(2R,3R,4S,5S)-2-(6-氨基嘌呤-9-基)-5-(二氟甲基)四氢呋喃-3,4-二醇 | 131077-98-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 中文名称: (2R,3R,4S,5S)-2-(6-氨基嘌呤-9-基)-5-(二氟甲基)四氢呋喃-3,4-二醇
• 中文别名: (2R,3R,4S,5S)-2-(6-氨基嘌呤-9-基)-5-(二氟甲基)噁戊环-3,4-二醇
• 英文名称: 5'-deoxy-5',5'-difluoroadenosine
• 英文别名: 5',5'-difluoro-5'-deoxyadenosine；Adenosine, 5'-deoxy-5',5'-difluoro-；(2R,3R,4S,5S)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(difluoromethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 131077-98-0
• 化学式: C₁₀H₁₁F₂N₅O₃
• 分子量: 287.226
• InChiKey: YQLJSFYLQCBEKY-LKCKTBJASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-硒代蛋氨酸 、 (2R,3R,4S,5S)-2-(6-氨基嘌呤-9-基)-5-(二氟甲基)四氢呋喃-3,4-二醇 在 fluorinase 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 水 为溶剂， 反应 19.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Exploration of a potential difluoromethyl-nucleoside substrate with the fluorinase enzyme

  摘要：

  The investigation of a difluoromethyl-bearing nucleoside with the fluorinase enzyme is described. 5',5'-Difluoro-5'-deoxyadenosine 7 (F(2)DA) was synthesised from adenosine, and found to bind to the fluorinase enzyme by isothermal titration calorimetry with similar affinity compared to 5'-fluoro-5'deoxyadenosine 2 (FDA), the natural product of the enzymatic reaction. F(2)DA 7 was found, however, not to undergo the enzyme catalysed reaction with L-selenomethionine, unlike FDA 2, which undergoes reaction with L-selenomethionine to generate Se-adenosylselenomethionine. A co-crystal structure of the fluorinase and F(2)DA 7 and tartrate was solved to 1.8 angstrom, and revealed that the difluoromethyl group bridges interactions known to be essential for activation of the single fluorine in FDA 2. An unusual hydrogen bonding interaction between the hydrogen of the difluoromethyl group and one of the hydroxyl oxygens of the tartrate ligand was also observed. The bridging interactions, coupled with the inherently stronger C-F bond in the difluoromethyl group, offers an explanation for why no reaction is observed. (C) 2015 Elsevier Inc. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2015.11.003
• 作为产物：
  描述：

  5'-deoxy-5',5'-difluoro-2',3'-O-isopropylideneadenosine 在 三氟乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以68%的产率得到(2R,3R,4S,5S)-2-(6-氨基嘌呤-9-基)-5-(二氟甲基)四氢呋喃-3,4-二醇
  参考文献：
  名称：

  4'，5'-不饱和5'-卤代核苷。基于机制的竞争性S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶抑制剂。

  摘要：

  （E）-和（Z）-5'-氟-4'，5'-二氢-5'-脱氧腺苷（分别为6和13）的设计和合成，这是一类新的基于机理的S-抑制剂描述了腺苷-L-高半胱氨酸（SAH）水解酶。为了确定抑制该酶所必需的结构-活性关系，合成了许多6和13的类似物。用氯代替6（即44）中的氟，在5'-乙烯基位置（即51和52）添加额外的氯，将2'-羟基修饰为脱氧（34和35）和阿拉伯糖（ 36和37）核苷提供了SAH水解酶的竞争性抑制剂。核苷6和13以及5'-脱氧-5'，5'-二氟腺苷（14）被证明是SAH水解酶的时间依赖性抑制剂。假定所有这三种化合物都通过强力亲电试剂来抑制，该亲电试剂是由6或13的3'-羟基氧化成酮（即3和/或E-异构体）而形成的。与提出的通过6、13和14灭活SAH水解酶的机理一致的观察结果是，纯化的大鼠肝脏SAH水解酶与6孵育会释放1当量的氟离子（通过19F NMR），与14孵育会导致释放2当量

