N³-benzoyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine | 86988-35-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: N³-benzoyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine
• 英文别名: 1-[(6aR,8R,9R,9aS)-9-hydroxy-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-3-benzoylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 86988-35-4
• 化学式: C₂₈H₄₂N₂O₈Si₂
• 分子量: 590.821
• InChiKey: SPZRITYJFHGMOE-LYPBTDJXSA-N

物化性质

• 沸点：
  600.7±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.21±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.91
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  3',5'-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷)尿苷	3',5'-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	69304-38-7	C21H38N2O7Si2	486.713
  ——	4-O-<(2,4,6-triisopropylphenyl)sulfonyl>-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	119694-66-5	C36H60N2O9SSi2	753.117
  尿嘧啶核苷	uridine	58-96-8	C9H12N2O6	244.204

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  ——	N3-benzoyl-2'-O-(2-cyanoethyl)-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	864837-09-2	C31H45N3O8Si2	643.885
  ——	N3-benzoyl-2'-O-(2-methoxycarbonylethyl)-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	949158-26-3	C32H48N2O10Si2	676.912
  ——	N3-benzoyl-2'-O-(2-ethoxycarbonylethyl)-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	1285534-76-0	C33H50N2O10Si2	690.938
  ——	N3-benzoyl-2'-O-[2-(2,2,2-trifluoroethoxycarbonyl)ethyl]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	949158-35-4	C33H47F3N2O10Si2	744.91
  ——	N3-benzoyl-2'-O-(2-cyanoethyl)uridine	864837-38-7	C19H19N3O7	401.376
  ——	3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disilyl)-2'-O-methyluridine	83167-64-0	C22H40N2O7Si2	500.74
  ——	2'-O-[2-(methoxycarbonyl)ethyl]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	949158-27-4	C25H44N2O9Si2	572.803
  ——	2'-O-[2-(N,N-dimethylcarbamoyl)ethyl]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	1285534-77-1	C26H47N3O8Si2	585.845
  ——	2'-O-[2-(N-methylcarbamoyl)ethyl]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine	949158-28-5	C25H45N3O8Si2	571.819
  ——	3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-O2,2'-cyclouridine	88121-27-1	C21H36N2O6Si2	468.698

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N³-benzoyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine 在 正丙胺 、 caesium carbonate 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 14.5h， 生成 3-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxypropanoic acid
  参考文献：
  名称：

  使用Oxa-Michael反应合成寡聚核苷酸，并掺入这些修饰的核糖核苷的寡核苷酸衍生物的化学和生物学性质，合成2'- O- [2-（N-甲基氨基甲酰基）乙基]核糖核苷

  摘要：

  为了开发含有新的2'- O-修饰的核糖核苷作为核酸药物的寡核苷酸，我们合成了3种类型的在2'-羟基被2-（甲氧基羰基）乙基（MOCE），2-（N-甲基氨基甲酰基）修饰的核糖核苷衍生物。通过适当保护的核糖核苷（U，C，A和G）衍生物的oxa-Michael反应，将乙基（MCE）和2-（N，N-二甲基氨基甲酰基）乙基（DMCE）基团作为关键中间体。其中，发现2'- O- MCE核糖核苷在碱性条件下最稳定。研究2'- O-修饰对掺入2'- O的寡核苷酸的核酸酶抗性的影响修饰的核糖核苷及其对互补RNA和DNA链的杂交亲和力，成功合成了2' - O -MCE-核糖核苷亚磷酰胺衍生物，并进行了2' - O -MCE-寡核苷酸和2'- O-甲基-核苷酸的合成包含2' - O -MCE-核糖核苷的寡核苷酸。2'- Ô -MCE寡核苷酸和嵌合低聚物2'- ö -MCE和2'- ö甲基基团如此得到证实互补RNA链和高得多的核酸酶抗性比相应的2'-

  DOI：

  10.1021/jo101963z
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基溴化铵 、 sodium carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 N³-benzoyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  新型甲硅烷基和三苯甲基修饰的核苷的合成及其体外生长抑制活性。

