9-{2-deoxy-3,5-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)(dimethyl)silyl]-β-D-erythro-pentofuranosyl}-6-{[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]oxy}-9H-purin-2-amine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-{2-deoxy-3,5-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)(dimethyl)silyl]-β-D-erythro-pentofuranosyl}-6-{[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]oxy}-9H-purin-2-amine
• 英文别名: 2',3',5'-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O6-[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]guanosine；[2-amino-9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]purin-6-yl] 2,4,6-trimethylbenzenesulfonate
• 化学式: C₃₇H₆₅N₅O₇SSi₃
• 分子量: 808.275
• InChiKey: LLHCOBAKLRARTL-QBVBFOPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.8
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  158
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-{2-deoxy-3,5-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)(dimethyl)silyl]-β-D-erythro-pentofuranosyl}-6-{[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]oxy}-9H-purin-2-amine 在 吡啶 、 亚硝酸特丁酯 、 氟化氢吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.12h， 以44%的产率得到2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O6-(mesitylsulfonyl)-2-fluoro-inosine
  参考文献：
  名称：

  鸟嘌呤核苷的 光不稳定性N-羟基吡啶-2（1 H）-one衍生物：独立的鸟嘌呤自由基产生的新方法†

  摘要：

  一电子氧化 鸟嘌呤壳聚糖是在DNA中氧化产生的损伤的形成中的重要反应中间体，并且已采用多种方法从鸟嘌呤部分提取单个电子。在这项研究中，利用鸟嘌呤基团的位点特异性，独立生成的另一种方法是利用N-羟基吡啶-2（1 H）-one 作为...的光不稳定改性剂 鸟嘌呤，建议。新型光不稳定6-[（1-氧化-2-吡啶基）氧代] -6-脱氧- 和 2'，6-二脱氧鸟苷 能够产生中性的衍生物 鸟嘌呤 激进的 （G（-H）˙）经光解合成并表征。的一代G（-H）˙ 通过N–O键的均相分解可以继续进行，并通过连续的光解产物分析和捕集研究以及激光闪光光解实验得到了证实。

  DOI：

  10.1039/b909138f
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 9-{2-deoxy-3,5-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)(dimethyl)silyl]-β-D-erythro-pentofuranosyl}-6-{[(2,4,6-trimethylphenyl)sulfonyl]oxy}-9H-purin-2-amine
  参考文献：
  名称：

  O6-Alkyl-2-Haloinosine 衍生物的 C?C 交叉偶联反应和单锅交叉偶联/O6-脱保护程序

  摘要：

  研究了O 6 -烷基-2-溴-和2-氯肌苷衍生物与芳基-、杂芳基-和烷基硼酸的C  C交叉偶联反应条件。使用甲硅烷基保护的 2-溴-O 6-甲基肌苷进行优化实验，确定 [PdCl 2 (dcpf)]/K 3 PO 4在 1,4-二恶烷中是这些反应的最佳条件 (dcpf=1,1 '-双（二环己基膦）二茂铁）。尝试O 6 去甲基化以及用胺取代 C-6 甲氧基均不成功，这导致考虑 Pd 可裂解基团，例如 C  C 交叉偶联和O6-脱保护可以一步完成。因此，选择肌苷 2-氯-O 6 -烯丙基肌苷作为底物，并在以 2-氯-O 6 -甲基肌苷为模型底物重新评估交叉偶联条件后，一步 C  C 交叉-用O 6 -烯丙基类似物进行偶联/去保护反应。这些反应是在 C  C 交叉偶联条件下对嘌呤核苷进行修饰和脱保护的单锅程序的第一个例子。

  DOI：

  10.1002/asia.201200093

文献信息

• Modification of Guanine with PhotolabileN-Hydroxypyridine-2(1H)-thione: Monomer Synthesis, Oligonucleotide Elaboration, and Photochemical Studies
  作者：Despoina Vrantza、Panagiotis Kaloudis、Leondios Leondiadis、Thanasis Gimisis、Georgios C. Vougioukalakis、Michael Orfanopoulos、Didier Gasparutto、Jean Cadet、Susana Encinas、Cecilia Paris、Miguel A. Miranda

  DOI：10.1002/hlca.200690220

  日期：2006.10

  N-hydroxypyridine-2(1H)-thione (NHPT), inserted as a photolabile modifier at the 6-position of 2′-deoxyguanosine or guanosine, has been evaluated. In particular, 6-[(1-oxidopyridin-2-yl)sulfanyl]- (1a) and 6-[(pyridin-2-yl)sulfanyl]-2′,6-dideoxyguanosine (2a), novel photolabile derivatives of the natural nucleosides, were synthesized and characterized. The observed photolysis products of 1a in organic solvents

  已经评估了N-羟基吡啶-2（1 H）-硫酮（NHPT）的光化学性质，该化合物作为光不稳定的改性剂插入2'-脱氧鸟苷或鸟苷的6-位。特别是6-[（（1-氧化吡啶-2-基）硫烷基]-（1a）和6-[（吡啶-2-基）硫烷基] -2′，6-二脱氧鸟苷（2a），它们的新的光不稳定衍生物。合成并表征了天然核苷。观察到的1a在有机溶剂中的光解产物只能通过假设与相应的6-[（2-硫氧吡啶吡啶-1（2 H）-基）氧基]类似物3a快速平衡来合理化（方案5）。1a的瞬态光谱表示适用于三重态三重态能量转移或单重态氧产生的强三重态激发态。NHPT功能足够稳定，可以用于（稍加修饰的）自动化固相寡核苷酸合成。讨论了上述化合物的用途，以及它们在DNA中活性氧物种的光敏化中的潜在用途。