2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 5'-aldehyde | 161867-43-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 5'-aldehyde
• 英文别名: (2S,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolane-2-carbaldehyde
• CAS: 161867-43-2
• 化学式: C₂₁H₃₈N₂O₆Si₂
• 分子量: 470.714
• InChiKey: KQGNYKBKFZNGNB-VDHUWJSZSA-N

物化性质

• 密度：
  1.10±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.41
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.76
• 拓扑面积：
  94.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 5'-aldehyde 在 palladium on activated charcoal sodium hydroxide 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 62.0h， 生成 (2S)-2-amino-N-[3-[[(1R,2S)-1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]-3-(2,3-dihydroindol-1-yl)-1-hydroxy-3-oxopropan-2-yl]amino]propyl]-4-methylpentanamide
  参考文献：
  名称：

  基于硫酰化物的核苷型穆雷霉素抗生素的合成研究。具有生物活性的5'-表乡村霉素类似物的合成

  摘要：

  一种新的合成方法，以muraymycins的5差向异构体，复杂的核苷类抗生素家族，报道基于经由硫叶立德与尿苷酰醛衍生物的反应得到的环氧酰胺的合成16，29和30，随后随后的环氧乙烷与二胺的开环反应。这一新策略为制备具有生物学意义的穆雷霉素类似物提供了极好的机会。实际上，生物学研究表明，这些5'-表位分子在生物学上与天然抗生素一样有效，除了代表着一条趋向于天然同源物的趋同而灵活的途径外。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2005.09.086
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 二氯乙酸 、 二甲基亚砜 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 生成 2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 5'-aldehyde
  参考文献：
  名称：

  白霉素核苷抗生素硫庚糖核中非典型立体化学的生物合成起源

  摘要：

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b12565

文献信息

• Function-Oriented Synthesis of Liponucleoside Antibiotics
  作者：Tetsuya Tanino、Mayumi Yamaguchi、Akira Matsuda、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1002/ejoc.201400140

  日期：2014.3

  Function-oriented synthesis of a class of liponucleoside antibiotics was investigated through rational simplification guided by previous structure–activity relationship studies of caprazamycins and muraymycins to address the issue associated with their molecular complexity. A lactam-fused isoxazolidine scaffold was designed, and a diverse set of lactam-fused isoxazolidines derivatives were constructed

  以功能为导向的一类脂核苷类抗生素的合成是通过合理简化的方法进行研究的，该研究以先前对卡普拉霉素和壁霉素的构效关系研究为指导，以解决与其分子复杂性相关的问题。设计了内酰胺稠合异恶唑烷支架，并通过烯基硝酮的分子内 1,3-偶极环加成构建了一组多样化的内酰胺稠合异恶唑烷衍生物。几种类似物对一系列革兰氏阳性耐药细菌病原体表现出中等活性。
• Synthesis of isoxazolidine-containing uridine derivatives as caprazamycin analogues
  作者：Mayumi Yamaguchi、Akira Matsuda、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1039/c4ob02142h

  日期：——

  antibacterial nucleoside natural products, was conducted by scaffold-hopping of the structurally complex diazepanone moiety to the isoxazolidine scaffold. The designed isoxazolidine-containing uridine derivatives were synthesized by an intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition of alkenyl nitrone as a key step. The lactone-fused isoxazolidine intermediate was easily converted to the target compounds by

  通过将结构复杂的二氮杂one酮部分跃迁到异恶唑烷骨架上，简化了有前途的抗菌核苷天然产物辣椒素的简化。通过烯内酮的分子内1，3-偶极环加成反应合成了设计的含异恶唑烷的尿苷衍生物。内酯稠合的异恶唑烷中间体通过亲核取代和亲电子封端所得伯醇使内酯部分开环后，通过依次引入关键取代基，可以轻松地将其转化为目标化合物。几种类似物对流感嗜血杆菌ATCC 10211（MIC 0.25-0.5杯mL（-1））表现出良好的活性，对耐万古霉素的屎肠球菌SR7914（MIC 4-8杯mL（-1））表现出中等的活性。
• Stereoselective One-Pot Synthesis of Constrained N,O-Orthogonally Protected <i>C</i>-Glycosyl Norstatines [C(1‘)-Aminoglycosyl-1,3-dioxolan-4-ones]
  作者：Andrea Guerrini、Greta Varchi、Arturo Battaglia

  DOI：10.1021/jo0608164

  日期：2006.9.1

  usually with high diastereomeric excesses. Both the sulfinyl group at the nitrogen atom and the acetal moiety of the dioxolanone ring were selectively removed, thus demonstrating the orthogonality of the two protecting groups. In fact, the MeO- induced methanolysis of the acetal group gave the corresponding methyl C-glycosyl-sulfinylamino-isoserinates, while the acid induced removal of the sulfinyl group

