macrocyclization of the open-chain derivatives 22-24 using HATU. None of the macrocylic compounds 25, 28-30, and 32 inhibited their target enzymes. NMR and MS studies on the interaction of macrocycle 29 and chymotrypsin established that compound 29 was in fact a substrate of the enzyme. This result indicated that while the design had been partially successful in identifying a compound that bound, the reduction
通过使用一系列酶-
抑制剂复合物的已知结构作为设计基础,将通用大环肽结构2设计为一系列
蛋白酶的潜在
抑制剂。选择靶标2的大环性质以降低
水解酶促步骤中的熵优势,从而抑制酶的功能。通过分子建模将连接基团的性质鉴定为
苯并恶唑,以便保留肽链的公认构象。通过改变P(1)组(通过结合苯丙
氨酸,
天冬氨酸或赖
氨酸)来调节潜在
抑制剂的特异性,以允许被不同的酶类别识别。由双
氨基酸衍
生物5制备靶标 本身通过使用
有机锌试剂与
碘代
苯并噻唑7的Pd催化偶联以及随后使用
HATU对开链衍
生物22-24进行大环化来制备。大环化合物25、28-30和32没有一个抑制它们的靶酶。核磁共振和质谱研究大环29和胰凝乳
蛋白酶之间的相互作用确定了化合物29实际上是酶的底物。该结果表明,尽管该设计已成功地部分鉴定了结合的化合物,但由于其大环性质,其熵优势的降低不足以使29充当
抑制剂。核磁共振和质谱研究大环29和胰凝乳
蛋白酶之间的相互作用确定