4-C-(hydroxymethyl)-1,2-O-isopropylidene-β-L-threo-pentofuranose

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 4-C-(hydroxymethyl)-1,2-O-isopropylidene-β-L-threo-pentofuranose
• 英文别名: 4-hydroxymethyl-1,2-O-isopropylidene-α-D-xylofuranose；4-C-hydroxymethyl-1,2-O-(1-methylethylidene)-β-L-threo-pentofuranose；(3aR,6R,6aR)-5,5-bis(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-6,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxol-6-ol
• 化学式: C₉H₁₆O₆
• 分子量: 220.222
• InChiKey: IQMIEGQNCDSYBA-QYNIQEEDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  88.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-C-(hydroxymethyl)-1,2-O-isopropylidene-β-L-threo-pentofuranose 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 盐酸 、 硫酸 、 氢溴酸 、 氢气 、 sodium methylate 、 四氯化锡 、 铜 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 锌 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 25.0~100.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 169.33h， 生成 1-(2,3-dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 1-(3-Azido-2,3-dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-threo-pentofuranosyl)thymine, 1-(2,3-Dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pentofuranosyl)thymine and 1-(2,3-Dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pent-2-enofuranosyl)thymine

  摘要：

  1-(2-O-乙酰基-3,5-二-O-苯甲酰基-4-C-苯氧甲基-α-L-阿拉伯呋喃糖基)嘧啶(II)经选择性去乙酰化、甲磺酰化和与1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一烯处理转化为2,2'-脱水衍生物V。用氯化氢或溴化氢裂解化合物V中的2,2'-脱水环得到相应的2'-氯和2'-溴衍生物VI和VII。化合物VII与Cu/Zn偶对反应，随后脱苯甲酰化导致1-(2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-戊-2-烯呋喃糖基)嘧啶(IX)。对IX进行催化氢化得到1-(2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-甘油-戊呋喃糖基)嘧啶(X)。用三丁基锡氢化合物VI并脱苯甲酰化得到1-(2-脱氧-4-C-羟甲基-α-L-赤霉-戊呋喃糖基)嘧啶(XII)。化合物XII的三苯甲基化，随后甲磺酰化、去三苯甲基化和亲核取代与叠氮化合物反应得到1-(3-叠氮基-2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-顺-戊呋喃糖基)嘧啶(XXII)。

  DOI：

  10.1135/cccc19930409
• 作为产物：
  描述：

  1,2:5,6-di-O-isopropylidene-α-D-glucofuranose 在 sodium periodate 、 palladium 10% on activated carbon 、 水 、 氢气 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 50.0 ℃ 、810.65 kPa 条件下， 反应 6.0h， 生成 4-C-(hydroxymethyl)-1,2-O-isopropylidene-β-L-threo-pentofuranose
  参考文献：
  名称：

  [EN] MODIFIED NUCLEOSIDE PHOSPHORAMIDITES
  [FR] PHOSPHORAMIDITES DE NUCLÉOSIDES MODIFIÉS

  摘要：

  本发明公开涉及包含式(I)和式(II)的5'-磷酰胺基核苷单体的化合物和组合物，以及它们的制备和使用方法，其中取代基如所附权利要求中所定义。

  公开号：

  WO2019053659A1

文献信息

• Selective biocatalytic deacylation studies on furanose triesters: a novel and efficient approach towards bicyclonucleosides
  作者：Ashok K. Prasad、Neerja Kalra、Yogesh Yadav、Sunil K. Singh、Sunil K. Sharma、Shamkant Patkar、Lene Lange、Carl E. Olsen、Jesper Wengel、Virinder S. Parmar

  DOI：10.1039/b711455a

  日期：——

  the deacylation of 4-C-acyloxymethyl-3,5-di-O-acyl-1,2-O-(1-methylethylidene)-beta-L-threo-pentofura nose to form 3,5-di-O-acyl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-(1-methylethylidene)-alpha-D-xylo-pentofura nose in a highly selective and efficient manner. The rate of lipase-catalyzed deacylation of tributanoyl furanose is 2.3 times faster than the rate of deacylation of the triacetyl furanose derivative. In order

  Lipozyme TL IM催化4-C-酰氧基甲基-3,5-二-O-酰基-1,2-O-（1-甲基乙叉基）-β-L-苏-五氟呋喃鼻的脱酰基反应以形成3,5-di -O-酰基-4-C-羟甲基-1,2-O-（1-甲基亚乙基）-α-D-木基-五氟呋喃鼻具有高度选择性和高效的方式。脂肪酶催化的三丁酰呋喃糖的脱酰速率比三乙酰基呋喃糖衍生物的脱酰速率快2.3倍。为了确认脂肪酶催化的脱酰产物的结构，将其转化为双环糖衍生物，其可用于合成在开发新型反义和反义寡核苷酸中重要的双环核苷。进一步，
• Deacylation studies on furanose triesters using an immobilized lipase: Synthesis of a key precursor for bicyclonucleosides
  作者：Ashok K. Prasad、Neerja Kalra、Yogesh Yadav、Rajesh Kumar、Sunil K. Sharma、Shamkant Patkar、Lene Lange、Jesper Wengel、Virinder S. Parmar

  DOI：10.1039/b618426j

  日期：——

  Lipozyme® TL IM immobilized on silica catalyses the deacylation of 4-C-acyloxymethyl-3,5-di-O-acyl-1,2-O-(1-methylethylidene)-β-L-threo-pentofuranose to form 3,5-di-O-acyl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-(1-methylethylidene)-α-D-xylo-pentofuranose in a highly selective and efficient manner.

