2-amino-6-chloro-9-(3’,5’-di-O-acetyl-2’-deoxy-β-dribofuranosyl)purine | 69992-11-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2-amino-6-chloro-9-(3’,5’-di-O-acetyl-2’-deoxy-β-dribofuranosyl)purine
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-3-acetyloxy-5-(2-amino-6-chloropurin-9-yl)oxolan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 69992-11-6
• 化学式: C₁₄H₁₆ClN₅O₅
• 分子量: 369.765
• InChiKey: KMAOKSXABOUEOX-IVZWLZJFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-amino-6-chloro-9-(3’,5’-di-O-acetyl-2’-deoxy-β-dribofuranosyl)purine 在 亚硝酸苄基三乙基铵 、 氨 、 乙酰氯 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 7.08h， 生成 克拉屈滨
  参考文献：
  名称：

  Efficient Syntheses of 2-Chloro-2‘-deoxyadenosine (Cladribine) from 2‘-Deoxyguanosine¹

  摘要：

  We report efficient syntheses of the clinical agent cladribine (2-chloro-2'-deoxyadenosine, CldAdo), which is the drug of choice against hairy-cell leukemia and other neoplasms, from 2'-deoxyguanosine. Treatment of 3',5'-di-O-acetyl- or benzoyl-2'-deoxyguanosine (1) with 2,4,6-triisopropyl- or 4-methylbenzenesulfonyl chloride gave high yields of the 6-O-arylsulfonyl derivatives 2 or 2%. Deoxychlorination at C6 of 1 also proceeded to give the 2-amino-6-chloropurine derivative 5 in excellent yields. The nonaqueous diazotization/chloro dediazoniation (acetyl chloride/benzyltriethylammonium nitrite) of 2, 2%, and 5 gave the 2-chloropurine derivatives 3, 3'b, and 6, respectively. The selective ammonolysis at C6 (arylsulfonate with 3 or chloride with 6) and accompanying deprotection of the sugar moiety gave CldAdo (64-75% overall yield from 1).

  DOI：

  10.1021/jo020644k
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧鸟苷 在 4-二甲氨基吡啶 、 四乙基氯化铵 、 N,N-二甲基苯胺 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.42h， 生成 2-amino-6-chloro-9-(3’,5’-di-O-acetyl-2’-deoxy-β-dribofuranosyl)purine
  参考文献：
  名称：

  用于标记ADP-核糖基转移酶靶蛋白的链终止和可点击NAD +类似物

  摘要：

  ADP-核糖基转移酶（ART）使用NAD +作为底物，并通过将多个ADP-核糖单元转移到靶蛋白上形成聚（ADP-核糖），在DNA损伤反应和细胞周期调控等众多生物学过程中发挥重要作用。 （PAR）大小可变的链。努力确定PARylation的直接靶标以及特定的ADP核糖受体位点，都必须解决PAR的复杂性。在本文中，我们报道了新的NAD +类似物，它们可以被野生型ART有效处理，并且由于缺少所需的羟基而导致链终止，从而显着降低了蛋白质修饰的复杂性。由于存在炔基，这些NAD +类似物允许通过点击化学进行后续操作，以使用染料或亲和标记物进行标记。这项研究提供了对ARTs底物范围的深入了解，并可能为进一步研究PAR代谢的化学工具铺平道路。

  DOI：

  10.1002/anie.201404431

文献信息

• [EN] PHOSPHATE AND PHOSPHONATE BASED COMPOUNDS OF 6-THIO-2'-DEOXYGUANOSINE AS ANTI-CANCER AGENTS<br/>[FR] COMPOSÉS À BASE DE PHOSPHATE ET DE PHOSPHONATE DE 6-THIO -2'-DÉSOXYGUANOSINE COMME AGENTS ANTICANCÉREUX
  申请人：MINGHUI PHARMACEUTICAL (SHANGHAI) LTD

  公开号：WO2020154917A1

  公开（公告）日：2020-08-06

  Phosphates and phosphonates compounds of 6-thio-2'-deoxyguanosine are provided. The uses and pharmaceutical compositions of these compounds are disclosed.

  提供了6-硫-2'-脱氧鸟苷的磷酸盐和膦酸盐化合物。这些化合物的用途和药用组合物已被披露。
• Stabilization of DNA duplex by 2-substituted adenine as a minor groove modifier
  作者：Makiko Tanaka、Ryota Kozakai、Yoshio Saito、Isao Saito

  DOI：10.1016/j.bmcl.2011.09.104

  日期：2011.12

  2-(1-Naphthalenylethynyl)-2′-deoxyadenosine (NA) was synthesized and incorporated into oligodeoxynucleotides. DNA duplexes containing newly designed 5′-NAT-3′/3′-TNA-5′ base pairs are considerably stabilized than unmodified duplexes by stacking interaction of naphthalene rings in the narrow minor groove as characterized by a new emission at longer wavelength and exciton coupled CD signals.

