tert-butyl (2S)-2-amino-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]propanoate | 1346620-26-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: tert-butyl (2S)-2-amino-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]propanoate
• CAS: 1346620-26-5
• 化学式: C₂₇H₅₁N₃O₇Si₂
• 分子量: 585.889
• InChiKey: KBLROBYWWLRVOO-OMTGHCCBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.27
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (2S)-2-amino-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]propanoate 在 1,4-环己二烯 、 palladium 10% on activated carbon 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 57.0h， 生成 tert-butyl (2S)-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]-2-[3-[[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]propylamino]propanoate
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶核苷氨基酸的立体选择性合成

  摘要：

  构想并合成了5'-脱氧尿苷和甘氨酸的新型杂合结构。此类核苷氨基酸（NAA）代表穆来霉素核苷抗生素核心结构的简化类似物，使其成为结构与活性关系（SAR）研究的有用合成构件。已开发的合成路线的关键步骤是将二脱氢氨基酸前体高效且高度非对映选择性地不对称氢化成受保护的NAA。预期通过该途径合成未保护的穆雷霉素衍生物将需要在尿嘧啶碱基的N-3处具有合适的中间保护基。在最初尝试使用PMB-和BOM-N-3保护后，这两个步骤都导致了脱保护步骤的问题，然后构想出N-3无保护基团的路线。尽管尿嘧啶-3-NH具有明显的酸性，但该途径与涉及N-3保护的初始策略一样有效，立体选择性也相同。所获得的NAA构件被用于合成截短的5'-脱氧村霉素类似物。

  DOI：

  10.1021/jo201935w
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 5'-aldehyde 在 (+)-1,2-bis-((2S,5S)-2,5-dimethylphospholano)-benzene-(cyclooctadiene)-rhodium(I) tetrafluoroborate 、 氢气 、 四丁基碘化铵 、 双(三甲基硅烷基)氨基钾 、 sodium carbonate 、 钯 、 正丁胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 甲苯 为溶剂， -78.0~20.0 ℃ 、100.0 kPa 条件下， 反应 133.75h， 生成 tert-butyl (2S)-2-amino-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]propanoate
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶核苷氨基酸的立体选择性合成

  摘要：

  构想并合成了5'-脱氧尿苷和甘氨酸的新型杂合结构。此类核苷氨基酸（NAA）代表穆来霉素核苷抗生素核心结构的简化类似物，使其成为结构与活性关系（SAR）研究的有用合成构件。已开发的合成路线的关键步骤是将二脱氢氨基酸前体高效且高度非对映选择性地不对称氢化成受保护的NAA。预期通过该途径合成未保护的穆雷霉素衍生物将需要在尿嘧啶碱基的N-3处具有合适的中间保护基。在最初尝试使用PMB-和BOM-N-3保护后，这两个步骤都导致了脱保护步骤的问题，然后构想出N-3无保护基团的路线。尽管尿嘧啶-3-NH具有明显的酸性，但该途径与涉及N-3保护的初始策略一样有效，立体选择性也相同。所获得的NAA构件被用于合成截短的5'-脱氧村霉素类似物。

  DOI：

  10.1021/jo201935w

文献信息

• Solid Phase‐Supported Synthesis of Muraymycin Analogues
  作者：Kristin Leyerer、Stefan Koppermann、Christian Ducho

  DOI：10.1002/ejoc.201901256

  日期：2019.12.8

  Naturally occurring muraymycin nucleoside antibiotics represent a promising class of novel antimicrobial agents. In order to facilitate the synthesis of muraymycins and their analogues, we have now established a novel solid phase‐based synthetic strategy using a modular approach. The efficiency of this new method was exemplified in an alanine scan of the muraymycin peptide unit that provided new structure‐activity

  天然存在的穆雷霉素核苷抗生素代表了一种有前途的新型抗菌剂。为了促进穆来霉素及其类似物的合成，我们现在使用模块化方法建立了一种新颖的基于固相的合成策略。这种新方法的效率在穆来霉素肽单元的丙氨酸扫描中得到了证明，该扫描提供了新的结构-活性关系（SAR）见解。
• Merging Natural Products: Muraymycin–Sansanmycin Hybrid Structures as Novel Scaffolds for Potential Antibacterial Agents
  作者：Giuliana Niro、Stefanie C. Weck、Christian Ducho