  Lipozyme® TL IM固定在硅胶上作为催化剂，能够高度选择性和高效地将4-C-酰氧甲基-3,5-二-O-酰基-1,2-O-(1-甲基亚乙基)-β-L-苏式-戊呋喃糖转化为3,5-二-O-酰基-4-C-羟甲基-1,2-O-(1-甲基亚乙基)-α-D-木式-戊呋喃糖。
• Chemo-enzymatic synthesis of 3′-O,4′-C-methylene-linked α-<scp>l</scp>-arabinonucleosides
  作者：Rajesh Kumar、Manish Kumar、Jyotirmoy Maity、Ashok K. Prasad

  DOI：10.1039/c6ra17218k

  日期：——

  Lipozyme[registered sign] TL IM has catalyzed the diastereoselective acetylation of C-4'-hydroxymethyl over the other three hydroxyl groups of C-4'-hydroxymethyl-[small beta]-D-xylofuranosylnucleosides using vinyl acetate as acetyl donor to afford the corresponding C-4'-acetoxymethylnucleosides in...

  脂酶[注册标志] TL IM使用乙酸乙烯酯作为乙酰基供体，催化C-4'-羟甲基在C-4'-羟甲基-[小β] -D-木呋喃糖基核苷的其他三个羟基上的非对映选择性乙酰化。相应的C-4'-乙酰氧基甲基核苷
• XNA (xylo Nucleic Acid): A Summary and New Derivatives
  作者：B. Ravindra Babu、Raunak、Nicolai E. Poopeiko、Martin Juhl、Andrew D. Bond、Virinder S. Parmar、Jesper Wengel

  DOI：10.1002/ejoc.200500023

  日期：2005.6

  furanose conformation. Besides, an efficient synthesis of known xylo-LNA phosphoramidite 19, required for the incorporation of 1-(2'-O,4'-C-methylene-β-D-xylofuranosyl)thymine (monomer L) is described. For comparison, hydridization data of various XNAs reported in the literature are included in the discussion section. The thermal denaturation studies show that XNAs containing conformationally locked

  完全修饰的同型嘧啶 2'-脱氧-木核酸 (dXNA) 与互补的 DNA/RNA 形成三螺旋，其热稳定性与相应的 DNA:DNA 和 DNA:RNA 双链体的热稳定性相当。然而，在 DNA 链中插入单个或几个 dXNA 单体会显着降低双链体的稳定性。已知 dXNA 单体在溶液中主要采用 N 型呋喃糖构象。为了提高结合亲和力，已经合成了七种糖修饰的 XNA 单体（H、F、N、M、K、P 和 Q），并研究了它们对 DNA 和 RNA 互补物杂交的影响。预计引入 2'-氟和 2'-羟基取代基会导致对衍生自 1-(2'-deoxy-2' 的单体 F 的 C3'-内型呋喃糖构象的构象限制 -氟-β-D-呋喃木糖基）胸腺嘧啶和衍生自 1-（β-D-呋喃木糖基）胸腺嘧啶的单体 H。存在面向小沟的官能团，如 1-(2'-amino-2'-deoxy-2'-N,4'-C-methylene-β-D-xylofuranosyl)thymine
• Synthesis and biological evaluation of branched and conformationally restricted analogs of the anticancer compounds 3′-C-ethynyluridine (EUrd) and 3′-C-ethynylcytidine (ECyd)
  作者：Patrick J. Hrdlicka、Nicolai K. Andersen、Jan S. Jepsen、Flemming G. Hansen、Kim F. Haselmann、Claus Nielsen、Jesper Wengel

  DOI：10.1016/j.bmc.2005.01.029

  日期：2005.4

  The synthesis of branched and conformationally restricted analogs of the anticancer nucleosides 3'-C-ethynyluridine (EUrd) and 3'-C-ethynylcytidine (ECyd) is presented. Molecular modeling and (1)H NMR coupling constant analysis revealed that the furanose rings of all analogs except the LNA analog are conformationally biased towards South conformation, and are thus mimicking the structure of ECyd. All

  提出了抗癌核苷3'-C-乙炔基尿苷（EUrd）和3'-C-乙炔基胞苷（ECyd）的分支和构象受限的类似物的合成。分子建模和（1）1 H NMR偶合常数分析表明，除LNA类似物外，所有类似物的呋喃糖环均在构象上偏向South构象，因此模仿ECyd的结构。所有靶标核苷都没有抗HIV或抗癌活性。