2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine
• 英文别名: 2',3'-di-O-tert-butyldimethylsilyluridine；2’,3’-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine；1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₂₁H₄₀N₂O₆Si₂
• 分子量: 472.729
• InChiKey: FZXFJQVZSQAGPM-VDHUWJSZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.21
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二甲基亚砜 、 苯 为溶剂， 反应 1.75h， 生成 1-<2,3-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-4α-hydroxymethyl-β-D-ribo-pentofuranosyl>uracil
  参考文献：
  名称：

  核苷和核苷酸。185.4'α-C-支链糖嘧啶核苷的合成及生物学活性。

  摘要：

  由2'-脱氧胞苷或尿苷合成了一系列的4'α-C-支链嘧啶核苷。在2'-脱氧胞苷系列中，在4'α-位置的取代基在体外以Me（23）> CN（22）> C（symbol）CH（21）> CH =的顺序影响对L1210小鼠白血病细胞的细胞毒性。 CH（2）（19）> Et（24）> CH = CHCl（20）。然而，在4'α位具有乙炔基和氰基的尿苷和胞苷衍生物没有显示出任何细胞毒性。还检查了这些核苷在体外对HSV-1，HSV-2和HIV-1的抗病毒活性。化合物22和23显示出针对HSV-1和HSV-2的抗病毒活性，而没有显示出对宿主细胞（MRC-5细胞）的明显毒性。尽管几乎所有核苷都具有抗HIV-1活性，

  DOI：

  10.1021/jm990050i
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 水 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 78.0h， 生成 2',3'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  碱基取代的5'- O-（N-异亮氨酰）氨磺酰基核苷类似物作为潜在的抗菌剂

  摘要：

  氨基酰基氨磺酰基腺苷是体外相应的原核和真核tRNA合成酶的众所周知的纳摩尔抑制剂。受Cubist Pharmaceuticals含芳基四唑的化合物和天然抗生素albomycin中发现的修饰碱基的启发，氨磺酰化腺苷的选择性问题促使我们研究腺嘌呤碱基在药理上的重要性。因此，我们合成并评估了几种异亮氨酰氨磺酰基核苷类似物，它们具有尿嘧啶，胞嘧啶，次黄嘌呤，鸟嘌呤，1，3-二氮杂腺嘌呤（苯并咪唑）或4-硝基苯并咪唑作为杂环碱基。基于微霉素C的结构和抗菌活性，我们还制备了它们的六肽基缀合物，以提高它们的吸收潜力。我们进一步在体外和细胞分析中将它们的抗菌活性与母体异亮氨酰氨磺酰基腺苷（Ile-SA）进行了比较。令人惊讶地，发现含有尿嘧啶类似物的最强的体外抑制作用16楼。不幸的是，由于低吸收，仅发现非常弱的生长抑制特性。根据先前的文献发现对结果进行讨论。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2014.03.040

文献信息

• Hafnium Triflate as a Highly Potent Catalyst for Regio- and Chemoselective­ Deprotection of Silyl Ethers
  作者：Shan-Shan Gong、Qi Sun、Xiu-An Zheng、Rui Kong、Hua-Shan Huang、Jing-Ying Wei、Ji-Zong Chen

  DOI：10.1055/s-0037-1610307

  日期：2019.2

  3° alkyl and aryl tert-butyldimethylsilyl (TBS) ethers are significantly different, ranging from 0.05 mol% to 3 mol%, regioselective deprotection of TBS could be easily implemented. Moreover, chemoselective cleavage of different silyl ethers or removal of TBS in the presence of most hydroxyl protecting groups was also accomplished. NMR analyses of silyl products from TBS deprotection indicated that Hf(OTf)4-catalyzed

  摘要 作为IVB族过渡金属路易斯酸，三氟甲磺酸[[Hf（OTf）4 ]在脱甲硅烷基化反应中表现出极高的效能。由于1°，2°，3°烷基和芳基叔丁基二甲基甲硅烷基（TBS）醚的脱保护所需的Hf（OTf）4的量显着不同，范围为0.05 mol％至3 mol％，因此TBS的区域选择性脱保护可以轻松实现。此外，还实现了在大多数羟基保护基存在下，不同甲硅烷基醚的化学选择性裂解或TBS的去除。来自TBS脱保护的甲硅烷基产物的NMR分析表明，取决于所使用的溶剂，Hf（OTf）4催化的甲硅烷基化可能通过不同的机理进行。 作为IVB族过渡金属路易斯酸，三氟甲磺酸[[Hf（OTf）4 ]在脱甲硅烷基化反应中表现出极高的效能。由于1°，2°，3°烷基和芳基叔丁基二甲基甲硅烷基（TBS）醚的脱保护所需的Hf（OTf）4的量显着不同，范围为0.05 mol％至3 mol％，因此TBS的区域选择性脱保护可以轻松实现。此
• Novel thioglycosyl analogs of glycosyltransferase substrates as antiviral compounds against classical swine fever virus and hepatitis C virus
  作者：Gabriela Pastuch-Gawolek、Binay Chaubey、Boguslaw Szewczyk、Ewelina Krol

