U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5''-(2)H-UTP | 1261286-82-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5''-(2)H-UTP
• 英文别名: U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5"-(2)H-UTP
• CAS: 1261286-82-1
• 化学式: C₉H₁₅N₂O₁₅P₃
• 分子量: 491.091
• InChiKey: PGAVKCOVUIYSFO-GMCJMENFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.5
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  264.37
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5''-(2)H-UTP 在 ¹⁵N-ammonium chloride 、 磷酸肌酸 、 adenylate kinase from chicken muscle 、 creatine phosphokinase from rabbit muscle 、 cytidine monophosphate kinase, recombinant from E_. coli 、 cytidine triphosphate synthase, recombinant from E_. coli 、 dATP 、 氨苄西林 、 卡那霉素 B 、 magnesium chloride 作用下， 反应 20.0h， 以48%的产率得到U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5"-(2)H-CTP
  参考文献：
  名称：

  酶法从头合成嘧啶核苷酸

  摘要：

  稳定同位素标记的使用彻底改变了核酸的 NMR 研究，并且需要掺入特定同位素标记的方法以促进特定的 NMR 实验和应用。酶促合成提供了一种高效灵活的方法，可以从各种市售的专门标记的前体合成核苷三磷酸，从而可以对体外转录制备的 RNA 进行同位素标记。在这里，我们概括了体外嘧啶的从头生物合成，使用重组表达的酶进行具有多种稳定同位素标记模式的 UTP 和 CTP 的高效单锅合成。(13)C、(15)N、(2)H 标记的 HIV-2 TAR RNA 的过滤 NMR 实验证明了该方法的实用性和价值。这种灵活的酶促合成将使实施详细且信息丰富的 RNA 稳定同位素标记方案变得更加经济高效，为研究 RNA 分子的结构和动力学提供先进的工具。

  DOI：

  10.1021/ja1059685
• 作为产物：
  描述：

  (15)N,2,3,3-(2)H-L-aspartic acid 、 potassium hydrogencarbonate 、 D-glucose-1,2,3,4,5,6,6-d7 在 磷酸肌酸 、 adenylate kinase from chicken muscle 、 creatine phosphokinase from rabbit muscle 、 glucose-6-phosphate isomerase from baker's yeast 、 hexokinase from baker's yeast 、 dATP 、 氯化铵 、 potassium hydroxide 、 magnesium chloride 、 alpha-酮戊二酸 、 glucose-6-phosphate dehydrogenase from baker's yeast 、 orotate monophosphate decarboxylase, recombinant from E_. coli 、 phosphogluconate dehydrogenase, recombinant from E_. coli 、 ribose-5-phosphate isomerase from spinach 、 ribose-phosphate diphosphate kinase, recombinant from E_. coli 、 uridine monophosphate kinase, recombinant from E_. coli 、 烟酰胺腺嘌呤双核苷酸磷酸盐 、 fumaric acid disodium salt 作用下， 反应 162.0h， 以30%的产率得到U-(15)N,5, 3', 4', 5', 5''-(2)H-UTP
  参考文献：
  名称：

  酶法从头合成嘧啶核苷酸

  摘要：

  稳定同位素标记的使用彻底改变了核酸的 NMR 研究，并且需要掺入特定同位素标记的方法以促进特定的 NMR 实验和应用。酶促合成提供了一种高效灵活的方法，可以从各种市售的专门标记的前体合成核苷三磷酸，从而可以对体外转录制备的 RNA 进行同位素标记。在这里，我们概括了体外嘧啶的从头生物合成，使用重组表达的酶进行具有多种稳定同位素标记模式的 UTP 和 CTP 的高效单锅合成。(13)C、(15)N、(2)H 标记的 HIV-2 TAR RNA 的过滤 NMR 实验证明了该方法的实用性和价值。这种灵活的酶促合成将使实施详细且信息丰富的 RNA 稳定同位素标记方案变得更加经济高效，为研究 RNA 分子的结构和动力学提供先进的工具。

  DOI：

  10.1021/ja1059685