2'-C-甲基胞嘧啶核苷 | 20724-73-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 核苷类药物 - 核苷中间体
• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 2'-C-甲基胞嘧啶核苷
• 中文别名: 2’-C-甲基胞嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-C-methylcytidine
• 英文别名: 2′-C-methylcytidine；NM107；2’-C-methylcytidine；2'CMC；2'-methylcytidine；4-amino-1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-methyloxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 20724-73-6
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₅
• 分子量: 257.246
• InChiKey: PPUDLEUZKVJXSZ-VPCXQMTMSA-N

物化性质

• 熔点：
  243-245°C
• 沸点：
  523.9±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.72±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  H2O：>20mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S26
• 危险类别码：
  R36/37/38
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2934999090
• 危险标志：
  GHS07
• 危险性描述：
  H315,H319,H335
• 危险性防范说明：
  P261,P305 + P351 + P338
• 储存条件：
  存储条件：吸湿性，于-20°C冷冻环境中，在惰性气氛下保存。

制备方法与用途

生物活性

NM107（2'-C-甲基胞苷）是丙型肝炎病毒 (HCV) NS5B 聚合酶的核苷抑制剂，在野生型复制子细胞中的 EC50 为 1.85 μM。

靶点

• HCV

体外研究

NM107（25 μM；24 小时；Huh7-1 细胞和细胞培养的 HCV）处理可减少细胞外病毒滴度并降低细胞内 RNA 水平。

具体结果如下：

• RT-PCR
  • 细胞系：Huh7-1 细胞和细胞培养的 HCV (HCVcc)
  • 浓度：25 μM
  • 培养时间：24 小时
  • 结果：细胞外病毒滴度下降与细胞内 RNA 水平同步减少。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-C-甲基胞嘧啶核苷 在 吡啶 、 咪唑 、 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 氟化铵 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 58.5h， 生成 3'-O-[N-(tert-butoxycarbonyl)-L-valinyl]-2'-C-methyl-β-D-cytidine
  参考文献：
  名称：

  NM 283, AN EFFICIENT PRODRUG OF THE POTENT ANTI-HCV AGENT 2′-C-METHYLCYTIDINE

  摘要：

  In order to improve the oral bioavailability of 2'-C-methylcytidine, a potent anti-HCV agent, the corresponding 3'-O-L-valinyl ester derivative (NM 283) has been synthesized. Based on its ease Of synthesis and its physicochemical properties, NM 283 has emerged as a promising antiviral drug for treatment of chronic HCV infection.

  DOI：

  10.1081/ncn-200060112
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰尿苷 在 氯化亚砜 、 草酰氯 、 2,4,6-三叔丁基苯酚 、 四丁基氟化铵 、 氨 、 三甲基铝 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 乙醚 、 乙醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 甲苯 为溶剂， 反应 66.33h， 生成 2'-C-甲基胞嘧啶核苷
  参考文献：
  名称：

  嘧啶2'-酮核苷的烷基加成反应：2'-支链糖嘧啶核苷的合成（核苷和核苷酸.LXXXI。

  摘要：

  4-乙氧基-1-(3,5-O-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基-β-D-赤式-戊呋喃-2-糖基)-2(1H)-嘧啶酮(11)与各种有机金属试剂反应，生成了相应的2'-支链糖嘧啶核苷。只有在与MeMgBr和EtMgBr的反应中，观察到更受阻的β-进攻，得到了2'-烷基呋喃糖苷(13a, b)。在11与MeLi、Me3Al或PhMgBr的反应中，立体选择性地得到了2'-甲基或苯基阿拉伯糖苷(12a, b, c)。还描述了这些嘧啶核苷转化为胞嘧啶衍生物的过程，并讨论了它们的抗白血病和抗病毒活性。

  DOI：

  10.1248/cpb.36.945

文献信息

• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR SYNTHESIS OF PHOSPHORYLATED MOLECULES<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE DE MOLÉCULES PHOSPHORYLÉES
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2019195494A1

  公开（公告）日：2019-10-10

  The invention provides compositions and methods for synthesis of phosphorylated organic compounds, including nucleoside triphosphates.