  DOI：10.1016/j.ejmech.2017.05.051

  日期：2017.9

  pathogens for which new therapeutic approaches are in high demand. Herein, we report the synthesis of newly designed thioglycosyl analogs of glycosyltransferase substrates which were evaluated using cell-based assays for cytotoxicity and antiviral activity against both viruses. The antiviral activity of synthesized compounds against CSFV and HCV was confirmed using pseudo-plaque reduction assays where a significant

  丙型肝炎病毒（HCV）和经典猪瘟病毒（CSFV）是重要的病原体，急需新的治疗方法。在这里，我们报告了新设计的糖基转移酶底物的硫代糖基类似物的合成，使用基于细胞的分析方法对两种病毒的细胞毒性和抗病毒活性进行了评估。使用假斑减少测定法证实了合成化合物对CSFV和HCV的抗病毒活性，其中在选定化合物的存在下观察到了明显的病毒生长停滞。我们显示了该系列化合物13和14对体外CSFV和HCV感染发挥了最显着的抑制作用。糖缀合物13和14不仅抑制病毒在低微摩尔范围内的IC 50值的传播，而且以剂量依赖的方式有效地抑制了病毒蛋白的产生。另外，使用体外HCV感染和复制模型的研究表明，这两种化合物均能够显着减少病毒基因组复制。我们证明了化合物13和14表现出强烈的抑制作用，最多可复制90％，这使它们成为开发新的抗-CSFV和抗-HCV药物的有前途的替代方法。
• Biosynthetic Origin of the Atypical Stereochemistry in the Thioheptose Core of Albomycin Nucleoside Antibiotics
  作者：Richiro Ushimaru、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.8b12565

  日期：2019.2.13

  d-ribofuranose ring and an l-amino acid moiety. The conversion of l-to d-amino acid configuration is catalyzed by the PLP-dependent epimerase AbmD. The d- ribo to d- xylo conversion of the thiofuranose ring appears according to gene deletion experiments to be mediated by AbmJ, which is annotated as a radical S-adenosyl-l-methionine (SAM) enzyme. These studies establish several key steps in the assembly of the

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。
• Novel Uridine Glycoconjugates, Derivatives of 4-Aminophenyl 1-Thioglycosides, as Potential Antiviral Compounds
  作者：Ewelina Krol、Gabriela Pastuch-Gawolek、Binay Chaubey、Gabriela Brzuska、Karol Erfurt、Boguslaw Szewczyk

  DOI：10.3390/molecules23061435

  日期：——

  series of uridine glycoconjugates, derivatives of 4-aminophenyl 1-thioglycosides, was designed and synthesized. All compounds were evaluated in vitro for their antiviral activity against hepatitis C virus (HCV) and classical swine fever virus (CSFV), two important human and animal viral pathogens for which new or improved therapeutic options are needed. The antiviral activity of all synthesized compounds

  设计并合成了一系列新颖的尿苷糖缀合物，即4-氨基苯基1-硫代糖苷的衍生物。体外评估了所有化合物对丙型肝炎病毒（HCV）和经典猪瘟病毒（CSFV）的抗病毒活性，丙型肝炎病毒是两种重要的人和动物病毒病原体，需要新的或改良的治疗方法。使用假斑减少测定法证实了所有合成化合物的抗病毒活性，其中在这些化合物的存在下观察到了CSFV和HCV生长的明显停滞。两种合成的化合物9和12对HCV和CSFV传播表现出显着的抑制作用，HCV的IC50值分别为4.9和13.5 µM，CSFV的IC50值分别为4.2和4 µM，具有低细胞毒性。使用各种感染和复制模型，我们已经表明，这两种化合物均能够在低微摩尔范围内将IC50值显着降低高达90％的病毒基因组复制。合成化合物的结构活性分析表明，高抗病毒活性归因于糖缀合物的疏水性以及将能够协调金属离子的元素引入连接糖和尿苷部分的间隔基，这可用于开发新的未来的抗病毒化合物。
• Modified phosphotriester method for chemical synthesis of ribooligonucleotides. Part I. Synthesis of riboundecaadenylate and two fragments constituting the sequence of R-17 translation control signal
  作者：Wing L. Sung、Saran A. Narang

  DOI：10.1139/v82-021

  日期：1982.1.15

  A modified phosphotriester method has been successfully applied for the chemical synthesis of ribooligonucleotides. The starting material is a fully protected ribomononucleoside containing a 3′-phosphotriester group 5. The coupling reaction is performed using mesitylenesulfonyl tetrazole and purification of the product achieved using reversed phase column chromatography. The effectiveness of this method has been demonstrated by achieving an efficient and rapid synthesis of r-A₇, r-A₁₁, r5′-AAACAUGAGGA-3′, and r5′-UUACCCAUGU-3′ (R-17, translation control sequence).

  一种改良的磷酸三酯方法已成功应用于核糖寡核苷酸的化学合成。起始物是含有3'-磷酸三酯基团的完全保护的核糖单核苷酸。偶联反应使用二甲苯磺酰四唑进行，并通过反相柱层析纯化产物。该方法的有效性已通过成功合成r-A₇、r-A₁₁、r5′-AAACAUGAGGA-3′和r5′-UUACCCAUGU-3′（R-17，翻译控制序列）来证明。