  摘要：

  为了研究这些核苷衍生物的体外抗增殖活性，合成了十七个甲硅烷基和三苯甲基修饰的（5'-O-和3'，5'-di-O-）核苷。针对一小组肿瘤细胞系（HL-60，K-562，Jurkat，Caco-2和HT-29）以固定的100μM浓度评估了这些化合物的子集。还以两种人胶质瘤细胞株（U373和Hs683）的不同浓度对整套样品进行了测试，得出GI50值，最好的结果是〜25μM。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.04.036

文献信息

• A General Method for the Synthesis of 2‘-O-Cyanoethylated Oligoribonucleotides Having Promising Hybridization Affinity for DNA and RNA and Enhanced Nuclease Resistance
  作者：Hisao Saneyoshi、Kohji Seio、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1021/jo051741r

  日期：2005.12.1

  2‘-O-cyanoethylated 5‘-O-dimethoxytritylribonucleoside 3‘-phosphoramidite derivatives in high yields. Fully 2‘-O-cyanoethylated oligoribonucleotides, (Uce)12 and (GceAceCceUce)3, were successfully synthesized in the phosphoramidite approach by use of the phosphoramidite building blocks. It was also found that oligoribonucleotides having a 2‘-O-cyanoethylated ribonucleoside (Uce, Cce, Ace, or Gce) could be obtained

  开发了一种有效的合成2'-O-氰基乙基化寡核糖核苷酸的新方法，该方法是一类新型的2'-O-修饰的RNA。适当保护的核糖核苷衍生物与丙烯腈在Cs 2 CO 3存在下于t- BuOH中反应，以优异的收率得到2'-O-氰基乙基化核糖核苷衍生物，通过连续的选择性脱保护/保护策略将其转化为2'-O -氰基乙基化的5'- O-二甲氧基三苯甲基核糖核苷3'-亚磷酰胺衍生物高产率。完全2'-O-氰基乙基化的寡核糖核苷酸（Uce）12和（GceAceCceUce）3通过使用亚磷酰胺构件成功地以亚磷酰胺方法合成了α-β。还发现，可以通过从完全保护的寡核糖核苷酸中间体中选择性除去TBDMS基团而获得具有2'-O-氰基乙基化核糖核苷的寡核糖核苷酸（Uce，Cce，Ace或Gce），而无需通过使用NEt 3 ·3HF作为脱甲硅烷试剂。详细的T m实验表明，含有2'-O-氰基乙基化核糖核苷的寡核糖核苷酸对DNA和RN
• Efficient Large Scale Synthesis of 2‘-<i>O</i>-Alkyl Pyrimidine Ribonucleosides
  作者：Saroj K. Roy、Jin-yan Tang

  DOI：10.1021/op990100t

  日期：2000.5.1

  An efficient process to synthesize 2‘-O-alkyl pyrimidine ribonucleosides in high yield has been described. The inexpensive method was used on a multikilogram-scale synthesis and optimized reaction ...

  已经描述了一种以高产率合成 2'-O-烷基嘧啶核糖核苷的有效方法。廉价的方法用于多公斤级合成和优化反应...
• Stereoselective Synthesis of Highly Functionalized Arabinosyl Nucleosides through Application of an <i>N</i>-Nitro Protecting Group
  作者：David H. Hilko、Laurent F. Bornaghi、Sally-Ann Poulsen

  DOI：10.1021/acs.joc.8b01834

  日期：2018.10.5

  3-N-nitro group by reductive nitration (zinc metal in acetic acid, 5 min) and the silyl protecting groups of the alkyne and 3′,5′ hydroxyls (fluoride reagent, 16 h) was established as the final synthetic step. This application of the 3-N-nitro protecting group addresses the significant shortfalls of the conventional approach to synthesis of 2′ modified nucleosides, wherein condensation of a 2′ modified

