N-芴甲氧羰基-3-[[(4-甲氧基苯基)甲基]硒基]-L-丙氨酸 | 150308-80-8

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 丙氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-芴甲氧羰基-3-[[(4-甲氧基苯基)甲基]硒基]-L-丙氨酸
• 英文名称: Fmoc-Sec(Mob)-OH
• 英文别名: Fmoc-(Se)-p-methoxybenzylselenocysteine；Fmoc-Sec(PMB)-OH；N-9-Fluorenylmethoxycarbonyl-Se-4-methoxybenzylselenocysteine；(2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-[(4-methoxyphenyl)methylselanyl]propanoic acid
• CAS: 150308-80-8
• 化学式: C₂₆H₂₅NO₅Se
• 分子量: 510.448
• InChiKey: XCPAYIZRJRMXBI-DEOSSOPVSA-N

物化性质

• 沸点：
  708.5±60.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.31
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  84.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 危险性防范说明：
  P261,P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H332,H335

制备方法与用途

用途

N-芴甲氧羰基-3-[[(4-甲氧基苯基)甲基]硒基]-L-丙氨酸是一种硒代氨基酸原料，简称Fmoc-Sec(PMB)OH。它可以将硒代氨基酸掺入蛋白质中。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-3-[[(4-甲氧基苯基)甲基]硒基]-L-丙氨酸 在 二乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.16h， 生成 boc-Glu(OtBu)-Se(mob)Cys-NHS ester
  参考文献：
  名称：

  硒代谷胱甘肽二硒化物：GPx样催化循环中独特的氧化还原反应和加扰的蛋白质中二硫键的修复。

  摘要：

  硒谷胱甘肽（GSeH）是天然丰富的谷胱甘肽（GSH）的硒类似物。在这项研究中，这种水溶性小三肽是通过液相肽合成（LPPS）以高产率（高达98％）以氧化二硒化物形式（即GSeSeG（1））合成的。将获得的1用于研究谷胱甘肽过氧化物酶（GPx）样的催化循环。除了GSeO 2 H以外，还通过77 Se NMR光谱对重要的中间体GSe –和GSeSG进行了表征。GSeSG的各种硫醇，如半胱氨酸和二硫苏糖醇硫醇交换，结果发现，以促进转换为GSE -显著。此外，GSeSR与1的比例不成比例观察到RSSR，这是由Se-S键的杂合裂解引发的，并被生成的硒酸酯催化。根据这些氧化还原行为，有人提出，硒原子与GPx活性位点上存在的氨基或芳香基团之间的相互作用可以促进Se-S键的杂化裂解。另一方面，当在NADPH和谷胱甘肽还原酶的存在下，催化量1与加扰的RNase A的4S物种反应时，天然蛋白质得到了有效的再生，

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.7b00751
• 作为产物：
  描述：

  FMOC-L-丝氨酸甲酯 在 吡啶 、 三乙基硼氢化锂 、 三甲基氢氧化锡 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N-芴甲氧羰基-3-[[(4-甲氧基苯基)甲基]硒基]-L-丙氨酸
  参考文献：
  名称：

  2,2'-二硫双（5-硝基吡啶）（DTNP）在受保护的含硒代半胱氨酸肽中用于脱保护和二硒化物形成的用途。

  摘要：

  与固相肽合成中可用于半胱氨酸衍生物的大量侧链保护基团相比，类似的硒代半胱氨酸硒显着缺乏- 文献中的保护基团。然而，对含硒代半胱氨酸的肽和蛋白质的兴趣日益增长，需要相应增加合成这些目标分子的途径。因此，为硒代半胱氨酸设计新的侧链保护策略以及用于去除硒代半胱氨酸的多种新型脱保护化学变得很重要。在本文中，我们概述了两种新的 Fmoc 硒代半胱氨酸衍生物 [Fmoc-Sec(Meb) 和 Fmoc-Sec(Bzl)] 的合成，以配合市售的 Fmoc-Sec(Mob) 衍生物并将它们合并到两个模型肽中。使用我们小组先前描述的 2,2'-二硫双 (5-硝基吡啶) (DTNP) 条件对这些肽进行了 Sec 脱保护试验。进一步评估了脱保护方法是否适用于介导催产素模板化目标肽中同时形成的二硒化物。发现 Sec(Mob) 和 Sec(Meb) 对 DTNP 条件非常不稳定，无论是否存在茴香硫醚，而 Sec(Bzl)

  DOI：

  10.1002/psc.1430

文献信息

• Chemically Diverse Helix-Constrained Peptides Using Selenocysteine Crosslinking
  作者：Aline Dantas de Araujo、Samuel R. Perry、David P. Fairlie

  DOI：10.1021/acs.orglett.8b00233

  日期：2018.3.2

  The use of selenocysteines and various cross-linkers to induce helicity in a bioactive peptide is described. The higher reactivity of selenocysteine, relative to cysteine, facilitates rapid cross-linking within unprotected linear peptides under mild aqueous conditions. Alkylating agents of variable topology and electrophilicity were used to link pairs of selenocysteines within a p53 peptide. Facile

