2’,3’,5’-O-tri(t-butyldimethylsilyl)-O⁶-methylguanosine | 869477-34-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2’,3’,5’-O-tri(t-butyldimethylsilyl)-O⁶-methylguanosine
• 英文别名: 2',3',5'-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-O6-methylguanosine；9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-methoxypurin-2-amine
• CAS: 869477-34-9
• 化学式: C₂₉H₅₇N₅O₅Si₃
• 分子量: 640.059
• InChiKey: BPFNUBWQWNQIBE-PTGPVQHPSA-N

物化性质

• 沸点：
  628.0±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.09±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.12
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2’,3’,5’-O-tri(t-butyldimethylsilyl)-O⁶-methylguanosine 在 四丁基氟化铵 、 氨 、 亚硝酸异戊酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 24.67h， 生成 海绵核苷
  参考文献：
  名称：

  A New Method for Synthesis of 2-Alkoxyadenosine Analogs

  摘要：

  O(6)-Methylguanosine and 2-amino-6-chloropurine riboside derivative were treated with isoamylnitrite in the presence of an appropriate alcohol to give the corresponding 2-alkoxy-6-methoxy (or chloro) purine riboside derivatives.

  DOI：

  10.3987/com-11-12295
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 咪唑 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 caesium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 2’,3’,5’-O-tri(t-butyldimethylsilyl)-O⁶-methylguanosine
  参考文献：
  名称：

  N-羟甲基化核碱基的 NMR分析–对甲醛毒性和核酸脱甲基酶的影响†

  摘要：

  甲醛是通过酶催化的脱甲基反应在细胞中产生的，包括那些在N-甲基化核酸上发生的反应。甲醛与核碱基反应形成N外源添加时可能导致其毒性/致癌性的-羟甲基化加合物，但这些反应的化学方法尚未完全定义。我们报告了甲醛与规范/修饰的核碱基反应的NMR研究。结果表明，用胸苷和尿苷一磷酸盐观察到，环内氮上的羟甲基大麻胺比环外氮上的同等大麻胺更快形成。然而，由腺嘌呤，鸟嘌呤和胞嘧啶形成的环外加合物在溶液中更稳定。核酸脱甲基酶（FTO）催化的（6-甲基）腺苷羟化反应导致（6-羟甲基）腺苷为主要观察产物。相反，没有证据表明FTO催化的（3-甲基）胸腺嘧啶核苷具有稳定的3-羟甲基加合物。总的来说，通过与甲醛反应或通过脱甲基酶催化而形成的核酸碱基的N-羟甲基化加合物具有基本不同的稳定性，其中一些足够稳定以在疾病或核酸/核碱基活性的调节中具有功能性作用。

  DOI：

  10.1039/c8ob00734a

文献信息

• One-Pot Synthesis of 2-Nitrooxyalkoxylated Inosine Analogs Using Cyclic Ether and Isoamyl Nitrite
  作者：Tokumi Maruyama、Norikazu Sakakibara、Masahiro Komatsu

  DOI：10.3987/com-11-12362

  日期：——

  An O 6 -methylguanosine derivative (1) was treated with isoamyl nitrite in the presence of a cyclic ether such as trimethylene oxide, tetrahydrofuran, or tetrahydropyran to give the corresponding 2-nitrooxyalkoxy-6-methoxypurine riboside derivatives (2a-c).

  在环醚如三亚甲基氧、四氢呋喃或四氢吡喃存在下，用亚硝酸异戊酯处理O 6 -甲基鸟苷衍生物(1)，得到相应的2-硝基氧基烷氧基-6-甲氧基嘌呤核苷衍生物(2a-c)。
• CC Cross‐Coupling Reactions of<i>O</i>⁶‐Alkyl‐2‐Haloinosine Derivatives and a One‐Pot Cross‐Coupling/<i>O</i>⁶‐Deprotection Procedure
  作者：Venkateshwarlu Gurram、Narender Pottabathini、Ramesh Garlapati、Avinash B. Chaudhary、Balaram Patro、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1002/asia.201200093

