脱氧尿苷 5'-三磷酸酯 | 1173-82-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 中文名称: 脱氧尿苷 5'-三磷酸酯
• 中文别名: 脱氧尿苷5'-三磷酸酯；2'-脱氧尿苷-5'-三磷酸
• 英文名称: 2'-deoxyuridine-5'-triphosphate
• 英文别名: dUTP；Deoxyuridine triphosphate；[[(2R,3S,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 1173-82-6
• 化学式: C₉H₁₅N₂O₁₄P₃
• 分子量: 468.144
• InChiKey: AHCYMLUZIRLXAA-SHYZEUOFSA-N

物化性质

• 密度：
  2.010±0.06 g/cm3(Predicted)
• 物理描述：
  Solid
• 碰撞截面：
  185.3 Ų [M+Na]+ [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.5
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  239
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

ADMET

代谢

有机磷化合物的代谢主要通过氧化、通过酯酶的水解以及与谷胱甘肽反应进行。去甲基化和葡萄糖醛酸化也可能发生。有机磷农药的氧化可能导致产生中等毒性的产物。一般来说，磷酰硫酯本身并不直接有毒，但需要通过氧化代谢转化为近端毒素。谷胱甘肽转移酶反应产生的产物在大多数情况下毒性较低。对氧磷酶（PON1）是有机磷化合物代谢中的关键酶。PON1可以通过水解使一些有机磷化合物失活。PON1水解多种有机磷杀虫剂以及神经毒剂（如梭曼、沙林和VX）的活性代谢物。PON1的多态性导致该酯酶的酶水平和催化效率存在差异，这反过来表明不同个体可能更容易受到有机磷暴露的毒性影响。

Metabolism of organophosphates occurs principally by oxidation, by hydrolysis via esterases and by reaction with glutathione. Demethylation and glucuronidation may also occur. Oxidation of organophosphorus pesticides may result in moderately toxic products. In general, phosphorothioates are not directly toxic but require oxidative metabolism to the proximal toxin. The glutathione transferase reactions produce products that are, in most cases, of low toxicity. Paraoxonase (PON1) is a key enzyme in the metabolism of organophosphates. PON1 can inactivate some organophosphates through hydrolysis. PON1 hydrolyzes the active metabolites in several organophosphates insecticides as well as, nerve agents such as soman, sarin, and VX. The presence of PON1 polymorphisms causes there to be different enzyme levels and catalytic efficiency of this esterase, which in turn suggests that different individuals may be more susceptible to the toxic effect of organophosphate exposure.

来源:Toxin and Toxin Target Database (T3DB)

毒理性

• 毒性总结

脱氧尿苷三磷酸（dUTP）可能会错误地并入DNA并导致DNA损伤。由dUTP引起的DNA损伤程度取决于焦磷酸酶dUTPase和尿嘧啶-DNA糖基酶（UDG）的水平。由于dUTP的错误掺入导致的DNA损伤高度依赖于焦磷酸酶dUTPase的水平，后者限制了细胞内dUTP的积累。（A4337）此外，一些细胞系中由于胸腺嘧啶合成酶（TS）抑制后dUTP的积累和随后的尿嘧啶错误掺入DNA，会导致细胞活力的丧失。（PMCID: PMC2364072）

Deoxyuridine triphosphate (dUTP) can be misincorporated into DNA and cause DNA damage. The extent of DNA damage caused by dUTP is dependent on the levels of the pyrophosphatase dUTPase and uracil-DNA glycosylase (UDG). DNA damage due to dUTP misincorporation is highly dependent on the levels of the pyrophosphatase dUTPase, which limits intracellular accumulation of dUTP. (A4337) Also, loss of viability following thymidylate synthase (TS) inhibition occurs as a consequence of accumulation of dUTP in some cell lines and subsequent misincorporation of uracil into DNA. (PMCID: PMC2364072)

来源:Toxin and Toxin Target Database (T3DB)

毒理性

• 致癌物分类

对人类无致癌性（未列入国际癌症研究机构IARC清单）。

No indication of carcinogenicity to humans (not listed by IARC).