  从2'，3'，5'-tri的6个步骤合成了在C2'带有卤素（Cl，Br或I）和在C5带有乙炔基的2'-脱氧-2'，5-二取代的阿拉伯糖基尿苷衍生物- ø -乙酰基-5-碘尿苷在61％（化合物的总产率3，Cl）的，47％（化合物4，Br）和19％（化合物5，I）。稳定2'- O- triflyl离去基团中间体以克服自发的分子内2,2'-脱水尿苷的形成对于合成至关重要。具体来说，赞成S N在分子内环化作用下与卤素亲核体反应2，通过在N-3处引入相邻的吸电子硝基取代基降低了O-2氧的亲核性。3- N-硝基的引入迅速进行（三氟乙酸硝鎓，1分钟），并以定量产率进行。采用一锅法通过还原硝化（乙酸中的锌金属，5分钟）和炔烃和3'，5'羟基的甲硅烷基保护基（氟化试剂，16 h）除去3- N-硝基的方法是确定为最终的合成步骤。3- N-硝基保护基团解决了合成2'修饰核苷的常规方法的重大缺陷，其中2'修饰糖片
• A new method for synthesizing the antineoplastic nucleosides 1-(2-azido-2-deoxy-.BETA.-D-arabinofuranosyl)cytosine (cytarazid) and 1-(2-amino-2-deoxy-.BETA.-D-arabinofuranosyl)cytosine (cytaramin) from uridine.
  作者：Akira MATSUDA、Johji YASUOKA、Tohru UEDA

  DOI：10.1248/cpb.37.1659

  日期：——

  A new method was developed for synthesizing of antineoplastic nucleosides 1-(2-azido-2-deoxy-β-D-arabinofuranosyl)cytosine (2) and 1-(2-amino-2-deoxy-β-D-arabinofuranosyl)-cytosine (3) from uridine. The reaction of N3-benzoyluridine derivative (5) with DPPA, triphenylphosphine and diethyl azodicarboxylate gave the desired 2'-azido-arabinosyl derivative (6), which was subsequently transformed to lead 2 and 3.

  研究人员开发了一种新方法，从尿苷合成抗肿瘤核苷 1-(2-叠氮-2-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃糖基)胞嘧啶(2)和 1-(2-氨基-2-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃糖基)-胞嘧啶(3)。N3-苯甲酰基尿苷衍生物 (5) 与 DPPA、三苯基膦和偶氮二甲酸二乙酯反应，得到了所需的 2'-叠氮-阿拉伯呋喃糖基衍生物 (6)，随后将其转化为引线 2 和引线 3。
• Nucleosides and nucleotides. 95. Improved synthesis of 1-(2-azido-2-deoxy-.beta.-D-arabinofuranosyl)cytosine (Cytarazid) and -thymine. Inhibitory spectrum of Cytarazid on the growth of various human tumor cells in vitro
  作者：Akira Matsuda、Johji Yasuoka、Takuma Sasaki、Tohru Ueda

  DOI：10.1021/jm00107a018

  日期：1991.3

  eta-D-arabinofuranosyl)thymine (7), it was heated in N,N-dimethylformamide to produce 6,2'-imino-1-(2-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl)thymine (8). This reaction disclosed the arabino configuration for 5a. Similarly the N3-benzoyluracil derivative 4b was transformed to the corresponding 2'-"up"-azidouridine derivative 5b, which was further converted to 1-(2-azido-2-deoxy-1-beta-D-arabinofuranosyl)cytosine

  N3-苯甲酰基-1- [3,5-O-（四异丙基二硅氧烷] -1,3-二基）-β-D-呋喃核糖基]胸腺嘧啶（4a）与叠氮磷酸二苯酯，偶氮二羧酸二乙酯和三苯膦在四氢呋喃中的反应得到N3-苯甲酰基-1- [2-叠氮基-2-脱氧-3，5-O-（四异丙基二硅氧烷] -1，3-二基）-β-D-阿拉伯呋喃糖基] t亚胺（5a），产率高。在5a的解封序列得到1-（2-叠氮基-2-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃糖基）胸腺嘧啶（7）之后，将其在N，N-二甲基甲酰胺中加热以产生6,2'-亚氨基-1- （2-脱氧-β-D-阿拉伯呋喃糖基）胸腺嘧啶（8）。该反应公开了5a的阿拉伯糖构型。类似地，将N3-苯甲酰基尿嘧啶衍生物4b转化为相应的2'-“上”-叠氮基尿苷衍生物5b，将其进一步转化为1-（2-叠氮基-2-脱氧-1-β-D-阿拉伯呋喃糖基）胞嘧啶（1 ，阿糖胞苷）。