N⁶,N⁶-di-benzoyl-2',3'-O-isopropylideneadenosine | 67662-04-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N⁶,N⁶-di-benzoyl-2',3'-O-isopropylideneadenosine
• 英文别名: N-benzoyl-N-(9-(6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-yl)benzamide；N-[9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]purin-6-yl]-N-benzoylbenzamide
• CAS: 67662-04-8
• 化学式: C₂₇H₂₅N₅O₆
• 分子量: 515.525
• InChiKey: VOELTMNZMSGNSH-NWOYTWEOSA-N

物化性质

• 沸点：
  737.2±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.48±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶,N⁶-di-benzoyl-2',3'-O-isopropylideneadenosine 在 吡啶 、 sodium iodide 作用下， 以 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 生成 N⁶,N⁶-dibenzoyl-5'-deoxy-5'-iodo-2',3'-O-isopropylideneadenosine
  参考文献：
  名称：

  表观遗传致癌基因MMSET的结构和N-烷基紫杉醇衍生物的抑制作用

  摘要：

  NSD赖氨酸甲基转移酶亚家族的成员是令人信服的肿瘤学靶标，原因是最近在几种血液系统癌症中获得了功能获得性突变和易位。迄今为止，已证明这些蛋白质对小分子抑制具有顽固性。在这里，我们提出了使用溶液相和晶体结构方法鉴定MMSET（aka NSD2或WHSC1）抑制剂的初步努力。在比较NSD1和MMSET结构迁移率的2D NMR实验的基础上，我们设计了一个在其SET结构域的N末端螺旋结构中具有五个点突变的MMSET构建体，用于结晶实验，并阐明了分辨率为2.1Å的突变体MMSET SET结构域的结构。NSD1和MMSET晶体系统均被证明对抑制剂的浸泡或共结晶具有抵抗力。然而，对烷基SETD2和MMSET表现出低微摩尔抑制作用的N-烷基西芬芬净衍生物。

  DOI：

  10.1021/acschembio.6b00308
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 吡啶 、 水 作用下， 反应 4.0h， 生成 N⁶,N⁶-di-benzoyl-2',3'-O-isopropylideneadenosine
  参考文献：
  名称：

  同工酶特异性抑制剂的方法。16.L-乙硫氨酸和β，γ-亚氨基-ATP的新型甲基-C5'共价加合物，其为大鼠甲硫氨酸腺苷转移酶的有效多底物抑制剂。

  摘要：

  通过一锅5'-O-三甲基甲硅烷基化，N6-苯甲酰基化和去甲硅烷基化容易地合成的N6，N6-二苯甲酰基-2'，3'-O-异丙基亚氨腺苷被转化为相应的5'-醛。将其用CH 2 ＝ CHMgBr处理，在脱苯甲酰化后，分别得到5′-C-乙烯基-2′，3′-O-异丙基亚氨腺苷的5′S和5′R差向异构体的1∶3混合物。通过对5'R差向异构体的单晶X射线衍射分析来确定构型。混合的差向异构5'-C-乙烯基核苷的5'-O-四氢吡喃基衍生物的氢硼化反应很容易提供5'（S，R）-C-（2-羟乙基）-2'，3'-O-异丙基亚丙基腺苷。用L-高半胱氨酸二钠处理该5'（S，R）-C-（2-O-甲苯磺酰基）衍生物可方便地引入L-乙硫氨酸系统。用较早的合成蛋氨酸-ATP加合物的方法，保护了α-氨基酸，在O5'处引入了β，γ-亚氨基三磷酰基，并去除了保护基，得到标题加合物它的两个5'差向异构体的2：3混合物。它是标题酶的M

  DOI：

  10.1021/jm00124a026

文献信息

• Dehydroxymethylation of Alcohols Enabled by Cerium Photocatalysis
  作者：Kaining Zhang、Liang Chang、Qing An、Xin Wang、Zhiwei Zuo

  DOI：10.1021/jacs.9b05932

  日期：2019.7.3

  functionality has been reliably transferred into nucleophilic radicals with the loss of one molecule of formaldehyde. Intriguingly, we found that the dehydroxymethylation process can be significantly promoted by the cerium catalyst, and the stabilization effect of the fragmented radicals also plays a significant role. This operationally simple protocol has enabled the direct utilization of primary alcohols as unconventional

