2-Amino-9-((2R,3R,3aS,9aR)-3-hydroxy-5,5,7,7-tetraisopropyl-hexahydro-1,4,8-trioxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-1,9-dihydro-purin-6-one | 473278-52-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2-Amino-9-((2R,3R,3aS,9aR)-3-hydroxy-5,5,7,7-tetraisopropyl-hexahydro-1,4,8-trioxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-1,9-dihydro-purin-6-one
• 英文别名: 9-[(6aR,8R,9R,9aS)-9-hydroxy-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-3,6,6a,8,9,9a-hexahydrofuro[3,2-f][1,5,2,4]dioxadisilocin-8-yl]-2-amino-1H-purin-6-one
• CAS: 473278-52-3
• 化学式: C₂₃H₄₁N₅O₅Si₂
• 分子量: 523.78
• InChiKey: JJVKQEHYDPSMAV-WGQQHEPDSA-N

物化性质

• 沸点：
  571.9±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.32±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.45
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-Amino-9-((2R,3R,3aS,9aR)-3-hydroxy-5,5,7,7-tetraisopropyl-hexahydro-1,4,8-trioxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-1,9-dihydro-purin-6-one 在 cesium hydroxide 、 methoxyethyl bromide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 鸟苷
  参考文献：
  名称：

  使用新型的硅基保护基合成2'-O-甲氧基乙基鸟苷。

  摘要：

  描述了2'-O-甲氧基乙基鸟苷（8）的短而有效的合成。该策略的核心是开发一种新型的基于硅的保护基（MDPSCl（2），2），用于保护核糖的3'，5'-羟基。用2进行的鸟苷甲硅烷基化具有极好的区域选择性，产率为79％。用甲氧基乙基溴化物和NaHMDS进行6的2′-羟基的烷基化，以85％的收率得到化合物7，而甲硅烷基保护基没有任何明显的裂解，也不需要保护鸟嘌呤碱基部分。最终，使用TBAF实现了7的脱保护并且以97％的产率产生了8。

  DOI：

  10.1021/jo025970e
• 作为产物：
  描述：

  bis(diisopropylsilyl)methane 在 咪唑 、 四氯化碳 、 palladium dichloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 2-Amino-9-((2R,3R,3aS,9aR)-3-hydroxy-5,5,7,7-tetraisopropyl-hexahydro-1,4,8-trioxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-1,9-dihydro-purin-6-one
  参考文献：
  名称：

  使用新型的硅基保护基合成2'-O-甲氧基乙基鸟苷。

  摘要：

  描述了2'-O-甲氧基乙基鸟苷（8）的短而有效的合成。该策略的核心是开发一种新型的基于硅的保护基（MDPSCl（2），2），用于保护核糖的3'，5'-羟基。用2进行的鸟苷甲硅烷基化具有极好的区域选择性，产率为79％。用甲氧基乙基溴化物和NaHMDS进行6的2′-羟基的烷基化，以85％的收率得到化合物7，而甲硅烷基保护基没有任何明显的裂解，也不需要保护鸟嘌呤碱基部分。最终，使用TBAF实现了7的脱保护并且以97％的产率产生了8。

  DOI：

  10.1021/jo025970e

文献信息

• Reagent and process for protecting active groups
  申请人：——

  公开号：US20030225262A1

  公开（公告）日：2003-12-04

  Silylating reagents having a group other than a divalent oxygen separating two silyl groups provide regioselective protection of reactive groups under robust conditions, such as basic conditions used in alkylation, acylation and deoxygenation. In particular, silylating reagents having a group other than oxygen separating two silyl groups are useful for protecting two hydroxy groups of a ribonucleic or deoxyribonucleic acid. Alkylation of a 2′-hydroxy group of a ribonucleoside protected with the inventive silylating agents in the presence of an excess of a mild hindered base such as sodium HMDS may be carried out without protecting the exocyclic amine and oxo functionalities of nucleobases.

  具有除了双价氧以外的其他基团的硅基化试剂，在强韧条件下提供对反应基团的区域选择性保护，例如烷基化、酰化和脱氧等碱性条件。特别是，具有除氧以外的基团分隔两个硅基团的硅基化试剂对于保护核糖核酸或脱氧核糖核酸的两个羟基是有用的。在存在过量轻微阻碍碱（如钠HMDS）的情况下，可在创新的硅基化试剂保护的核糖核苷酸的2'-羟基上进行烷基化，而无需保护嘌呤碱基的外环胺基和羟基官能团。
• Novel synthesis of 2′-O-methylguanosine
  作者：Suetying Chow、Ke Wen、Yogesh S. Sanghvi、Emmanuel A. Theodorakis

  DOI：10.1016/s0960-894x(03)00291-9

  日期：2003.5

  An efficient and chemoselective synthesis of 2'-O-methylguanosine (6) has been accomplished in high yield without protection of the guanine base. The salient feature of the synthesis of 6 lies in the application of methylene-bis-(diisopropylsilyl chloride), (MDPSCl(2), 2) as a new 3',5'-O-protecting group for nucleosides. Use of CH(3)Cl as a weak electrophile and NaHMDS as a mild base was crucial to

  在不保护鸟嘌呤碱基的情况下，高产率地完成了2'-O-甲基鸟嘌呤（6）的高效化学选择合成。6合成的显着特征在于，亚甲基双-（二异丙基甲硅烷基氯）（MDPSCl（2），2）作为新的3'，5'-O-核苷保护基的应用。CH（3）Cl作为弱亲电试剂和NaHMDS作为温和碱的使用对于3'，5'-O保护的鸟苷2'-O-甲基化的成功至关重要。
• MDPSCL₂: A New Protecting Group for Chemoselective Synthesis of 2′-<i>O</i>-Alkylated Guanosines
  作者：Suetying Chow、Ke Wen、Yogesh S. Sanghvi、Emmanuel A. Theodorakis

  DOI：10.1081/ncn-120021959

  日期：2003.10

  An improved strategy for the synthesis of 2'-O-methyl-guanosine (6) and 2'-MOE-guanosine (8) is reported. The regioselectivity of the alkylation was attained using a novel silicon-based protecting group, methylene-bis (diiso-propyl-silylchloride) (MDPSCl2, 2). The alkylation proceeded in a chemoselective manner using NaHMDS as the base and MeCl or MOE-Br as the appropriate electrophiles.