(2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol | 306305-07-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
• 英文别名: 9-(2-deoxy-4-C-ethynyl-β-D-ribopentofuranosyl)adenine；2'-deoxy-4'-C-ethynyladenosine；4'-ethynyl-2'-deoxyadenosine；4′-ethynyl-2′-deoxyadenosine；EdA；4'-C-ethynyl-2'-deoxyadenosine；(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 306305-07-7
• 化学式: C₁₂H₁₃N₅O₃
• 分子量: 275.267
• InChiKey: HMIGVKANVVLEOA-JOAULVNJSA-N

物化性质

• 沸点：
  608.8±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1?+-.0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于二甲基亚砜

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 储存条件：
  -20°C，干燥，密封

制备方法与用途

4'-乙炔基-2'-脱氧腺苷（4'-E-dA）是一种核苷逆转录酶（RT）抑制剂，属于抗病毒药物，对耐药HIV变异体有较强的抑制作用，在MT-4细胞中的EC50值为98 nM。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol 在 bovine intestine adenosine deaminase 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 4'-ethynyl-2'-deoxyinosine
  参考文献：
  名称：

  Effects of Substitutions at the 4′ and 2 Positions on the Bioactivity of 4′-Ethynyl-2-Fluoro-2′-Deoxyadenosine

  摘要：

  摘要 核苷（t）ide 逆转录酶抑制剂（NRTIs）是大多数抗艾滋病毒疗法的支柱。我们已经证明，4′-乙炔基-2-氟-2′-脱氧腺苷（EFdA）是一种高效的 NRTI；然而，EFdA 具有强大抗病毒活性的原因还不十分清楚。在这里，我们结合使用了结构、计算和生化方法，研究糖环或腺嘌呤环中的取代如何影响 EFdA 等基于 dA 的 NRTI 通过 HIV RT 结合到 DNA 中，以及它们对腺苷脱氨酶（ADA）脱氨作用的敏感性。对 4′-取代的 NRTI 进行的核磁共振（NMR）光谱研究表明，乙炔基或氰基能使糖环稳定在 C-2′-exo/C-3′-endo （北）构象。对 4′-取代的 NRTI 通过 RT 结合的稳态动力学分析表明，NRTI 糖环的北构象与结合到新生 DNA 链的效率之间存在相关性。结构分析和 ADA 脱氨动力学表明，4′-乙炔基和氰基取代会通过活性位点的立体相互作用降低腺苷基化合物对 ADA 的敏感性。不过，降低对 ADA 易感性的主要决定因素是 2-卤取代，它改变了 pK a 的 pK a。这些结果让我们深入了解了 NRTI 的结构属性如何通过与 RT 和 ADA 活性位点的相互作用影响其抗病毒活性。

  DOI：

  10.1128/aac.01703-13
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯基)-2'-脱氧腺苷 在 吡啶 、 咪唑 、 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 potassium tert-butylate 、 四丁基氟化铵 、 对甲苯磺酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 甲胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-ethynyl-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol
  参考文献：
  名称：

  4'-C-氰基-和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷的设计，高效合成和抗HIV活性。

  摘要：

  一些4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷在一系列4'-C-取代的2'-脱氧核苷中显示出最有效的抗HIV活性，其4'-C取代基为甲基，乙基，乙炔基和以此类推。我们的假设是，它们在C-4'位的取代基越小，它们显示出的生物活性就越好。因此，取代基小于乙炔基的4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷将具有更强的抗病毒活性。为了证明我们的假设，我们计划开发4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'-CNdNs）和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'- EdNs）。因此，我们成功开发了六个2'的有效合成 -在2'-脱氧腺苷和2,6-二氨基嘌呤2'-脱氧核糖苷的糖部分的C-4'位置带有氰基或乙炔基的-脱氧嘌呤核苷。不幸的是，4'-C-氰基衍生物显示出较低的抗HIV-1活性，而两种4'-C-乙炔基衍生物表明其体内毒性很高。

  DOI：

  10.1081/ncn-120037508

文献信息

• 4' -C-substituted-2-haloadenosine derivative
  申请人：Kohgo Satoru

  公开号：US20050215512A1

  公开（公告）日：2005-09-29

  The present invention provides a 4′-C-substituted-2-haloadenosine derivative represented by the following formula (wherein X represents a halogen atom, R 1 represents an ethynyl group or a cyano group, and R 2 represents hydrogen, a phosphate residue, or a phosphate derivative residue). The present invention also provides a pharmaceutical composition containing the derivative and a pharmaceutically acceptable carrier therefor.

