（2S,4R）-1-（（S）-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基）-4-羟基-N-（4-（4-甲基噻唑-5-基）苄基）吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐 | 1448189-80-7

• 物质功能分类: 医药中间体 - 原料药中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: （2S,4R）-1-（（S）-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基）-4-羟基-N-（4-（4-甲基噻唑-5-基）苄基）吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐
• 英文名称: (2S,4R)-1-((S)-2-amino-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide hydrochloride
• 英文别名: (2S,4R)-1-[(2S)-2-amino-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide hydrochloride；(2S,4R)-1-[(2S)-2-amino-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide hydrochloride；(2S,4R)-1-((S)-2-amino-3,3-dimethylbutyryl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide hydrochloride；(4R)-3-methyl-L-valyl-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-5-thiazolyl)phenyl]methyl]-L-prolinamide hydrochloride；(S,R,S)-AHPC hydrochloride；VHL-032；(2S,4R)-1-[(2S)-2-amino-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide;hydrochloride
• CAS: 1448189-80-7
• 化学式: C₂₂H₃₀N₄O₃S*ClH
• 分子量: 467.032
• InChiKey: JYRTWGCWUBURGU-MSSRUXLCSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMF：20mg/mL； DMSO：20mg/mL；乙醇：20mg/mL； PBS（pH 7.2）：10 mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.49
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

概述

(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐是一种医药中间体。文献报道，该化合物可用于制备将内源蛋白质募集至E3泛素连接酶以进行降解的功能的化合物。

用途

(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐在PROTAC化合物的合成中充当试剂，该化合物能够介导致癌的c-ABL和BCR-ABL的降解。

应用

(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐是有机合成中间体和医药中间体，可用于实验室研发过程及化工医药合成过程中。

合成方法

在二氧六环(20 mL)中加入4N氯化氢溶液(80 mL)，室温下搅拌2小时。然后加入N-[(2S)- 1 -[(2S,4R)-4-羟基-2-({4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基氨基甲酰基)吡咯烷-1-基]-3,3-二甲基-1-氧丁-2-基]氨基甲酸酯(12 g, 22.61 mmol)，搅拌后通过LC-MS检测到所需的产物。沉淀固体经过过滤收集，得到黄色固体ULM-1 (收率48%)。

用途

这是一种小分子配体和蛋白质降解剂盐酸盐，适合并结合使用von Hippel-Lindau（VHL）蛋白质进行靶向蛋白质降解及PROTAC（蛋白质水解化学书-靶向嵌合体）技术。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  （2S,4R）-1-（（S）-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基）-4-羟基-N-（4-（4-甲基噻唑-5-基）苄基）吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 N1-(3-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)benzyl)-N12-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)dodecanediamide
  参考文献：
  名称：

  基于光亲和力的片段筛选平台，可有效识别蛋白配体。

  摘要：

  基因组分析的进步使人们能够鉴定与疾病有关的新蛋白质。为了验证这些目标，需要使用工具分子来证明配体具有改善疾病的作用。当前，由于仅报道了一部分蛋白质组的工具，配体发现平台对于利用基因组分析的见解至关重要。碎片筛选提供了一种探索化学空间的有效方法。这里展示的是一个称为PhABits（PhotoAffinity Bits）的片段筛选平台，该平台利用光反应片段库共价捕获片段-蛋白质相互作用。可以对命中进行分析以确定效力和交联位点，然后在竞争性替代测定中将其发展为报道基因，以鉴定新的命中物质。

  DOI：

  10.1002/anie.202008361
• 作为产物：
  描述：

  Boc-L-羟脯氨酸 在 盐酸 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 （2S,4R）-1-（（S）-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基）-4-羟基-N-（4-（4-甲基噻唑-5-基）苄基）吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐
  参考文献：
  名称：

  基于 VHL 的 EZH2 降解剂的设计、合成和评估以增强对淋巴瘤的治疗活性

  摘要：

  开发传统的 EZH2 抑制剂是为了抑制酶促甲基化活性，由于 EZH2 在癌症发展中的非酶促功能，它们可能具有治疗局限性。在这里，我们报告了基于蛋白水解靶标嵌合体 (PROTAC) 的 EZH2 降解剂，以靶向淋巴瘤中的整个 EZH2。设计并合成了两个系列的 EZH2 降解剂来劫持包含 von Hippel-Lindau (VHL) 或 cereblon (CRBN) 的 E3 连接酶系统，并且一些基于 VHL 的化合物能够介导 EZH2 降解。两种最好的降解剂 YM181 和 YM281 在弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 和其他亚型淋巴瘤中诱导强烈的细胞活力抑制，优于临床使用的 EZH2 抑制剂 EPZ6438 (tazemetostat)，后者仅对 DLBCL 有效。EZH2 降解剂在淋巴瘤异种移植物和患者来源的原发性淋巴瘤细胞中显示出有希望的抗肿瘤活性。我们的研究表明，EZH2

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c00460

文献信息

• [EN] MERTK DEGRADERS AND USES THEREOF<br/>[FR] AGENTS DE DÉGRADATION DE MERTK ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：KYMERA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2020010210A1

  公开（公告）日：2020-01-09

  The present invention provides compounds, compositions thereof, and methods of using the same.

