3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷 | 76054-81-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷
• 中文别名: 3'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)胸苷
• 英文名称: 3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine
• 英文别名: 3'-O-dimethoxytritylthymidine；3'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]thymidine；3'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)thymidine；1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 76054-81-4
• 化学式: C₃₁H₃₂N₂O₇
• 分子量: 544.604
• InChiKey: UDDSFNVDTHTTMK-UPRLRBBYSA-N

物化性质

• 熔点：
  54-55 °C
• 密度：
  1.34±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷 在 sodium periodate 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 beta-胸苷
  参考文献：
  名称：

  Selective Cleavage of O-(Dimethoxytrityl) Protecting Group with Sodium Periodate

  摘要：

  在水有机溶剂中，过碘酸钠在温和的反应条件下选择性地去除了O-(二甲氧基三苯甲基)保护基团。利用核苷衍生物进行了裂解的选择性研究，这些核苷衍生物受到核苷和核苷酸化学中常用的各种基团的保护。

  DOI：

  10.1135/cccc20020502
• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷
  参考文献：
  名称：

  含4'- C-取代胸苷的寡脱氧核苷酸的合成与评价

  摘要：

  将4'- C-羟基甲基胸苷转化为4'- C-甲氧基甲基胸苷和4'- C-氨基甲基胸苷，通过亚磷酰胺化学将其掺入寡脱氧核苷酸中。修饰的寡核苷酸表现出优异的杂交性，并且对蛇毒磷酸二酯酶的稳定性显着提高。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)01432-3
• 作为试剂：
  描述：

  5'-O-dimethoxytritylthymidine 3'-H-phosphonothioate triethyl ammonium salt 在 3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷 、 氯磷酸二苯酯 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 、 、 1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphinothioyloxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 、 1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphinothioyloxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Nucleoside H-Phosphonates. 17. Synthetic and ³¹P NMR Studies on the Preparation of Dinucleoside H-Phosphonothioates

  摘要：

  Formation of H-phosphonothioate diesters via condensation of H-phosphonate monoesters with a hydroxylic component in the presence of various coupling agents and possible side reactions that may accompany this process were studied using P-31 NMR spectroscopy. Optimal reaction conditions, which eliminate or significantly suppress the side reactions, have been designed and assessed in syntheses of dinucleoside H-phosphonothioate diesters.

  DOI：

  10.1021/jo960810m

文献信息

• A New Reagent System for Efficient Silylation of Alcohols: Silyl Chloride-<i>N</i>-Methylimidazole-Iodine
  作者：Jacek Stawinski、Agnieszka Bartoszewicz、Marcin Kalek、Johan Nilsson、Renata Hiresova

  DOI：10.1055/s-2007-992379

  日期：2008.1

  reactions of alcohols with silyl chlorides in the presence of N-methylimidazole were significantly accelerated by the added iodine, and on this basis a general, and high yielding method for efficient silylation of primary, secondary, and tertiary alcohols was developed.

  发现在N-甲基咪唑存在下醇与甲硅烷基氯的反应通过加入碘显着加速，并在此基础上开发了一种通用的、高收率的伯、仲和叔醇的有效硅烷化方法。
• Novel phosphitylating reagents containing a phosphorus–fluorine bond and their application in efficient synthesis of phosphorofluoridates and phosphorofluoridothionates
  作者：Wojciech Dąbkowski、Izabela Tworowska

  DOI：10.1039/b103082p

  日期：——

  Novel phosphitylating reagents containing a P–F bond are obtained in excellent yield from commercial materials. They react with alcohols at 20 °C in neutral solvents in the presence of tetrazole, chlorotrimethylsilane or benzoyl chloride to give the intermediate phosphorofluoridites. Subsequent oxidation or sulfurization followed by the removal of protecting groups gives the phosphorofluoridates and thiophosphorofluoridates in over 90% total yield.

  包含 P–F 键的新型磷酸化试剂以优异的产率从商业原料中获得。它们在四唑、氯三甲基硅烷或苯甲酰氯的存在下，在中性溶剂中于 20 °C 下与醇反应，生成中间体氟磷酸酯。随后的氧化或硫化处理及保护基团的去除，可得到总产率超过 90% 的氟磷酸酯和硫氟磷酸酯。
• A novel approach to the synthesis of lipophilic thymidinemonophosphoglucopyranosides as drug delivery systems
  作者：Antonio De Nino、Angelo Liguori、Antonio Procopio、Edoardo Roberti、Giovanni Sindona

