卡那霉素 B | 4696-76-8

• 物质功能分类: 原料药 - 抗生素类药物 - 氨基糖苷类药
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 卡那霉素 B
• 中文别名: 卡那霉素B
• 英文名称: kananmycin B
• 英文别名: Kanamycin B；bekanamycin；kanamycin；Kan B；kanendomycin；(2R,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-amino-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxyoxane-3,4-diol
• CAS: 4696-76-8
• 化学式: C₁₈H₃₇N₅O₁₀
• 分子量: 483.519
• InChiKey: SKKLOUVUUNMCJE-FQSMHNGLSA-N

物化性质

• 熔点：
  178-182° (dec)
• 比旋光度：
  D18 +130° (c = 0.5 in water); D21 +114° (c = 0.98 in water)
• 沸点：
  580.49°C (rough estimate)
• 密度：
  1.3771 (rough estimate)
• 溶解度：
  酸水溶液（微溶）、甲醇（微溶、加热、超声处理）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.2
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  288
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  15

制备方法与用途

生物活性

Bekanamycin（卡那霉素B）是一种氨基糖苷类抗生素，源自** Streptomyces kanamyceticus**。它能抑制一系列革兰氏阳性及阴性细菌。

体外研究

Bekanamycin（卡那霉素B）以浓度依赖的方式可逆地减少终板电位的量子含量，但对记录的前突触动作电位的外部配置没有明显影响。这种由Bekanamycin引起的可诱发递质释放减少可以通过增加外部钙离子浓度或使用如氨基吡啶等药物来对抗。Bekanamycin通过干扰去极化过程中发生在运动神经末梢的钙离子流入，从而表现出强烈的抑制递质释放的作用。

用途

Bekanamycin是一种抗生素类药物，也是生产硫酸地贝卡星和硫酸阿贝卡星的中间体。

类别

有毒物品

毒性分级

中毒

急性毒性

腹腔-小鼠 LD50: 800毫克/公斤；皮下-小鼠 LD50:750毫克/公斤

可燃性危险特性

可燃；燃烧会产生有毒氮氧化物烟雾

储运特性

通风、低温、干燥

灭火剂

干粉、泡沫、沙土、二氧化碳、雾状水

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  卡那霉素 B 在 palladium on activated charcoal 、 Raney nickel W₂ 吡啶 、 二碳酸二叔丁酯 、 4,4'-硫联二(6-叔丁基-2-甲基苯酚) 、 zinc diacetate 、 氢气 、 copper diacetate 、 三乙胺 、 间氯过氧苯甲酸 、 三氟乙酸 、 lithium chloride 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 氯仿 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 25.0~90.0 ℃ 、303.98 kPa 条件下， 反应 106.0h， 生成 1-C-(hydroxymethyl)-6''-deoxy-6''-chlorokanamycin B
  参考文献：
  名称：

  New derivatives of kanamycin B obtained by combined modifications in positions 1 and 6". Synthesis, microbiological properties, and in vitro and computer-aided toxicological evaluation

  摘要：

  Substitution of the C-1 atom in the 2-deoxystreptamine moiety of gentamicin C2, a broad-spectrum aminoglycoside antibiotic, by an axial hydroxymethyl group has been reported to confer protection against most clinically important bacterial enzymes inactivating aminoglycosides, while simultaneously reducing the nephrotoxic potential of this drug. We report here on a similar modification of kanamycin B. Microbiological evaluation, however, revealed no useful protection, as established by the almost complete lack of activity of 1-C-(hydroxymethyl)kanamycin B against an array of organisms producing defined types of aminoglycoside-inactivating enzymes and against which 1-C-(hydroxymethyl)gentamicin C2 and amikacin (1-N-[(S)-2-hydroxy-4-aminobutyryl]kanamycin A) are active. Moreover, toxicological evaluation, based on the in vitro measurement of the drug inhibitory potential toward lysosomal phospholipases, a predictive test of the intrinsic nephrotoxic potential of aminoglycosides, showed not decreased but rather increased toxicity. Comparative conformational analysis of the interactions of the drug with a phosphatidylinositol monolayer explained the lack of protective effect, since no significant change of the mode of insertion of the derivative in this monolayer was detected compared to that of kanamycin B. Combination of a 1-C-(hydroxymethyl) substituent with a 6"-chloro, 6"-azido, or 6"-acetamido substituent resulted in a partial improvement of the toxicological behavior with no loss of activity for the 6"-chloro and the 6"-azido derivatives, but not to the extent of obtaining better derivatives than kanamycin B itself. We, therefore, suggest that the advantages of an axial hydroxymethyl substituent at C-1 are probably restricted to the gentamicin family and do not extend to kanamycins. It might be concluded that the structural differences between gentamicins and kanamycins play an important, still undescribed role both in their effective recognition by aminoglycoside-inactivating enzymes, which are responsible for most of the clinically important cases of resistance to aminoglycosides, and also in the interactions with phospholipids, which in turn cause nephrotoxicity.