来源:Toxin and Toxin Target Database (T3DB)

安全信息

• 危险类别码：
  R36/37/38

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  脱氧尿苷 5'-三磷酸酯 在 N-碘代丁二酰亚胺 、 sodium azide 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 15.0h， 以79%的产率得到[(2R,3S,5R)-3-羟基-5-(5-碘-2,4-二氧代嘧啶-1-基)四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯
  参考文献：
  名称：

  一种新的有效的立体选择性方法，使用钯催化的Heck反应合成（E）-5-氨基烯丙基-嘧啶-5'-三磷酸酯。

  摘要：

  描述了一种从商业上可获得的嘧啶-5'-三磷酸酯开始合成（E）-5-氨基烯丙基-嘧啶-5'-三磷酸酯的有效的总体两步策略。该方法包括嘧啶-5'-三磷酸的区域选择性碘化，然后钯催化的Heck与烯丙胺的偶联。催化反应是高度立体选择性的，并且与反应物中存在的许多官能团相容。

  DOI：

  10.1080/15257770.2014.978013
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 吡啶 、 水 、 碘 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 脱氧尿苷 5'-三磷酸酯
  参考文献：
  名称：

  一种核苷四磷酸的合成方法

  摘要：

  本发明公开了一种核苷四磷酸的合成方法。所述方法包括以下步骤：将核苷与环状磷酸化试剂发生选择性磷酸化反应，再经氧化、水解开环，即得所述核苷四磷酸。所述环状磷酸化试剂的结构如式I所示：式I。本方法将核苷在该高选择性磷酸化试剂作用下,选择性地生成5＇‑核苷四磷酸，在此过程中并不需要将3＇‑OH(以及2＇‑OH)保护起来，即能有效抑制3＇(以及2＇‑)四磷酸的生成。本发明合成的核苷四磷酸在DNA测序、标记、延伸等生物学领域具有广泛用途，目前其销售价格昂贵，合成方法复杂，反应选择性差；而本发明提供的合成方法选择性好，容易分离纯化，且所需实验条件简单，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。

  公开号：

  CN109232693A
• 作为试剂：
  描述：

  5-aminoallyl-2-deoxyuridine-5'-triphosphate 、 、 、 三乙胺 在 SEPHADEX 、 nucleotide 、 脱氧尿苷 5'-三磷酸酯 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 以to give the fluorescent nucleotide conjugate as an orange solid (Compound 107) Alternatively a fluorescent conjugate (Compound 108) of deoxyuridine-5′-triphosphate的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of fluorinated xanthene derivatives

  摘要：

  提供了易于合成的氟代间苯二酚和氨基酚衍生物的方法，产率良好且无异构体。这些新颖的方法使用通常可获得的前体和标准实验室试剂和设备，以相对较大的数量可重复地生产这些合成有用的试剂。由此产生的氟代间苯二酚和氨基酚在制备氟代荧光素和罗多尔染料方面具有实用性。

  公开号：

  US06229055B1

文献信息

• ANTI-TUMOR EFFECT POTENTIATOR
  申请人：Fukuoka Masayoshi

  公开号：US20120225838A1

  公开（公告）日：2012-09-06

  There is provided an agent for potentiating the effects of an anti-tumor agent. An anti-tumor effect potentiator containing, as an active ingredient, a uracil compound represented by the following formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof: wherein X represents a C 1-5 alkylene group and one of methylene groups constituting the alkylene group is optionally substituted with an oxygen atom; R 1 represents a hydrogen atom or a C 1-6 alkyl group; R 2 represents a hydrogen atom or a halogen atom; and R 3 represents a C 1-6 alkyl group, a C 2-6 alkenyl group, a C 3-6 cycloalkyl group, a (C 3-6 cycloalkyl) C 1-6 alkyl group, a halogeno-C 1-6 alkyl group or a saturated heterocyclic group.

  提供了一种用于增强抗肿瘤药物效果的药剂。 一种抗肿瘤效应增强剂，其包含以下式(I)所代表的尿嘧啶化合物或其药用可接受的盐作为活性成分： 其中X代表一个C1-5烷基基团，构成该烷基基团的亚甲基基团之一可以选择性地被氧原子取代； R1代表氢原子或一个C1-6烷基基团；R2代表氢原子或卤原子；R3代表一个C1-6烷基基团，一个C2-6烯基基团，一个C3-6环烷基基团，一个(C3-6环烷基)C1-6烷基基团，一个卤代C1-6烷基基团或一个饱和杂环基团。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS OF PHOSPHORYLATED MOLECULES<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE DE MOLÉCULES PHOSPHORYLÉES
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2019195494A1

  公开（公告）日：2019-10-10

  The invention provides compositions and methods for synthesis of phosphorylated organic compounds, including nucleoside triphosphates.

