺乳动物的乳汁中。为了探索可以通过β3GlcNAcT和β4GalT的组合合成的寡糖和衍生物，分别使用39个糖核苷酸库对来自幽门螺杆菌（Hpbeta3GlcNAcT）和脑膜炎奈瑟氏球菌（NmLgtA）的两种细菌β3GlcNAcT的供体底物特异性进行了研究。执行。这两个beta3GlcNAcT具有互补的供体底物混杂，并产生了13种不同的三糖。他们分别用来研究三种脑膜炎奈瑟氏球菌（NmLgtB），幽门螺杆菌（Hpbeta4GalT）和牛（Bbeta4GalT）的beta4GalT的受体底物特异性。13种三糖中有10种被证明是这些beta4

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.02.043
• 作为产物：
  描述：

  Α-D-五乙酸甘露糖酯 在 水 、 三溴化磷 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 27.5h， 生成 尿苷二磷酸酯甘露糖
  参考文献：
  名称：

  Stereoselective Chemical Synthesis of Sugar Nucleotides via Direct Displacement of Acylated Glycosyl Bromides

  摘要：

  The use of Leloir glycosyltransferases to prepare biologically relevant oligosaccharides and glycoconjugates requires access to sugar nucleoside diphosphates, which are notoriously difficult to efficiently synthesize and purify. We report a novel stereoselective route to UDP- and GDP-alpha-d-mannose as well as UDP- and GDP-beta-l-fucose via direct displacement of acylated glycosyl bromides with nucleoside 5'-diphosphates.

  DOI：

  10.1021/ol063068d

文献信息

• Efficient one-pot multienzyme synthesis of UDP-sugars using a promiscuous UDP-sugar pyrophosphorylase from Bifidobacterium longum (BLUSP)
  作者：Musleh M. Muthana、Jingyao Qu、Yanhong Li、Lei Zhang、Hai Yu、Li Ding、Hamed Malekan、Xi Chen

  DOI：10.1039/c2cc17577k

  日期：——

  A promiscuous UDP-sugar pyrophosphorylase (BLUSP) was cloned from Bifidobacterium longum strain ATCC55813 and used efficiently with a Pasteurella multocida inorganic pyrophosphatase (PmPpA) with or without a monosaccharide 1-kinase for one-pot multienzyme synthesis of UDP-galactose, UDP-glucose, UDP-mannose, and their derivatives. Further chemical diversification of a UDP-mannose derivative resulted in the formation of UDP-N-acetylmannosamine.

  从双歧杆菌（Bifidobacterium longum）ATCC55813株中克隆得到一种非特异的UDP-糖焦磷酸化酶（BLUSP），并将其与巴氏杆菌（Pasteurella multocida）的无机焦磷酸酶（PmPpA）有效配合使用，无论是否加入单糖1-激酶，都能实现UDP-半乳糖、UDP-葡萄糖、UDP-甘露糖及其衍生物的一锅法多酶合成。进一步对UDP-甘露糖衍生物进行化学修饰，形成了UDP-N-乙酰甘露糖胺。
• Active-site engineering of nucleotidylyltransferases and general enzymatic methods for the synthesis of natural and "unnatural" UDP- and TDP-nucleotide sugars
  申请人：——

  公开号：US20030055235A1

  公开（公告）日：2003-03-20

  The present invention provides mutant nucleotidylyl-transferases, such as E p , having altered substrate specificity; methods for their production; and methods of producing nucleotide sugars, which utilize these nucleotidylyl-transferases. The present invention also provides methods of synthesizing desired nucleotide sugars using natural and/or modified Ep or other nucleotidyltransferases; and nucleotide sugars sythesized by the present methods. The present invention further provides new glycosyl phosphates, and methods for making them.

  本发明提供了一种突变型核苷酸转移酶，如E p ，具有改变的底物特异性；其生产方法；以及利用这些核苷酸转移酶生产核苷酸糖的方法。本发明还提供了使用天然和/或修饰的Ep或其他核苷酸转移酶合成所需的核苷酸糖的方法；以及通过本发明方法合成的核苷酸糖。本发明进一步提供了新的糖基磷酸酯，及其制造方法。
• Exploring the broad nucleotide triphosphate and sugar-1-phosphate specificity of thymidylyltransferase Cps23FL from <i>Streptococcus pneumonia</i> serotype 23F
  作者：Siqiang Li、Hong Wang、Guoxia Jin、Zonggang Chen、Guofeng Gu

  DOI：10.1039/d0ra05799a

  日期：——

  is the initial enzyme that catalyses the thymidylyl transfer reaction in prokaryotic deoxythymidine diphosphate-L-rhamnose (dTDP-Rha) biosynthetic pathway. In this study, the broad substrate specificity of Cps23FL towards six glucose-1-phosphates and nine nucleoside triphosphates as substrates was systematically explored, eventually providing access to nineteen sugar nucleotide analogs.

