(1R,3R,4R,5R,8R)-5,8-Bis(benzyloxy)-4-hydroxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxabicyclo[3.3.0]oct-6-ene | 352422-92-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (1R,3R,4R,5R,8R)-5,8-Bis(benzyloxy)-4-hydroxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxabicyclo[3.3.0]oct-6-ene
• 英文别名: 1-[(2R,3R,3aS,6R,6aR)-3-hydroxy-3a,6-bis(phenylmethoxy)-2,3,6,6a-tetrahydrocyclopenta[b]furan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 352422-92-5
• 化学式: C₂₆H₂₆N₂O₆
• 分子量: 462.502
• InChiKey: LJIKKQGTLVPPBK-OKSAAUDNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,3R,4R,5R,8R)-5,8-Bis(benzyloxy)-4-hydroxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxabicyclo[3.3.0]oct-6-ene 在 palladium dihydroxide 偶氮二异丁腈 、 氢气 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 甲醇 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 45.0h， 生成 (1R,3R,5R,8R)-5,8-dihydroxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxabicyclo[3.3.0]octane
  参考文献：
  名称：

  Bicyclic nucleosides; stereoselective dihydroxylation and 2′-deoxygenationElectronic supplementary information (ESI) available: 13C NMR spectra for compounds 7, 8 and 17 as well as 1H NMR data spectra for compounds 5, 11 and 18. See http://www.rsc.org/suppdata/ob/b2/b210439c/

  摘要：

  采用立体选择性二羟基化反应制备了一系列多羟基化的双环核苷衍生物。在与三环呋喃糖底物比较时，二羟基化的立体选择性完全反转后，获得了四种异构体中三种的保护产物。经过优化的去氧程序，得到了相应的2'-脱氧核苷衍生物。

  DOI：

  10.1039/b210439c
• 作为产物：
  描述：

  (3aR,5R,6R,6aR)-6-(benzyloxy)-5-((R)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolan-4-yl)-2,2-dimethyl-6-vinyltetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole 在 Grubbs catalyst first generation 吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 cerium(III) chloride 、 sodium methylate 、 sodium hydride 、 高碘酸 、 pyridinium chlorochromate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 溶剂黄146 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 264.75h， 生成 (1R,3R,4R,5R,8R)-5,8-Bis(benzyloxy)-4-hydroxy-3-(thymin-1-yl)-2-oxabicyclo[3.3.0]oct-6-ene
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of bicyclic nucleosides by ring-closing metathesis

  摘要：

  环闭合转位法用于构建构象受限的双环核苷。从二乙酮-D-葡萄糖出发，经过两次烯基格林纳反应、后续双键的转位以及通过氧化/还原反应序列解决立体化学，成功合成了不饱和双环糖类衍生物11。比较了两条在3-O-保护基团上不同的合成路线。因此，额外的保护步骤显著提高了产率。将11进行标准转化，得到含有具有较高进一步功能化潜力的烯基部分的双环核苷22。作为示例，合成了两种简单的双环核糖核苷类似物4和5，这些类似物限制在不寻常的南型构象中。

  DOI：

  10.1039/b101364p

文献信息

• A conformationally locked tricyclic nucleoside. Synthesis, crystal structure and incorporation into oligonucleotides
  作者：Jacob Ravn、Niels Thorup、Poul Nielsen

  DOI：10.1039/b104438a

  日期：——

  tricyclic nucleoside is synthesised from a bicyclic nucleoside precursor by applying a stereoselective dihydroxylation, a regioselective tosylation and an intramolecular ether formation. This tricyclic nucleoside is constructed as a conformationally locked thymidine analogue and has been analysed by X-ray crystallography. Thus, the furanose ring of this nucleoside adopts a perfect S-type conformation and

  三环的 核苷 由双环合成 核苷 前体通过应用立体选择性二羟基化，区域选择性甲苯磺酸化和分子内 醚编队。这个三环的核苷 被构造为构象锁定 胸苷 类似物，并已被分析 X射线晶体学。因此，这个的呋喃糖环核苷采用完美的S型构型和扭转角γ，说明C4'–C5'键限制在+ ac范围内。三环核苷 并入两个非美国数字 寡核苷酸 与相应的未修饰的寡脱氧核苷酸序列相比，该序列显示出对互补DNA和RNA的亲和力大大降低。
• 10.1081/ncn-120022619
  作者：Albaek, Nanna、Ravn, Jacob、Freitag, Morten、Thomasen, Helena、Christensen, Nanna K.、Petersen, Michael、Nielsen, Poul

  DOI：10.1081/ncn-120022619

  日期：——
• Bicyclic nucleosides; stereoselective dihydroxylation and 2′-deoxygenationElectronic supplementary information (ESI) available: 13C NMR spectra for compounds 7, 8 and 17 as well as 1H NMR data spectra for compounds 5, 11 and 18. See http://www.rsc.org/suppdata/ob/b2/b210439c/
  作者：Jacob Ravn、Morten Freitag、Poul Nielsen

  DOI：10.1039/b210439c

  日期：2003.2.27

  A series of polyhydroxylated bicyclic nucleoside derivatives is approached applying stereoselective dihydroxylation reactions. Three out of four isomeric and protected products were obtained after the stereoselectivity of dihydroxylation has been completely inverted comparing a bicyclic nucleoside with a tricyclic furanose substrate. A corresponding 2′-deoxynucleoside derivative has been obtained after an optimized deoxygenation procedure.

  采用立体选择性二羟基化反应制备了一系列多羟基化的双环核苷衍生物。在与三环呋喃糖底物比较时，二羟基化的立体选择性完全反转后，获得了四种异构体中三种的保护产物。经过优化的去氧程序，得到了相应的2'-脱氧核苷衍生物。
• Synthesis of bicyclic nucleosides by ring-closing metathesis
  作者：Jacob Ravn、Poul Nielsen

  DOI：10.1039/b101364p

  日期：——

  The ring-closing metathesis method is applied in the construction of conformationally restricted bicyclic nucleosides. From diacetone-D-glucose, the unsaturated bicyclic carbohydrate derivative 11 is efficiently obtained through two vinyl group Grignard additions, subsequent metathesis of the double bonds, and resolution of the stereochemistry by an oxidation/reduction reaction sequence. Two separate routes differing in the 3-O-protecting group are compared. Thus, an additional protecting step improves the yields significantly. Standard conversions of 11 give the bicyclic nucleoside 22 containing an olefinic moiety with a high potential for further functionalisation. As examples, two simple bicyclic ribo-nucleoside analogues 4 and 5, which are restricted to the unusual South-type conformations, are synthesised.

  环闭合转位法用于构建构象受限的双环核苷。从二乙酮-D-葡萄糖出发，经过两次烯基格林纳反应、后续双键的转位以及通过氧化/还原反应序列解决立体化学，成功合成了不饱和双环糖类衍生物11。比较了两条在3-O-保护基团上不同的合成路线。因此，额外的保护步骤显著提高了产率。将11进行标准转化，得到含有具有较高进一步功能化潜力的烯基部分的双环核苷22。作为示例，合成了两种简单的双环核糖核苷类似物4和5，这些类似物限制在不寻常的南型构象中。