  DOI：10.1016/0008-6215(96)00042-0

  日期：1996.6

  paper describes the synthesis of the hexadecyl phosphotriesters of thymidine 3′-(5′-deoxythymidin-5′-yl phosphate), thymidine 5′-(5′-deoxythymidin-5′-yl phosphate), thymidine 5′-(3′,5′-dideoxythymidin-5′-yl phosphate), thymidine 3′-[(methyl 6-deoxy-α- d -glucopyranosid-6-yl) phosphate], and thymidine 5′-[(methyl 6-deoxy-α- d -glucopyranosid-6-yl) phosphate]. The novel approach is based on the condensation

  摘要本文描述了胸苷3'-（5'-脱氧胸苷5'-基磷酸），胸苷5'-（5'-脱氧胸苷5'-基磷酸），胸苷5'-（ 3′，5′-二脱氧胸苷5′-基磷酸），胸苷3′-[（（甲基6-脱氧-α-d-吡喃葡萄糖苷-6-基）磷酸]]和胸苷5′-[（甲基6-脱氧） -α-d-吡喃葡萄糖苷-6-基）磷酸盐]。该新方法基于未保护的核苷或吡喃糖苷与亲脂性磷酸二酯5'-O-二甲氧基三苯甲基胸苷3'-（十六烷基磷酸酯）和3'-O-二甲氧基三苯甲基胸苷5'-（磷酸十六烷基酯）的缩合。由十六烷基二氯次氯酸盐和5'-O-二甲氧基三苯甲基-或3'-二甲氧基三苯甲基-胸苷制成。后者是由得自胸苷的5'-O-（4-硝基苯甲酰基）胸苷高产率制备的，通过一锅法将4-硝基苯甲酸和双（2-氧代恶唑烷-3-基）次膦酰氯。在合成的早期引入脂族链防止了核碱基的烷基化，并允许未保护的核苷和吡喃糖苷的区域选择性磷酸化。
• Acylphosphonates
  作者：Mitsuo Fujii、Kouji Ozaki、Mitsuo Sekine、Tsujiaki Hata

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)81630-6

  日期：1987.1

  synthesized by a new method via dideoxyribonucleoside 2,2,2-trichloroethoxycarbonylphosphonates and aroylphosphonates. The conversion of dideoxyribonucleoside 2,2,2-trichloroethoxycarbonylphosphonates to dideoxyribonucleoside trimethylsilyl phosphites by treatment with Me3SiCl-Zn-acetylacetone proceeded with retention configuration at phosphorus. The silyl phosphite intermediates were converted to the phosphorothioates

  通过二脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯和芳酰基膦酸酯通过新方法合成了脱氧核糖核苷硫代磷酸酯。通过用Me 3 SiCl-Zn-乙酰丙酮处理，将双脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯转化为双脱氧核糖核苷三甲基甲硅烷基亚磷酸酯，在磷处具有保留构型。通过用硫原位处理将亚磷酸甲硅烷基酯中间体转化为硫代磷酸酯。通过n-BuNH 2的作用，很容易将芳酰基从8-11上除去，并通过单质硫处理原位转化为双脱氧核糖核苷硫代磷酸酯中的仅一种非对映异构体（Rp-构型）。
• Solid-Phase Synthesis of Stereoregular Oligodeoxyribonucleoside Phosphorothioates Using Bicyclic Oxazaphospholidine Derivatives as Monomer Units
  作者：Natsuhisa Oka、Mika Yamamoto、Terutoshi Sato、Takeshi Wada

  DOI：10.1021/ja805780u

  日期：2008.11.26

  Nucleoside 3'-O-bicylic oxazaphospholidine derivatives were designed as monomer units for a solid-phase synthesis of stereoregular oligodeoxyribonucleoside phosphorothioates (PS-ODNs). The trans-isomers of appropriately designed nucleoside 3'-O-bicyclic oxazaphospholidine derivatives were generated exclusively by the reaction between the 3'-OH of the corresponding protected nucleosides and 2-chloro-1

  核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物被设计为单体单元，用于固相合成有规立构寡脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs)。适当设计的核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物的反式异构体仅通过相应受保护核苷的 3'-OH 与 2-氯-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物之间的反应生成。得到的反式-氧氮杂磷脂异构体在构型上是稳定的，在固体载体上缩合过程中，在酸性活化剂存在下差向异构化不会损害它们的非对映纯度。因此，通过使用氧氮杂磷脂单体和酸性活化剂形成 (Rp)- 和 (Sp)-硫代磷酸酯核苷酸间键的过程中，非对映纯度没有任何损失（非对映选择性 > 或 = 99:1）。此外，从头分子轨道计算表明，氧氮杂磷脂衍生物的差向异构化最有可能通过 N-质子化加速的边缘反转过程进行。计算不仅合理化了本研究中观察到的环结构与 oxazaphospholidines