N-苯甲酰-2'-脱氧-3'-O-(1,1-二甲基乙基)二甲基硅氧基-腺苷 | 51549-40-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: N-苯甲酰-2'-脱氧-3'-O-(1,1-二甲基乙基)二甲基硅氧基-腺苷
• 中文别名: N-(9-((2R,4S,5R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-5-(羟甲基)四氢呋喃-2-基)-9H-嘌呤-6-基)苯甲酰胺
• 英文名称: 6-N-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: N⁵-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine；N⁶-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxyadenosine；3'-O-(tert-butyl)dimethylsilyl-N⁶-benzoyl-2'-deoxyadenosine；N-benzoyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyldeoxyadenosine；N⁶-benzoyl-O^3'-(tert-butyl-dimethyl-silanyl)-2'-deoxy-adenosine；N-(9-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)benzamide；N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 51549-40-7
• 化学式: C₂₃H₃₁N₅O₄Si
• 分子量: 469.616
• InChiKey: JGELYOCTJSVMRL-RCCFBDPRSA-N

物化性质

• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.75
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-苯甲酰-2'-脱氧-3'-O-(1,1-二甲基乙基)二甲基硅氧基-腺苷 在 吡啶 、 咪唑 、 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 potassium tert-butylate 、 四丁基氟化铵 、 对甲苯磺酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 甲胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
  参考文献：
  名称：

  4'-C-氰基-和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷的设计，高效合成和抗HIV活性。

  摘要：

  一些4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷在一系列4'-C-取代的2'-脱氧核苷中显示出最有效的抗HIV活性，其4'-C取代基为甲基，乙基，乙炔基和以此类推。我们的假设是，它们在C-4'位的取代基越小，它们显示出的生物活性就越好。因此，取代基小于乙炔基的4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷将具有更强的抗病毒活性。为了证明我们的假设，我们计划开发4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'-CNdNs）和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'- EdNs）。因此，我们成功开发了六个2'的有效合成 -在2'-脱氧腺苷和2,6-二氨基嘌呤2'-脱氧核糖苷的糖部分的C-4'位置带有氰基或乙炔基的-脱氧嘌呤核苷。不幸的是，4'-C-氰基衍生物显示出较低的抗HIV-1活性，而两种4'-C-乙炔基衍生物表明其体内毒性很高。

  DOI：

  10.1081/ncn-120037508
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯基)-2'-脱氧腺苷 在 吡啶 、 咪唑 、 溶剂黄146 作用下， 反应 20.5h， 生成 N-苯甲酰-2'-脱氧-3'-O-(1,1-二甲基乙基)二甲基硅氧基-腺苷
  参考文献：
  名称：

  含有桥联的非手性核苷酸间3'-氨基磷酸酯键的寡脱氧核苷酸的合成和选择性切割

  摘要：

  使用固相亚磷酰胺方法制备了包含非手性桥连的3'-氨基磷酸酯键3'-NH-PO-5'的自互补寡聚脱氧核苷酸十二聚体。通过温和的酸解可以选择性地完成PN键的切割。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)60176-4

文献信息

• <i>cis</i>-Tetrahydrofuran-3,4-diol Structure as a Key Skeleton of New Protecting Groups Removable by Self-Cyclization under Oxidative Conditions
  作者：Eri Utagawa、Mitsuo Sekine、Kohji Seio

  DOI：10.1021/jo061006v

  日期：2006.9.1

  once-generated neighboring hydroxyl group on the acyl carbon. It turned out that these acyl groups could be introduced into the 5‘-hydroxyl group of a 3‘-O-protected thymidine derivative by use of the corresponding acyl imidazolides or 4-nitrophenyl esters as well as by reaction with carbonyldiimidazole or 4-nitrophenyl chloroformate. Among the acyl groups tested, it was found that the CTFOC group could be

  已经研究了具有顺式-四氢呋喃-3,4-二醇（1,4-脱水赤藓糖醇）主链结构和TrS或MMTrS基团的各种碳酸酯型酰基基团，作为5'-羟基的新“保护”保护基团组核苷。这些酰基的设计方式是通过I 2促进去除TrS或MMTrS基团，然后进行自我环化，使涉及到一次生成的相邻羟基在分子内攻击酰基碳的分子进行自我环化，从而对它们进行脱保护。结果表明，这些酰基可以引入3'- O的5'-羟基通过使用相应的酰基咪唑啉化物或4-硝基苯基酯以及与羰基二咪唑或4-硝基苯基氯甲酸酯反应来保护-胸腺嘧啶核苷衍生物。在测试的酰基中，发现可以将CTFOC基团容易地引入3'-掩蔽的脱氧核糖核苷衍生物的5'-羟基中，并在温和的条件下使用碘将其迅速去除。
• [EN] CYCLIC DINUCLEOTIDES AS STING AGONISTS<br/>[FR] DINUCLÉOTIDES CYCLIQUES UTILISÉS EN TANT QU'AGONISTES DE STING
  申请人：JANSSEN BIOTECH INC