  日期：2012.8

  CC cross‐coupling and O6‐deprotection could be accomplished in a single step. Thus, inosine 2‐chloro‐O6‐allylinosine was chosen as the substrate and, after re‐evaluation of the cross‐coupling conditions with 2‐chloro‐O6‐methylinosine as a model substrate, one‐step CC cross‐coupling/deprotection reactions were performed with the O6‐allyl analogue. These reactions are the first such examples of a one‐pot

  研究了O 6 -烷基-2-溴-和2-氯肌苷衍生物与芳基-、杂芳基-和烷基硼酸的C  C交叉偶联反应条件。使用甲硅烷基保护的 2-溴-O 6-甲基肌苷进行优化实验，确定 [PdCl 2 (dcpf)]/K 3 PO 4在 1,4-二恶烷中是这些反应的最佳条件 (dcpf=1,1 '-双（二环己基膦）二茂铁）。尝试O 6 去甲基化以及用胺取代 C-6 甲氧基均不成功，这导致考虑 Pd 可裂解基团，例如 C  C 交叉偶联和O6-脱保护可以一步完成。因此，选择肌苷 2-氯-O 6 -烯丙基肌苷作为底物，并在以 2-氯-O 6 -甲基肌苷为模型底物重新评估交叉偶联条件后，一步 C  C 交叉-用O 6 -烯丙基类似物进行偶联/去保护反应。这些反应是在 C  C 交叉偶联条件下对嘌呤核苷进行修饰和脱保护的单锅程序的第一个例子。
• A simple method for C-6 modification of guanine nucleosides
  作者：Mahesh K. Lakshman、Josh Frank

  DOI：10.1039/b905298d

  日期：——

  to the O6-(benzotriazol-1-yl) derivatives via reaction with 1H-benzotriazol-1-yloxy-tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate (BOP) and 1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7ene (DBU). The easily isolated, stable and storable, O6-(benzotriazol-1-yl) guanosine derivatives upon exposure to a range of nucleophiles, under appropriate conditions, led to the C-6 modified 2-amino purine nucleoside analogues

  在 C-6 位置引入各种取代基的简便方法 鸟苷 和 2'-脱氧鸟苷被报道。在简单的 1 步转化中，叔丁基二甲基甲硅烷基保护的鸟苷和2'-脱氧鸟苷通过与 1 H-苯并三唑-1-基氧基-三（二甲氨基）鏻六氟磷酸盐 (BOP)反应转化为O 6 -(苯并三唑-1-基) 衍生物和1,8-二氮杂双环[5.4.0]undec-7ene(DBU)。容易分离、稳定和可储存的O 6 -(苯并三唑-1-基)鸟苷衍生物在适当条件下暴露于一系列亲核试剂后，以良好的产率得到 C-6 修饰的 2-氨基嘌呤核苷类似物。
• Reaction of O6-methylguanosine with nitrite in the presence of carboxylic acid: synthesis of the purin-2-yl carboxylate
  作者：Tokumi Maruyama、Nobuyasu Moriwaka、Yosuke Demizu、Masami Ohtsuka

  DOI：10.1016/j.tetlet.2005.09.140

  日期：2005.11

  O6-Methylguanosine derivative was treated with sodium nitrite or isoamylnitrite in the presence of carboxylic acid to give the purin-2-yl carboxylate, an unusual product bearing a carboxylic group at the 2-position of the purine moiety.

  在羧酸存在下，用亚硝酸钠或亚硝酸异戊酯处理O6-甲基鸟苷衍生物，得到嘌呤-2-基羧酸盐，其为嘌呤部分2-位带有羧基的不寻常产物。
• One-Pot Etherification of Purine Nucleosides and Pyrimidines
  作者：Hari Prasad Kokatla、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1021/ol101655h

  日期：2010.10.15

  A one-pot synthesis of ethers derived from inosine, guanosine, 2'-deoxyguanosine, and pyrimidinones is described Exposure of the heterocycle to 1H-benzotriazol-1-yloxy-tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate (BOP) and Cs2CO3 produces a reactive intermediate, which is converted to the desired ether by subsequent addition of an appropriate alcohol or phenol and Cs2CO3. Although rapid formation of HMPA from BOP can occur in the presence of an alcohol and base, as demonstrated by the reaction with methanol, under appropriate conditions these heteroaryl ethers can be efficiently synthesized