(S)-methyl 3-(4-(benzyloxy)-3-iodophenyl)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanamido)propanoate | 1364705-39-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-methyl 3-(4-(benzyloxy)-3-iodophenyl)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanamido)propanoate
• 英文别名: methyl (2S)-3-(3-iodo-4-phenylmethoxyphenyl)-2-[[(2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoyl]amino]propanoate
• CAS: 1364705-39-4
• 化学式: C₂₅H₃₁IN₂O₆
• 分子量: 582.435
• InChiKey: GHZZZPHSFHDSMY-JXFKEZNVSA-N

物化性质

• 沸点：
  684.9±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.398±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-methyl 3-(4-(benzyloxy)-3-iodophenyl)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanamido)propanoate 在 N-甲基吗啉 、 盐酸 、 (1,1'-bis(diphenylphosphino)ferrocene)palladium(II) dichloride 、 potassium phosphate 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 甲烷磺酸 、 palladium 10% on activated carbon 、 四丁基氟化铵 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 水 、 氢气 、 potassium acetate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 2-甲基四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 甲基叔丁基醚 、 N,N-二甲基乙酰胺 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 93.5h， 生成 rac-(8S,11S,14S)-18-(2-aminoethoxy)-N-(cyanomethyl)-3-hydroxy-11-methyl-14-[methyl-[rac-(2S)-4-amino-2-[[2-(4-isopropoxyphenyl)-4,6-dimethyl-pyrimidine-5-carbonyl]amino]butanoyl]amino]-10,13-dioxo-9,12-diazatricyclo[13.3.1.12,6]icosa-1(18),2(20),3,5,15(19),16-hexaene-8-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  [EN] PROCESS FOR MAKING ARYLOMYIN RING ANALOGS
  [FR] PROCÉDÉ DE FABRICATION D'ANALOGUES DE L'ANNEAU D'ARYLOMYCINE

  摘要：

  制备化合物t的芳基肽环或其盐或溶剂合物的方法，其中R、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R5、R10和Pg1如本文所定义。

  公开号：

  WO2018183198A1
• 作为产物：
  描述：

  L-酪氨酸 在 ammonium hydroxide 、 氯化亚砜 、 碘 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 potassium iodide 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 (S)-methyl 3-(4-(benzyloxy)-3-iodophenyl)-2-((S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanamido)propanoate
  参考文献：
  名称：

  立体合成基于霉素的革兰氏阴性抗生素GDC-5338。

  摘要：

  我们在此报告了新型广谱抗生素GDC-5338的高效，立体控制和无色谱合成方法。该路线的特点是功能化三肽主链的构建，通过Pd催化的Suzuki-Miyaura反应的高产量大环化以及关键酰胺键的后期精制和最小的立体化学腐蚀。通过广泛的反应开发和分析理解，这些关键的进展使GDC-5338的制备可以分17个步骤，15％的总收率，> 99 A％HPLC和> 99：1 dr。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.9b03481

文献信息

• Initial Analysis of the Arylomycin D Antibiotics
  作者：Yun Xuan Tan、David S. Peters、Shawn I. Walsh、Matthew Holcomb、Diogo Santos-Martins、Stefano Forli、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/acs.jnatprod.9b01174

  日期：2020.7.24

  The arylomycins are a class of natural product antibiotics that inhibit bacterial type I signal peptidase and are under development as therapeutics. Four classes of arylomycins are known, arylomycins A–D. Previously, we reported the synthesis and analysis of representatives of the A, B, and C classes and showed that their spectrum of activity has the potential to be much broader than originally assumed

  芳霉素是一类天然产物抗生素，可抑制细菌 I 型信号肽酶，正在开发作为治疗剂。已知四类芳霉素，芳霉素 A-D。之前，我们报告了 A、B 和 C 类代表的综合和分析，并表明它们的活动范围可能比最初假设的要广泛得多。连同获得性和先天性耐药机制的比较，这使我们认为 arylomycins 是潜在的抗生素，曾经具有广谱活性的抗生素，但在今天的检查中，由于先前的选择而只有窄谱活性在与其他首先推动它们进化的微生物竞争的过程中产生抗药性。有趣的是，放线菌素，据报道，芳霉素 D 类中唯一确定的成员具有抗 MRSA 的活性。为了证实和理解这种活性，合成了几种放线菌素衍生物。我们证明先前报告的放线菌素结构不正确，确定可能是正确的支架，确认支架具有抗 MRSA 的活性，并确定此活动的起源。
• Process for making arylomycin ring analogs
  申请人：Genentech, Inc.

  公开号：US11192924B2

  公开（公告）日：2021-12-07

  Methods for making an arylomycin ring of formula t or salts or solvates thereof, wherein R, R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R5, R10 and Pg1 are as defined herein.

  制造式 t 的芳基霉素环的方法 或其盐或溶剂，其中 R、R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R5、R10 和 Pg1 如本文所定义。
• Biaryl-Bridged Macrocyclic Peptides: Conformational Constraint via Carbogenic Fusion of Natural Amino Acid Side Chains
  作者：Falco-Magnus Meyer、James C. Collins、Brendan Borin、James Bradow、Spiros Liras、Chris Limberakis、Alan M. Mathiowetz、Laurence Philippe、David Price、Kun Song、Keith James

  DOI：10.1021/jo202105v

  日期：2012.4.6

  A general method for constraining peptide conformations via linkage of aromatic sidechains has been developed. Macrocydization of suitably functionalized tri-, tetra- and pentapeptides via Suzuki-Miyaura cross-coupling has been used to generate side chain to side chain, biaryl-bridged 14- to 21-membered macrocyclic peptides. Biaryl bridges possessing three different configurations, meta-meta, meta-ortho, and ortho-meta, were systematically explored through regiochemical variation of the aryl halide and aryl boronate coupling partners, allowing fine-tuning of the resultant macrocycle conformation. Suzuki-Miyaura macrocyclizations were successfully achieved both in solution and on solid phase for all three sizes of peptide. This approach constitutes a means of constraining peptide conformation via direct carbogenic fusion of side chains of naturally occurring amino acids such as phenylalanine and tyrosine, and so is complementary to strategies involving non-natural, for example, hydrocarbon, bridges.
• Macrolactamization Approaches to Arylomycin Antibiotics Core
  作者：Ngiap-Kie Lim、Xin Linghu、Nicholas Wong、Haiming Zhang、C. Gregory Sowell、Francis Gosselin

  DOI：10.1021/acs.orglett.8b03603

  日期：2019.1.4

  Two practical entries to arylomycin antibiotics core structures are investigated. In route A, the activation of L-Hpg for the key macrolactamization step is achieved in 89% yield in the presence of unprotected phenol and amine functionalities. Alternatively, a propanephosphonic acid anhydride (T3P)-promoted coupling between theL-Tyr and L-Ala moieties in route B led to a facile macrolactamization in 68% yield with a marked reduction in competing oligomerization.
• PROCESS FOR MAKING ARYLOMYIN RING ANALOGS
  申请人：F. Hoffmann-La Roche AG

  公开号：EP3601240A1

  公开（公告）日：2020-02-05