胞苷 3',5'-二磷酸酯 | 2922-94-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 中文名称: 胞苷 3',5'-二磷酸酯
• 中文别名: 胞苷3',5'-二磷酸酯
• 英文名称: cytidine 3',5'-bis(monophosphate)
• 英文别名: deoxycytidine 3',5'-diphosphate；O^5'-phosphono-[3']cytidylic acid；Cytidin-3',5'-diphosphorsaeure；Cytidin-2',5'-diphosphat；Cytidin-3',5'-diphosphat；Cytidine 3',5'-diphosphate；[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] dihydrogen phosphate
• CAS: 2922-94-3
• 化学式: C₉H₁₅N₃O₁₁P₂
• 分子量: 403.179
• InChiKey: MVGIITUCOOTSAP-XVFCMESISA-N

物化性质

• 沸点：
  811.1±75.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.35±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  222
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-O-t-butyldimethylsilylcytidylyl (3'-> 5') adenosine 5'-monophosphate 在 RNase T₂ 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 胞苷 3',5'-二磷酸酯
  参考文献：
  名称：

  制备'2，（'3）-O-酰基-pCpA衍生物作为T4 RNA连接酶介导的“化学氨基酰化”的底物

  摘要：

  描述了'2（'3）-O-（氨基）酰基-pCpA衍生物的合成，并对其产物进行了化学表征，并在存在E的情况下作为T4 RNA连接酶的底物。大肠杆菌tRNA phe -C OH。如此衍生的修饰的（N-乙酰氨基）酰基-tRNA的特征在于其色谱和生化性质，以及它们在肽基转移酶反应中充当P-位tRNA供体的能力。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(84)85106-6

文献信息

• Phosphorylation of Nucleotides with Inorganic Cyclo-Triphosphate
  作者：Mitsutomo Tsuhako、Rumi Kunitomi、Yoshinobu Baba、Tohru Miyajima

  DOI：10.1246/bcsj.64.490

  日期：1991.2

  5′-bis(monophosphate) (2′,5′-NDP’s), nucleoside 3′,5′-bis(monophosphate) (3′,5′-NDP’s), and nucleoside 2′,3′-cyclic 5′-bis(monophosphate) (cNDP’s). (2) The phosphorylation of 5′-NMP’s was strongly dependent on mixing ratio, pH, reaction temperature, and time. Under conditions of high mixing ratios of P3m to 5′-NMP’s (5:1–10:1), high pH (12), and room temperature, 92–98% of 5′-NMP’s was converted into 3′,5′-NDP’s and

  在各种条件下（P3m 与核苷酸的混合比、pH 值）在水溶液中研究了核苷酸（核苷 3'-和 5'-单磷酸酯，以及 2'-脱氧核苷 5'-单磷酸酯）与无机环三磷酸钠 (P3m) 的磷酸化、反应温度和时间）。(I) 未受保护的 5'-单磷酸核苷 (5'-NMP's) 很容易在顺式 2',3'-二醇处被 P3m 磷酸化，形成选择性核苷 2',5'-双（单磷酸）（2',5 '-NDP's）、核苷 3',5'-双（单磷酸）（3',5'-NDP）和核苷 2',3'-环状 5'-双（单磷酸）（cNDP）。(2) 5'-NMP's 的磷酸化强烈依赖于混合比、pH、反应温度和时间。在 P3m 与 5'-NMP's 的高混合比 (5:1–10:1)、高 pH (12) 和室温条件下，92-98% 的 5'-NMP's 转化为 3',5' -NDP 和 2'，大致等摩尔量的 5'-NDP。(3) 在 5'-NMP's
• MODIFIED NUCLEOTIDES METHODS AND KITS
  申请人：Etienne Christopher L.

  公开号：US20120252691A1

  公开（公告）日：2012-10-04

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修饰核苷酸及其修饰方法，使用含有生物素等标记的基团修饰核苷酸，使其能够被检测，从而得到修饰后的核苷酸，并且使用修饰后的核苷酸进行定量和定性分析的方法。
• Modified Nucleotides Methods and Kits
  申请人：Pierce Biotechnology, Inc.

  公开号：EP2669291A1

  公开（公告）日：2013-12-04

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays. The modified nucleotide compound having the structure (I): (P1)(P2)-Nucleoside(Nus)-Connecting Group (Alk)-Linking Group (Lnk)-Observable Label (Obs) (I).

  修改核苷酸，以及使用可以检测它们并导致修改核苷酸的基团或标签（例如生物素）来修改核苷酸的方法，以及在定量和定性分析中使用修改核苷酸的方法。具有结构（I）的修改核苷酸化合物：（P1）（P2）-核苷（Nus）-连接基团（Alk）-连接基团（Lnk）-可观察标签（Obs）（I）。
• MODIFIED NUCLEOTIDES
  申请人：Opperman Kay

  公开号：US20110262917A1

  公开（公告）日：2011-10-27

  Modified nucleotides, and methods to modify nucleotides with a moiety or label, such as biotin, that permits their detection and results in a modified nucleotide, and methods of use of the modified nucleotide in quantitative and qualitative assays.

  修改核苷酸，以及使用分子或标记（如生物素）修饰核苷酸的方法，使其能够被检测并产生修改的核苷酸，以及在定量和定性分析中使用修改的核苷酸的方法。
• Method for detection of specific nucleic acid sequences
  申请人：SYNTEX (U.S.A.) INC.

  公开号：EP0357336A2

  公开（公告）日：1990-03-07

  A method is disclosed for detecting the presence of a target nucleotide sequence in a polynucleotide. The method comprises hybridizing a first nucleotide sequence and a second nucleotide sequence to non-contiguous portions of a target nucleotide sequence, covalently attaching the first and second sequences when they are hybridized to the target sequence, and determining the presence of covalently attached first and second sequences. The presence of the covalently attached first and second sequences is related to the presence of the target nucleotide sequence. The invention may be applied to target nucleotide sequences in DNA or RNA. Specific target nucleotide sequences of interest will frequently be characteristic of particular microorganisms, viruses, viroids, or genetic characteristics, including genetic abnormalities.

  本发明公开了一种检测多核苷酸中是否存在目标核苷酸序列的方法。该方法包括将第一核苷酸序列和第二核苷酸序列与目标核苷酸序列的非连续部分杂交，当第一序列和第二序列与目标序列杂交时将它们共价连接，并确定共价连接的第一序列和第二序列的存在。共价连接的第一和第二序列的存在与靶核苷酸序列的存在有关。本发明可应用于 DNA 或 RNA 中的靶核苷酸序列。感兴趣的特定靶核苷酸序列往往是特定微生物、病毒、病毒或遗传特征（包括遗传异常）的特征。