  DOI：10.1002/chem.202003387

  日期：2020.12.15

  different Gram‐positive and Gram‐negative bacteria, which are poorly understood so far. Herein, the synthesis of a novel hybrid structure is reported, derived from the 5′‐defunctionalized uridine core moiety of muraymycins and the peptide chain of sansanmycin B, as a new scaffold for the development of antimicrobial agents. The reported muraymycin–sansanmycin hybrid scaffold showed nanomolar activity against

  为了克服细菌耐药性，迫切需要新型抗菌剂。所谓的核苷抗生素类别为开发新抗生素提供了有希望的候选者，因为这些化合物阻断了临床上未开发的细菌靶点：整合膜蛋白MraY，细胞壁（肽聚糖）生物合成中的关键酶。除了尿苷衍生的核心基序外，核苷抗生素还表现出显着的结构多样性。一些亚类还对不同的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌表现出特定的选择性，但迄今为止人们对此知之甚少。在此，报道了一种新型混合结构的合成，该结构源自穆雷霉素的 5'-去功能化尿苷核心部分和桑桑霉素 B 的肽链，作为开发抗菌药物的新支架。报道的穆雷霉素-山散霉素混合支架对细菌靶酶MraY表现出纳摩尔级活性，但对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌和铜绿假单胞菌没有显着的抗菌活性。
• Synthesis of an Antimicrobial Enterobactin‐Muraymycin Conjugate for Improved Activity Against Gram‐Negative Bacteria
  作者：Christian Rohrbacher、Robert Zscherp、Stefanie C. Weck、Philipp Klahn、Christian Ducho

  DOI：10.1002/chem.202202408

  日期：2023.1.24

  The synthesis of a thiol-containing muraymycin analogue and its use in an antimicrobial muraymycin-enterobactin conjugate with an intracellularly cleavable disulfide linker is reported. This conjugation approach was shown to increase antimicrobial activity against an efflux-deficient E. coli strain.

  报道了含硫醇的胞壁霉素类似物的合成及其在具有细胞内可裂解二硫化物接头的抗菌胞壁霉素-肠杆菌素缀合物中的用途。这种结合方法被证明可以增加对外排缺陷型大肠杆菌菌株的抗菌活性。
• Stereoselective Synthesis of Uridine-Derived Nucleosyl Amino Acids
  作者：Anatol P. Spork、Daniel Wiegmann、Markus Granitzka、Dietmar Stalke、Christian Ducho

  DOI：10.1021/jo201935w

  日期：2011.12.16

  nucleosyl amino acids (NAAs) represent simplified analogues of the core structure of muraymycin nucleoside antibiotics, making them useful synthetic building blocks for structure–activity relationship (SAR) studies. The key step of the developed synthetic route was the efficient and highly diastereoselective asymmetric hydrogenation of didehydro amino acid precursors toward protected NAAs. It was anticipated

  构想并合成了5'-脱氧尿苷和甘氨酸的新型杂合结构。此类核苷氨基酸（NAA）代表穆来霉素核苷抗生素核心结构的简化类似物，使其成为结构与活性关系（SAR）研究的有用合成构件。已开发的合成路线的关键步骤是将二脱氢氨基酸前体高效且高度非对映选择性地不对称氢化成受保护的NAA。预期通过该途径合成未保护的穆雷霉素衍生物将需要在尿嘧啶碱基的N-3处具有合适的中间保护基。在最初尝试使用PMB-和BOM-N-3保护后，这两个步骤都导致了脱保护步骤的问题，然后构想出N-3无保护基团的路线。尽管尿嘧啶-3-NH具有明显的酸性，但该途径与涉及N-3保护的初始策略一样有效，立体选择性也相同。所获得的NAA构件被用于合成截短的5'-脱氧村霉素类似物。