4′-C-cyano-2′-deoxyadenosine | 583047-53-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 4′-C-cyano-2′-deoxyadenosine
• 英文别名: 4'-C-cyano-2'-deoxyadenosine；4'-cyano-2'-deoxyadenosine；CNdA；2'-deoxy-4'-cyanoadenosine；(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-carbonitrile；(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolane-2-carbonitrile
• CAS: 583047-53-4
• 化学式: C₁₁H₁₂N₆O₃
• 分子量: 276.255
• InChiKey: VULVVXJCXNIUHO-MVKOHCKWSA-N

物化性质

• 沸点：
  716.6±70.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.85±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  143
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4′-C-cyano-2′-deoxyadenosine 在 bovine intestine adenosine deaminase 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 4'-C-cyano-2-deoxyinosine
  参考文献：
  名称：

  Effects of Substitutions at the 4′ and 2 Positions on the Bioactivity of 4′-Ethynyl-2-Fluoro-2′-Deoxyadenosine

  摘要：

  摘要 核苷（t）ide 逆转录酶抑制剂（NRTIs）是大多数抗艾滋病毒疗法的支柱。我们已经证明，4′-乙炔基-2-氟-2′-脱氧腺苷（EFdA）是一种高效的 NRTI；然而，EFdA 具有强大抗病毒活性的原因还不十分清楚。在这里，我们结合使用了结构、计算和生化方法，研究糖环或腺嘌呤环中的取代如何影响 EFdA 等基于 dA 的 NRTI 通过 HIV RT 结合到 DNA 中，以及它们对腺苷脱氨酶（ADA）脱氨作用的敏感性。对 4′-取代的 NRTI 进行的核磁共振（NMR）光谱研究表明，乙炔基或氰基能使糖环稳定在 C-2′-exo/C-3′-endo （北）构象。对 4′-取代的 NRTI 通过 RT 结合的稳态动力学分析表明，NRTI 糖环的北构象与结合到新生 DNA 链的效率之间存在相关性。结构分析和 ADA 脱氨动力学表明，4′-乙炔基和氰基取代会通过活性位点的立体相互作用降低腺苷基化合物对 ADA 的敏感性。不过，降低对 ADA 易感性的主要决定因素是 2-卤取代，它改变了 pK a 的 pK a。这些结果让我们深入了解了 NRTI 的结构属性如何通过与 RT 和 ADA 活性位点的相互作用影响其抗病毒活性。

  DOI：

  10.1128/aac.01703-13
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯基)-2'-脱氧腺苷 在 吡啶 、 咪唑 、 ammonium hydroxide 、 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 盐酸羟胺 、 四丁基氟化铵 、 对甲苯磺酸 、 甲基磺酰氯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 7.25h， 生成 4′-C-cyano-2′-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  4'-C-氰基-和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷的设计，高效合成和抗HIV活性。

  摘要：

  一些4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷在一系列4'-C-取代的2'-脱氧核苷中显示出最有效的抗HIV活性，其4'-C取代基为甲基，乙基，乙炔基和以此类推。我们的假设是，它们在C-4'位的取代基越小，它们显示出的生物活性就越好。因此，取代基小于乙炔基的4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷将具有更强的抗病毒活性。为了证明我们的假设，我们计划开发4'-C-氰基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'-CNdNs）和4'-C-乙炔基-2'-脱氧嘌呤核苷（4'- EdNs）。因此，我们成功开发了六个2'的有效合成 -在2'-脱氧腺苷和2,6-二氨基嘌呤2'-脱氧核糖苷的糖部分的C-4'位置带有氰基或乙炔基的-脱氧嘌呤核苷。不幸的是，4'-C-氰基衍生物显示出较低的抗HIV-1活性，而两种4'-C-乙炔基衍生物表明其体内毒性很高。

  DOI：

  10.1081/ncn-120037508

文献信息

• Synthesis of 4′-<i>C</i>-Ethynyl and 4′-<i>C</i>-Cyano Purine Nucleosides from Natural Nucleosides and Their Anti-HIV Activity
  作者：Satoru Kohgo、Kohei Yamada、Kenji Kitano、Shinji Sakata、Hiroyuki Hayakawa、Daisuke Nameki、Eiichi Kodama、Masao Matsuoka、Hiroaki Mitsuya、Hiroshi Ohrui

  DOI：10.1081/ncn-120022678

  日期：2003.10

  Purine 2'-deoxynucleosides bearing an ethynyl or a cyano group at C-4' of the sugar moiety were synthesized from the corresponding 2'-deoxynucleosides. These compounds exhibited very potent anti-HIV activity, and remained active against drug resistant HIV strains.
• US5192749A
  申请人：——

  公开号：US5192749A

  公开（公告）日：1993-03-09