ascamycin | 91432-48-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: ascamycin
• 英文别名: 2-chloro-5'-O-(N-(L-alanyl)sulfamoyl)adenosine (Ascamycin)；[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-2-chloropurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl N-[(2S)-2-aminopropanoyl]sulfamate
• CAS: 91432-48-3
• 化学式: C₁₃H₁₈ClN₇O₇S
• 分子量: 451.848
• InChiKey: LZMCAAGVMFMSKC-IZKXYQSCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  226
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

制备方法与用途

生物活性

Ascamycin 是一种由链霉菌属 (Streptomyces sp. JCM9888) 产生的 5'-O-磺酰胺核糖核苷抗生素。它对 Xanthomonas 菌具有选择性的抑菌活性，对 Xanthomonas citri 的 MIC 值为 0.4 μg/mL、Xanthomonas oryzae 和 Mycobacterium phlei 的 MIC 值分别为 12.5 μg/mL。

靶点

• MIC: 0.4 μg/mL ( Xanthomonas citri ), 12.5 μg/mL ( Xanthomonas oryzae ) 和 12.5 μg/mL ( Mycobacterium phlei )

体外研究

Ascamycin 的 C-1' 上的碱基为 C2-氯腺嘌呤，但缺乏氯。Ascamycin 具有对 Xanthomonas 种类的选择性抗菌活性。当 Ascamycin 去除 dAMP 后，Dealanylascamycin 展现了广泛对抗各种革兰氏阴性和阳性细菌的抗菌活性。Xanthomonas citri 的敏感性归因于其细胞表面的 Ascamycin-去 dAMP 酶。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ascamycin 生成 L-丙氨酸
  参考文献：
  名称：

  ISONO, KIYOSHI;URAMOTO, MASAKAZU;OSADA, HIROYUKI;UBUKATA, MAKOTO;KUSAKABE+, 12TH SYMP. NUCL. ACIDS CHEM., KANAZAWA, OCT. 30-NOV. I, 1984, OXFORD; WAS+

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  2-chloro-9-(2',3'-O-isopropylidene-5'-O-sulfamoyl-β-D-ribofuranosyl)-adenine 在 sodium hydride 、 caesium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 paraffin 为溶剂， 反应 11.25h， 生成 ascamycin
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and biological activity of aminoacyl analogs of ascamycin.

  摘要：

  通过N6-叔丁氧基羰基-2-氯-9-(2', 3'-O-异亚丙基-5'-O-氨磺酰基-β)的缩合反应合成了L-Prolyl和其他Ascamycin氨酰基衍生物(1) -D-呋喃核糖基)腺嘌呤 (9) 与相应的叔丁氧基羰基氨基酰基咪唑在 Cs2CO3 存在下在 DMF 中反应作为关键步骤。 L-脯氨酰衍生物(2)和L-苯丙氨酰衍生物(3)以及1对柑橘黄单胞菌表现出选择性毒性。 L-脯氨酰-L-脯氨酰衍生物 (5) 以及 dealanylascamycin (6) 对各种革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌表现出广泛的毒性。 D-丙氨酰衍生物(4)失去了抗菌活性。在这些类似物中，2 是 Xc-氨基肽酶（来自柑橘小杆菌细胞的泡霉素脱丙氨酶）的最佳底物（15.3M/分钟/毫克蛋白质）。该酶几乎不水解 4（每毫克蛋白质 0.2 M/分钟）。该酶的底物特异性决定了类似物的抗菌活性。图2显示对克尔斯滕肉瘤病毒转化的Balb3T3(KN-3T3)细胞比对非转化细胞(Balb 3T3)更大的选择性毒性。

  DOI：

  10.1271/bbb1961.52.1117

文献信息

• A facile synthesis of ascamycin and related analogues
  作者：Julia Castro-Pichel、María Teresa García-López、Federico G. De las Heras

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)89967-1

  日期：1987.1
• UBUKATA, MAKOTO;OSADA, HIROYUKI;MAGAE, JUNJI;ISONO, KIYOSHI, AGR. AND BIOL. CHEM., 52,(1988) N 5, 1117-1122
  作者：UBUKATA, MAKOTO、OSADA, HIROYUKI、MAGAE, JUNJI、ISONO, KIYOSHI

