N2-异丁酰-2'-甲氧基鸟苷 | 63264-29-9

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 脱氧核苷酸及其类似物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: N2-异丁酰-2'-甲氧基鸟苷
• 英文名称: N²-isobutyryl-2'-O-methylguanosine
• 英文别名: N2-Isobutyryl-2'-O-methyl-guanosine；N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-methoxyoxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 63264-29-9
• 化学式: C₁₅H₂₁N₅O₆
• 分子量: 367.362
• InChiKey: RPULCYXEYODQOG-AKAIJSEGSA-N

物化性质

• 密度：
  1.68±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P264,P271,P280,P302+P352,P304+P340,P305+P351+P338,P312,P362,P403+P233,P501
• 危险性描述：
  H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

N2-异丁基-2'-O-甲基鸟苷（N2-IBU-2'-OME-RG）是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要依赖于抑制DNA合成和诱导细胞凋亡等过程。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-异丁酰-2'-甲氧基鸟苷 在 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 12.0h， 以91.5%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  [EN] SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (SINA) MOLECULES AND USES THEREOF FOR CORONAVIRUS DISEASES
  [FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE INTERFÉRENT COURT (SINA) ET LEURS UTILISATIONS POUR LES MALADIES À CORONAVIRUS

  摘要：

  本发明涉及制药化合物和制剂领域，以及它们在治疗疾病中的使用方法。描述了包含修饰核苷酸的短干扰核酸（siNA）分子，含有这些分子的组合物，以及用于治疗或预防冠状病毒感染的用途。具体来说，本发明涉及对广泛谱的冠状病毒，尤其是β-冠状病毒，包括引发COVID-19的SARS-CoV-2的有效siNA分子领域。

  公开号：

  WO2021207637A1
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 吡啶 、 三乙烯二胺 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydroxide 、 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.08h， 生成 N2-异丁酰-2'-甲氧基鸟苷
  参考文献：
  名称：

  通过O 6-三甲基甲硅烷基乙基-3'，5'-二叔丁基硅烷二基鸟苷的有效烷基化，方便地合成N 2-异丁酰基-2'- O-甲基鸟苷

  摘要：

  我们提出了一种新颖的合成N 2-异丁酰基-2' - O-甲基鸟苷的途径，引入了3'，5'-二叔丁基甲硅烷基和O 6-三甲基甲硅烷基乙基作为2'- O-期间的有效保护剂。用NaH / CH 3 I进行甲基化步骤。然后用TBAF在单个步骤中同时除去这些保护基。八步合成很容易进行，使用方便的市售试剂。粗混合物的纯度令人满意，因此仅需进行三次色谱纯化。从鸟苷中以25％的总收率获得标题化合物。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2007.08.006

文献信息

• Process for the preparation of 2'-O-alkyl purine phosphoramidites
  申请人：Isis Pharmceuticals, Inc.

  公开号：US05646265A1

  公开（公告）日：1997-07-08

  2'-O-alkylated guanosine, uridine, cytidine, and 2,6-diaminopurine 3'-O-phosphoramidites are prepared by alkylating nucleoside precursors, adding suitable blocking groups and phosphitylating. Alkylation is effected on 2,6-diamino-9-(.beta.-D-ribofuranosyl)purine followed by deamination to prepare guanosine 2'-O-alkylated 3'-O-phosphormidites. Alkylation is effected on a dialkyl stannylene derivative of uridine to prepare uridine 2'-O-alkylated 3'-O-phosphormidites. Alkylation is effected directly on cytidine to prepare cytidine 2'-O-alkylated 3'-O-phosphormidites. Alkylation is effected directly on 2,6-diaminopurine to prepare 2,6-diaminopurine 2'-O-alkylated 3'-O-phosphormidites.

  2'-O-烷基化鸟苷、尿苷、胞苷和2,6-二氨基嘌呤3'-O-磷酰胺酯是通过烷基化核苷前体、添加适当的阻断基团和磷酰化来制备的。烷基化是在2,6-二氨基-9-(β-D-核糖呋喃基)嘌呤上进行的，随后进行去氨基化以制备鸟苷2'-O-烷基化3'-O-磷酰胺酯。烷基化是在尿苷的二烷基基锡衍生物上进行的，以制备尿苷2'-O-烷基化3'-O-磷酰胺酯。烷基化是直接在胞苷上进行的，以制备胞苷2'-O-烷基化3'-O-磷酰胺酯。烷基化是直接在2,6-二氨基嘌呤上进行的，以制备2,6-二氨基嘌呤2'-O-烷基化3'-O-磷酰胺酯。
• Methods for synthesizing nucleosides, nucleoside derivatives and non-nucleoside derivatives
  申请人：——

  公开号：US20020120129A1

  公开（公告）日：2002-08-29

  The present invention provides methods for the chemical synthesis of nucleosides and derivatives thereof, including 2′-amino, 2′-N-phthaloyl, 2′-O-methyl, 2′-O-silyl, 2′OH nucleosides, C-nucleosides, nucleoside phosphoramidites, C-nucleoside phosphoramidites, and non-nucleoside derivatives.

