2,6-二氯-9-(3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)嘌呤 | 38925-80-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 2,6-二氯-9-(3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)嘌呤
• 英文名称: 2,6-Dichloro-9-(2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)-purine
• 英文别名: (2R,3S,5R)-5-(2,6-Dichloro-9H-purin-9-yl)-2-(((4-methylbenzoyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-methylbenzoate；[(2R,3S,5R)-5-(2,6-dichloropurin-9-yl)-3-(4-methylbenzoyl)oxyoxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzoate
• CAS: 38925-80-3
• 化学式: C₂₆H₂₂Cl₂N₄O₅
• 分子量: 541.39
• InChiKey: GITNWEFFGFSPFZ-XUVXKRRUSA-N

物化性质

• 熔点：
  159-162 °C
• 沸点：
  679.3±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.48±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.7
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,6-二氯-9-(3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)嘌呤 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 5.0h， 以86%的产率得到克拉屈滨
  参考文献：
  名称：

  2-取代的dATP衍生物作为小槽中修饰的DNA的聚合酶催化合成的基础

  摘要：

  制备了2位带有2个不同取代基（Cl，NH 2，CH 3，乙烯基，乙炔基和苯基）的2'-脱氧腺苷三磷酸（dATP）衍生物，并作为DNA聚合酶的底物进行了测试。2-苯基-dATP不是DNA聚合酶的底物，但是带有较小取代基的dATP在引物延伸实验中是良好的底物，在小沟中产生了被取代的DNA。乙烯基修饰的DNA用于硫醇-烯加成，乙炔基修饰的DNA用于CuAAC点击反应，以在小沟中形成标记有荧光染料的DNA

  DOI：

  10.1002/anie.201609007
• 作为产物：
  描述：

  1-Α-氯-3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖 、 2,6-二氯嘌呤 在 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 16.5h， 以78%的产率得到2,6-二氯-9-(3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)嘌呤
  参考文献：
  名称：

  以2-取代腺嘌呤为碱基的[(二氢呋喃-2-基)氧基]甲基膦酸核苷的合成及体外抗病毒活性

  摘要：

  从 2-脱氧-3,5-双-O-(4-甲基苯甲酰基)开始合成具有2-取代腺嘌呤碱基部分的[(2',5'-二氢呋喃-2-基)氧基]甲基-膦酸核苷描述了-α-L-呋喃核糖酰氯和2,6-二氯嘌呤。关键步骤是在呋喃环的 C(2) 处区域特异性和立体选择性引入膦酸酯合成子。合成的化合物均未显示出显着的体外抗 HIV、BVDV 和 HBV 活性。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201400418

文献信息

• Nucleic Acid Analysis Using an Expanded Genetic Alphabet to Quench Fluorescence
  作者：Christopher B. Sherrill、David J. Marshall、Michael J. Moser、Christine A. Larsen、Lygia Daudé-Snow、James R. Prudent

  DOI：10.1021/ja0315558

  日期：2004.4.1

  specific and sensitive method that allows for the fast and specific quantitation of genetic sequences in a closed tube format. During PCR amplification, enzymatic site-specific incorporation of a quencher covalently linked to isoguanine allows for the simultaneous detection and identification of multiple targets. The specificity of method is then established by analysis of thermal denaturation or melting

  有机化学使合成扩展自然基因字母表的分子成为可能。使用先前描述的由异鸟嘌呤和 5-甲基异胞嘧啶构建的非标准 DNA 碱基对，我们报告了一种高度特异和灵敏的方法，该方法允许在封闭管格式中对基因序列进行快速和特异的定量。在 PCR 扩增过程中，与异鸟嘌呤共价连接的猝灭剂的酶促位点特异性掺入允许同时检测和识别多个目标。然后通过分析扩增子的热变性或熔解来确定方法的特异性。通过在反应混合物中加入一个独立的目标，进一步验证所有反应的适当功能。我们报告说该方法对单拷贝水平敏感，并且特异性通过使用四个单独的荧光报告基因同时对四个目标进行多重终点基因型分析来证明。该方法适用于使用先前开发的引物组对 RNA 和 DNA 进行定量和定性分析。尽管所描述的方法采用了常用的 PCR，但将报告基团酶促掺入 DNA 位点特异性应在整个分子生物学中找到广泛的用途。
• Purine and 1-deazapurine ribonucleosides and deoxyribonucleosides: synthesis and biological activity
  作者：Gloria Cristalli、Sauro Vittori、Alessandra Eleuteri、Mario Grifantini、Rosaria Volpini、Giulio Lupidi、Laura Capolongo、Enrico Pesenti

  DOI：10.1021/jm00111a044

  日期：1991.7

  6-hydroxylamino derivatives of 1-deazapurine 9, 12, and 17 and also the blocked compound 13 are inhibitors of ADA whereas the purine derivatives 4 and 6 and the nitro compounds 11 and 16 are resistant to the enzyme. 7-(Hydroxylamino)-3-(2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranosyl)-3H-imi dazo[4,5- b]pyridine, the less cytotoxic but the most active ADA inhibitor in the series (Ki = 2.7 x 10(-7)), greatly potentiates