  来自肺炎链球菌血清型 23F 的葡萄糖-1-磷酸胸苷转移酶 (Cps23FL)是在原核脱氧胸苷二磷酸-L-鼠李糖 (dTDP-Rha) 生物合成途径中催化胸苷转移反应的初始酶。在这项研究中，系统地探索了 Cps23FL 对六种葡萄糖 1-磷酸和九种三磷酸核苷作为底物的广泛底物特异性，最终提供了对 19 种糖核苷酸类似物的访问。
• Phosphomannose isomerase/GDP-mannose pyrophosphorylase from Pyrococcus furiosus: a thermostable biocatalyst for the synthesis of guanidinediphosphate-activated and mannose-containing sugar nucleotides
  作者：Rahman M. Mizanur、Nicola L. B. Pohl

  DOI：10.1039/b822794b

  日期：——

  Herein we present an analysis of the chemical function of a recombinant bifunctional phosphomannose isomerase/GDP-mannose pyrophosphorylase (manC) from Pyrococcus furiosusDSM 3638 and its use in the synthesis of guanidinediphospho-hexoses and a range of nucleotidediphospho-mannoses. This enzyme is unusually promiscuous in both its nucleotide triphosphate (NTP) and sugar-1-phosphate acceptance. It accepts all five naturally occurring NTPs (ATP, CTP, GTP, dTTP and UTP) and a range of sugar-1-phosphates (glucose-, mannose-, galactose-, glucosamine-, N-acetylglucosamine- and fucose-1-phosphate). A truncated GDP-mannose pyrophosphorylase domain of the whole length enzyme showed almost 100-fold less sugar nucleotidyltransferase activity with only GTP and mannose 1-phosphate as substrates. The temperature stability and inherently broad substrate tolerance of this archaeal enzyme make it an effective reagent for the rapid chemoenzymatic synthesis of a range of natural and unnatural sugar nucleotides that are challenging to make by chemical means alone.

  在本文中，我们分析了来自 Pyrococcus furiosusDSM 3638 的重组双功能磷甘露糖异构酶/GDP-甘露糖焦磷酸化酶（manC）的化学功能，以及它在合成鸟苷酸二磷六糖和一系列核苷酸二磷甘露糖中的应用。这种酶在接受核苷酸三磷酸（NTP）和糖-1-磷酸方面都异常杂乱。它能接受所有五种天然存在的 NTP（ATP、CTP、GTP、dTTP 和 UTP）和一系列糖-1-磷酸（葡萄糖、甘露糖、半乳糖、葡萄糖胺、N-乙酰葡萄糖胺和岩藻糖-1-磷酸）。全长酶的截短 GDP-甘露糖焦磷酸化酶结构域在仅以 GTP 和 1-磷酸甘露糖为底物的情况下，糖核苷酸转移酶活性几乎降低了 100 倍。这种古菌酶的温度稳定性和固有的广泛底物耐受性使其成为一种有效的试剂，可用于快速化学合成一系列天然和非天然糖核苷酸，而这些糖核苷酸很难通过化学方法单独制造。
• Structure−Activity Relationship of Uridine 5‘<b>-</b>Diphosphoglucose Analogues as Agonists of the Human P2Y₁₄ Receptor
  作者：Hyojin Ko、Ingrid Fricks、Andrei A. Ivanov、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm061222w

  日期：2007.5.1

  moieties abolished activity; this is among the least permissive P2Y receptors. However, a 2-thiouracil modification in 15 (EC50 49 +/- 2 nM) enhanced the potency of UDPG (but not UDP-glucuronic acid) by 7-fold. 4-Thio analogue 13 was equipotent to UDPG, but S-alkylation was detrimental. Compound 15 was docked in a rhodposin-based receptor homology model, which correctly predicted potent agonism of UDP-fructose

  UDP葡萄糖（UDPG）及其衍生物是Gi蛋白偶联的P2Y14受体的天然激动剂，它存在于免疫系统中。我们合成并表征了在碱基，核糖和葡萄糖部分修饰的UDPG的药理学新类似物，作为结合建模设计新配体的基础。通过工程化的Galpha-q / i蛋白将在COS-7细胞中表达的重组人P2Y14受体与磷脂酶C偶联。尿嘧啶或核糖部分的大多数修饰废除了活性。这是最不被允许的P2Y受体之一。然而，在15（EC50 49 +/- 2 nM）中的2-硫尿嘧啶修饰将UDPG（而不是UDP-葡萄糖醛酸）的效力提高了7倍。4-硫代类似物13与UDPG等价，但是S-烷基化是有害的。化合物15停靠在基于罗丹蛋白的受体同源性模型中，该模型正确预测了UDP-果糖，UDP-甘露糖和UDP-肌醇的有效激动作用。UDPG的己糖部分与多个H键和带电荷的残基相互作用，并为激动剂修饰提供了肥沃的区域。