  DOI：——

  日期：——
• ISONO, KIESI;UBUKATA, MAKOTO
  作者：ISONO, KIESI、UBUKATA, MAKOTO

  DOI：——

  日期：——
• ANTI-MICROBIAL AGENTS AND USES THEREOF
  申请人：Tan Derek Shieh

  公开号：US20090170805A1

  公开（公告）日：2009-07-02

  Many pathogens, including Mycobacterium tuberculosis and Yersinia pestis , rely on an iron acquisition system based on siderophores, secreted iron-chelating compounds with extremely high Fe(III) affinity. The compounds of the invention are inhibitors of domain salicylation enzymes, which catalyze the salicylation of an aroyl carrier protein (ArCP) domain to form a salicyl-ArCP domain thioester intermediate via a two-step reaction. The compounds include the intermediate mimic 5′-O—[N-(salicyl)sulfamoyl]-adenosine (salicyl-AMS) and analogs thereof. These compounds are inhibitors of the salicylate activity of MbtA, YbtE, PchD, and other domain salicylation enzymes involved in the biosynthesis of siderophores. Therefore, these compounds may be used in the treatment of infection caused by microorganisms which rely on siderphore-based iron acquisition systems. Pharmaceutical composition and methods of using these compounds to treat or prevent infection are also provided as well as methods of preparing the inventive compounds.
• Synthesis and biological activity of aminoacyl analogs of ascamycin.
  作者：Makoto UBUKATA、Hiroyuki OSADA、Junji MAGAE、Kiyoshi ISONO

  DOI：10.1271/bbb1961.52.1117

  日期：——

  L-Prolyl and other aminoacyl derivatives of ascamycin (1) were synthesized by a condensation reaction of N6-t-butyloxycarbonyl-2-chloro-9-(2', 3'-O-isopropylidene-5'-O-sulfamoyl-β-D-ribofuranosyl)adenine (9) with the corresponding t-butyloxycarbonylaminoacylimidazole in the presence of Cs2CO3 in DMF as the key step. The L-prolyl derivative (2) and L-phenylalanyl derivative (3) as well as 1 showed selective toxicity against Xanthomonas citri. The L-prolyl-L-prolyl derivative (5) as well as dealanylascamycin (6) showed broad toxicity against various Gram-negative and Gram-positive bacteria. The D-alanyl derivative (4) lost its antibacterial activity. 2 was the best substrate (15.3M/min per mg of protein) for an Xc-aminopeptidase (an ascamycin-dealanylating enzyme from X. citri cells) among these analogs. This enzyme scarcely hydrolyzed 4 (0.2 M/min per mg of protein). The substrate specificity of the enzyme accounts for antibacterial activity of the analogs. 2 showed greater selective toxicity against Kirsten sarcoma virus transformed Balb3T3 (KN-3T3) cells than against nontransformed cells (Balb 3T3).

  通过N6-叔丁氧基羰基-2-氯-9-(2', 3'-O-异亚丙基-5'-O-氨磺酰基-β)的缩合反应合成了L-Prolyl和其他Ascamycin氨酰基衍生物(1) -D-呋喃核糖基)腺嘌呤 (9) 与相应的叔丁氧基羰基氨基酰基咪唑在 Cs2CO3 存在下在 DMF 中反应作为关键步骤。 L-脯氨酰衍生物(2)和L-苯丙氨酰衍生物(3)以及1对柑橘黄单胞菌表现出选择性毒性。 L-脯氨酰-L-脯氨酰衍生物 (5) 以及 dealanylascamycin (6) 对各种革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌表现出广泛的毒性。 D-丙氨酰衍生物(4)失去了抗菌活性。在这些类似物中，2 是 Xc-氨基肽酶（来自柑橘小杆菌细胞的泡霉素脱丙氨酶）的最佳底物（15.3M/分钟/毫克蛋白质）。该酶几乎不水解 4（每毫克蛋白质 0.2 M/分钟）。该酶的底物特异性决定了类似物的抗菌活性。图2显示对克尔斯滕肉瘤病毒转化的Balb3T3(KN-3T3)细胞比对非转化细胞(Balb 3T3)更大的选择性毒性。