  本发明提供了核苷及其衍生物的化学合成方法，包括2'-氨基、2'-N-邻苯二甲酰基、2'-O-甲基、2'-O-硅基、2'-OH 核苷、C-核苷、核苷磷酰胺酯、C-核苷磷酰胺酯和非核苷衍生物。
• CAL-B-Catalyzed Acylation of Nucleosides and Role of the Sugar Conformation: An Improved Understanding of the Enzyme-Substrate Recognition
  作者：Saúl Martínez-Montero、Susana Fernández、Yogesh S. Sanghvi、Vicente Gotor、Miguel Ferrero

  DOI：10.1002/ejoc.201200609

  日期：2012.10

  that the sugar ring conformation of nucleosides plays a critical role during Candida antarctica lipase B (CAL-B) catalyzed acylation. Specifically, the North (N), but not the South (S) nucleoside sugar ring conformation is preferred for efficient binding at the catalytic site. In this study, we used nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy experiments to establish the sugar ring conformation of nucleosides

  我们证明核苷的糖环构象在南极念珠菌脂肪酶 B (CAL-B) 催化酰化过程中起着关键作用。具体而言，北 (N) 而非南 (S) 核苷糖环构象对于在催化位点的有效结合是优选的。在这项研究中，我们使用核磁共振 (NMR) 光谱实验来建立核苷的糖环构象，并进行分子建模研究以支持观察结果。与具有 S 构象的 2'-脱氧核苷相比，具有 N-构象的核糖和 2'-取代的 (OMe, F) 核苷经历快速而容易的酰化。这项研究提高了我们对糖构象在使用 CAL-B 进行生物转化过程中酶-底物识别中所起关键作用的理解。
• Improved Synthetic Approaches Toward 2′-O-Methyl-Adenosine and Guanosine and Their N-Acyl Derivatives
  作者：Leonid Beigelman、Peter Haeberli、David Sweedler、Alexander Karpeisky

  DOI：10.1016/s0040-4020(00)00002-8

  日期：2000.2

  We developed several improved approaches toward 2′-O-methyl adenosine and guanosine and their N-acyl derivatives. (a) Transglycosylation of N4-acetyl-5′, 3′-di-O-acetyl-2′-O-methyl cytidine with N6-Bz-adenine provided N6-benzoyl-5′3′-di-O-acetyl-2′-O-methyl adenosine in 50% yield. (b) Regioselective methylation of 2-amino-6-chloro purine riboside with MeI/NaH followed by hydrolysis provided 2′-O-Me-guanosine

  我们针对2'- O-甲基腺苷和鸟苷及其N-酰基衍生物开发了几种改进的方法。（a）用N 6 -Bz-腺嘌呤将N 4-乙酰基-5'，3'-二-O-乙酰基-2'- O-甲基胞苷进行糖基化，得到N 6-苯甲酰基-5'3'-二-O -乙酰基-2'- O-甲基腺苷，产率为50％。（b）用MeI / NaH对2-氨基-6-氯嘌呤核糖核苷进行区域选择性甲基化，然后水解，从而以高收率提供了2' - O -Me-鸟苷。相同的2' - O -Me前体被转化为2'- O-Me-腺苷，收率58％。（c）通过5'，3'- O- TIPDSi衍生物的甲基化和选择性的N 2-，将2，6-二氨基嘌呤核糖苷非常有效地转化为N 2-异丁酰基（异丙基苯氧基乙酰基）2' - O - Me-鸟苷。酰化，脱氨基和去甲硅烷基化可提供目标化合物的70％合并收率。（d）N 1 -Bzl-鸟苷的Mg 2+和Ag +定向甲基化以大于80％的产率进行，比率为2'-
• TRINUCLEOTIDE MRNA CAP ANALOGS
  申请人：Arcturus Therapeutics, Inc.

  公开号：US20180105551A1

  公开（公告）日：2018-04-19

  What is described is a trinucleotide cap analog comprising m 7 G(5′)p 3 -N 1 pN 2 for increased efficiency of in vitro transcription of m7G(5′)p 3 -RNA, wherein m 7 G is N 7 -methylguanosine or analog, (5′)p 3 is a 5′,5′-triphosphate bridge, and N 1 or N 2 or both ribonucleotide analogs linked to each other by a phosphate, p, and wherein the trinucleotide cap analog increases the efficiency of in vitro transcription.

  所描述的是一种三核苷酸帽结构的类似物，包括m7G(5′)p3-N1pN2，用于增加m7G(5′)p3-RNA的体外转录效率，其中m7G是N7-甲基鸟嘌呤或类似物，(5′)p3是5′,5′-三磷酸桥，N1或N2或两者都是核苷酸类似物，通过磷酸连接在一起，所述的三核苷酸帽结构类似物可以提高体外转录效率。