乙酰胆碱结合蛋白(AChBPs)的X射线晶体结构揭示了对经典
配体结合袋的两种不同可能的扩展,已知该
配体结合袋可容纳多种
烟碱激动剂。其中一个口袋的大小受到限制,而另一个口袋的大小却相当大,并沿着亚基之间的界面裂口突出。为了探测功能性
烟碱乙酰胆碱受体(nAChRs)中的这些假定的扩展,制备了3-(二甲基
氨基)丁基
二甲基氨基甲酸酯(
DMABC)和1-(
吡啶-3-基)-1,4-二氮杂ze的细长类似物,并在神经元处进行了药理学表征异聚nAChRs。尽管新的类似物相对于母体化合物显示出较低的结合亲和力,但所选化合物的功能表征显示它们保留了部分α4β2nAChR激动剂活性。结构-活性关系数据并未表明取代基大小的上限,如果将
配体结合在较小的口袋中,这是可以预期的。数据更好地与结合模式一致,在该结合模式中,取代基沿着受体的界面裂隙突出。通过对接至α4-β2nAChR界面的同源性模型以及通过表面等离振子共振生