  2-（1- Naphthalenylethynyl）-2'-脱氧腺苷（Ñ A）合成并掺入寡脱氧核苷酸。DNA双链体含有新设计的5'- Ñ AT-3'/ 3'-T Ñ A-5'通过堆叠在窄小沟作为在更长的特征在于一种新的发射萘环的相互作用碱基对比未修饰双链体相当稳定波长和激子耦合的CD信号。
• 2-Substituted 2′-deoxyinosine 5′-triphosphates as substrates for polymerase synthesis of minor-groove-modified DNA and effects on restriction endonuclease cleavage
  作者：Ján Matyašovský、Michal Hocek

  DOI：10.1039/c9ob02502b

  日期：——

  Five 2-substituted 2'-deoxyinosine triphosphates (dRITP) were synthesized and tested as substrates in enzymatic synthesis of minor-groove base-modified DNA. Only 2-methyl and 2-vinyl derivatives proved to be good substrates for Therminator DNA polymerase, whilst all other dRITPs and other tested DNA polymerases did not give full length products in primer extension. The DNA containing 2-vinylhypoxanthine

  合成了五种2-取代的2'-脱氧肌苷三磷酸酯（dRITP），并作为酶法合成了小沟碱基修饰的DNA的底物。事实证明，只有2-甲基和2-乙烯基衍生物是Therminator DNA聚合酶的良好底物，而所有其他dRITP和其他经过测试的DNA聚合酶在引物延伸方面均未提供全长产物。然后通过与硫醇的硫醇-烯反应进一步修饰含有2-乙烯基次黄嘌呤的DNA。由于小槽内硫醇与乙烯基之间的邻近作用，含半胱氨酸的小槽结合十二肽与DNA之间发生了交联反应。2位取代的dIRTP，以及先前制备的2位取代的2' 然后，将三磷酸脱氧腺苷（dRATP）酶促合成小沟槽修饰的DNA，以研究小沟槽修饰对II型限制性核酸内切酶（REs）切割DNA的影响。尽管RE应该通过大槽中的H键识别序列，但是一些小槽修饰也对切割具有抑制作用。
• Modified Nucleotides for Discrimination between Cytosine and the Epigenetic Marker 5-Methylcytosine
  作者：Janina von Watzdorf、Kim Leitner、Andreas Marx

  DOI：10.1002/anie.201511520

  日期：2016.2.24

  for diagnostics. Here we describe that modified dGTP analogues as well as modified primers are able to sense the presence or absence of a single methylation of C, even though this modification does not interfere directly with Watson-Crick nucleobase pairing. By screening several modified nucleotide scaffolds, O(6)-modified 2'-deoxyguanosine analogues were identified as discriminating between C and 5mC

  5-Methyl-2'-deoxycytosine 是真核细胞中最常见的 DNA 表观遗传标记，在基因调控中起关键作用，并影响发育和癌变等各种细胞过程。因此，5mC的检测可以作为诊断的重要生物标志物。在这里，我们描述了修饰的 dGTP 类似物以及修饰的引物能够感知 C 的单个甲基化是否存在，即使这种修饰不会直接干扰 Watson-Crick 核碱基配对。通过筛选几个修饰的核苷酸支架，O(6)-修饰的 2'-脱氧鸟苷类似物被确定为区分 C 和 5mC。这些修饰的核苷酸可能会在位点特异性 5mC 检测中得到应用，例如，通过实时 PCR 方法。
• 2-Allyl- and Propargylamino-dATPs for Site-Specific Enzymatic Introduction of a Single Modification in the Minor Groove of DNA
  作者：Ján Matyašovský、Radek Pohl、Michal Hocek

  DOI：10.1002/chem.201803973

  日期：2018.10.9

  one modified nucleotide into the primer. Using a template encoding for two consecutive adenines, conditions were found for incorporation of either one or two modified nucleotides. In all cases, addition of a mixture of natural dNTPs led to primer extension resulting in site‐specific single modification of DNA in the minor groove. The allylamino‐substituted DNA was used for the thiol‐ene addition, whereas

  制备了一系列 2-烷基氨基-2'-脱氧腺苷三磷酸 (dATP)，并发现它们是 Therminator DNA 聚合酶的底物，该酶仅将一个修饰的核苷酸掺入引物中。使用编码两个连续腺嘌呤的模板，找到了掺入一个或两个修饰核苷酸的条件。在所有情况下，添加天然 dNTP 混合物都会导致引物延伸，从而在小沟中产生 DNA 的位点特异性单一修饰。烯丙氨基取代的 DNA 用于硫醇烯加成，而用于 CuAAC 点击反应的炔丙氨基 DNA 用于在小沟中用荧光染料标记 DNA。该方法用于构建用于检测寡核苷酸的 FRET 探针。