1,2:3,4-di-O-isopropylidene-β-D-psicofuranose | 34626-95-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1,2:3,4-di-O-isopropylidene-β-D-psicofuranose
• 英文别名: 1,2:3,4-di-O-isopropylidine-β-D-psicofuranose；1,3:4,5-di-O-isopropylidene-β-D-psicofuranose；l,2:3,4-di-O-isopropylidine-β-D-psicofuranose；1,2:3,4-Di-O-Isopropyliden-β-D-psicofuranose；1,2:3,4-Di-O-isopropylidene-D-psicofuranose；1,2:3,4-diisopropylidene-D-psicofuranose；1,2:3,4-di-O-isopropylidene-beta-D-psicofuranose；[(3'aR,4S,6'R,6'aR)-2,2,2',2'-tetramethylspiro[1,3-dioxolane-4,4'-6,6a-dihydro-3aH-furo[3,4-d][1,3]dioxole]-6'-yl]methanol
• CAS: 34626-95-4
• 化学式: C₁₂H₂₀O₆
• 分子量: 260.287
• InChiKey: KKYWZUFDUCTWSE-HNBLOZHYSA-N

物化性质

• 熔点：
  51-53 °C
• 沸点：
  339.2±37.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  66.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,2:3,4-di-O-isopropylidene-β-D-psicofuranose 在 吡啶 、 咪唑 、 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 sodium tetrahydroborate 、 sodium azide 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 碘 、 对甲苯磺酸 、 三苯基膦 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 85.0h， 生成 糖脂
  参考文献：
  名称：

  由d-果糖有效合成d-核糖-C 18-植物鞘氨醇和l-阿拉伯糖-C 18-植物鞘氨醇

  摘要：

  d -核糖-C 18 -phytosphingosine和升-阿拉伯-C 18 -phytosphingosine合成从市售廉价的起始d -fructose。金属介导的断裂和立体选择性还原被用作关键步骤提供的亲水性部分d -核糖和升-阿拉伯phytosphingosines。格拉布斯的交叉复分解和氢化作用使疏水尾部得以结合。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2011.10.003
• 作为产物：
  描述：

  2,2,2',2'-四甲基四氢螺[1,3-二氧戊环-4,6'-[1,3]二氧杂环戊并[4,5-c]吡喃]-7'-醇 在 高氯酸 、 2,2-二甲氧基丙烷 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 反应 3.0h， 以71.8%的产率得到1,2:3,4-di-O-isopropylidene-β-D-psicofuranose
  参考文献：
  名称：

  从d-果糖方便地合成l-核糖

  摘要：

  从商业上廉价的d-果糖开始，完成了立体选择性合成1-核糖的有效方法。该方法中的中间体可以用作制备1-核苷类似物的通用前体。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2011.04.012

文献信息

• Competitive inhibitors of type B ribose 5-phosphate isomerases: design, synthesis and kinetic evaluation of new d-allose and d-allulose 6-phosphate derivatives
  作者：Sandrine Mariano、Annette K. Roos、Sherry L. Mowbray、Laurent Salmon

  DOI：10.1016/j.carres.2009.02.024

  日期：2009.5

  demonstrated to have competitive inhibition. Kinetic evaluation on Rpi activity of both EcRpiB and RpiB from Mycobacterium tuberculosis (MtRpiB) shows that several of the designed 6-carbon high-energy intermediate analogues are new competitive inhibitors of both RpiBs. One of them, 5-phospho-D-ribonate, not only appears as the strongest competitive inhibitor of a Rpi ever reported in the literature, with