  公开号：WO2019118839A1

  公开（公告）日：2019-06-20

  Disclosed are compounds, compositions and methods for treating of diseases, syndromes, or disorders that are affected by the modulation of STING. Such compounds are represented by Formula (I) as follows: wherein B2,X2, R2a, R2b, R2c, Z-M-Y, Y1-M1Z1, B1, X1, R1a, R1b, R1c are as defined herein.

  揭示了一种通过调节STING来治疗受影响的疾病、综合征或紊乱的化合物、组合物和方法。这些化合物由以下式（I）表示：其中B2、X2、R2a、R2b、R2c、Z-M-Y、Y1-M1Z1、B1、X1、R1a、R1b、R1c如本文所定义。
• Enantiodivergent Formation of C–P Bonds: Synthesis of P-Chiral Phosphines and Methylphosphonate Oligonucleotides
  作者：Dongmin Xu、Nazaret Rivas-Bascón、Natalia M. Padial、Kyle W. Knouse、Bin Zheng、Julien C. Vantourout、Michael A. Schmidt、Martin D. Eastgate、Phil S. Baran

  DOI：10.1021/jacs.9b13898

  日期：2020.3.25

  Phosphorous Incorporation (PI, abbreviated Π) reagents for the modular, scalable, and stereospecific synthesis of chiral phosphines and methyl-phosphonate nucleotides are reported. Synthesized from trans-limonene oxide, this reagent class displays an unexpected reactivity profile and enables access to chemical space distinct from that of the Phosphorous-Sulfur Incorporation reagents previously disclosed

  报告了用于手性膦和甲基膦酸核苷酸的模块化、可扩展和立体特异性合成的磷结合 (PI，缩写为 Π) 试剂。该试剂类由反式柠檬烯氧化物合成，显示出意想不到的反应性特征，并能够进入与之前公开的磷硫结合试剂不同的化学空间。在这里，适应性强的磷 (V) 支架能够连续添加碳亲核试剂以产生各种对映纯 CP 构建块。将三个碳亲核试剂添加到 Π，然后进行立体有择还原，得到有用的 P-手性膦；引入而不是单个甲基揭示了甲基膦酸酯寡核苷酸前体的首次立体定向合成。虽然两种 Π 对映异构体都可用，
• Stereochemistry of oxidation of diastereoisomeric d(TpA) phosphonates with sulphur and iodine–[¹⁸O]water
  作者：Frank Seela、Uwe Kretschmer

  DOI：10.1039/c39900001154

  日期：——

  Oxidation of the diastereoisomeric phosphonate diesters of d(TpA)(3a) or (3b) with sulphur showed that the reaction is stereospecific and proceeds with retention of configuration; oxidation with I2–H218O, however, leads to (Sp)-[18O]d(TpA), preferentially, regardless of the diastereoisomeric phosphonate diester used.

  d（T p A）（3a）或（3b）的非对映异构膦酸酯二酯被硫氧化后，表明该反应具有立体特异性，并保持构型；氧化与I 2 -H 2 18 O，然而，导致（SP） - [ 18 O] d（T p A），优选，而不管非对映异构膦酸二酯的使用。
• One-Pot Synthesis of Dinucleoside (3′,5′)-Methylphosphonothioates and their Seleno Congeners via the Phosphonotriazolidite Approach
  作者：Lucyna Wozniak、Malgorzata Bukowiecka-Matusiak、Marcin Gora、Wojciech Stec

  DOI：10.1055/s-2006-941577

  日期：2006.6

  An efficient method for large laboratory scale synthesis of dinucleoside (3',5')-methylphosphonothioates and their methylphosphonoselenoate congeners is presented. Bis-(1,2,4-triazoloyl)methylphosphonite generated in situ from methyldichlorophosphine is used as a phosphitylating agent and the preparations are performed as one-pot-reactions without isolation of the reactive PIII intermediates.

  提出了一种用于大规模实验室规模合成二核苷 (3',5')-甲基硫代膦酸酯及其甲基膦酰硒酸酯同系物的有效方法。由甲基二氯膦原位生成的双-(1,2,4-三唑酰基)甲基亚膦酸酯用作亚磷酸化剂，制备过程为一锅反应，无需分离反应性 PIII 中间体。