  DOI：

  10.1021/jm00108a037
• 作为试剂：
  描述：

  U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5''-(2)H-UTP 在 ¹⁵N-ammonium chloride 、 磷酸肌酸 、 adenylate kinase from chicken muscle 、 creatine phosphokinase from rabbit muscle 、 cytidine monophosphate kinase, recombinant from E_. coli 、 cytidine triphosphate synthase, recombinant from E_. coli 、 dATP 、 氨苄西林 、 卡那霉素 B 、 magnesium chloride 作用下， 反应 20.0h， 以48%的产率得到U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5"-(2)H-CTP
  参考文献：
  名称：

  酶法从头合成嘧啶核苷酸

  摘要：

  稳定同位素标记的使用彻底改变了核酸的 NMR 研究，并且需要掺入特定同位素标记的方法以促进特定的 NMR 实验和应用。酶促合成提供了一种高效灵活的方法，可以从各种市售的专门标记的前体合成核苷三磷酸，从而可以对体外转录制备的 RNA 进行同位素标记。在这里，我们概括了体外嘧啶的从头生物合成，使用重组表达的酶进行具有多种稳定同位素标记模式的 UTP 和 CTP 的高效单锅合成。(13)C、(15)N、(2)H 标记的 HIV-2 TAR RNA 的过滤 NMR 实验证明了该方法的实用性和价值。这种灵活的酶促合成将使实施详细且信息丰富的 RNA 稳定同位素标记方案变得更加经济高效，为研究 RNA 分子的结构和动力学提供先进的工具。

  DOI：

  10.1021/ja1059685

文献信息

• [EN] DERIVATIVES OF AMANITA TOXINS AND THEIR CONJUGATION TO A CELL BINDING MOLECULE<br/>[FR] DÉRIVÉS DE TOXINES D'AMANITES ET LEUR CONJUGAISON À UNE MOLÉCULE DE LIAISON CELLULAIRE
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2017046658A1

  公开（公告）日：2017-03-23

  Derivatives of Amernita toxins of Formula (I), wherein, formula (a) R 1, R 2, R 3, R 4, R 5, R 6, R 7, R 8, R 9, R 10, X, L, m, n and Q are defined herein. The preparation of the derivatives. The therapeutic use of the derivatives in the targeted treatment of cancers, autoimmune disorders, and infectious diseases.

  Amernita毒素的衍生物的化学式（I），其中，化学式（a）中的R 1、R 2、R 3、R 4、R 5、R 6、R 7、R 8、R 9、R 10、X、L、m、n和Q在此处被定义。这些衍生物的制备。这些衍生物在靶向治疗癌症、自身免疫性疾病和传染病中的治疗用途。
• [EN] A CONJUGATE OF A CYTOTOXIC AGENT TO A CELL BINDING MOLECULE WITH BRANCHED LINKERS<br/>[FR] CONJUGUÉ D'UN AGENT CYTOTOXIQUE À UNE MOLÉCULE DE LIAISON CELLULAIRE AVEC DES LIEURS RAMIFIÉS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020257998A1

  公开（公告）日：2020-12-30

  Provided is a conjugation of cytotoxic drug to a cell-binding molecule with a side-chain linker. It provides side-chain linkage methods of making a conjugate of a cytotoxic molecule to a cell-binding ligand, as well as methods of using the conjugate in targeted treatment of cancer, infection and immunological disorders.

  提供了一种将细胞毒性药物与一个侧链连接分子结合的共轭物。它提供了制备细胞毒性分子与细胞结合配体的共轭物的侧链连接方法，以及在靶向治疗癌症、感染和免疫性疾病中使用该共轭物的方法。
• [EN] CROSS-LINKED PYRROLOBENZODIAZEPINE DIMER (PBD) DERIVATIVE AND ITS CONJUGATES<br/>[FR] DÉRIVÉ DE DIMÈRE DE PYRROLOBENZODIAZÉPINE RÉTICULÉ (PBD) ET SES CONJUGUÉS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020006722A1

  公开（公告）日：2020-01-09

  A novel cross-linked cytotoxic agents, pyrrolobenzo-diazepine dimer (PBD) derivatives, and their conjugates to a cell-binding molecule, a method for preparation of the conjugates and the therapeutic use of the conjugates.

  一种新型的交联细胞毒剂，吡咯苯并二氮杂环二聚体（PBD）衍生物，以及它们与细胞结合分子的结合物，一种制备这些结合物的方法以及这些结合物的治疗用途。
• Substituted 1,3-thiazole compounds, their production and use
  申请人：——

  公开号：US20040053973A1

  公开（公告）日：2004-03-18

  (1) A 1,3-thiazole compound of which the 5-position is substituted with a 4-pyridyl group having a substituent including no aromatic group or (2) a 1,3-thiazole compound of which the 5-position is substituted with a pyridyl group having at the position adjacent to a nitrogen atom of the pyridyl group a substituent including no aromatic group has an excellent p38 MAP kinase inhibitory activity.

  (1) 一种1,3-噻唑化合物，其5位被取代为含有一个取代基的4-吡啶基团，该取代基不包括芳香基，或者(2) 一种1,3-噻唑化合物，其5位被取代为一个吡啶基团，该吡啶基团的氮原子邻近位置有一个取代基，该取代基不包括芳香基，具有出色的p38 MAP激酶抑制活性。
• Bifunctional antibiotics for targeting rRNA and resistance-causing enzymes
  申请人：Baasov Timor

  公开号：US20050004052A1

  公开（公告）日：2005-01-06

  A novel group of aminoglycosides which share some structural features of currently available aminoglycosides with regard to the backbone, while also having significant structural differences. The similarity enables these aminoglycosides to be highly potent and effective antibiotics, while the significant differences enable these aminoglycosides to reduce or even block antibiotic resistance.

  一种新型氨基糖苷类药物，与目前已有的氨基糖苷类药物在骨架方面具有一些结构特征，同时又具有显著的结构差异。这种相似性使得这些氨基糖苷类药物具有很高的抗菌作用和有效性，而显著的差异使得这些氨基糖苷类药物能够减少甚至阻止抗生素耐药性的发展。