  脱羟甲基化是将醇原料直接转化为少一个碳原子的烷基合成子，是一种利用醇材料的普遍性和稳健性的非常规且未充分探索的策略。在温和且氧化还原中性的反应条件下，利用廉价的铈催化剂，提供了光催化脱羟甲基化平台。通过配体到金属的电荷转移催化，醇官能团已可靠地转移到亲核自由基中，同时失去一分子甲醛。有趣的是，我们发现铈催化剂可以显着促进脱羟甲基化过程，并且碎片自由基的稳定作用也起着重要作用。这种操作简单的方案能够直接利用伯醇作为非常规烷基亲核试剂，用于自由基介导的 1,4-共轭加成与迈克尔受体。广泛的醇类，从简单的乙醇到复杂的核苷和类固醇，已成功应用于这种片段偶联转化。此外，该催化系统的模块化已在多种自由基介导的转化中得到证实，包括氢化、胺化、烯基化和氧化。
• GMP Synthetase: Synthesis and Biological Evaluation of a Stable Analog of the Proposed AMP-XMP Reaction Intermediate
  作者：Edward J. Salaski、Hans Maag

  DOI：10.1055/s-1999-3104

  日期：——

  The enzyme guanosine monophosphate synthetase is part of the de novo purine synthesis pathway and is responsible for the conversion of xanthosine monophosphate to guanosine monophosphate. The phosphate-linked adenyl-XMP 1 has been proposed as the intermediate in a stepwise mechanism for this conversion. Direct observation of 1; either as produced in the enzymatic reaction, or as a potential synthetic target is not readily feasible due to the high lability of the phosphate linkage. We therefore undertook the synthesis of the phosphonate 2 as a stable analog of this proposed intermediate. The successful synthetic strategy involved the coupling under Mitsunobu conditions of a 2-phosphorylmethyl inosine with an adenosine derivative. This gave 2 after deprotection and 5′ monophosphate formation of the initial coupling product. Compound 2 inhibited GMP synthetase with a Ki of 0.56 μM.

  酶鸟苷酸合成酶是新生嘌呤合成途径的一部分，负责将黄苷酸单磷酸转化为鸟苷酸单磷酸。已提出磷酸链接的腺苷-XMP 1是这一转化过程的中间体。然而，由于磷酸链接的高不稳定性，直接观察1（无论是在酶反应中产生的或作为潜在合成目标）并不容易。因此，我们进行了磷酸酯2的合成，作为这一提议中间体的稳定类似物。成功的合成策略涉及将2-磷酸甲基肌苷与腺苷衍生物在Mitsunobu反应条件下偶联。经过去保护和初始偶联产物的5′单磷酸形成后得到了化合物2。化合物2以0.56 μM的Ki值抑制了GMP合成酶。
• Inhibitors of nicotinamide N-methyltransferase designed to mimic the methylation reaction transition state
  作者：Matthijs J. van Haren、Rebecca Taig、Jilles Kuppens、Javier Sastre Toraño、Ed E. Moret、Richard B. Parsons、Davide Sartini、Monica Emanuelli、Nathaniel I. Martin

  DOI：10.1039/c7ob01357d

  日期：——

  inhibitors derived from the structures of the substrates involved in the methylation reaction. By covalently linking fragments of the NNMT substrates a diverse library of bisubstrate-like compounds was prepared. The ability of these compounds to inhibit NNMT was evaluated providing valuable insights into the structural tolerances of the enzyme active site. These studies led to the identification of new

  烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）是一种催化烟酰胺甲基化以形成N的酶′-甲基烟酰胺。NNMT及其甲基化产物最近都与多种疾病有关，这表明该酶作为其治疗目标的作用已超出其先前在排毒中赋予的代谢功能。我们在这里描述了来自参与甲基化反应的底物结构的NNMT抑制剂的系统开发。通过共价连接NNMT底物的片段，制备了多种双底物样化合物库。评估了这些化合物抑制NNMT的能力，为了解酶活性位点的结构耐受性提供了宝贵的见识。
• Development of O–H insertion for the attachment of phosphonates to nucleosides; synthesis of α-carboxy phosphononucleosides
  作者：Isabelle Hladezuk、Veronique Chastagner、Stuart G. Collins、Stephen J. Plunkett、Alan Ford、Sebastien Debarge、Anita R. Maguire

  DOI：10.1016/j.tet.2011.12.077

  日期：2012.2

  Development of rhodium catalysed O-H insertion reactions employing alpha-diazophosphonates with appropriately protected adenosine, uridine and thymidine derivatives is described. This synthetic methodology leads, following deprotection, to novel phosphononucleoside derivatives bearing a carboxylic acid moiety adjacent to the phosphonate. Protection strategies are critical to the success of the key O-H insertion. There are two important aspects: avoiding competing insertion pathways or catalyst poisoning, and being able to achieve deprotection without degradation of the phosphononucleosides. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Copper-Mediated Cross-Coupling of <i>H</i>-Phosphonates with Vinyliodonium Salts: A Novel Very Mild Synthesis of 2-Arylvinylphosphonates
  作者：Sabine Thielges、Philippe Bisseret、Jacques Eustache

  DOI：10.1021/ol047516y

  日期：2005.2.1

  We report a novel, very mild, highly stereoselective preparation of 2-arylvinylphosphonates at room temperature that involves the copper iodide-mediated cross-coupling of H-phosphonates with vinyliodonium tetrafluoroborates.