  合成了一系列6-（羟氨基）嘌呤和-1-脱氮嘌呤核苷，并测试了它们的抗肿瘤和腺苷脱氨酶抑制活性。所有检查的分子均显示出与参考化合物6-（羟基氨基）-9-β-D-呋喃呋喃糖基嘌呤（HAPR）和ara-A相当的体外活性，其ID50为0.9 microM至约100 microM。1-脱氮嘌呤9、12和17的6-羟基氨基衍生物以及被保护的化合物13是ADA的抑制剂，而嘌呤衍生物4和6以及硝基化合物11和16对该酶具有抗性。7-（羟氨基）-3-（2-脱氧-β-D-赤-戊呋喃糖基）-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶，细胞毒性较小，但是该系列中活性最高的ADA抑制剂（Ki = 2.7 x 10（-7）），可大大增强ara-A的体外抗肿瘤活性。
• Synthesis of 2-Substituted 6-(Hydroxymethyl)purine Bases and Nucleosides
  作者：Peter Šilhár、Radek Pohl、Ivan Votruba、Michal Hocek

  DOI：10.1135/cccc20051669

  日期：——

  A facile and efficient methodology of the synthesis of 6-(hydroxymethyl)purine derivatives (bases and nucleosides) was developed based on Pd-catalyzed cross-coupling reactions of 6-halopurines or N-protected 2-amino-6-halopurines with (benzoyloxymethyl)zinc iodide followed by deprotection. Regioselective hydroxymethylations of 2,6-dihalopurines were also studied and used for the synthesis of 2-chloro-6-(hydroxymethyl)- or 2,6-bis(hydroxymethyl)purines. The 6-(hydroxymethyl)purine ribonucleoside 5f exerted high cytostatic effect and moderate inhibition of adenosine deaminase, while all the other derivatives were much less effective or entirely inactive.

  基于钯催化的交叉偶联反应，开发出一种简便高效的合成6-(羟甲基)嘌呤衍生物（碱基和核苷）的方法。该方法利用6-卤代嘌呤或N-保护的2-氨基-6-卤代嘌呤与（苯甲氧甲基）锌碘化物进行交叉偶联反应，然后进行去保护。还研究了2,6-二卤代嘌呤的区域选择性羟甲基化反应，并用于合成2-氯-6-(羟甲基)或2,6-双(羟甲基)嘌呤。其中6-(羟甲基)嘌呤核苷5f表现出高的细胞静止效应和适度的腺苷脱氨酶抑制作用，而其他衍生物则效果较弱或完全无效。
• Base-Modified Nucleosides Related to 2-Chloro-2?-deoxyadenosine
  作者：Zygmunt Kazimierczuk、Juhani A. Vilpo、Frank Seela

  DOI：10.1002/hlca.19920750715

  日期：1992.11.11

  Derivatives of 2-chloro-2′-deoxyadenosine (1a) containing secondary 6-NH2 groups (5a-c) or a 8-Br substituent (9) were synthesized. They were tested together with ring-modified congeners containing a pyrrolo[2,3-b]pyridine, pyrrolo[3,2-c]pyridine, or pyrazolo[3,4-d]pyrimidine ring system as inhibitors of various leukemic cell lines. Only the 8-Br derivatives 9 showed inhibitory activity, whereas the

  合成了含有仲6-NH 2基团（5a-c）或8-Br取代基（9）的2-氯-2'-脱氧腺苷（1a）的衍生物。将它们与含有吡咯并[2,3- b ]吡啶，吡咯并[3,2- c ]吡啶或吡唑并[3,4- d ]嘧啶环系统作为各种白血病细胞系抑制剂的环修饰同类物一起进行了测试。。仅8-Br衍生物9表现出抑制活性，而碱基修饰的同类物没有活性。化合物1a在ap K a = 1.4（2'-脱氧腺苷在p K a= 3.8）。质子化发生在N（7），而不是在dA观察到的N（1）。
• The N-7 regioisomer of 2-chloro-2′-deoxyadenosine: synthesis, crystal structure, conformation, and stability
  作者：Victoria L. Worthington、William Fraser、Carl H. Schwalbe

  DOI：10.1016/0008-6215(95)00168-s

  日期：1995.10

  from the crystal structure of 7 suggest that the molecule can adopt either anti or syn conformations with a slight preference for anti by 0.4 kcal mol − in heat of formation ( ΔH f ). NOE experiments in (CD 3 ) 2 SO solution support the theoretical results indicating the presence of both syn and anti conformations and that the anti population is marginally favoured. The antileukaemic agent 2-chloro-2′-deoxyadenosine

  摘要核苷6-氨基-2-氯-7-（2-脱氧-β-d-赤型呋喃呋喃糖基）-7H-嘌呤7可从2,6-二氯嘌呤分两步获得。这种不寻常的核苷的晶体结构显示了一个分叉的分子内氢键，从氨基到O-5'，而到O-4'的分支较弱，这施加了同糖苷扭转角：X = 67.0°。使用AM1参数的半经验计算和从7的晶体结构得出的原子坐标的优化表明该分子可以采用反式或顺式构象，在形成热中（ΔHf ）。（CD 3）2 SO溶液中的NOE实验支持理论结果，该理论结果表明同时存在顺式构象和反式构象，并且抗人口数受到偏爱。N-7区域异构体7的抗白血病药物2-氯-2'-脱氧腺苷（6）的稳定性为9.6 kcal mol-，比7更稳定。6比7更高的稳定性似乎主要归因于糖苷配基互变异构体8和9的相对稳定性，二者之间的能量差为6.7 kcal mol-，而9 H互变异构体8更好。同样，除去2-氯取代基对互变异构影响很小。