  描述了硒代半胱氨酸和各种交联剂在生物活性肽中诱导螺旋的用途。相对于半胱氨酸，硒代半胱氨酸的较高反应性促进了在温和的水性条件下未保护的线性肽内的快速交联。拓扑和亲电性可变的烷基化试剂用于连接p53肽中的半胱氨酸对。轻松的硒醚形成可实现螺旋肽结构的多种修饰。
• Cyclization of Peptides by using Selenolanthionine Bridges
  作者：Aline Dantas de Araujo、Mehdi Mobli、Glenn F. King、Paul F. Alewood

  DOI：10.1002/anie.201204229

  日期：2012.10.8

  Selenocysteine does the job: Lanthionine bridges are important structural elements in naturally occurring lantibiotics. They can be engineered into peptides to increase biological activity and metabolic stability. Macrocyclization of peptides by intramolecular thiolation of cysteine is often difficult but can be achieved by replacing cysteine with the more reactive isosteric selenocysteine amino acid

  硒代半胱氨酸发挥作用：羊毛硫氨酸桥是天然存在的羊毛硫抗生素中的重要结构元素。它们可以被工程化为肽以增加生物活性和代谢稳定性。通过半胱氨酸的分子内硫醇化作用使肽大环化通常是困难的，但是可以通过用反应性更强的等排硒代半胱氨酸氨基酸代替半胱氨酸来实现。
• Investigation of peptide thioester formation via <i>N</i> →<i>Se</i> acyl transfer
  作者：Anna L. Adams、Derek Macmillan

  DOI：10.1002/psc.2469

  日期：2013.2

  occasionally observed significant thioester hydrolysis as a consequence of long reaction times (~48 h) and sought to accelerate the reaction. Here, we present a faster route to peptide thioesters, by replacing the C‐terminal cysteine residue with selenocysteine and initiating thioester formation via an N→Se acyl shift. This modification allows thioester formation to take place at lower temperatures

  天然化学连接被广泛用于蛋白质的收敛合成。生产该过程所需的肽硫酯可能具有挑战性，特别是在使用基于Fmoc的固相肽合成时。先前我们已经报道了在Fmoc固相肽合成之后，通过N → S合成肽硫酯的方法在弱酸性条件下，由C端半胱氨酸残基的存在引发的酰基转移。在典型的反应条件下，由于反应时间长（〜48小时），我们偶尔会观察到明显的硫酯水解，并试图加速反应。在这里，我们提出了一种更快的肽硫酯途径，方法是用硒代半胱氨酸取代C端半胱氨酸残基，并通过N → Se引发硫酯形成酰基转移。这种修饰使得硫酯的形成可以在较低的温度和较短的时间范围内进行。当线性前体具有N端半胱氨酸和C端硒代半胱氨酸时，我们还证明了该策略的应用如何还可以加速肽环化。版权所有©2013欧洲多肽协会和John Wiley＆Sons，Ltd.
• Synthesis of a Selenocysteine-Containing Peptide by Native Chemical Ligation
  作者：Matt D. Gieselman、Lili Xie、Wilfred A. van der Donk

  DOI：10.1021/ol015712o

  日期：2001.5.1

  synthesis of selenocysteine derivatives and selenocysteine-containing peptides is described. Fmoc-Se-p-methoxybenzylselenocysteine (1) was prepared and used for solid-phase synthesis of peptides with an N-terminal unprotected selenocysteine. Subsequent native chemical ligation with a peptide thioester provided a 17-mer that corresponds to the C-terminus of ribonucleotide reductase with selenocysteine in place

  [本文中的反应]描述了合成硒代半胱氨酸衍生物和含硒代半胱氨酸的肽的新方法。制备了Fmoc-Se-对甲氧基苄基硒代半胱氨酸（1），并用于固相合成具有N端未保护的硒代半胱氨酸的肽。随后与肽硫酯的天然化学连接提供了一个17聚体，其对应于用硒代半胱氨酸代替半胱氨酸的核糖核苷酸还原酶的C末端。
• Selenocysteine in Native Chemical Ligation and Expressed Protein Ligation
  作者：Robert J. Hondal、Bradley L. Nilsson、Ronald T. Raines

  DOI：10.1021/ja005885t

  日期：2001.5.1

  Instruments. NMR spectra were obtained with Bruker AC-300 and Varian UNITY-500 spectrometers. Mass spectra were obtained with Perkin Elmer Sciex API 365 electrospray ionization (ESI) and Bruker Biflex III matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) instruments at the University of Wisconsin Biotechnology Center. Ultraviolet and visible absorbance was recorded with a Cary

  仪器。NMR 谱是用 Bruker AC-300 和 Varian UNITY-500 光谱仪获得的。使用威斯康星大学生物技术中心的 Perkin Elmer Sciex API 365 电喷雾电离 (ESI) 和 Bruker Biflex III 基质辅助激光解吸/电离飞行时间 (MALDI-TOF) 仪器获得质谱。紫外和可见光吸光度用来自 Varian 的配备有 Varian 温度控制器的 Cary Model 3 UV/VIS 分光光度计记录。