methyl 2-O-pivaloyl-3-O-benzyl-4-O-levulinoyl-L-idopyranosiduronate trichloroacetimidate | 615543-18-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl 2-O-pivaloyl-3-O-benzyl-4-O-levulinoyl-L-idopyranosiduronate trichloroacetimidate
• 英文别名: methyl 3-O-benzyl-4-O-levulinoyl-2-O-pivaloyl-L-idopyranosiduronate trichloroacetimidate；methyl (2R,3S,4S,5R)-5-(2,2-dimethylpropanoyloxy)-3-(4-oxopentanoyloxy)-4-phenylmethoxy-6-(2,2,2-trichloroethanimidoyl)oxyoxane-2-carboxylate
• CAS: 615543-18-5
• 化学式: C₂₆H₃₂Cl₃NO₁₀
• 分子量: 624.9
• InChiKey: YSHKNJJXHPCHMU-QBSQKGQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  148
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-O-pivaloyl-3-O-benzyl-4-O-levulinoyl-L-idopyranosiduronate trichloroacetimidate 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 吡啶 、 lithium hydroxide 、 sodium hydroxide 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 水 、 双氧水 、 三乙胺三氧化硫 、 一水合肼 、 溶剂黄146 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 42.5h， 生成 (2R,3S,4S,5R,6R)-3-(((2R,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-bis(benzyloxy)-6-((sulfooxy)methyl)tetrahydro-2H-pyran-2-yl)oxy)-6-((5-(benzyl((benzyloxy)carbonyl)amino)pentyl)oxy)-4-(benzyloxy)-5-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  从头开始合成用于组装肝素寡糖的糖醛酸结构单元。

  摘要：

  描述了一种有效的从头合成糖醛酸结构单元的方法。合成策略依赖于硫代缩醛保护的二醛12a和17的立体选择性伸长。二醛由D-木糖（一种便宜的市售来源）制备。进行高度立体选择性MgBr（2）OEt（2）介导的向海山醛醇缩合成C4-醛12a以获得D-葡萄糖醛酸结构单元16，而L-艾杜糖醛结构单元22由MgBr（2）OEt制备（2）C5-醛的介导的氰化作用。肝素二糖的合成证明了从头策略用于组装糖胺聚糖寡糖的实用性。

  DOI：

  10.1002/chem.200700141
• 作为产物：
  描述：

  tris(thiophenyl) 3-O-benzyl-1,2-O-isopropylidene-β-L-orthoidofuranuronate 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 碳酸二异丙酯 、 氟化氢吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 (+)-10-camphorsulfonic acid 、 三氟乙酸 、 copper(II) oxide 、 copper dichloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 134.24h， 生成 methyl 2-O-pivaloyl-3-O-benzyl-4-O-levulinoyl-L-idopyranosiduronate trichloroacetimidate
  参考文献：
  名称：

  合成用于糖胺聚糖模块组装的艾杜糖酸结构单元。

  摘要：

  糖胺聚糖的模块合成需要直接的方法来生产大量受保护的糖醛酸构件。特别地，已证明完全分化的艾杜糖酸的制备特别具有挑战性。描述了一种通过九步步骤从双丙酮葡萄糖制得3-O-苄基-1,2-O-异亚丙基-α--1-吡喃二葡萄糖醛酸甲酯6的有效途径，总产率为36％。异吡喃二葡萄糖醛酸酸酯6可用作糖基受体和中间体，可以进一步加工成艾杜糖醛酸三氯乙酰亚氨酸酯糖基供体，用于组装此处所示的糖胺聚糖结构。

  DOI：

  10.1021/jo0340760

文献信息

• Preparation and Use of Microarrays Containing Synthetic Heparin Oligosaccharides for the Rapid Analysis of Heparin–Protein Interactions
  作者：Christian Noti、Jose L. de Paz、Laura Polito、Peter H. Seeberger

  DOI：10.1002/chem.200601103

  日期：2006.11.24

  the chemical synthesis of a library containing heparin oligosaccharides ranging from di- to hexamers of different sequences and sulfation patterns. An amine-terminated linker was placed at the reducing end of the synthetic structures to allow for immobilization onto N-hydroxysuccinimide activated glass slides and creation of heparin microarrays. Key features of this modular synthesis, such as the influence

  肝素是一种高度硫酸化的线性聚合物，它通过与许多蛋白质相互作用而参与过多的生物过程。该多糖的化学复杂性和异质性可以解释以下事实：尽管将其广泛用作抗凝药，但对定义的肝素序列的结构-功能关系仍知之甚少。在这里，我们提出了一个化学合成的文库，其中包含肝素寡糖，其范围从二聚体到不同序列和硫酸化模式的六聚体。将胺端基的接头置于合成结构的还原端，以使其固定在N-羟基琥珀酰亚胺活化的载玻片上，并创建肝素微阵列。这种模块化综合的主要特点 讨论了诸如胺连接基对糖苷化效率的影响，使用2-叠氮基葡萄糖作为糖基化寡糖组装剂以及保护基团策略与硫酸化-脱保护步骤的相容性等问题。使用自动打印机构建包含该寡糖文库的肝素微阵列，并用于表征三种肝素结合生长因子的碳水化合物结合亲和力。研究了与血管生成，细胞生长和分化有关的FGF-1，FGF-2和FGF-4。这些肝素芯片有助于发现结合FGF的新的硫酸化序列，并通过在单个载玻片上使