  这项发明提供了合成磷酸化有机化合物的组合物和方法，包括核苷三磷酸。
• [EN] INHIBITORS OF HEPATITIS C VIRUS REPLICATION<br/>[FR] INHIBITEURS DE LA RÉPLICATION DU VIRUS DE L'HÉPATITE C
  申请人：MERCK SHARP & DOHME

  公开号：WO2010111483A1

  公开（公告）日：2010-09-30

  The present invention relates to compounds of formula (I) that are useful as hepatitis C virus (HCV) NS5A inhibitors, the synthesis of such compounds, and the use of such compounds for inhibiting HCV NS5A activity, for treating or preventing HCV infections and for inhibiting HCV viral replication and/or viral production in a cell-based system.

  本发明涉及一种公式（I）的化合物，该化合物可用作丙型肝炎病毒（HCV）NS5A抑制剂，以及该类化合物的合成，以及利用该类化合物抑制HCV NS5A活性，用于治疗或预防HCV感染，以及在基于细胞的系统中抑制HCV病毒复制和/或病毒产生。
• Macroheterocyclic nucleoside derivatives and their analogues, production and use thereof
  申请人：Ivachtchenko Alexandre Vasilievich

  公开号：US20180099989A1

  公开（公告）日：2018-04-12

  Nucleosides and nucleotides (nucleos(t)ides) have been in clinical use for almost 50 years and have become cornerstones of treatment for patients with viral infections or cancer. The approval of several additional drugs over the past decade demonstrates that this family still possesses strong potential. Therefore nucleos(t)ide are of great interest as promising chemotherapeutic agents, including: 2′-deoxy-L-uridine (CAS No 31501-19-6), 2′-deoxy-D-uridine (CAS No 951-78-0), telbivudine (CAS No 3424-98-4), zidovudine (AZT, CAS No 30516-87-1), trifluridine (CAS No 70-00-8), clevudine (CAS No 163252-36-6), PSI-6206 (CAS No 863329-66-2), 2′-(5)-2′-chloro-2′-deoxy-2′-fluorouridine (CAS No 1673560-41-2), ND06954 (CAS No 114248-23-6), stavudine (CAS No 3056-17-5), 5-ethynyltavudine (Festinavir, CAS No 634907-30-5), torcitabine (CAS No 40093-94-5), (−)-beta-D-(2R,4R)-dioxolane-thymine (DOT, 1-((2R,4R)-2-(hydroxymethyl)-1,3-dioxolan-4-yl)-5-methyl-2,4 (1H,3H)-pyrimidinedione, CAS No. 127658-07-5), 2-(6-amino-purin-9-yl)-ethanol (CAS No 707-99-3), 2′-C-methylcytidine (CAS No 20724-73-6), PSI-6130 (CAS No 817204-33-4), gemcitabine (CAS No 95058-81-4), 2′-chloro-2′-deoxy-2′-fluorocytidine (CAS No 1786426-19-4), 2′,2′-dichloro-2′-deoxycytidine (CAS No 1703785-65-2), 2′-C-methylcytidine (CAS No 20724-73-6), PSI-6130 (CAS No 817204-33-4), lamivudine (3TC, CAS No 134678-17-4), emtricitabine (CAS No 143491-57-0), 2′-deoxyadenosine (CAS No 958-09-8), 2′-deoxy-β-L-adenosine (CAS No 14365-45-8), 2′-deoxy-4′-C-ethynyl-2-fluoroadenosine (CAS No 865363-93-5), didanosine (CAS No 69655-05-6), entecavir (CAS No 209216-23-9), FMCA (CAS No 1307273-70-6), dioxolane-G (DOG, CAS No 145514-01-8), β-D-2′-deoxy-2′-(R)-fluoro-2′-β-C-methylguanosine (CAS No 817204-45-8), abacavir (ABC, CAS No 136470-78-5), dioxolane-A (DOA, CAS #145514-02-9), [(2R,4R)-4-(6-cyclopropylamino-purin-9-yl)-[1,3]dioxolan-2-yl]-methanol (CAS No 1446751-04-7), amdoxovir (AMDX, CAS No 145514-04-1), (R)-1-(6-amino-purin-9-yl)-propan-2-ol (CAS No 14047-28-0), and [(2S,5R)-5-(6-amino-purin-9-yl)-4-fluoro-2,5-dihydro-furan-2-yl]-methanol. Macroheterocyclic nucleoside derivative and its analogue of the general formula 1 or general formula 2, a stereoisomer, isotope-enriched analogue, pharmaceutically acceptable salt, hydrate, solvate, or crystalline or polymorphic form thereof, wherein: Ar is aryl or hetaryl; R 1 and R 2 are not necessarily the same substituents selected from H, F, Cl, CH 3 , OH; R 3 is H or CH 3 ; X is oxygen or ethanediyl-1,1 (C═CH 2 ); Y is CH(R 4 )(CH 2 ) k , CH(R 4 )(CH 2 ) m C(O)O(CH 2 ) n ; R 4 is H or CH 3 ; k has a value from zero to six; m has a value from zero to two; n has a value of one to four; Q is a radical selected from Q1-Q4; wherein: R 5 is the substituent selected from H, F, Cl, CH 3 , OH; the arrow (→) indicates the location, joined by Q1-Q4.