  已经开发出合成构象受限的C-糖基降他汀类药物的方法。该反应的关键步骤是在二恶唑酮的手性（2 S）-烯酸酯中添加（S）-N-亚磺酰基甲亚胺，该化合物利用Seebach的“ SRS”原理。三取代的C-糖基-α-羟基-β-氨基酸形成为N，O-正交保护的1'-糖基-亚磺酰基氨基-二氧戊环-4-酮，通常具有高的非对映异构体过量。氮原子上的亚硫酰基和二氧戊环环的乙缩醛部分均被选择性除去，从而证明了两个保护基的正交性。事实上，中地球轨道-诱导的乙缩醛的甲醇分解得到相应的C-糖基-亚磺酰基氨基-异丝氨酸甲酯，而酸诱导的亚磺酰基的去除得到了N-去保护的1'-糖基氨基-二氧杂戊环4-酮，在某些情况下会发生一锅碱基诱导的环化反应，产生相应的糖基-β-内酰胺。这允许通过化学相关方法或通过对β-内酰胺进行的NOE实验来评估母体1'-糖基-亚磺酰基氨基-二氧戊环-4-酮的立体化学构型。
• Nucleosides and Nucleotides. 185. Synthesis and Biological Activities of 4‘α-<i>C</i>-Branched-Chain Sugar Pyrimidine Nucleosides
  作者：Makoto Nomura、Satoshi Shuto、Motohiro Tanaka、Takuma Sasaki、Shuichi Mori、Shiro Shigeta、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jm990050i

  日期：1999.7.1

  4'alpha-position did not show any cytotoxicity. The antiviral activities of these nucleosides against HSV-1, HSV-2, and HIV-1 in vitro were also examined. Compounds 22 and 23 showed antiviral activities against HSV-1 and HSV-2 without showing significant toxicity to the host cells (MRC-5 cells). Although almost all of the nucleosides showed anti-HIV-1 activities, they were also cytotoxic to the host cells (MT-4)

  由2'-脱氧胞苷或尿苷合成了一系列的4'α-C-支链嘧啶核苷。在2'-脱氧胞苷系列中，在4'α-位置的取代基在体外以Me（23）> CN（22）> C（symbol）CH（21）> CH =的顺序影响对L1210小鼠白血病细胞的细胞毒性。 CH（2）（19）> Et（24）> CH = CHCl（20）。然而，在4'α位具有乙炔基和氰基的尿苷和胞苷衍生物没有显示出任何细胞毒性。还检查了这些核苷在体外对HSV-1，HSV-2和HIV-1的抗病毒活性。化合物22和23显示出针对HSV-1和HSV-2的抗病毒活性，而没有显示出对宿主细胞（MRC-5细胞）的明显毒性。尽管几乎所有核苷都具有抗HIV-1活性，
• Intramolecular Participation of Amino Groups in the Cleavage and Isomerization of Ribonucleoside 3′-Phosphodiesters: The Role in Stabilization of the Phosphorane Intermediate
  作者：Luigi Lain、Harri Lönnberg、Tuomas Lönnberg

  DOI：10.1002/chem.201301711

  日期：2013.9.9

  the cleavage of the 3′,5′‐phosphodiester linkage and its isomerization to a 2′,5′‐linkage are pH‐independent and 50–80 times as fast as the corresponding reactions of uridylyl‐3′,5′‐uridine (3′,5′‐UpU). The cleavage of the resulting 2′,5′‐isomer is also accelerated, albeit less than with the 3′,5′‐isomer, whereas isomerization back to the 3′,5′‐diester is not enhanced. When the amino groups are deprotonated

  双核苷3'，5'-磷酸二酯模型，5'-氨基-4'-氨基甲基-5'-脱氧尿苷3'，5'-胸苷，在3'-的4'-位置结合了两个氨基甲基官能团已制备了连接的核苷，并在很宽的pH范围内研究了其水解反应。发现氨基官能团可加速质子化和中性形式的磷酸二酯键的裂解和异构化。当以质子化形式存在时，3'，5'-磷酸二酯键的裂解及其异构化为2'，5'-键是pH无关的，并且是uridylyl-3'相应反应的50-80倍，5'-尿苷（3'，5'-UpU）。生成的2'，5'-异构体的裂解也被加速，尽管比3'，5'-异构体的裂解少，但是回到3'，5'-二酯的异构化并没有增强。当氨基去质子化时 两种异构体的裂解反应仍然与pH无关，并且比UpU与pH无关的裂解快了1000倍。有趣的是，现在2'至3'异构化比其逆反应快得多。讨论了这些反应的机理。速率加速很大程度上是由质子化的氨基与磷烷中间体的静电和氢键相互作用引起的。