  这项发明提供了合成磷酸化有机化合物的组合物和方法，包括核苷三磷酸。
• [EN] NOVEL HYDROGEN PEROXIDE-ACTIVABLE, ANTI-OXIDANT COMPOUNDS AND METHODS USING SAME<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ANTI-OXYDANTS ACTIVABLES PAR PEROXYDE D'HYDROGÈNE, COMPOSÉS ANTI-OXYDANTS ET PROCÉDÉS LES UTILISANT
  申请人：BETH ISRAEL HOSPITAL

  公开号：WO2016073357A1

  公开（公告）日：2016-05-12

  The present invention includes 4-(hydroxymethyl)phenylboronic esters, which react with hydrogen peroxide to form 4-hydroxybenzyl alcohol, which is an anti-inflammatory and/or anti-oxidant compound. In certain embodiments, the compositions of the invention may be used to treat or prevent oxidative stress and/or inflammation, including ischemic disease.

  本发明包括4-(羟甲基)苯硼酸酯，它们与过氧化氢反应形成4-羟基苯甲醇，这是一种抗炎和/或抗氧化剂化合物。在某些实施例中，本发明的组合物可用于治疗或预防氧化应激和/或炎症，包括缺血性疾病。
• [EN] COMBINATION OF CHIMERIC ANTIGEN RECEPTOR THERAPY AND AMINO PYRIMIDINE DERIVATIVES<br/>[FR] THÉRAPIE COMBINÉE PAR RÉCEPTEUR ANTIGÉNIQUE CHIMÉRIQUE ET DÉRIVÉS D'AMINO PYRIMIDINE
  申请人：NOVARTIS AG

  公开号：WO2016164580A1

  公开（公告）日：2016-10-13

  The invention provides compositions and methods for treating diseases associated with expression of CD19, e.g., by administering a recombinant T cell comprising the CD19 CAR as described herein, in combination with a BTK inhibitor, e.g., an amino pyrimidine derivative described herein. The invention also provides kits and compositions described herein.

  这项发明提供了用于治疗与CD19表达相关疾病的组合物和方法，例如，通过给予包含本文所述的CD19 CAR的重组T细胞，结合一种BTK抑制剂，例如，本文所述的氨基嘧啶衍生物。该发明还提供了本文所述的试剂盒和组合物。
• HYBRID ANTICANCER PRODRUG SIMULTANEOUSLY PRODUCING CINNAMALDEHYDE AND QUINONE METHIDE AND METHOD FOR PREPARING SAME
  申请人：INDUSTRIAL COOPERATION FOUNDATION CHONBUK NATIONAL UNIVERSITY

  公开号：US20170014518A1

  公开（公告）日：2017-01-19

  The present invention relates to a hybrid anticancer prodrug simultaneously producing cinnamaldehyde and quinone methide. The hybrid anticancer prodrug according to the present invention sequentially releases quinone methide and cinnamaldehyde by H 2 O 2 and acidic pH, and thus alkylates antioxidant GSH through the release of quinone methide, thereby inhibiting an antioxidative system and increasing oxidation stress, and generates and accumulates reactive oxygen species (ROS) through the release of cinnamaldehyde, thereby promoting apoptosis, and thus the hybrid anticancer prodrug according to the present invention can be favorably used as an anticancer drug by creating a synergetic anticancer effect through double stimulus-response and sequential treatment action in a cancer cell-specific manner.

  本发明涉及一种同时产生肉桂醛和醌甲醚的杂合抗癌前药。根据本发明的杂合抗癌前药通过过氧化氢和酸性pH依次释放醌甲醚和肉桂醛，从而通过释放醌甲醚来烷基化抗氧化剂GSH，抑制抗氧化系统并增加氧化应激，并通过释放肉桂醛产生和积累活性氧种（ROS），从而促进凋亡，因此，根据本发明的杂合抗癌前药可以通过在癌细胞特异性方式下的双重刺激-响应和顺序治疗作用产生协同抗癌效果，从而可以作为抗癌药物有利地使用。