  这项研究报告了D-阿洛糖6-磷酸（All6P），D-阿洛糖（或D-庚糖）6-磷酸（Allu6P）和7种D-核糖5-磷酸异构酶（Rpi）抑制剂的合成。抑制剂被设计为6碳高能中间体的类似物，该中间体被假定为由Escherichiacoli（EcRpiB）的B型Rpi催化的All6P到Allu6P异构化反应（Allpi活性）。可以通过All6P或Allu6P的氧化裂解轻松获得的5-Phospho-D-ribonate，导致了原始的合成子5-dihydrogenophospho-D-ribono-1,4-lactone，可以通过亲核加成反应从中合成其他抑制剂步。对EcRpiB的Allpi活性的动力学评估表明，这些化合物中的两个，即5-磷酸-D-核糖异羟肟酸和N-（5-磷酸-D-核糖酰基）-甲胺，​​确实起着新型的EcRpiB抑制剂的作用。进一步，已证明5-磷酸-D-核糖异羟肟酸具有竞争性抑制作用。
• <i>p</i>-Nitrophenyl carbonate promoted ring-opening reactions of DBU and DBN affording lactam carbamates
  作者：Madhuri Vangala、Ganesh P Shinde

  DOI：10.3762/bjoc.12.197

  日期：——

  The amidine bases DBU (1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7-ene) and DBN (1,5-diazabicyclo[4.3.0]non-5-ene) display nucleophilic behaviour towards highly electrophilic p-nitrophenyl carbonate derivatives with ring opening of the bicyclic ring to form corresponding substituted epsilon-caprolactam and gamma-lactam derived carbamates. This simple method presents a unified strategy to synthesize structurally

  BU碱DBU（1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯）和DBN（1,5-二氮杂双环[4.3.0] non-5-ene）对高度亲电子的对硝基苯基碳酸酯显示亲核行为具有双环开环的衍生物，形成相应的取代的ε-己内酰胺和γ-内酰胺衍生的氨基甲酸酯。这种简单的方法提出了一种统一的策略，可以合成结构多样的具有较大底物范围的ε-己内酰胺和γ-内酰胺化合物。
• Synthesis and Antiviral Properties of Spirocyclic [1,2,3]-Triazolooxazine Nucleosides
  作者：Antonio Dell'Isola、Matthew M. W. McLachlan、Benjamin W. Neuman、Hawaa M. N. Al-Mullah、Alexander W. D. Binks、Warren Elvidge、Kenneth Shankland、Alexander J. A. Cobb

  DOI：10.1002/chem.201403560

  日期：2014.9.8

  efficient synthesis of spirocyclic triazolooxazine nucleosides is described. This was achieved by the conversion of β-D-psicofuranose to the corresponding azido-derivative, followed by alkylation of the primary alcohol with a range of propargyl bromides, obtained by Sonogashira chemistry. The products of these reactions underwent 1,3-dipolar addition smoothly to generate the protected spirocyclic adducts

  描述了螺环三唑并恶嗪核苷的有效合成。这是通过将 β-D-psicofuranose 转化为相应的叠氮基衍生物，然后用 Sonogashira 化学获得的一系列炔丙基溴对伯醇进行烷基化来实现的。这些反应的产物顺利进行 1,3-偶极加成以生成受保护的螺环加合物。这些很容易脱保护，得到相应的核糖核苷。使用MHV（小鼠肝炎病毒）作为模型研究获得的化合物文库的抗病毒活性，其中衍生物3f显示出最有希望的活性和耐受性。
• Synthesis and antiviral activity of novel spirocyclic nucleosides
  作者：Alexander J. A. Cobb、Antonio Dell’Isola、Ban O. Abdulsattar、Matthew M. W. McLachlan、Benjamin W. Neuman、Christin Müller、Kenneth Shankland、Hawaa M. N. Al-Mulla、Alexander W. D. Binks、Warren Elvidge

  DOI：10.1039/c8nj02777c

  日期：——

  azetidinic system is described, along with two analogous phosphonate derivatives of the former. These systems were constructed from the same β-D-psicofuranose starting material. The triazole spirocyclic nucleosides were constructed using the 1-azido-1-hydroxymethyl derived sugars, where the primary alcohol was alkylated with a range of propargyl bromides, whereas the azetidine systems orginated from the corresponding