  DOI：

  10.1021/jm00106a028

文献信息

• 4'-5'-Unsaturated 5'-halogenated nucleosides. Mechanism-based and competitive inhibitors of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase
  作者：Esa T. Jarvi、James R. McCarthy、Shujaath Mehdi、Donald P. Matthews、Michael L. Edwards、Nellikunja J. Prakash、Terry L. Bowlin、Prasad S. Sunkara、Philippe Bey

  DOI：10.1021/jm00106a028

  日期：1991.2

  an extra chlorine to the 5'-vinyl position (i.e. 51 and 52), modification of the 2'-hydroxyl group to the deoxy (34 and 35) and arabino (36 and 37) nucleosides provided competitive inhibitors of SAH hydrolase. Nucleosides 6 and 13, as well as 5'-deoxy-5',5'-difluoroadenosine (14) proved to be time-dependent inhibitors of SAH hydrolase. All three compounds are postulated to inhibit through the potent

  （E）-和（Z）-5'-氟-4'，5'-二氢-5'-脱氧腺苷（分别为6和13）的设计和合成，这是一类新的基于机理的S-抑制剂描述了腺苷-L-高半胱氨酸（SAH）水解酶。为了确定抑制该酶所必需的结构-活性关系，合成了许多6和13的类似物。用氯代替6（即44）中的氟，在5'-乙烯基位置（即51和52）添加额外的氯，将2'-羟基修饰为脱氧（34和35）和阿拉伯糖（ 36和37）核苷提供了SAH水解酶的竞争性抑制剂。核苷6和13以及5'-脱氧-5'，5'-二氟腺苷（14）被证明是SAH水解酶的时间依赖性抑制剂。假定所有这三种化合物都通过强力亲电试剂来抑制，该亲电试剂是由6或13的3'-羟基氧化成酮（即3和/或E-异构体）而形成的。与提出的通过6、13和14灭活SAH水解酶的机理一致的观察结果是，纯化的大鼠肝脏SAH水解酶与6孵育会释放1当量的氟离子（通过19F NMR），与14孵育会导致释放2当量
• 5'-deoxy-5',5'-dihalo adenosines and purine analogues
  申请人：Merrell Dow Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US04997925A1

  公开（公告）日：1991-03-05

  This invention relates to certain 5',5'-dihaloaristeromycin/adenosine derivatives which are useful in inhibiting AdoMet-dependent transmethylation and in the treatment of patients afflicted with neoplastic or viral disease states.

  本发明涉及某些5'，5'-二卤代阿立司曼/腺苷衍生物，其在抑制AdoMet依赖性转甲基化和治疗患有肿瘤或病毒性疾病状态的患者方面具有用途。
• Novel aristeromycin/adenosine derivatives
  申请人：MERRELL PHARMACEUTICALS INC.

  公开号：EP0304889A2

  公开（公告）日：1989-03-01

  This invention relates to certain aristeromycin/adenosine derivatives which are useful in inhibiting AdoMet-dependent transmethylation and in the treatment of patients afflicted with neoplastic or viral disease states.

  本发明涉及某些阿里斯托霉素/腺苷衍生物，这些衍生物可用于抑制 AdoMet 依赖性转甲基化和治疗肿瘤性或病毒性疾病患者。
• Use of 5'-vinylhalo-aristeromycin/adenosine analogs as immunosuppressants
  申请人：MERRELL DOW PHARMACEUTICALS INC.

  公开号：EP0471383A2

  公开（公告）日：1992-02-19

  The present invention relates to the use of certain 5'-vinylhalo-aristeromycin/adenosine analogs for the preparation of a pharmaceutical composition useful in effecting immunosuppression.

  本发明涉及使用某些 5'-vinylhalo-aristeromycin/adenosine 类似物制备可用于实施免疫抑制的药物组合物。
• US4997924A
  申请人：——

  公开号：US4997924A

  公开（公告）日：1991-03-05