  核苷和核苷酸（核苷（t）酸）已经在临床上使用了近50年，已成为治疗病毒感染或癌症患者的治疗基石。过去十年批准了几种额外的药物，表明这个家族仍然具有强大的潜力。因此，核苷（t）酸作为有前途的化疗药物具有很大的吸引力，包括：2'-脱氧-L-尿苷（CAS号31501-19-6）、2'-脱氧-D-尿苷（CAS号951-78-0）、替比夫定（CAS号3424-98-4）、阿司匹林（AZT，CAS号30516-87-1）、三氟胸苷（CAS号70-00-8）、克雷胸苷（CAS号163252-36-6）、PSI-6206（CAS号863329-66-2）、2'-(5)-2'-氯-2'-脱氧-2'-氟尿苷（CAS号1673560-41-2）、ND06954（CAS号114248-23-6）、司他夫定（CAS号3056-17-5）、5-乙炔基司他夫定（费司那韦，CAS号634907-30-5）、托西他滨（CAS号40093-94-5）、（-）-β-D-(2R,4R)-二氧杂环己嘧啶（DOT，1-((2R,4R)-2-(羟甲基)-1,3-二氧杂环己-4-基)-5-甲基-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮，CAS号127658-07-5）、2-(6-氨基嘌呤-9-基)-乙醇（CAS号707-99-3）、2'-C-甲基胞苷（CAS号20724-73-6）、PSI-6130（CAS号817204-33-4）、吉西他滨（CAS号95058-81-4）、2'-氯-2'-脱氧-2'-氟胞苷（CAS号1786426-19-4）、2',2'-二氯-2'-脱氧胞苷（CAS号1703785-65-2）、2'-C-甲基胞苷（CAS号 ）、PSI-6130（CAS号 ）、拉米夫定（3TC，CAS号134678-17-4）、恩替卡韦（CAS号143491-57-0）、2'-脱氧腺苷（CAS号958-09-8）、2'-脱氧-β-L-腺苷（CAS号14365-45-8）、2'-脱氧-4'-C-乙炔基-2-氟腺苷（CAS号865363-93-5）、地达诺辛（CAS号69655-05-6）、恩替卡韦（CAS号209216-23-9）、FMCA（CAS号1307273-70-6）、二氧杂环己胞苷（DOG，CAS号145514-01-8）、β-D-2'-脱氧-2'-(R)-氟-2'-β-C-甲基鸟苷（CAS号817204-45-8）、阿巴卡韦（ABC，CAS号136470-78-5）、二氧杂环己-A（DOA，CAS号145514-02-9）、[(2R,4R)-4-(6-环丙基氨基嘌呤-9-基)-[1,3]二氧杂环己-2-基]-甲醇（CAS号1446751-04-7）、阿姆多氧韦（AMDX，CAS号145514-04-1）、(R)-1-(6-氨基嘌呤-9-基)-丙醇（CAS号14047-28-0）、和[(2S,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-氟-2,5-二氢呋喃-2-基]-甲醇。 宏环核苷衍生物及其一般式1或一般式2的类似物，立体异构体，同位素富集类似物，药学上可接受的盐，水合物，溶剂合物，或其结晶或多形式， 其中： Ar是芳基或杂芳基； R 1 和R 2 不一定相同，选自H，F，Cl，CH 3 ，OH的取代基； R 3 是H或CH 3 ； X是氧或乙烯二基-1,1（C═CH 2 ）； Y是CH(R 4 )(CH 2 ) k ，CH(R 4 )(CH 2 ) m C(O)O(CH 2 ) n ； R 4 是H或CH 3 ； k的值从零到六； m的值从零到二； n的值从一到四； Q是从Q1-Q4中选择的基团； 其中：R 5 是选自H，F，Cl，CH 3 ，OH的取代基； 箭头（→）表示位置，由Q1-Q4连接。
• NUCLEOTIDES CONTAINING AN N-[(S)-1-CYCLOBUTOXYCARBONYL]PHOSPHORAMIDATE FRAGMENT, ANALOGS THEREOF, AND USE THEREOF
  申请人：Alla Chem, LLC