  本发明提供了化合物、其组合物以及使用相同的方法。
• A “Click Chemistry Platform” for the Rapid Synthesis of Bispecific Molecules for Inducing Protein Degradation
  作者：Ryan P. Wurz、Ken Dellamaggiore、Hannah Dou、Noelle Javier、Mei-Chu Lo、John D. McCarter、Dane Mohl、Christine Sastri、J. Russell Lipford、Victor J. Cee

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01781

  日期：2018.1.25

  chimeras (PROTACs) are bispecific molecules containing a target protein binder and an ubiquitin ligase binder connected by a linker. By recruiting an ubiquitin ligase to a target protein, PROTACs promote ubiquitination and proteasomal degradation of the target protein. The generation of effective PROTACs depends on the nature of the protein/ligase ligand pair, linkage site, linker length, and linker composition

  蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 是双特异性分子，包含靶蛋白结合剂和通过接头连接的泛素连接酶结合剂。通过将泛素连接酶募集到靶蛋白，PROTAC 促进靶蛋白的泛素化和蛋白酶体降解。有效 PROTAC 的产生取决于蛋白质/连接酶配体对的性质、连接位点、接头长度和接头组成，所有这些都很难以系统的方式解决。在此，我们描述了一种用于合成 PROTAC 的“点击化学”方法。我们通过溴结构域和 extraterminal domain-4 (BRD4) 配体 JQ-1 (3) 以及靶向 cereblon (CRBN) 和 Von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白的连接酶结合剂证明了这种方法的效用。
• BRM TARGETING COMPOUNDS AND ASSOCIATED METHODS OF USE
  申请人：Arvinas Operations, Inc.

  公开号：US20190300521A1

  公开（公告）日：2019-10-03

  The present disclosure relates to bifunctional compounds, which find utility as modulators of SMARCA2 or BRM (target protein). In particular, the present disclosure is directed to bifunctional compounds, which contain on one end a ligand that binds to the Von Hippel-Lindau E3 ubiquitin ligase, and on the other end a moiety which binds the target protein, such that the target protein is placed in proximity to the ubiquitin ligase to effect degradation (and inhibition) of target protein. The present disclosure exhibits a broad range of pharmacological activities associated with degradation/inhibition of target protein. Diseases or disorders that result from aggregation or accumulation of the target protein are treated or prevented with compounds and compositions of the present disclosure.

  本公开涉及双功能化合物，其作为SMARCA2或BRM（靶蛋白）的调节剂具有实用性。具体而言，本公开涉及包含一端结合Von Hippel-Lindau E3泛素连接酶的配体，另一端结合靶蛋白的双功能化合物，使得靶蛋白与泛素连接酶靠近以实现靶蛋白的降解（和抑制）。本公开展示了与靶蛋白降解/抑制相关的广泛药理活性。本公开的化合物和组合物用于治疗或预防由靶蛋白聚集或积累导致的疾病或紊乱。
• IRAK DEGRADERS AND USES THEREOF
  申请人：Kymera Therapeutics, Inc.

  公开号：US20190192668A1

  公开（公告）日：2019-06-27

  The present invention provides compounds, compositions thereof, and methods of using the same.

  本发明提供了化合物、其组合物以及使用这些化合物的方法。
• [EN] POLYCYCLIC COMPOUNDS AND METHODS FOR THE TARGETED DEGRADATION OF RAPIDLY ACCELERATED FIBROSARCOMA POLYPEPTIDES<br/>[FR] COMPOSÉS POLYCYCLIQUES ET MÉTHODES POUR LA DÉGRADATION CIBLÉE DE POLYPEPTIDES DU FIBROSARCOME RAPIDEMENT ACCÉLÉRÉ
  申请人：ARVINAS OPERATIONS INC

  公开号：WO2020051564A1

  公开（公告）日：2020-03-12

  The present disclosure relates to bifunctional compounds, ULM— L—PTM, which find utility as modulators of Rapidly Accelerated Fibrosarcoma (RAF, such as c-RAF, A- RAF and/or B-RAF; the target protein). In particular, the present disclosure is directed to bifunctional compounds, which contain on one end a Von Hippel-Lindau, cereblon, Inhibitors of Apotosis Proteins or mouse double-minute homolog 2 ligand which binds to the respective E3 ubiquitin ligase and on the other end a moiety which binds the target protein RAF, such that the target protein is placed in proximity to the ubiquitin ligase to effect degradation (and inhibition) of target protein. The present disclosure exhibits a broad range of pharmacological activities associated with degradation/inhibition of target protein. Diseases or disorders that result from aggregation or accumulation of the target protein, or the constitutive activation of the target protein, are treated or prevented with compounds and compositions of the present disclosure.

  本公开涉及双功能化合物ULM—L—PTM，其作为快速加速纤维肉瘤（RAF，如c-RAF、A-RAF和/或B-RAF；目标蛋白）的调节剂具有实用性。具体而言，本公开涉及含有一端结合到相应E3泛素连接酶的Von Hippel-Lindau、cereblon、凋亡抑制蛋白或鼠双分子同源物2配体的双功能化合物，另一端结合到目标蛋白RAF的部分，使得目标蛋白与泛素连接酶靠近，以实现目标蛋白的降解（和抑制）。本公开展示了与目标蛋白的降解/抑制相关的广泛药理活性范围。本公开的化合物和组合物用于治疗或预防由目标蛋白的聚集或积累，或目标蛋白的构成性激活导致的疾病或紊乱。