  描述了包含三唑或氮杂环丁烷系统的许多螺环核糖核苷的合成，以及前者的两种类似的膦酸酯衍生物。这些系统是由相同的β- D- psicofuranose起始原料构建的。使用1-叠氮基-1-羟甲基衍生的糖构建三唑螺环核苷，其中伯醇被一系列炔丙基溴烷基化，而氮杂环丁烷体系则由相应的1-氰基-1-羟甲基糖产生。由于它们与利巴韦林的相似性，因此使用MHV（鼠肝炎病毒）作为模型对化合物库的抗病毒特性进行了研究。
• Conformation-specific cleavage of antisense oligonucleotide-RNA duplexes by RNase H
  作者：Pushpangadan I. Pradeepkumar、Edouard Zamaratski、András Földesi、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1039/b006476i

  日期：——

  The North-form (3′-endo) constrained 1-(1′,3′-O-anhydro-β-D-psicofuranosyl)thymine block, , was systematically incorporated at various sites, one at a time, into a set of four antisense oligonucleotides (AONs). The hybrids of these AONs with a matched 15mer RNA target were subjected to the RNase H cleavage reaction, and compared with that of the native counterpart, in order to probe how far the local influence of a single North-locked sugar is transmitted in steering conformational changes in the neighbouring nucleotides. It was found that the introduction of a single North-sugar locked nucleotide in the AONs makes up to four of the neighbouring nucleotides at the 5′-end of the modification site resistant to the RNase H cleavage reaction. This suggests that a stretch of 5-nucleotides, including the nucleotide, in the AON strand adopts a North-type conformation, giving a local RNA/RNA type hybrid structure instead of a regular DNA/RNA type duplex structure. Although these 5-nucleotide regions were completely resistant to RNase H promoted hydrolysis, they could serve as the binding site for the enzyme. Interestingly, none of these local adaptations of the RNA/RNA type structure were observable by CD spectroscopy, showing it to be an unsuitable means of monitoring any subtle alteration of the local structure. This work, therefore, constitutes an example of how the engineered conformation of a substrate can be used to exploit the stereochemical sensitivity of an enzyme to map local microscopic conformational changes. The other implication of this work is that it provides a new tool to gather local structural information, which may help to optimize the number of constrained residues which need to be incorporated to induce the antisense strand to adopt either A- or B-type geometry in the hybrid duplex, with or without the loss of RNase H recognition and/or cleavage properties.

  北型（3′-内源）限制结构的1-(1′,3′-O-脱水-β-D-小学糖基)胸苷区块被系统性地逐一引入到一组四个反义寡核苷酸（AONs）的不同位置。这些AON与相匹配的15个核苷酸的RNA靶标形成的杂合体被用于RNase H裂解反应，并与其天然同类进行比较，以探讨一个北锁定糖的局部影响在多大程度上传播到邻近的核苷酸，进而引导构象变化。研究发现，在AON中引入一个北糖锁定核苷酸后，修改位点5'端的多达四个邻近核苷酸对RNase H裂解反应具有抗性。这表明，包含该核苷酸在内的AON链中的5核苷酸段采纳了北型构象，形成局部的RNA/RNA型杂合结构，而不是常规的DNA/RNA型双链结构。尽管这些5核苷酸区域完全抗拒RNase H促进的水解，它们仍然可以作为酶的结合位点。有趣的是，通过圆二色谱（CD谱）无法观察到这些RNA/RNA型结构的任何局部适应性，显示这种方法不适合监测局部结构的细微变化。因此，这项工作展示了如何利用底物的工程化构象来利用酶的立体化学敏感性，以映射局部微观构象变化。这项工作的另一个意义在于，它提供了一种新的工具来收集局部结构信息，这可能有助于优化需要引入的限制残基的数量，以诱导反义链在混合双链中采用A型或B型几何结构，而不损失RNase H的识别和/或裂解特性。