  本发明提供了一种由以下公式表示的4'-C-取代-2-卤腺苷衍生物（其中X代表卤素原子，R1代表乙炔基或氰基，R2代表氢、磷酸残基或磷酸衍生物残基）。本发明还提供了含有该衍生物和药用可接受载体的药物组合物。
• [EN] ENGINEERED PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE VARIANT ENZYMES<br/>[FR] ENZYMES VARIANTES DE PURINE NUCLÉOSIDE PHOSPHORYLASE MODIFIÉES
  申请人：CODEXIS INC

  公开号：WO2020014047A1

  公开（公告）日：2020-01-16

  The present invention provides engineered purine nucleoside phosphorylase (PNP) enzymes, polypeptides having PNP activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PNP enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PNP enzymes and methods of using the engineered PNP enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

  本发明提供了经过工程改造的嘌呤核苷酸磷酸酶（PNP）酶、具有PNP活性的多肽以及编码这些酶的多核苷酸，以及包含这些多核苷酸和多肽的载体和宿主细胞。同时还提供了生产PNP酶的方法。本发明还提供了包含PNP酶的组合物以及使用经过工程改造的PNP酶的方法。本发明在制造药物化合物方面具有特殊用途。
• Synthesis of nucleotide analogues, EFdA, EdA and EdAP, and the effect of EdAP on hepatitis B virus replication
  作者：Mai Kamata、Toshifumi Takeuchi、Ei Hayashi、Kazane Nishioka、Mizuki Oshima、Masashi Iwamoto、Kota Nishiuchi、Shogo Kamo、Shusuke Tomoshige、Koichi Watashi、Shinji Kamisuki、Hiroshi Ohrui、Fumio Sugawara、Kouji Kuramochi

  DOI：10.1080/09168451.2019.1673696

  日期：2020.2.1

  4'-ethynyl-2'-deoxyadenosine (EdA) are nucleoside analogues which inhibit human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) reverse transcriptase. EdAP, a cyclosaligenyl (cycloSal) phosphate derivative of EdA, inhibits the replication of the influenza A virus. The common structural feature of these compounds is the ethynyl group at the 4'-position. In this study, these nucleoside analogues were prepared by a common

  4′-乙炔基-2-氟-2′-脱氧腺苷（EFdA）和4′-乙炔基-2′-脱氧腺苷（EdA）是抑制人免疫缺陷病毒1型（HIV-1）逆转录酶的核苷类似物。EdAP，EdA的磷酸环saligenyl（cycloSal）衍生物，可抑制甲型流感病毒的复制。这些化合物的共同结构特征是在4'-位的乙炔基。在这项研究中，这些核苷类似物是通过一种常见的合成策略从已知的1,2-二-O-乙酰基-D-呋喃核糖开始制备的。EdAP的生物学评估表明，该化合物可剂量依赖性地减少乙型肝炎病毒（HBV）复制，而对本研究中测试的宿主细胞无细胞毒性。
• [EN] 4'-C-ETHYNYL PURINE NUCLEOSIDES<br/>[FR] NUCLEOSIDES DE PURINE 4'-C-ETHYNYLE
  申请人：YAMASA CORP

  公开号：WO2000069877A1

  公开（公告）日：2000-11-23

  The invention provides 4'-C-ethynyl purine nucleosides represented by formula (I), wherein B represents a base selected from the group consisting of purine and derivatives thereof; X represents a hydrogen atom or a hydroxyl group; and R represents a hydrogen atom or a phosphate residue; and a pharmaceutical composition containing any one of the compounds and a pharmaceutically acceptable carrier. Preferably, the composition is used as an anti-HIV agent or a drug for treating AIDS.

  该发明提供了由式(I)表示的4'-C-乙炔基嘌呤核苷，其中B代表从嘌呤及其衍生物组成的群体中选择的碱基；X代表氢原子或羟基；而R代表氢原子或磷酸盐残基；以及含有任何一种化合物和药学上可接受的载体的制药组合物。最好，该组合物用作抗HIV剂或治疗艾滋病的药物。
• 4'-C-ethynyl pyrimidine nucleoside compounds
  申请人：——

  公开号：US20020022722A1

  公开（公告）日：2002-02-21

  The invention provides 4′-C-ethynyl pyrimidine nucleosides (other than 4′-C-ethynylthymidine) represented by formula [I]: 1 wherein B represents a base selected from the group consisting of pyrimidine and derivatives thereof; X represents a hydrogen atom or a hydroxyl group; and R represents a hydrogen atom or a phosphate residue; and a pharmaceutical composition containing any one of the compounds and a pharmaceutically acceptable carrier. Preferably, the composition is used as an anti-HIV agent or a drug for treating AIDS.

  本发明提供了4'-C-乙炔基嘧啶核苷（不包括4'-C-乙炔基胸腺嘧啶）的化合物，其化学式为[I]：其中B代表从嘧啶和其衍生物中选择的碱基；X代表氢原子或羟基；R代表氢原子或磷酸残基；以及含有上述任一化合物和药学上可接受的载体的制药组合物。优选地，该组合物用作抗HIV剂或治疗艾滋病的药物。