  公开号：EP3473636A1

  公开（公告）日：2019-04-24

  The present invention relates to a prodrug and application thereof in the treatment of viral and cancerous diseases. Said prodrug inhibits HCV NS5B of HBV polymerase, DNA polymerase, and HIV-1 of reverse transcriptase (RT) and is used for the treatment of hepatitis B and C infection in mammals. The present invention also relates to the prodrugs of general formula 1 and stereoisomers thereof and their isotopically enriched analogs, pharmaceutically acceptable salts, hydrates, solvates, or crystalline or polycrystalline forms of the prodrugs of general formula 1 and stereoisomers thereof, wherein n is 1 or 0; Nuc is R1 is hydrogen or methyl; R2, R3 are optionally identical substituents selected from H, F, CI, CH3, OH provided that a solid line together with a dashed line above thereof (----) denote a carbon-carbon single bond (C-C), or R2 and R3 denote hydrogen provided that a solid line together with a dashed line above thereof (----) denote a carbon-carbon double bond (C=C); X is O, CH2 or C=CH2; Y is O, S, CH2 or a HO-CH group provided that a solid line together with a dashed line above thereof (----) denote a carbon-carbon single bond (C-C), or Y is a CH group provided that a solid line together with a dashed line above thereof (----) denote a carbon-carbon double bond (C=C).

  本发明涉及一种前药及其在治疗病毒性和癌症性疾病中的应用。该前药抑制HBV聚合酶的HCV NS5B，DNA聚合酶和HIV-1的逆转录酶（RT），用于治疗哺乳动物中的乙型和丙型肝炎感染。 本发明还涉及一般式1及其立体异构体的前药及其同位素富集的类似物，药学上可接受的盐，水合物，溶剂合物，或一般式1及其立体异构体的晶体或多晶形式， 其中n为1或0； Nuc为 R1为氢或甲基； R2，R3为可选相同的取代基，选自H，F，CI，CH3，OH，前提是实线与其上方的虚线（----）表示碳-碳单键（C-C），或R2和R3表示氢，前提是实线与其上方的虚线（----）表示碳-碳双键（C=C）；X为O，CH2或C= ；Y为O，S， 或HO-CH基团，前提是实线与其上方的虚线（----）表示碳-碳单键（C-C），或Y为CH基团，前提是实线与其上方的虚线（----）表示碳-碳双键（C=C）。
• Nucleoside derivatives as inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase
  申请人：——

  公开号：US20020147160A1

  公开（公告）日：2002-10-10

  The present invention provides nucleoside compounds and certain derivatives thereof which are inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase. These compounds are inhibitors of RNA-dependent RNA viral replication and are useful for the treatment of RNA-dependent RNA viral infection. They are particularly useful as inhibitors of hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase, as inhibitors of HCV replication, and/or for the treatment of hepatitis C infection. The invention also describes pharmaceutical compositions containing such nucleoside compounds alone or in combination with other agents active against RNA-dependent RNA viral infection, in particular HCV infection. Also disclosed are methods of inhibiting RNA-dependent RNA polymerase, inhibiting RNA-dependent RNA viral replication, and/or treating RNA-dependent RNA viral infection with the nucleoside compounds of the present invention.

  本发明提供了核苷化合物及其某些衍生物，这些衍生物是RNA依赖性RNA病毒聚合酶的抑制剂。这些化合物是RNA依赖性RNA病毒复制的抑制剂，可用于治疗RNA依赖性RNA病毒感染。它们特别适用于作为丙型肝炎病毒（HCV）NS5B聚合酶的抑制剂，作为HCV复制的抑制剂，以及/或用于治疗丙型肝炎感染。本发明还描述了包含这种核苷化合物的药物组合物，单独使用或与其他对RNA依赖性RNA病毒感染，特别是HCV感染有效的制剂组合使用。还公开了使用本发明的核苷化合物抑制RNA依赖性RNA聚合酶、抑制RNA依赖性RNA病毒复制和/或治疗RNA依赖性RNA病毒感染的方法。